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RÉPUBLIQUE ALGÉRIENNE DÉMOCRATIQUE ET POPULAIRE
MINISTÈRE DE L’ENSEIGNEMENT SUPÉRIEUR ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE
UNIVERSITÉ MOHAMED KHIDER BISKRA
FACULTÉ DES SCIENCES EXACTES ET DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE
DÉPARTEMENT DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE
MÉMOIRE DE FIN D'ETUDES
EN VUE DE L’OBTENTION DU DIPLÔME: MASTER
FILIÈRE : BIOCHIMIE
SPÉCIALITÉ : BIOCHIMIE ET BIOLOGIE MOLÉCULAIRE
Contribution à une étude comparative des paramètres microbiologiques et
physicochimiques entre deux types de sol traités par les vers de terre
issus de la région de Bordj Ben Azouz
Présenté par :
BISSA Samira
Devant le jury:
Président: TRABSA Hayet
Promoteur: GHITI Hassina
Examinateur : YASRI Nabila
Promotion : Juin 2013
SOMMAIRE
PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE
CHAPITRE I : Généralités sur les vers de terre
CHAPITRE II : Ecologie
PARTIE EXPIREMENTALE
CHAPITRE I : Matériels et méthodes
CHAPITRE II : Résultats et discussion
INTRODCUTION
CONCLUSION
INTRODCUTION
les vers de terre sont reconnue par Charles Darwin dès 1881, il donna à
cette famille ses lettres de noblesse en lui consacrant un ouvrage : « Formation
de la terre végétale due à l’action des vers de terre ». Ses membres se
distinguent par leur « métier » : il y a les laboureurs et les digesteurs et leur
mode de vie., l’utilisation des vers de terre étaient bien connue aux temps de la
grec antique Aristote les appelait« les intestins de la terre », probablement en
raison du fait qu’ils vivent et se déplacent dans la terre, tout en la « digérant ».
Les lombriciens constutuent de 50 à 75 % de la biomasse animale des sols
,donc la biomasse faunistique des sols est constituée principalement par les vers
de terre.
Objectif
L’objectif de notre travail consiste à étudier l’action des
vers de terre sur les caractéristiques biologiques , physicochimiques
du sol additionné ou non de fumier de cheval comme source de
matière organique., avec un suivi d’évolution de la biomasse
bactérienne du cast ( fèces) des vers de terre en fonction du
temps et type de traitements( sol , sol traité avec le fumier de
cheval) .C’est la première étude en l’Algérie .
CHAPITRE I : Généralités sur les vers de terre
Biologie
• Les ancêtres des
vers de terre
actuels vivaient
dans l’eau.
• Leur histoire
remonte au
Précambrien, il y
a environ, 700
millions d’années.
Classification
• Résumé sur le
tableau suivant:
Morphologie
• Anatomie allongée
• Circulaire
• Annelées de 60 à 200
segements .
Physiologie
• N’ont pas des organes
respiratoire.
• Leur régime alimentaire
contient des matériels
végétales
morts, microorganismes
• hermaphrodites simultanés.
• Cycle de vie : Cocon
>Juvénile > Adulte
• Locomotion par l’allongement
des segments .
• Rencontre beaucoup de
prédateurs : les oiseaux
, les taupes…etc
Embranchement Annélida
Classe Clitellata
Ordre Oligochaeta
Famille Lombricidae
Genres Lumbricus, Eisenia, Dendrobaena, Eudrilus
Espèces Lumbricus terrestris
Eisenia faetida
Dendrobaena veneta
Eudrilus eugeniae
Ecologie
• Bouché en 1972
classer les vers de
terre en trois
catégories
écologiques selon
leurs : Localisation
,régime alimentaire
,anatomie
, pigmentation .
Interactions Vers
de terre - Sol
• La drilosphère:
c’est la zone
d’influence des
lombriciens sur le
fonctionnement des
sols .
Bioturbation des
déjections
• Galeries
• Turricules (cast)
• Middens
Action sur la
flore microbienne
• Schéma suivante
CHAPITRE II : Ecologie
Turricules
Galeries
Tube digestif:
- Augmentation de la flore ingéré et la séléction de certaine flore
bactériennes.
Cast:
-Suppression des champignons
pathogène
-Prolifération bactériennes .
Sol :
7000 procaryotes ont été
décrits à l’heure
actuelle, l’énorme diversité
taxonomique et génétique des
microorganismes telluriques se
traduit par une implication forte
dans de nombreuses fonctions
environnementales du sol.
