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Síndrome del QT prolongado

     Manuel Gonzalez
     Luisa Rodriguez
      Viviana Mojica
•Enfermedad familiar caracterizada por una prolongaciòn
anormal de la repolarización ventricular.

•Alto riesgo de Taquiarritmias ventriculares.

•Con base en el patron de transmisiòn se conocen dos
síndromes clínicos :

‫ ئ‬Más común: Autosómico Dominante con un fenotipo
cardiaco puro (Romano-Ward3)

‫ ئ‬Menos común: Autosómico Recesivo, donde coexisten
anormalidades cardiacas y Sordera. (Jervell and Lange-
Nielsen4).
‫ ئ‬SCN5A: Codifica un canal de sodio cardiaco
(cromosoma 3).

‫ئ‬HERG: Codifica una proteína del canal de K (Ikr).
(cromosoma 7).

‫ ئ‬KvLQT1: Codifica la subunidad α de IKs (cromosoma
11).

‫ ئ‬KCNE1:Codifica a minK, una subunidad auxiliar de Iks
(cromosoma 21).

‫ئ‬El gen ANKB del cromosoma 4 (LQT 4).
Tipos de LQTS
Tipo   Cromosoma – Locus   Gen                  Proteina               Mecanismo alterado

LQT1   11 – 11p15.5        KCNQ1 (KVLQT1)       Sub α canal K          Repolarización

LQT2   7 – 7q35-q36        KCNH2 (HERG)         Sub α canal K          Repolarización


LQT3   3 – 3p21-p23        SCN5A                Sub α canal Na         Repolarización


LQT4   4 – 4q25-q27        ANKB                 Proteina adapatadora   Anclaje de los
                                                                       trasportadores de
                                                                       iones
LQT5   21 – 21q22.1-p22    KCNE1                Sub β canal K          Repolarización


LQT6   21 – 21q22.1-p22    KCNE2                Sub β canal K          Repolarización



                           BIOLOGICAL RESEARCH FOR NURSING Vol. 5, No. 2, October 2003
Frecuencia de presentación
Compendium of cardiac channel
 mutations in 541 consecutive
 unrelated patients referred for
  long QT syndrome genetic
            testing
    David J. Tester, Melissa L. Will,
     Carla M. Haglund, Michael J.
              Ackerman.
    Heart Rhythm 2005;2:507-517
Resultados
                         541 Pacientes
    272 Genotipo (+)                      269 Genotipo (-)

243 Una sola
  mutación      29 Multiples

  120 LQT1
  93 LQT2                                88 KCNQ1
  26 LQT3                                89 KCNH2
                       211 Variantes     32 SCN5A
                                         1 KCNE1
                                         1 KCNE2
Resultados: mutaciones más
      frecuentemente observadas
No.      Exon   Nucleotido   Variante   Localizació No. de ptes
                                        n
KCNQ1-LQT1

18       3      del 572-576 L191fs/90   S2-S3        7

55       7      1032 G→A SP/A344/G      S6           6
                         -A
71       12     1571 T →G V524G         C-terminal   7

75       13     1615 C →T R539W         C-terminal   6

KCNH2-LQT2

43       7      1838 C →T T613M         Poro         6
Genetic Testing in the Long QT Syndrome
    Development and Validation of an Efficient
                  Approach
         to Genotyping in Clinical Practice.
Napolitano. C, Priori. S, Schwartz. P, Bloise. R, Ronchetti.
   E, Nastoli. J, Bottelli. G, Cerrone. M, Leonardi. S,
      JAMA, December 21, 2005—Vol 294, No. 23
Resultados
                    430                                     1115
                  Probandos                             Familiares


                 310 (72%)                       521                 594   No
                  Mutaciones                    Afectados            Afectados


 296  Una sola             14 (4.5%)                 247 Casos
   mutación
                                Múltiples
                               mutaciones            Padres
144 (49%) KCNQ1        88%                           genotipificados
115 (39%) KCNH2
30 (10%) SCN5A                       12
                                Heterocigotos         29 (12%)
5 (1.7%) KCNE1                                        Casos esporadicos

2 (0.7%) KCNE2                       2
                                Homocigotos
Resultados
             • Mutaciones identificadas en los probandos

