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Universidad de Oriente
             Núcleo Bolívar
     Escuela de Ciencias de la Salud
  Departamento de Ciencias Fisiológicas
        Asignatura: Bioquímica




    UNIDAD XIV.
BIOLOGÍA MOLECULAR


     Prof. Zulay Castillo Pérez
ÁCIDOS NUCLEICOS
ÁCIDOS NUCLEICOS

El DNA, es la base química de la herencia y
está   organizada    en   genes,   unidades
fundamentales de la información genética.
Los genes controlan la síntesis de varios
tipos de RNA, que en su mayor parte están
involucrados en la síntesis de proteínas.
ÁCIDOS NUCLEICOS


Los   genes   no   funcionan    de   manera
autónoma; su replicación y funcionamiento
se controlan por varios productos de gen, a
menudo en colaboración componentes de
varias vías de transducción de señales.
ÁCIDOS NUCLEICOS

El conocimiento de la estructura y función
de los ácidos nucleicos es esencial para
comprender la genética y muchos aspectos
de la fisiopatología de la enfermedad, así
como los fundamentos genéticos de la
enfermedad.
ÁCIDOS NUCLEICOS

 Avery, MacLeod y McCarty
 (1944): El DNA contiene la
    información genética.
 Determinación genética del
carácter (tipo) de la cápsula de
  un neumococo específico
 podía ser transmitida a otro
    neumococo de un tipo
      capsular diferente
introduciendo DNA purificado
del primer tipo en el segundo.
Reglas de Chargaff para ADN de Doble hélice, 1949
ÁCIDOS NUCLEICOS

La información Genética reside en el orden de las
unidades monoméricas en los polímeros, por lo que
debe existir un mecanismo para reproducir o replicar
esta información específica con un elevado grado de
fidelidad.
Ese requerimiento, junto con los datos de Chargaff,
condujo a Watson, Crick (1953) a proponer el modelo
de una molécula de doble tira del DNA.
Estructura tridimensional de la molécula de ADN
Apareamiento entre bases nitrogenadas
ÁCIDOS NUCLEICOS




El “inicio” se define como 5‘ y el
 “fin” como 3'
Los términos 5’ y 3’ indican la
 posición de los nucleótidos en el
 esqueleto de ADN en relación con
 la molécula de azúcar
Las dos cadenas de la doble hélice
 están orientadas en direcciones
 opuestas
ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN)
Constituido por 4 desoxinucleótidos:
desoxiadenosina, desoxiguanosina,
desoxicitidinay desoxitimidina

Azúcar + fosfato + base nitrogenada
Parejas: A con T/G con C

Gobierno de la síntesis de proteínas
Información – código genético
secuencia de nucleótidos
No todo el ADN está formado por genes
TIPOS DE ADN
  Dependen del enrollamiento de la cadena y su
                 orientación:



ADN B: hélice orientada a la
derecha con una distancia de 3,4 Aº
entre pares de bases y 10,4 pares de
base por vuelta.

Forma predominante in vivo.
TIPOS DE ADN



ADN A: predomina          en   los
híbridos ADN-ARN es similar a
la B pero mas compacta 2,3 Aº
entre pares de bases y 11 pares de
bases por vuelta.
TIPOS DE ADN


ADN Z: las bases de las dos
cadenas se posicionan mas hacia la
periferia de una hélice orientada a
la izquierda. Hay una distancia de
38 Aº entre pares de bases y 12
bases por vuelta
TIPOS DE ADN
ÁCIDO RIBONUCLEICO (ARN)

Una sola hebra.
Nucleótidos:
Uridina, Adenosina, Guanosina, Citdina
Azúcar + fosfato + base nitrogenada
5 a 10 veces más abundante que el ADN

Tipos
   ARNr
   ARNm
   ARNt
ARN
Formado     por   nucleótidos   unidos   por   enlaces
fosfodiéster. Presenta una composición similar a la del
DNA.

Generalmente son de cadena sencilla.

La estructura secundaria de las regiones de doble
cadena, se asemeja a la forma A del DNA, más que a la
forma B, la cual no puede ser adoptada debido a
impedimentos estéricos a causa del grupo OH del C2´ de
la ribosa.
ARN
Macromolécula sintetizada por las RNA polimerasas por
transcripción de una secuencia de nucleótidos de DNA que sirve
como molde.

A diferencia del DNA el RNA engloba a una familia muy
heterogénea.

La estructura primaria viene determinada por la secuencia de
nucleótidos y pueden presentar formas muy variadas de
estructuras secundarias, formadas por uniones intracatenarias.
También han sido observadas estructuras terciarias para ciertos
tRNAy rRNA.
TIPOS DE RNA EN EUCARIOTAS

RNA heterogéneo nuclear (hnRNA).

RNA mensajero (mRNA).

RNA ribosómico (rRNA).

RNA de transferencia (tRNA).

RNA citoplasmático pequeño (scRNA)
ARN HETEROGÉNEO NUCLEAR
             (hnRNA)
 Representa las moléculas precursoras del
  RNAm que son transcritas directamente del
  DNA y que codifican          para una proteína
  determinada.


