1. Universidad de Oriente
Núcleo Bolívar
Escuela de Ciencias de la Salud
Departamento de Ciencias Fisiológicas
Asignatura: Bioquímica
UNIDAD XIV.
BIOLOGÍA MOLECULAR
Prof. Zulay Castillo Pérez
3. ÁCIDOS NUCLEICOS
El DNA, es la base química de la herencia y
está organizada en genes, unidades
fundamentales de la información genética.
Los genes controlan la síntesis de varios
tipos de RNA, que en su mayor parte están
involucrados en la síntesis de proteínas.
4. ÁCIDOS NUCLEICOS
Los genes no funcionan de manera
autónoma; su replicación y funcionamiento
se controlan por varios productos de gen, a
menudo en colaboración componentes de
varias vías de transducción de señales.
5. ÁCIDOS NUCLEICOS
El conocimiento de la estructura y función
de los ácidos nucleicos es esencial para
comprender la genética y muchos aspectos
de la fisiopatología de la enfermedad, así
como los fundamentos genéticos de la
enfermedad.
6. ÁCIDOS NUCLEICOS
Avery, MacLeod y McCarty
(1944): El DNA contiene la
información genética.
Determinación genética del
carácter (tipo) de la cápsula de
un neumococo específico
podía ser transmitida a otro
neumococo de un tipo
capsular diferente
introduciendo DNA purificado
del primer tipo en el segundo.
10. ÁCIDOS NUCLEICOS
La información Genética reside en el orden de las
unidades monoméricas en los polímeros, por lo que
debe existir un mecanismo para reproducir o replicar
esta información específica con un elevado grado de
fidelidad.
Ese requerimiento, junto con los datos de Chargaff,
condujo a Watson, Crick (1953) a proponer el modelo
de una molécula de doble tira del DNA.
14. ÁCIDOS NUCLEICOS
El “inicio” se define como 5‘ y el
“fin” como 3'
Los términos 5’ y 3’ indican la
posición de los nucleótidos en el
esqueleto de ADN en relación con
la molécula de azúcar
Las dos cadenas de la doble hélice
están orientadas en direcciones
opuestas
15. ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN)
Constituido por 4 desoxinucleótidos:
desoxiadenosina, desoxiguanosina,
desoxicitidinay desoxitimidina
Azúcar + fosfato + base nitrogenada
Parejas: A con T/G con C
Gobierno de la síntesis de proteínas
Información – código genético
secuencia de nucleótidos
No todo el ADN está formado por genes
16. TIPOS DE ADN
Dependen del enrollamiento de la cadena y su
orientación:
ADN B: hélice orientada a la
derecha con una distancia de 3,4 Aº
entre pares de bases y 10,4 pares de
base por vuelta.
Forma predominante in vivo.
17. TIPOS DE ADN
ADN A: predomina en los
híbridos ADN-ARN es similar a
la B pero mas compacta 2,3 Aº
entre pares de bases y 11 pares de
bases por vuelta.
18. TIPOS DE ADN
ADN Z: las bases de las dos
cadenas se posicionan mas hacia la
periferia de una hélice orientada a
la izquierda. Hay una distancia de
38 Aº entre pares de bases y 12
bases por vuelta
20. ÁCIDO RIBONUCLEICO (ARN)
Una sola hebra.
Nucleótidos:
Uridina, Adenosina, Guanosina, Citdina
Azúcar + fosfato + base nitrogenada
5 a 10 veces más abundante que el ADN
Tipos
ARNr
ARNm
ARNt
21. ARN
Formado por nucleótidos unidos por enlaces
fosfodiéster. Presenta una composición similar a la del
DNA.
Generalmente son de cadena sencilla.
La estructura secundaria de las regiones de doble
cadena, se asemeja a la forma A del DNA, más que a la
forma B, la cual no puede ser adoptada debido a
impedimentos estéricos a causa del grupo OH del C2´ de
la ribosa.