              Probandos:                                  325
                                                      mutaciones en
             235  tipos de                            310 probandos
              mutaciones


138   No
reportadas     170 (72%) 12 (5.1%)                208 (64%)     Región poro o
               Cambio de          Sin sentido      dominio transmembrana
65   KCNH2     nucleotido
                                  11 (4.7%)        90 (28%)     C-terminal
56   KCNQ1     33 (14.1%)         Inserciones
               Deleciones                           26 (8%)     N-terminal
13   SCN5A                        3 (1.4%)
               6 (2.7%)           Duplicaciones
2    KCNE1     Errores splicing

2    KCNE2
Resultados
               • Derivación y validación de las mutaciones
                 prevalentes en LQTS



 310 P                                 31
 180
(58%)                                  25
64 Codones
 repetitivos                             8
En rojo las que coinciden en ambos estudios
Estrategias para genotipificación en LQTS

Métodos para identificación
Mutation detection in long QT
         syndrome: a
comprehensive set of primers and
       PCR conditions
  P Syrris, A Murray, N D Carter, W M
         McKenna and S Jeffery
    J. Med. Genet. 2001;38;705-710
Introduccion
• El metodo más comunmente usado para la
  detección de mutaciones es la PCR-SSCP.
• La investigación de todos los genes no ha
  sido posible porque no se han tipificado
  todos los sets de primers para algunos
  genes.
Mg 2 +




                   Materiales y metodos
         • PCR
           – Red Hot Taq DNA polimerasa
              • 50 ng de DNA en 25 μl
              • Concentración final  1 ´ buffer (20 mmol/l (NH4)2SO4, 75 mmol/l
                Tris-HCl, pH 8.8, at 25°C, 0.01% (v/v) Tween 20, 1.5 mmol/l
                MgCl2), dNTPs (0.2 mmol/l each), 0.2 μmol/l para cada primer.
              • 1.25 unidades de Red Hot Taq polimerasa.
              • Para mejorar la amplificación se variaba la Tº de apareamiento y la
                [Mg2+]
              • El programa va a iniciar con: 94°C por 3 minutos (1 ciclo), 94°C por
                1 minuto, Variación de Tº (70- 60°C, 70-58°C, 65-53°C, or 60-50°C
                dependiendo de las propiedades de melting de los primers.)
                descendiendo 1º por ciclo, 72°C por 1 minuto (35 ciclos), 72°C por
                10 minutos (1 ciclo).
Materiales y metodos
• PCR
  – HotStarTaq DNA polimerasa
    • Es un protocolo creado po Qiagen para facilitar la
      amplificacion de algunos fragmentos que son
      dificiles de obtener con las modificaciones de Tº.
    • Este Kit también consta con un Aditivo para la PCR
      conocido como Sustancia Q que facilita aun mas la
      obtencion de los fragmentos.
KCNQ1
HERG
SCN5A
SCN5A
KCNE1 Y KCNE2
Alteraciones en la detección de
          mutaciones
Alle lic dro po ut in lo ng QT
s yndro me g e ne tic te s ting : A
              po s s ible
me c hanis m unde rlying fals e -
         ne g ative re s ults
 Tester D, Cronk L, Carr J, Schulz V,
  Salisbury B, Judson R,Ackerm  an.
    Heart Rhythm 2006;3:815– 821
•ALLELIC DROPOUT
Es una amplificación diferencial de un alelo debido
a una interrupción en el primer para detección de
SNP.
Esto como posible mecanismo de falsos negativos
como resultados de las pruebas genéticas en LQT,
comprende numerosos estudios previos con PCR.
Long QT syndrome caused by a
 large duplication in the KCNH2
  (HERG) gene undetectable by
current polymerase chain reaction-
       based exon-scanning
          methodologies