 Incluyen secuencias codificantes (exones) y no
  codificantes   (intrones).    Este   RNA   será
  procesado.
RNA MENSAJERO (mRNA)
Representan las moléculas procesadas del hnRNA que
codifican para una proteína determinada. Su secuencia de
nucleótidos es traducida en una secuencia de aminoácidos en
el proceso de traducción para sintetizar una proteína .


Se incluyen formas muy heterogéneas tanto en tamaño como
en secuencia, existiendo, en general, una molécula de mRNA
para cada gen o grupo de genes que vayan a expresarse
ARN DE TRANSFERENCIA (tRNA)

Es el más pequeño con unos 75 nucleótidos de medida. Su
función es transportar los aminoácidos en forma activada hasta
el ribosoma, durante el proceso de traducción del mRNA.


Existe al menos un tipo de tRNA para cada uno de los 20
aminoácidos.


Todos presentan en su extremo 3´ la secuencia de nucleótidos
CCA, independientemente del aminoácido que transporten. El
extremo 3´ constituye el extremo aceptor del aminoácido.
ARN DE TRANSFERENCIA (tRNA)
ARN CITOPLASMÁTICO PEQUEÑO (scRNA)

Participa en el proceso de soldadura de los exones durante
la formación del mRNA.


Son pequeñas secuencias de unos 150 nucleótidos de
media: U1, U2, U3, U4, U5, U6,


Es un ARN de unos 300 nucleótidos es el RNA que forma
parte del SRP (Signal Recognition Particle) que ejerce una
función específica en el envío de proteínas recién sintetizadas
hacia compartimentos intra-o extracelulares.
DIFERENCIAS ENTRE ADN Y ARN

1) El azúcar en el RNA al cual se adhieren los fosfatos y las
  bases purínicas y pirimidínicas es la ribosa en lugar de la
  2'-desoxirribosa del DNA.


2) Los componentes pirimidinicos del RNA difieren de los
  del DNA. Aunque el RNA contiene los ribonucleótidos de
  adenina, guanina y citosina, no posee timina. En lugar de
  la timina, el RNA contiene el ribonucleótido de uracilo.
DIFERENCIAS ENTRE ADN Y ARN


3) El RNA existe como tira sencilla y no como molécula
  helicoidal de doble tira, como el DNA. Sin embargo
  dada   la   secuencia    de   bases    complementarias
  apropiadas con polaridad opuesta, la tira sencilla de
  RNA, es capaz de doblarse sobre si misma, como una
  horquilla y adquiere así características de tira doble.
EMPAQUETAMIENTO DEL ADN

Histonas:
proteínas asociadas con la cromatina del DNA.


Nucleosomas:
unidad      estructural construida con ocho
moléculas de histona y DNA superenrollado
con giro a la izquierda.
EMPAQUETAMIENTO DEL ADN
EMPAQUETAMIENTO DEL ADN
EMPAQUETAMIENTO DEL ADN


            1 Bucle son 50x106pb

            1 Roseton son 6 bucles

            1 Vuelta de espiral son
            30 rosetones

            2 Cromatidas con 2x10
            vueltas de espiral
ÁCIDOS NUCLEICOS

Transportar Información
REPLICACIÓN SEMICONSERVATIVA
             DEL ADN
• Proceso por el cual se sintetiza el ADN.


• Es semiconservativa porque las cadenas de ADN
 parental sirven como moldes para las dos cadenas
 complementarias


• Cada molécula generada por el proceso de replicación
 contiene una cadena parenteral intacta y una nueva de
 síntesis.
REPLICACIÓN SEMICONSERVATIVA DEL ADN
SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS



 Las características principales en este proceso de
replicación fueron estudiadas en E. coli.


 Es bidireccional, se inicia con la unión de
aproximada de 30 moléculas de proteína ADN A, a
un único punto de origen llamado Ori C.
SÍNTESIS DEL ADN EN
             PROCARIOTAS

 Con ayuda de otras proteínas; las hebras
parentales se separan en esa región y copian se
generan dos horquillas de replicación que se
mueven en ambos sentidos alejándose del origen.
SÍNTESIS DEL ADN EN
                PROCARIOTAS

Desenrrollamiento de las cadenas parentales:
Es necesario que la hélice se desenrrolle por delante de la
horquilla de replicación para esto actúan las siguientes enzimas:


1) Helicasas:
separan las cadenas de ADN y desenrrollan la doble hélice
parental, las proteínas de unión de cadena sencilla impiden que
las cadenas se reasocien y las protegen del ataque de enzimas
que escinden los enlaces fosfodiéster en el ADN de cadena
única.
SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS
2) Topoisomerasas:

alivian el superenrrollamiento en la cadena doble parental
producido por el desenrrollamiento la más importante es la
ADN girasa

3) Polimerasas del ADN:

catalizan la síntesis del ADN, E. coli posee 3 ADN polimerasas,
la principal es Pol III todas copian una cadena molde en sentido
3’-5’ para producir una en sentido 5’-3’ sus sustrato son los
desoxirribonucleótidos fosfato (dATP, dTTP, dGTP, dCTP) para
adición de nucleótidos a la cadena en crecimiento.
SÍNTESIS DEL ADN EN
             PROCARIOTAS