Matériels et méthodes
Situation géographique de la commune de Bordj Ben Azouz
(El Bordj) (source :Google Maps 2013).
Présentation de la zone de l’échantillonnage
Plant de taravail
1/ Echnillonage de sol , de fumier et des vers de
terre
2/Traitements des echantiollons pendant 46 jours
3/ Prélevement des casts produis par les vers de terre
en 3 phase (après 20 , 30, 46 jours )
4/ Analyses biologique, physicochimique et
microbiologique des différents échantillons .
Analyses biologiques
Mesure de la biomasse des vers de terre (g) Mesure de poids des casts des vers de terre (mg/ ml)
Analyses physico-chimiques de sol et fumier
avant et après le traitement par les vers de terre
Mesure de Ph et Conductivité (CE) ( 10g / 100 ml )
Mesure d’Humidité (H%)
Mesure de matière organique (MO %)
Analyses microbiologiques de sols et de fumier et casts
1g de Fumier non
traité
1g de Sol non
traité
Poids des casts
collectés
0,5 de Sol traité et
de mélange
(Fumier - Sol)
traités
1/Préparation
d’une
suspension
mère de
chaque
échantillon
sur 100 ml
d’eau distillé
stérile avec
agitation 30
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2/ Préparation
des séries des
dilutions de
chaque
échantillons .
3/Ensemencement
en masse des
dilutions sur
BCPL
Dénombrement
• Réalisé à l'aide d’un package ( SPSS ) version 19 , dont on
applique une analyses ANOVA à deux facteurs (2 way ANOVA )
sur les déférentes paramètres mesurés comme variables
dépendantes et le temps de traitement et le type de
traitement ( Sol ou sol avec fumier ) comme facteurs
indépendants , avec un niveau de signification (Sigma <0,05).
Traitements statistiques des données
CHAPITRE II : Résultats et discussion
changements des structures
Avant
traitement
Après
traitement
Evolution de la biomasses des vers de terre ( g ) :
Source Ddl D Sig.
TEMPS 1 2,286 ,169
TAITEMENT 1 ,000 1,000
TEMPS *
TAITEMENT
1 5,143 ,053
Evolution des poids des casts des vers de terre (mg/ ml) :
Source Ddl D Sig
TEMPS 2 8,157 ,006
TARITEMENT 1 ,135 ,720
TEMPS *
TARITEMENT
2 ,115 ,893
Résultats des analyses physicochimiques de sol et fumier avant et
après traitement par les vers de terre
Source ddl D Sig.
TEMPS 1 37,654 ,000
Traitements 1 4,339 ,071
TEMPS * Traitements 1 2,981 ,123
Source ddl D Sig.
TEMPS 1 60,458 ,000
Traitements 1 ,745 ,413
TEMPS * Traitements 1 1,147 ,315
Source ddl D Sig.
TEMPS 1 17,128 ,003
Traitements 1 5,860 ,042
TEMPS * Traitements 1 1,372 ,275
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TEMPS 1 ,005 ,945
Traitements 1 ,576 ,470
TEMPS * Traitements 1 10,941 ,011
Résultats des analyses microbiologiques
Résultats de dénombrement de la flore bactérienne du sol et de fumier (UFC/g):
Source ddl D Sig.
JOURS 1 50201,829 ,000
TRAITEMENT 1 ,258 ,625
JOURS * TRAITEMENT 1 ,258 ,625
Résultats de dénombrement de la flore bactérienne du cast depuis le sol et le fumier (UFC/g) :
Source ddl D Sig.
JOURS 2 1,616 ,239
TARTEMENT 1 ,779 ,395
JOURS *
TARTEMENT
2 ,892 ,435
CONCLUSION
On conclue que les vers de terre ont un grande effect ecololoqique sur nos sol ,ils peuvent faire des
modifications significative sur les paramétres étudier :
 Le sol devient très granuleux et riche en matière organique , donc on confirme sont effet sur la
fertilaisation et l’aération du sol qui influence positvement sur les plantes .
 Une diminution de l’ humdité .
 Stabilisation de PH qui est un effet favorable sur la survie des macrafaune et mésofaune du sol.
 Augmentation dans la conductivité donc le sol devient très riche en minéraux.
 Aucune modification significative sur la biomasse bactérienne de sol ou de fumier – sol après la
déjestion .
 le type de nourriture , sol seulmement ou sol additioné de fumier cheval n’influenncé pas sur la
biomaasse bactérienne du cast
En fin on conclue que l’effet des vers de terre sur nos sol peut étre voire pandant une période plus long
par rapport à notre période .
ci pour votre attention

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Contribution à une étude comparative des paramètres microbiologiques et physicochimique entre deux types de sol traités par les vers de terre issus bissa samira 2013 master bbm

  • 1.