22. ARN
Macromolécula sintetizada por las RNA polimerasas por
transcripción de una secuencia de nucleótidos de DNA que sirve
como molde.
A diferencia del DNA el RNA engloba a una familia muy
heterogénea.
La estructura primaria viene determinada por la secuencia de
nucleótidos y pueden presentar formas muy variadas de
estructuras secundarias, formadas por uniones intracatenarias.
También han sido observadas estructuras terciarias para ciertos
tRNAy rRNA.
23. TIPOS DE RNA EN EUCARIOTAS
RNA heterogéneo nuclear (hnRNA).
RNA mensajero (mRNA).
RNA ribosómico (rRNA).
RNA de transferencia (tRNA).
RNA citoplasmático pequeño (scRNA)
24. ARN HETEROGÉNEO NUCLEAR
(hnRNA)
Representa las moléculas precursoras del
RNAm que son transcritas directamente del
DNA y que codifican para una proteína
determinada.
Incluyen secuencias codificantes (exones) y no
codificantes (intrones). Este RNA será
procesado.
25. RNA MENSAJERO (mRNA)
Representan las moléculas procesadas del hnRNA que
codifican para una proteína determinada. Su secuencia de
nucleótidos es traducida en una secuencia de aminoácidos en
el proceso de traducción para sintetizar una proteína .
Se incluyen formas muy heterogéneas tanto en tamaño como
en secuencia, existiendo, en general, una molécula de mRNA
para cada gen o grupo de genes que vayan a expresarse
26. ARN DE TRANSFERENCIA (tRNA)
Es el más pequeño con unos 75 nucleótidos de medida. Su
función es transportar los aminoácidos en forma activada hasta
el ribosoma, durante el proceso de traducción del mRNA.
Existe al menos un tipo de tRNA para cada uno de los 20
aminoácidos.
Todos presentan en su extremo 3´ la secuencia de nucleótidos
CCA, independientemente del aminoácido que transporten. El
extremo 3´ constituye el extremo aceptor del aminoácido.
28. ARN CITOPLASMÁTICO PEQUEÑO (scRNA)
Participa en el proceso de soldadura de los exones durante
la formación del mRNA.
Son pequeñas secuencias de unos 150 nucleótidos de
media: U1, U2, U3, U4, U5, U6,
Es un ARN de unos 300 nucleótidos es el RNA que forma
parte del SRP (Signal Recognition Particle) que ejerce una
función específica en el envío de proteínas recién sintetizadas
hacia compartimentos intra-o extracelulares.
29. DIFERENCIAS ENTRE ADN Y ARN
1) El azúcar en el RNA al cual se adhieren los fosfatos y las
bases purínicas y pirimidínicas es la ribosa en lugar de la
2'-desoxirribosa del DNA.
2) Los componentes pirimidinicos del RNA difieren de los
del DNA. Aunque el RNA contiene los ribonucleótidos de
adenina, guanina y citosina, no posee timina. En lugar de
la timina, el RNA contiene el ribonucleótido de uracilo.
30. DIFERENCIAS ENTRE ADN Y ARN
3) El RNA existe como tira sencilla y no como molécula
helicoidal de doble tira, como el DNA. Sin embargo
dada la secuencia de bases complementarias
apropiadas con polaridad opuesta, la tira sencilla de
RNA, es capaz de doblarse sobre si misma, como una
horquilla y adquiere así características de tira doble.
31. EMPAQUETAMIENTO DEL ADN
Histonas:
proteínas asociadas con la cromatina del DNA.
Nucleosomas:
unidad estructural construida con ocho
moléculas de histona y DNA superenrollado
con giro a la izquierda.
36. REPLICACIÓN SEMICONSERVATIVA
DEL ADN
• Proceso por el cual se sintetiza el ADN.
• Es semiconservativa porque las cadenas de ADN
parental sirven como moldes para las dos cadenas
complementarias
• Cada molécula generada por el proceso de replicación
contiene una cadena parenteral intacta y una nueva de
síntesis.
38. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS
Las características principales en este proceso de
replicación fueron estudiadas en E. coli.
Es bidireccional, se inicia con la unión de
aproximada de 30 moléculas de proteína ADN A, a
un único punto de origen llamado Ori C.
39. SÍNTESIS DEL ADN EN
PROCARIOTAS
Con ayuda de otras proteínas; las hebras
parentales se separan en esa región y copian se
generan dos horquillas de replicación que se
mueven en ambos sentidos alejándose del origen.
40. SÍNTESIS DEL ADN EN
PROCARIOTAS
Desenrrollamiento de las cadenas parentales:
Es necesario que la hélice se desenrrolle por delante de la
horquilla de replicación para esto actúan las siguientes enzimas:
1) Helicasas:
separan las cadenas de ADN y desenrrollan la doble hélice
parental, las proteínas de unión de cadena sencilla impiden que
las cadenas se reasocien y las protegen del ataque de enzimas
que escinden los enlaces fosfodiéster en el ADN de cadena
única.
41. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS
2) Topoisomerasas:
alivian el superenrrollamiento en la cadena doble parental
producido por el desenrrollamiento la más importante es la
ADN girasa
3) Polimerasas del ADN:
catalizan la síntesis del ADN, E. coli posee 3 ADN polimerasas,
la principal es Pol III todas copian una cadena molde en sentido
3’-5’ para producir una en sentido 5’-3’ sus sustrato son los
desoxirribonucleótidos fosfato (dATP, dTTP, dGTP, dCTP) para
adición de nucleótidos a la cadena en crecimiento.
42. SÍNTESIS DEL ADN EN
PROCARIOTAS
Eliminación de errores en el apareamiento
de bases:
el primer punto de control es ejercido por la Pol III
en su función exonucleasa y tras la replicación otros
mecanismos reparan apareamientos erróneos que
escapan a la primera corrección de errores.
43. SÍNTESIS DEL ADN EN PROCARIOTAS
Cebadores:
Para que la ADN polimerasa pueda dar inicio a la síntesis es
necesario un extremo 3’-OH libre que es aportado por el
cebador (oligonucleótido de ARN) y se sintetiza en dirección
5’ 3’ por una primasa (ARN polimerasa) que añade
inicialmente un desoxirribonucleótido al grupo 3’-OH y luego
continúa añadiendo al extremo 3’ de la cadena en crecimiento.
46. REPLICACIÓN DEL ADN EN EUCARIOTAS
El proceso es similar que en procariotas las
diferencias principales radican en el tamaño
del ADN eucariota y la asociación del ADN
eucariota con las histonas en los nucleosomas.
Hay muchos puntos de origen para la
replicación de este ADN.
47. REPLICACIÓN DEL ADN EN EUCARIOTAS
Polimerasas en eucariotas: existen al
menos 9 clases de ADN polimerasas (α, β, γ, δ,
ζ, ε, κ, η, ι) la δ es la principal enzima
replicativa las polimerasas α, β y ε participan
en la reparación del ADN, la polimerasa γ en
la replicación del ADN mitocondrial.
48. REPLICACIÓN DEL ADN
Una horquilla de replicación consiste en cuatro componentes
que se forman en la secuencia siguiente:
1)La DNA helicasa escinde un segmento corto de la dupleta de
DNA progenitor.
2) La primasa inicia la síntesis de una molécula de RNA para
iniciar la síntesis de DNA.
3) La DNA polimerasa inicia la síntesis de la tira hija naciente.
4) Las Proteínas de Unión al ADN de hebra simple (SSB) se
enlazan a DNA y evitan la conversión prematura de ssDNA a
dsDNA.
49. REPLICACIÓN DEL ADN
En 1968, Reiji Okazaki demostró que la síntesis de
una de las cadenas (conductora) en dirección 5’-3’
hacia la horquilla es continua y la otra cadena
(retrasada) es discontinua y se sintetiza en
fragmentos cortos (fragmentos de Okazaki) en
sentido 5’-3’ alejándose de la horquilla para
posteriormente unirse pero e conjunto el proceso
avanza hacia la horquilla de replicación.