Eliminación de errores en el apareamiento
de bases:
el primer punto de control es ejercido por la Pol III
en su función exonucleasa y tras la replicación otros
mecanismos reparan apareamientos erróneos que
escapan a la primera corrección de errores.
SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS


Cebadores:
Para que la ADN polimerasa pueda dar inicio a la síntesis es
necesario un extremo 3’-OH libre que es aportado por el
cebador (oligonucleótido de ARN) y se sintetiza en dirección
5’ 3’ por una primasa (ARN polimerasa) que añade
inicialmente un desoxirribonucleótido al grupo 3’-OH y luego
continúa añadiendo al extremo 3’ de la cadena en crecimiento.
REPLICACIÓN DEL ADN EN E. COLI
ORIGEN DE LA REPLICACIÓN EN
   CÉLULAS PROCARIOTAS
REPLICACIÓN DEL ADN EN EUCARIOTAS



El proceso es similar que en procariotas las
diferencias principales radican en el tamaño
del ADN eucariota y la asociación del ADN
eucariota con las histonas en los nucleosomas.
Hay muchos puntos de origen para la
replicación de este ADN.
REPLICACIÓN DEL ADN EN EUCARIOTAS



Polimerasas en eucariotas: existen al
menos 9 clases de ADN polimerasas (α, β, γ, δ,
ζ, ε, κ, η, ι) la δ es la principal enzima
replicativa las polimerasas α, β y ε participan
en la reparación del ADN, la polimerasa γ en
la replicación del ADN mitocondrial.
REPLICACIÓN DEL ADN

Una horquilla de replicación consiste en cuatro componentes
que se forman en la secuencia siguiente:

1)La DNA helicasa escinde un segmento corto de la dupleta de
DNA progenitor.

2) La primasa inicia la síntesis de una molécula de RNA para
iniciar la síntesis de DNA.

3) La DNA polimerasa inicia la síntesis de la tira hija naciente.

4) Las Proteínas de Unión al ADN de hebra simple (SSB) se
enlazan a DNA y evitan la conversión prematura de ssDNA a
dsDNA.
REPLICACIÓN DEL ADN


En 1968, Reiji Okazaki demostró que la síntesis de
una de las cadenas (conductora) en dirección 5’-3’
hacia la horquilla es continua y la otra cadena
(retrasada) es discontinua y se sintetiza en
fragmentos cortos (fragmentos de Okazaki) en
sentido 5’-3’ alejándose de la horquilla para
posteriormente unirse pero e conjunto el proceso
avanza hacia la horquilla de replicación.
REPLICACIÓN DEL ADN
REPLICACIÓN DEL ADN
REPLICACIÓN DEL ADN




 Modelo de
acción de la
  helicasa
REPLICACIÓN DEL ADN
                          Desenrollamiento del
                             ADN parental



                          Enrollamiento de las
                          hebras de ADN en la
                          cabeza de la horquilla de
                          replicación


                          Rotura transitoria que
                          sirve    como    eslabón
                          giratorio para permitirla
                          rotación libre de las
                          hebras de ADN



Modelo de acción de la topoisomerasa
REPLICACIÓN DEL ADN
TRANSCRIPCIÓN

Proceso de síntesis de ARN. Mecanismo celular por
el cual la información genética contenida en el ADN
es transferida a una molécula de ARN
TRANSCRIPCIÓN

Durante la transcripción la información genética del
ADN es copiada al ARN mensajero (ARNm):

La transcripción comienza al inicio del gen, en 5'
(región del promotor) y continua hasta el fin del gen
en 3‘.
La secuencia del ARNm es complementaria a la del
molde de ADN usada para la transcripción, excepto
que las bases de uracilo sustituyen a las timinas.
TRANSCRIPCIÓN
La nueva molécula de ARN es procesada a través
de:


“Splicing”: escisión de los intrones.

“Capping”: modificación del extremo 5’.

Poli-adenilación: adición de adeninas en el
extremo 3’.
TRANSCRIPCIÓN
                ARN Polimerasa

Utiliza   el   molde    de   ADN   para   polimerizar
ribonucleótidos 5´trifosfato (NTPs).
 El crecimiento es en dirección 5´-3´
 No requiere un cebador
 Solo se trascribe un fragmento del ADN utilizando
una sola hebra, denominada sin sentido y la otra es
la hebra con sentido.
TRANSCRIPCIÓN


                    intrón     intrón
  ADN


ARN                          Síntesis de ARN (transcripción)


                             Escisión de intrones (splicing)



Síntesis de proteínas
     (traducción)
TRANSCRIPCIÓN
TRANSCRIPCIÓN

Fases:
1)Iniciación: tiene lugar en secuencia promotora
o promotores
2)Elongación: por acción de la ARN Polimerasa
(ARNP)
3)Terminación:
  a) Independiente del factor
  b) Dependiente del factor
TRANSCRIPCIÓN

1) Iniciación:
 Aumento de la afinidad de la enzima ARNP con el
ADN mediante el factor σ en la interacción con el
promotor.
 Formación de un complejo promotor cerrado
(Hemivida de 10 seg. aprox.).
 Desenrrollamiento de aprox 12 pb del ADN (-9 a
+3, +1 primer nucleótido que se lee).
 Presente un sitio, que une ATP y GTP con
semisaturación de 100μM, Purina en el extremo 5´
TRANSCRIPCIÓN