  • 2.
  • 3. RÉPUBLIQUE ALGÉRIENNE DÉMOCRATIQUE ET POPULAIRE MINISTÈRE DE L’ENSEIGNEMENT SUPÉRIEUR ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE UNIVERSITÉ MOHAMED KHIDER BISKRA FACULTÉ DES SCIENCES EXACTES ET DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE DÉPARTEMENT DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE MÉMOIRE DE FIN D'ETUDES EN VUE DE L’OBTENTION DU DIPLÔME: MASTER FILIÈRE : BIOCHIMIE SPÉCIALITÉ : BIOCHIMIE ET BIOLOGIE MOLÉCULAIRE Contribution à une étude comparative des paramètres microbiologiques et physicochimiques entre deux types de sol traités par les vers de terre issus de la région de Bordj Ben Azouz Présenté par : BISSA Samira Devant le jury: Président: TRABSA Hayet Promoteur: GHITI Hassina Examinateur : YASRI Nabila Promotion : Juin 2013
  • 4. SOMMAIRE PARTIE BIBLIOGRAPHIQUE CHAPITRE I : Généralités sur les vers de terre CHAPITRE II : Ecologie PARTIE EXPIREMENTALE CHAPITRE I : Matériels et méthodes CHAPITRE II : Résultats et discussion INTRODCUTION CONCLUSION
  • 5. INTRODCUTION les vers de terre sont reconnue par Charles Darwin dès 1881, il donna à cette famille ses lettres de noblesse en lui consacrant un ouvrage : « Formation de la terre végétale due à l’action des vers de terre ». Ses membres se distinguent par leur « métier » : il y a les laboureurs et les digesteurs et leur mode de vie., l’utilisation des vers de terre étaient bien connue aux temps de la grec antique Aristote les appelait« les intestins de la terre », probablement en raison du fait qu’ils vivent et se déplacent dans la terre, tout en la « digérant ». Les lombriciens constutuent de 50 à 75 % de la biomasse animale des sols ,donc la biomasse faunistique des sols est constituée principalement par les vers de terre.
  • 6. Objectif L’objectif de notre travail consiste à étudier l’action des vers de terre sur les caractéristiques biologiques , physicochimiques du sol additionné ou non de fumier de cheval comme source de matière organique., avec un suivi d’évolution de la biomasse bactérienne du cast ( fèces) des vers de terre en fonction du temps et type de traitements( sol , sol traité avec le fumier de cheval) .C’est la première étude en l’Algérie .
  • 7. CHAPITRE I : Généralités sur les vers de terre Biologie • Les ancêtres des vers de terre actuels vivaient dans l’eau. • Leur histoire remonte au Précambrien, il y a environ, 700 millions d’années. Classification • Résumé sur le tableau suivant: Morphologie • Anatomie allongée • Circulaire • Annelées de 60 à 200 segements . Physiologie • N’ont pas des organes respiratoire. • Leur régime alimentaire contient des matériels végétales morts, microorganismes • hermaphrodites simultanés. • Cycle de vie : Cocon >Juvénile > Adulte • Locomotion par l’allongement des segments . • Rencontre beaucoup de prédateurs : les oiseaux , les taupes…etc Embranchement Annélida Classe Clitellata Ordre Oligochaeta Famille Lombricidae Genres Lumbricus, Eisenia, Dendrobaena, Eudrilus Espèces Lumbricus terrestris Eisenia faetida Dendrobaena veneta Eudrilus eugeniae
  • 8. Ecologie • Bouché en 1972 classer les vers de terre en trois catégories écologiques selon leurs : Localisation ,régime alimentaire ,anatomie , pigmentation . Interactions Vers de terre - Sol • La drilosphère: c’est la zone d’influence des lombriciens sur le fonctionnement des sols . Bioturbation des déjections • Galeries • Turricules (cast) • Middens Action sur la flore microbienne • Schéma suivante CHAPITRE II : Ecologie Turricules Galeries Tube digestif: - Augmentation de la flore ingéré et la séléction de certaine flore bactériennes. Cast: -Suppression des champignons pathogène -Prolifération bactériennes . Sol : 7000 procaryotes ont été décrits à l’heure actuelle, l’énorme diversité taxonomique et génétique des microorganismes telluriques se traduit par une implication forte dans de nombreuses fonctions environnementales du sol.