Koopmann T, Alders M, Jongbloed R, Guerrero S,
      Mannens M, Wild A, Bezzina C.
          Heart Rhythm 2006;3:52-55
Introdcucción
• Las metodologías de PCR y detección de exones,
  no detectan grandes rearreglos cromosomicos.
• El estudio analizó una serie de probandos
  negativos para los métodos convencionales de
  detección de LQTS.
• Se empleo la técnica MLPA (multiplex ligation-
  dependent probe amplification) que determina el
  relativo # de copias de un exon.
• Duplicación de 3.7Kb en el gen KCNH2 en una
  filia holandes con LQTS
Materiales y métodos
• 21 Pacientes
• Análisis MLPA: Sondas para exones
  KCNH2 1-4, 6, 9, 10 y 13
  KCNQ1 1-6 y 8-19
• Confirmación y análisis de la gran
  duplicación de KCNH2 por LA-PCR
Resultados
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Sindrome QT largo

  • 1. Síndrome del QT prolongado Manuel Gonzalez Luisa Rodriguez Viviana Mojica
  • 2. •Enfermedad familiar caracterizada por una prolongaciòn anormal de la repolarización ventricular. •Alto riesgo de Taquiarritmias ventriculares. •Con base en el patron de transmisiòn se conocen dos síndromes clínicos : ‫ ئ‬Más común: Autosómico Dominante con un fenotipo cardiaco puro (Romano-Ward3) ‫ ئ‬Menos común: Autosómico Recesivo, donde coexisten anormalidades cardiacas y Sordera. (Jervell and Lange- Nielsen4).
  • 3. ‫ ئ‬SCN5A: Codifica un canal de sodio cardiaco (cromosoma 3). ‫ئ‬HERG: Codifica una proteína del canal de K (Ikr). (cromosoma 7). ‫ ئ‬KvLQT1: Codifica la subunidad α de IKs (cromosoma 11). ‫ ئ‬KCNE1:Codifica a minK, una subunidad auxiliar de Iks (cromosoma 21). ‫ئ‬El gen ANKB del cromosoma 4 (LQT 4).
  • 4. Tipos de LQTS Tipo Cromosoma – Locus Gen Proteina Mecanismo alterado LQT1 11 – 11p15.5 KCNQ1 (KVLQT1) Sub α canal K Repolarización LQT2 7 – 7q35-q36 KCNH2 (HERG) Sub α canal K Repolarización LQT3 3 – 3p21-p23 SCN5A Sub α canal Na Repolarización LQT4 4 – 4q25-q27 ANKB Proteina adapatadora Anclaje de los trasportadores de iones LQT5 21 – 21q22.1-p22 KCNE1 Sub β canal K Repolarización LQT6 21 – 21q22.1-p22 KCNE2 Sub β canal K Repolarización BIOLOGICAL RESEARCH FOR NURSING Vol. 5, No. 2, October 2003
  • 6. Compendium of cardiac channel mutations in 541 consecutive unrelated patients referred for long QT syndrome genetic testing David J. Tester, Melissa L. Will, Carla M. Haglund, Michael J. Ackerman. Heart Rhythm 2005;2:507-517
  • 7. Resultados 541 Pacientes 272 Genotipo (+) 269 Genotipo (-) 243 Una sola mutación 29 Multiples 120 LQT1 93 LQT2 88 KCNQ1 26 LQT3 89 KCNH2 211 Variantes 32 SCN5A 1 KCNE1 1 KCNE2
  • 8. Resultados: mutaciones más frecuentemente observadas No. Exon Nucleotido Variante Localizació No. de ptes n KCNQ1-LQT1 18 3 del 572-576 L191fs/90 S2-S3 7 55 7 1032 G→A SP/A344/G S6 6 -A 71 12 1571 T →G V524G C-terminal 7 75 13 1615 C →T R539W C-terminal 6 KCNH2-LQT2 43 7 1838 C →T T613M Poro 6
  • 9. Genetic Testing in the Long QT Syndrome Development and Validation of an Efficient Approach to Genotyping in Clinical Practice. Napolitano. C, Priori. S, Schwartz. P, Bloise. R, Ronchetti. E, Nastoli. J, Bottelli. G, Cerrone. M, Leonardi. S, JAMA, December 21, 2005—Vol 294, No. 23