2) Elongación:
 Sitio para los rNTP, semisaturación de 10μM.
 Ataque nucleofílico por el hidróxilo 3’.
 Las primeras reacciones de formación de enlaces
fosfodiester tienen eficiencia baja. Aborto de 2 a 9
residuos.
 Disociación de la subunidad σ y se continua por
la polimerasa “core”.
TRANSCRIPCIÓN
TRANSCRIPCIÓN
Modelos de elongación del ADN transcrito:

a) Modelo de burbuja
TRANSCRIPCIÓN
b) Modelo de gusano:
TRANSCRIPCIÓN

3) Terminación:
a)Independiente del factor (características):
 Dos segmentos simétricos ricos en GC, que en el
trasncrito forman un bucle troncal.
 Trayecto posterior de 4 a 8 residuos de A.

La ARNP reduce la velocidad o realiza una pausa. La
estabilidad de los pbde GC hace que el molde sea
difícil de desenrollar.
TRANSCRIPCIÓN
b) Dependiente del factor:
Características:
 Se lleva a cabo por una proteína con actividad
ADN-ARN helicasa. La proteína ρ (rho) se une al
transcrito en formación cuando la ARNP realiza una
pausa.
 La pausa de la ARNP en lugares de terminación
dependiente de ρ posiblemente por acción de la
proteína NusA.
TRANSCRIPCIÓN
TRANSCRIPCIÓN
TRADUCCIÓN

 Síntesis de proteínas guiada por un molde de
ARNm.
 No es más que la etapa final de la expresión génica.
 Es sólo el primer paso en la constitución de una
proteína funcional.
 Todos los ARNm se leen en dirección 5´- 3´.
 Las cadenas polipeptídicas se sintetizan desde el
extremo amino terminal al carboxilo terminal.
TRADUCCIÓN

 Cada aminoácido viene codificado por tres bases
(codón) en el ARNm.
 Tiene lugar en los ribosomas.
 Implica la interacción de tres tipos de moléculas de
ARN (ARNm, ARNt y ARNr).
 El ARNt sirve de adaptador entre el ARNm y los
aminoácidos de la proteína.
TRADUCCIÓN
TRADUCCIÓN




         UTR: regiones que no
         codifican
TRADUCCIÓN

Etapas:
1)Iniciación: unión del ARNt iniciador y del
ARNm a la subunidad pequeña del ribosoma.
2)Elongación: unión de varios aminoácidos a la
cadena polipeptídica creciente.
3)Terminación: se encuentra el codón de
terminación y se disocia el ribosoma liberando la
cadena polipeptídica sintetizada.
TRADUCCIÓN
TRADUCCIÓN

  Factores de traducción. Proteínas que intervienen
     en cada una de las etapas de la traducción.




IF: factor de iniciación.
EF: factor de elongación.
RF: factor de liberación.
TRADUCCIÓN
Inicio de la traducción en células       1)
procariotas.

1)Unión de tres factores de iniciación
(IF-1, 2 y 3) a la subunidad pequeña     2)
ribosómica.
2)Unión a la subunidad ribosómica
pequeña del ARNm y del ARNt
iniciador (fMet), que se reconoce en
IF-2 unido a GTP. Liberación de IF-3 y
                                         3)
unión de la subunidad ribosómica
grande.
3)Unión de la subunidad ribosómica
grande al complejo por hidrólisis del
GTP, con liberación de IF-1 e IF-2
unido a GDP.
TRADUCCIÓN
Inicio de la traducción en células
eucariotas.
1)Unión de tres factores de iniciación
(eIF-3, 1 y 1A) a la subunidad pequeña
ribosómica.
2)Llegada al ribosoma del ARNt
iniciador (fMet) por el eIF-2
(formando complejo con GTP) y del
ARNm por varios IF.
3)Reconocimiento del codón de
iniciación (AUG) con hidrólisis de ATP.
4)Liberación de eIF-2 y otros IF por
hidrólisis de GTP.
5)Unión de la subunidad ribosómica
grande al complejo.
TRADUCCIÓN
1)
          Etapas de la elongación de
          la traducción.

          1)Unión del ARNt iniciador
          (fMet) al sitio P (peptidil) del
2)
          ribosoma.

          2)Llegada de un segundo
          aminoacil al sitio A (aminoacil)
          del ribosoma dirigido por EF-
          Tu (unido a GTP) que se libera
          luego de la hidrólisis del GTP.
TRADUCCIÓN
3)       Etapas de la elongación de la
         traducción.

         3)Formación del enlace peptídico y
         transferencia del fMet al aminoacil
         ARNt ubicado en el sitio A.
4)
         4) Translocación del peptidil ala-met
         al sitio P y la del ARNt libre al sitio E
         (liberación), dejando el sitio A vacío,
         ocasionada por el desplazamiento del
         ribosoma tres nucleótidos a través del
         ARNm mediado por EF-G por
         hidrólisis de GTP.
TRADUCCIÓN
1)    2)      Terminación de la
              traducción.