53. REPLICACIÓN DEL ADN
Desenrollamiento del
ADN parental
Enrollamiento de las
hebras de ADN en la
cabeza de la horquilla de
replicación
Rotura transitoria que
sirve como eslabón
giratorio para permitirla
rotación libre de las
hebras de ADN
Modelo de acción de la topoisomerasa
55. TRANSCRIPCIÓN
Proceso de síntesis de ARN. Mecanismo celular por
el cual la información genética contenida en el ADN
es transferida a una molécula de ARN
56. TRANSCRIPCIÓN
Durante la transcripción la información genética del
ADN es copiada al ARN mensajero (ARNm):
La transcripción comienza al inicio del gen, en 5'
(región del promotor) y continua hasta el fin del gen
en 3‘.
La secuencia del ARNm es complementaria a la del
molde de ADN usada para la transcripción, excepto
que las bases de uracilo sustituyen a las timinas.
57. TRANSCRIPCIÓN
La nueva molécula de ARN es procesada a través
de:
“Splicing”: escisión de los intrones.
“Capping”: modificación del extremo 5’.
Poli-adenilación: adición de adeninas en el
extremo 3’.
58. TRANSCRIPCIÓN
ARN Polimerasa
Utiliza el molde de ADN para polimerizar
ribonucleótidos 5´trifosfato (NTPs).
El crecimiento es en dirección 5´-3´
No requiere un cebador
Solo se trascribe un fragmento del ADN utilizando
una sola hebra, denominada sin sentido y la otra es
la hebra con sentido.
59. TRANSCRIPCIÓN
intrón intrón
ADN
ARN Síntesis de ARN (transcripción)
Escisión de intrones (splicing)
Síntesis de proteínas
(traducción)
61. TRANSCRIPCIÓN
Fases:
1)Iniciación: tiene lugar en secuencia promotora
o promotores
2)Elongación: por acción de la ARN Polimerasa
(ARNP)
3)Terminación:
a) Independiente del factor
b) Dependiente del factor
62. TRANSCRIPCIÓN
1) Iniciación:
Aumento de la afinidad de la enzima ARNP con el
ADN mediante el factor σ en la interacción con el
promotor.
Formación de un complejo promotor cerrado
(Hemivida de 10 seg. aprox.).
Desenrrollamiento de aprox 12 pb del ADN (-9 a
+3, +1 primer nucleótido que se lee).
Presente un sitio, que une ATP y GTP con
semisaturación de 100μM, Purina en el extremo 5´
63. TRANSCRIPCIÓN
2) Elongación:
Sitio para los rNTP, semisaturación de 10μM.
Ataque nucleofílico por el hidróxilo 3’.
Las primeras reacciones de formación de enlaces
fosfodiester tienen eficiencia baja. Aborto de 2 a 9
residuos.
Disociación de la subunidad σ y se continua por
la polimerasa “core”.
67. TRANSCRIPCIÓN
3) Terminación:
a)Independiente del factor (características):
Dos segmentos simétricos ricos en GC, que en el
trasncrito forman un bucle troncal.
Trayecto posterior de 4 a 8 residuos de A.
La ARNP reduce la velocidad o realiza una pausa. La
estabilidad de los pbde GC hace que el molde sea
difícil de desenrollar.
68. TRANSCRIPCIÓN
b) Dependiente del factor:
Características:
Se lleva a cabo por una proteína con actividad
ADN-ARN helicasa. La proteína ρ (rho) se une al
transcrito en formación cuando la ARNP realiza una
pausa.
La pausa de la ARNP en lugares de terminación
dependiente de ρ posiblemente por acción de la
proteína NusA.
71. TRADUCCIÓN
Síntesis de proteínas guiada por un molde de
ARNm.
No es más que la etapa final de la expresión génica.