  • 10. Situation géographique de la commune de Bordj Ben Azouz (El Bordj) (source :Google Maps 2013). Présentation de la zone de l’échantillonnage
  • 11. Plant de taravail 1/ Echnillonage de sol , de fumier et des vers de terre 2/Traitements des echantiollons pendant 46 jours 3/ Prélevement des casts produis par les vers de terre en 3 phase (après 20 , 30, 46 jours ) 4/ Analyses biologique, physicochimique et microbiologique des différents échantillons .
  • 12. Analyses biologiques Mesure de la biomasse des vers de terre (g) Mesure de poids des casts des vers de terre (mg/ ml)
  • 13. Analyses physico-chimiques de sol et fumier avant et après le traitement par les vers de terre Mesure de Ph et Conductivité (CE) ( 10g / 100 ml )
  • 15. Mesure de matière organique (MO %)
  • 16. Analyses microbiologiques de sols et de fumier et casts 1g de Fumier non traité 1g de Sol non traité Poids des casts collectés 0,5 de Sol traité et de mélange (Fumier - Sol) traités 1/Préparation d’une suspension mère de chaque échantillon sur 100 ml d’eau distillé stérile avec agitation 30 min 2/ Préparation des séries des dilutions de chaque échantillons . 3/Ensemencement en masse des dilutions sur BCPL Dénombrement
  • 17. • Réalisé à l'aide d’un package ( SPSS ) version 19 , dont on applique une analyses ANOVA à deux facteurs (2 way ANOVA ) sur les déférentes paramètres mesurés comme variables dépendantes et le temps de traitement et le type de traitement ( Sol ou sol avec fumier ) comme facteurs indépendants , avec un niveau de signification (Sigma <0,05). Traitements statistiques des données
  • 18. CHAPITRE II : Résultats et discussion changements des structures Avant traitement Après traitement
  • 19. Evolution de la biomasses des vers de terre ( g ) : Source Ddl D Sig. TEMPS 1 2,286 ,169 TAITEMENT 1 ,000 1,000 TEMPS * TAITEMENT 1 5,143 ,053
  • 20. Evolution des poids des casts des vers de terre (mg/ ml) : Source Ddl D Sig TEMPS 2 8,157 ,006 TARITEMENT 1 ,135 ,720 TEMPS * TARITEMENT 2 ,115 ,893
  • 21. Résultats des analyses physicochimiques de sol et fumier avant et après traitement par les vers de terre Source ddl D Sig. TEMPS 1 37,654 ,000 Traitements 1 4,339 ,071 TEMPS * Traitements 1 2,981 ,123
  • 22. Source ddl D Sig. TEMPS 1 60,458 ,000 Traitements 1 ,745 ,413 TEMPS * Traitements 1 1,147 ,315
  • 23. Source ddl D Sig. TEMPS 1 17,128 ,003 Traitements 1 5,860 ,042 TEMPS * Traitements 1 1,372 ,275
  • 24. Source ddl D Sig. TEMPS 1 ,005 ,945 Traitements 1 ,576 ,470 TEMPS * Traitements 1 10,941 ,011
  • 25. Résultats des analyses microbiologiques Résultats de dénombrement de la flore bactérienne du sol et de fumier (UFC/g): Source ddl D Sig. JOURS 1 50201,829 ,000 TRAITEMENT 1 ,258 ,625 JOURS * TRAITEMENT 1 ,258 ,625
  • 26. Résultats de dénombrement de la flore bactérienne du cast depuis le sol et le fumier (UFC/g) : Source ddl D Sig. JOURS 2 1,616 ,239 TARTEMENT 1 ,779 ,395 JOURS * TARTEMENT 2 ,892 ,435
  • 27. CONCLUSION On conclue que les vers de terre ont un grande effect ecololoqique sur nos sol ,ils peuvent faire des modifications significative sur les paramétres étudier :  Le sol devient très granuleux et riche en matière organique , donc on confirme sont effet sur la fertilaisation et l’aération du sol qui influence positvement sur les plantes .  Une diminution de l’ humdité .  Stabilisation de PH qui est un effet favorable sur la survie des macrafaune et mésofaune du sol.  Augmentation dans la conductivité donc le sol devient très riche en minéraux.  Aucune modification significative sur la biomasse bactérienne de sol ou de fumier – sol après la déjestion .  le type de nourriture , sol seulmement ou sol additioné de fumier cheval n’influenncé pas sur la biomaasse bactérienne du cast En fin on conclue que l’effet des vers de terre sur nos sol peut étre voire pandant une période plus long par rapport à notre période .
  • 28.
  • 29. ci pour votre attention