              1) Reconocimiento de
              un       codón      de
              terminación (ej: UAA)
              por un factor de
              liberación y no por un
              ARNt.
              2) Liberación de la
              cadena polipeptídica
              completa y disociación
              del ARNt y ARNm del
              ribosoma
CÓDIGO GENÉTICO
             Con 3 bases hay 64
           combinaciones posibles
              Parada y arranque
                Redundancia

            ¿Cuál es la secuencia de
            aminoácidos que se
            traduce de esta
            secuencia de ARN?
            CCA CAA GAC UAG
              a) Pro GIn Asp Stop
              b) Pro His Asp Trp
              c) His GIn Asp Stop
              d) Pro GIn His Stop

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Unidad XIV biologia molecular

  • 1. Universidad de Oriente Núcleo Bolívar Escuela de Ciencias de la Salud Departamento de Ciencias Fisiológicas Asignatura: Bioquímica UNIDAD XIV. BIOLOGÍA MOLECULAR Prof. Zulay Castillo Pérez
  • 3. ÁCIDOS NUCLEICOS El DNA, es la base química de la herencia y está organizada en genes, unidades fundamentales de la información genética. Los genes controlan la síntesis de varios tipos de RNA, que en su mayor parte están involucrados en la síntesis de proteínas.
  • 4. ÁCIDOS NUCLEICOS Los genes no funcionan de manera autónoma; su replicación y funcionamiento se controlan por varios productos de gen, a menudo en colaboración componentes de varias vías de transducción de señales.
  • 5. ÁCIDOS NUCLEICOS El conocimiento de la estructura y función de los ácidos nucleicos es esencial para comprender la genética y muchos aspectos de la fisiopatología de la enfermedad, así como los fundamentos genéticos de la enfermedad.
  • 6. ÁCIDOS NUCLEICOS Avery, MacLeod y McCarty (1944): El DNA contiene la información genética. Determinación genética del carácter (tipo) de la cápsula de un neumococo específico podía ser transmitida a otro neumococo de un tipo capsular diferente introduciendo DNA purificado del primer tipo en el segundo.
  • 7. Reglas de Chargaff para ADN de Doble hélice, 1949
  • 8.
  • 9.
  • 10. ÁCIDOS NUCLEICOS La información Genética reside en el orden de las unidades monoméricas en los polímeros, por lo que debe existir un mecanismo para reproducir o replicar esta información específica con un elevado grado de fidelidad. Ese requerimiento, junto con los datos de Chargaff, condujo a Watson, Crick (1953) a proponer el modelo de una molécula de doble tira del DNA.
  • 11.
  • 12. Estructura tridimensional de la molécula de ADN
  • 13. Apareamiento entre bases nitrogenadas
  • 14. ÁCIDOS NUCLEICOS El “inicio” se define como 5‘ y el “fin” como 3' Los términos 5’ y 3’ indican la posición de los nucleótidos en el esqueleto de ADN en relación con la molécula de azúcar Las dos cadenas de la doble hélice están orientadas en direcciones opuestas
  • 15. ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN) Constituido por 4 desoxinucleótidos: desoxiadenosina, desoxiguanosina, desoxicitidinay desoxitimidina Azúcar + fosfato + base nitrogenada Parejas: A con T/G con C Gobierno de la síntesis de proteínas Información – código genético secuencia de nucleótidos No todo el ADN está formado por genes
  • 16. TIPOS DE ADN Dependen del enrollamiento de la cadena y su orientación: ADN B: hélice orientada a la derecha con una distancia de 3,4 Aº entre pares de bases y 10,4 pares de base por vuelta. Forma predominante in vivo.
  • 17. TIPOS DE ADN ADN A: predomina en los híbridos ADN-ARN es similar a la B pero mas compacta 2,3 Aº entre pares de bases y 11 pares de bases por vuelta.
  • 18. TIPOS DE ADN ADN Z: las bases de las dos cadenas se posicionan mas hacia la periferia de una hélice orientada a la izquierda. Hay una distancia de 38 Aº entre pares de bases y 12 bases por vuelta
  • 20. ÁCIDO RIBONUCLEICO (ARN) Una sola hebra. Nucleótidos: Uridina, Adenosina, Guanosina, Citdina Azúcar + fosfato + base nitrogenada 5 a 10 veces más abundante que el ADN Tipos ARNr ARNm ARNt
  • 21. ARN Formado por nucleótidos unidos por enlaces fosfodiéster. Presenta una composición similar a la del DNA. Generalmente son de cadena sencilla. La estructura secundaria de las regiones de doble cadena, se asemeja a la forma A del DNA, más que a la forma B, la cual no puede ser adoptada debido a impedimentos estéricos a causa del grupo OH del C2´ de la ribosa.