Es sólo el primer paso en la constitución de una
proteína funcional.
Todos los ARNm se leen en dirección 5´- 3´.
Las cadenas polipeptídicas se sintetizan desde el
extremo amino terminal al carboxilo terminal.
72. TRADUCCIÓN
Cada aminoácido viene codificado por tres bases
(codón) en el ARNm.
Tiene lugar en los ribosomas.
Implica la interacción de tres tipos de moléculas de
ARN (ARNm, ARNt y ARNr).
El ARNt sirve de adaptador entre el ARNm y los
aminoácidos de la proteína.
75. TRADUCCIÓN
Etapas:
1)Iniciación: unión del ARNt iniciador y del
ARNm a la subunidad pequeña del ribosoma.
2)Elongación: unión de varios aminoácidos a la
cadena polipeptídica creciente.
3)Terminación: se encuentra el codón de
terminación y se disocia el ribosoma liberando la
cadena polipeptídica sintetizada.
77. TRADUCCIÓN
Factores de traducción. Proteínas que intervienen
en cada una de las etapas de la traducción.
IF: factor de iniciación.
EF: factor de elongación.
RF: factor de liberación.
78. TRADUCCIÓN
Inicio de la traducción en células 1)
procariotas.
1)Unión de tres factores de iniciación
(IF-1, 2 y 3) a la subunidad pequeña 2)
ribosómica.
2)Unión a la subunidad ribosómica
pequeña del ARNm y del ARNt
iniciador (fMet), que se reconoce en
IF-2 unido a GTP. Liberación de IF-3 y
3)
unión de la subunidad ribosómica
grande.
3)Unión de la subunidad ribosómica
grande al complejo por hidrólisis del
GTP, con liberación de IF-1 e IF-2
unido a GDP.
79. TRADUCCIÓN
Inicio de la traducción en células
eucariotas.
1)Unión de tres factores de iniciación
(eIF-3, 1 y 1A) a la subunidad pequeña
ribosómica.
2)Llegada al ribosoma del ARNt
iniciador (fMet) por el eIF-2
(formando complejo con GTP) y del
ARNm por varios IF.
3)Reconocimiento del codón de
iniciación (AUG) con hidrólisis de ATP.
4)Liberación de eIF-2 y otros IF por
hidrólisis de GTP.
5)Unión de la subunidad ribosómica
grande al complejo.
80. TRADUCCIÓN
1)
Etapas de la elongación de
la traducción.
1)Unión del ARNt iniciador
(fMet) al sitio P (peptidil) del
2)
ribosoma.
2)Llegada de un segundo
aminoacil al sitio A (aminoacil)
del ribosoma dirigido por EF-
Tu (unido a GTP) que se libera
luego de la hidrólisis del GTP.
81. TRADUCCIÓN
3) Etapas de la elongación de la
traducción.
3)Formación del enlace peptídico y
transferencia del fMet al aminoacil
ARNt ubicado en el sitio A.
4)
4) Translocación del peptidil ala-met
al sitio P y la del ARNt libre al sitio E
(liberación), dejando el sitio A vacío,
ocasionada por el desplazamiento del
ribosoma tres nucleótidos a través del
ARNm mediado por EF-G por
hidrólisis de GTP.
82. TRADUCCIÓN
1) 2) Terminación de la
traducción.
1) Reconocimiento de
un codón de
terminación (ej: UAA)
por un factor de
liberación y no por un
ARNt.
2) Liberación de la
cadena polipeptídica
completa y disociación
del ARNt y ARNm del
ribosoma
83. CÓDIGO GENÉTICO
Con 3 bases hay 64
combinaciones posibles
Parada y arranque
Redundancia
¿Cuál es la secuencia de
aminoácidos que se
traduce de esta
secuencia de ARN?
CCA CAA GAC UAG
a) Pro GIn Asp Stop
b) Pro His Asp Trp
c) His GIn Asp Stop
d) Pro GIn His Stop