  • 22. ARN Macromolécula sintetizada por las RNA polimerasas por transcripción de una secuencia de nucleótidos de DNA que sirve como molde. A diferencia del DNA el RNA engloba a una familia muy heterogénea. La estructura primaria viene determinada por la secuencia de nucleótidos y pueden presentar formas muy variadas de estructuras secundarias, formadas por uniones intracatenarias. También han sido observadas estructuras terciarias para ciertos tRNAy rRNA.
  • 23. TIPOS DE RNA EN EUCARIOTAS RNA heterogéneo nuclear (hnRNA). RNA mensajero (mRNA). RNA ribosómico (rRNA). RNA de transferencia (tRNA). RNA citoplasmático pequeño (scRNA)
  • 24. ARN HETEROGÉNEO NUCLEAR (hnRNA)  Representa las moléculas precursoras del RNAm que son transcritas directamente del DNA y que codifican para una proteína determinada.  Incluyen secuencias codificantes (exones) y no codificantes (intrones). Este RNA será procesado.
  • 25. RNA MENSAJERO (mRNA) Representan las moléculas procesadas del hnRNA que codifican para una proteína determinada. Su secuencia de nucleótidos es traducida en una secuencia de aminoácidos en el proceso de traducción para sintetizar una proteína . Se incluyen formas muy heterogéneas tanto en tamaño como en secuencia, existiendo, en general, una molécula de mRNA para cada gen o grupo de genes que vayan a expresarse
  • 26. ARN DE TRANSFERENCIA (tRNA) Es el más pequeño con unos 75 nucleótidos de medida. Su función es transportar los aminoácidos en forma activada hasta el ribosoma, durante el proceso de traducción del mRNA. Existe al menos un tipo de tRNA para cada uno de los 20 aminoácidos. Todos presentan en su extremo 3´ la secuencia de nucleótidos CCA, independientemente del aminoácido que transporten. El extremo 3´ constituye el extremo aceptor del aminoácido.
  • 28. ARN CITOPLASMÁTICO PEQUEÑO (scRNA) Participa en el proceso de soldadura de los exones durante la formación del mRNA. Son pequeñas secuencias de unos 150 nucleótidos de media: U1, U2, U3, U4, U5, U6, Es un ARN de unos 300 nucleótidos es el RNA que forma parte del SRP (Signal Recognition Particle) que ejerce una función específica en el envío de proteínas recién sintetizadas hacia compartimentos intra-o extracelulares.
  • 29. DIFERENCIAS ENTRE ADN Y ARN 1) El azúcar en el RNA al cual se adhieren los fosfatos y las bases purínicas y pirimidínicas es la ribosa en lugar de la 2'-desoxirribosa del DNA. 2) Los componentes pirimidinicos del RNA difieren de los del DNA. Aunque el RNA contiene los ribonucleótidos de adenina, guanina y citosina, no posee timina. En lugar de la timina, el RNA contiene el ribonucleótido de uracilo.
  • 30. DIFERENCIAS ENTRE ADN Y ARN 3) El RNA existe como tira sencilla y no como molécula helicoidal de doble tira, como el DNA. Sin embargo dada la secuencia de bases complementarias apropiadas con polaridad opuesta, la tira sencilla de RNA, es capaz de doblarse sobre si misma, como una horquilla y adquiere así características de tira doble.
  • 31. EMPAQUETAMIENTO DEL ADN Histonas: proteínas asociadas con la cromatina del DNA. Nucleosomas: unidad estructural construida con ocho moléculas de histona y DNA superenrollado con giro a la izquierda.
  • 34. EMPAQUETAMIENTO DEL ADN 1 Bucle son 50x106pb 1 Roseton son 6 bucles 1 Vuelta de espiral son 30 rosetones 2 Cromatidas con 2x10 vueltas de espiral
  • 36. REPLICACIÓN SEMICONSERVATIVA DEL ADN • Proceso por el cual se sintetiza el ADN. • Es semiconservativa porque las cadenas de ADN parental sirven como moldes para las dos cadenas complementarias • Cada molécula generada por el proceso de replicación contiene una cadena parenteral intacta y una nueva de síntesis.
  • 38. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS  Las características principales en este proceso de replicación fueron estudiadas en E. coli.  Es bidireccional, se inicia con la unión de aproximada de 30 moléculas de proteína ADN A, a un único punto de origen llamado Ori C.
  • 39. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS  Con ayuda de otras proteínas; las hebras parentales se separan en esa región y copian se generan dos horquillas de replicación que se mueven en ambos sentidos alejándose del origen.
  • 40. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS Desenrrollamiento de las cadenas parentales: Es necesario que la hélice se desenrrolle por delante de la horquilla de replicación para esto actúan las siguientes enzimas: 1) Helicasas: separan las cadenas de ADN y desenrrollan la doble hélice parental, las proteínas de unión de cadena sencilla impiden que las cadenas se reasocien y las protegen del ataque de enzimas que escinden los enlaces fosfodiéster en el ADN de cadena única.
  • 41. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS 2) Topoisomerasas: alivian el superenrrollamiento en la cadena doble parental producido por el desenrrollamiento la más importante es la ADN girasa 3) Polimerasas del ADN: catalizan la síntesis del ADN, E. coli posee 3 ADN polimerasas, la principal es Pol III todas copian una cadena molde en sentido 3’-5’ para producir una en sentido 5’-3’ sus sustrato son los desoxirribonucleótidos fosfato (dATP, dTTP, dGTP, dCTP) para adición de nucleótidos a la cadena en crecimiento.
  • 42. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS Eliminación de errores en el apareamiento de bases: el primer punto de control es ejercido por la Pol III en su función exonucleasa y tras la replicación otros mecanismos reparan apareamientos erróneos que escapan a la primera corrección de errores.
  • 43. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS Cebadores: Para que la ADN polimerasa pueda dar inicio a la síntesis es necesario un extremo 3’-OH libre que es aportado por el cebador (oligonucleótido de ARN) y se sintetiza en dirección 5’ 3’ por una primasa (ARN polimerasa) que añade inicialmente un desoxirribonucleótido al grupo 3’-OH y luego continúa añadiendo al extremo 3’ de la cadena en crecimiento.
  • 44. REPLICACIÓN DEL ADN EN E. COLI
  • 45. ORIGEN DE LA REPLICACIÓN EN CÉLULAS PROCARIOTAS
  • 46. REPLICACIÓN DEL ADN EN EUCARIOTAS El proceso es similar que en procariotas las diferencias principales radican en el tamaño del ADN eucariota y la asociación del ADN eucariota con las histonas en los nucleosomas. Hay muchos puntos de origen para la replicación de este ADN.
  • 47. REPLICACIÓN DEL ADN EN EUCARIOTAS Polimerasas en eucariotas: existen al menos 9 clases de ADN polimerasas (α, β, γ, δ, ζ, ε, κ, η, ι) la δ es la principal enzima replicativa las polimerasas α, β y ε participan en la reparación del ADN, la polimerasa γ en la replicación del ADN mitocondrial.
  • 48. REPLICACIÓN DEL ADN Una horquilla de replicación consiste en cuatro componentes que se forman en la secuencia siguiente: 1)La DNA helicasa escinde un segmento corto de la dupleta de DNA progenitor. 2) La primasa inicia la síntesis de una molécula de RNA para iniciar la síntesis de DNA. 3) La DNA polimerasa inicia la síntesis de la tira hija naciente. 4) Las Proteínas de Unión al ADN de hebra simple (SSB) se enlazan a DNA y evitan la conversión prematura de ssDNA a dsDNA.
  • 49. REPLICACIÓN DEL ADN En 1968, Reiji Okazaki demostró que la síntesis de una de las cadenas (conductora) en dirección 5’-3’ hacia la horquilla es continua y la otra cadena (retrasada) es discontinua y se sintetiza en fragmentos cortos (fragmentos de Okazaki) en sentido 5’-3’ alejándose de la horquilla para posteriormente unirse pero e conjunto el proceso avanza hacia la horquilla de replicación.
  • 52. REPLICACIÓN DEL ADN Modelo de acción de la helicasa
  • 53. REPLICACIÓN DEL ADN Desenrollamiento del ADN parental Enrollamiento de las hebras de ADN en la cabeza de la horquilla de replicación Rotura transitoria que sirve como eslabón giratorio para permitirla rotación libre de las hebras de ADN Modelo de acción de la topoisomerasa
  • 55. TRANSCRIPCIÓN Proceso de síntesis de ARN. Mecanismo celular por el cual la información genética contenida en el ADN es transferida a una molécula de ARN
  • 56. TRANSCRIPCIÓN Durante la transcripción la información genética del ADN es copiada al ARN mensajero (ARNm): La transcripción comienza al inicio del gen, en 5' (región del promotor) y continua hasta el fin del gen en 3‘. La secuencia del ARNm es complementaria a la del molde de ADN usada para la transcripción, excepto que las bases de uracilo sustituyen a las timinas.
  • 57. TRANSCRIPCIÓN La nueva molécula de ARN es procesada a través de: “Splicing”: escisión de los intrones. “Capping”: modificación del extremo 5’. Poli-adenilación: adición de adeninas en el extremo 3’.
  • 58. TRANSCRIPCIÓN ARN Polimerasa Utiliza el molde de ADN para polimerizar ribonucleótidos 5´trifosfato (NTPs).  El crecimiento es en dirección 5´-3´  No requiere un cebador  Solo se trascribe un fragmento del ADN utilizando una sola hebra, denominada sin sentido y la otra es la hebra con sentido.
  • 59. TRANSCRIPCIÓN intrón intrón ADN ARN Síntesis de ARN (transcripción) Escisión de intrones (splicing) Síntesis de proteínas (traducción)
  • 61. TRANSCRIPCIÓN Fases: 1)Iniciación: tiene lugar en secuencia promotora o promotores 2)Elongación: por acción de la ARN Polimerasa (ARNP) 3)Terminación: a) Independiente del factor b) Dependiente del factor
  • 62. TRANSCRIPCIÓN 1) Iniciación:  Aumento de la afinidad de la enzima ARNP con el ADN mediante el factor σ en la interacción con el promotor.  Formación de un complejo promotor cerrado (Hemivida de 10 seg. aprox.).  Desenrrollamiento de aprox 12 pb del ADN (-9 a +3, +1 primer nucleótido que se lee).  Presente un sitio, que une ATP y GTP con semisaturación de 100μM, Purina en el extremo 5´
  • 63. TRANSCRIPCIÓN 2) Elongación:  Sitio para los rNTP, semisaturación de 10μM.  Ataque nucleofílico por el hidróxilo 3’.  Las primeras reacciones de formación de enlaces fosfodiester tienen eficiencia baja. Aborto de 2 a 9 residuos.  Disociación de la subunidad σ y se continua por la polimerasa “core”.
  • 65. TRANSCRIPCIÓN Modelos de elongación del ADN transcrito: a) Modelo de burbuja
  • 67. TRANSCRIPCIÓN 3) Terminación: a)Independiente del factor (características):  Dos segmentos simétricos ricos en GC, que en el trasncrito forman un bucle troncal.  Trayecto posterior de 4 a 8 residuos de A. La ARNP reduce la velocidad o realiza una pausa. La estabilidad de los pbde GC hace que el molde sea difícil de desenrollar.
  • 68. TRANSCRIPCIÓN b) Dependiente del factor: Características:  Se lleva a cabo por una proteína con actividad ADN-ARN helicasa. La proteína ρ (rho) se une al transcrito en formación cuando la ARNP realiza una pausa.  La pausa de la ARNP en lugares de terminación dependiente de ρ posiblemente por acción de la proteína NusA.
  • 71. TRADUCCIÓN  Síntesis de proteínas guiada por un molde de ARNm.  No es más que la etapa final de la expresión génica.  Es sólo el primer paso en la constitución de una proteína funcional.  Todos los ARNm se leen en dirección 5´- 3´.  Las cadenas polipeptídicas se sintetizan desde el extremo amino terminal al carboxilo terminal.
  • 72. TRADUCCIÓN  Cada aminoácido viene codificado por tres bases (codón) en el ARNm.  Tiene lugar en los ribosomas.  Implica la interacción de tres tipos de moléculas de ARN (ARNm, ARNt y ARNr).  El ARNt sirve de adaptador entre el ARNm y los aminoácidos de la proteína.
  • 74. TRADUCCIÓN UTR: regiones que no codifican
  • 75. TRADUCCIÓN Etapas: 1)Iniciación: unión del ARNt iniciador y del ARNm a la subunidad pequeña del ribosoma. 2)Elongación: unión de varios aminoácidos a la cadena polipeptídica creciente. 3)Terminación: se encuentra el codón de terminación y se disocia el ribosoma liberando la cadena polipeptídica sintetizada.
  • 77. TRADUCCIÓN Factores de traducción. Proteínas que intervienen en cada una de las etapas de la traducción. IF: factor de iniciación. EF: factor de elongación. RF: factor de liberación.
  • 78. TRADUCCIÓN Inicio de la traducción en células 1) procariotas. 1)Unión de tres factores de iniciación (IF-1, 2 y 3) a la subunidad pequeña 2) ribosómica. 2)Unión a la subunidad ribosómica pequeña del ARNm y del ARNt iniciador (fMet), que se reconoce en IF-2 unido a GTP. Liberación de IF-3 y 3) unión de la subunidad ribosómica grande. 3)Unión de la subunidad ribosómica grande al complejo por hidrólisis del GTP, con liberación de IF-1 e IF-2 unido a GDP.
  • 79. TRADUCCIÓN Inicio de la traducción en células eucariotas. 1)Unión de tres factores de iniciación (eIF-3, 1 y 1A) a la subunidad pequeña ribosómica. 2)Llegada al ribosoma del ARNt iniciador (fMet) por el eIF-2 (formando complejo con GTP) y del ARNm por varios IF. 3)Reconocimiento del codón de iniciación (AUG) con hidrólisis de ATP. 4)Liberación de eIF-2 y otros IF por hidrólisis de GTP. 5)Unión de la subunidad ribosómica grande al complejo.
  • 80. TRADUCCIÓN 1) Etapas de la elongación de la traducción. 1)Unión del ARNt iniciador (fMet) al sitio P (peptidil) del 2) ribosoma. 2)Llegada de un segundo aminoacil al sitio A (aminoacil) del ribosoma dirigido por EF- Tu (unido a GTP) que se libera luego de la hidrólisis del GTP.
  • 81. TRADUCCIÓN 3) Etapas de la elongación de la traducción. 3)Formación del enlace peptídico y transferencia del fMet al aminoacil ARNt ubicado en el sitio A. 4) 4) Translocación del peptidil ala-met al sitio P y la del ARNt libre al sitio E (liberación), dejando el sitio A vacío, ocasionada por el desplazamiento del ribosoma tres nucleótidos a través del ARNm mediado por EF-G por hidrólisis de GTP.
  • 82. TRADUCCIÓN 1) 2) Terminación de la traducción. 1) Reconocimiento de un codón de terminación (ej: UAA) por un factor de liberación y no por un ARNt. 2) Liberación de la cadena polipeptídica completa y disociación del ARNt y ARNm del ribosoma
  • 83. CÓDIGO GENÉTICO Con 3 bases hay 64 combinaciones posibles Parada y arranque Redundancia ¿Cuál es la secuencia de aminoácidos que se traduce de esta secuencia de ARN? CCA CAA GAC UAG a) Pro GIn Asp Stop b) Pro His Asp Trp c) His GIn Asp Stop d) Pro GIn His Stop