  • 10. Resultados 430 1115 Probandos Familiares 310 (72%) 521 594 No Mutaciones Afectados Afectados 296 Una sola 14 (4.5%) 247 Casos mutación Múltiples mutaciones Padres 144 (49%) KCNQ1 88% genotipificados 115 (39%) KCNH2 30 (10%) SCN5A 12 Heterocigotos 29 (12%) 5 (1.7%) KCNE1 Casos esporadicos 2 (0.7%) KCNE2 2 Homocigotos
  • 11. Resultados • Mutaciones identificadas en los probandos Probandos: 325 mutaciones en 235 tipos de 310 probandos mutaciones 138 No reportadas 170 (72%) 12 (5.1%) 208 (64%) Región poro o Cambio de Sin sentido dominio transmembrana 65 KCNH2 nucleotido 11 (4.7%) 90 (28%) C-terminal 56 KCNQ1 33 (14.1%) Inserciones Deleciones 26 (8%) N-terminal 13 SCN5A 3 (1.4%) 6 (2.7%) Duplicaciones 2 KCNE1 Errores splicing 2 KCNE2
  • 12. Resultados • Derivación y validación de las mutaciones prevalentes en LQTS 310 P 31 180 (58%) 25 64 Codones repetitivos 8
  • 13. En rojo las que coinciden en ambos estudios
  • 16. Mutation detection in long QT syndrome: a comprehensive set of primers and PCR conditions P Syrris, A Murray, N D Carter, W M McKenna and S Jeffery J. Med. Genet. 2001;38;705-710
  • 17. Introduccion • El metodo más comunmente usado para la detección de mutaciones es la PCR-SSCP. • La investigación de todos los genes no ha sido posible porque no se han tipificado todos los sets de primers para algunos genes.
  • 18. Mg 2 + Materiales y metodos • PCR – Red Hot Taq DNA polimerasa • 50 ng de DNA en 25 μl • Concentración final  1 ´ buffer (20 mmol/l (NH4)2SO4, 75 mmol/l Tris-HCl, pH 8.8, at 25°C, 0.01% (v/v) Tween 20, 1.5 mmol/l MgCl2), dNTPs (0.2 mmol/l each), 0.2 μmol/l para cada primer. • 1.25 unidades de Red Hot Taq polimerasa. • Para mejorar la amplificación se variaba la Tº de apareamiento y la [Mg2+] • El programa va a iniciar con: 94°C por 3 minutos (1 ciclo), 94°C por 1 minuto, Variación de Tº (70- 60°C, 70-58°C, 65-53°C, or 60-50°C dependiendo de las propiedades de melting de los primers.) descendiendo 1º por ciclo, 72°C por 1 minuto (35 ciclos), 72°C por 10 minutos (1 ciclo).
  • 19. Materiales y metodos • PCR – HotStarTaq DNA polimerasa • Es un protocolo creado po Qiagen para facilitar la amplificacion de algunos fragmentos que son dificiles de obtener con las modificaciones de Tº. • Este Kit también consta con un Aditivo para la PCR conocido como Sustancia Q que facilita aun mas la obtencion de los fragmentos.
  • 20. KCNQ1
  • 21. HERG
  • 22. SCN5A
  • 23. SCN5A
  • 25. Alteraciones en la detección de mutaciones
  • 26. Alle lic dro po ut in lo ng QT s yndro me g e ne tic te s ting : A po s s ible me c hanis m unde rlying fals e - ne g ative re s ults Tester D, Cronk L, Carr J, Schulz V, Salisbury B, Judson R,Ackerm an. Heart Rhythm 2006;3:815– 821
  • 27. •ALLELIC DROPOUT Es una amplificación diferencial de un alelo debido a una interrupción en el primer para detección de SNP. Esto como posible mecanismo de falsos negativos como resultados de las pruebas genéticas en LQT, comprende numerosos estudios previos con PCR.
  • 28.
  • 29.
  • 30.
  • 31. Long QT syndrome caused by a large duplication in the KCNH2 (HERG) gene undetectable by current polymerase chain reaction- based exon-scanning methodologies Koopmann T, Alders M, Jongbloed R, Guerrero S, Mannens M, Wild A, Bezzina C. Heart Rhythm 2006;3:52-55
  • 32. Introdcucción • Las metodologías de PCR y detección de exones, no detectan grandes rearreglos cromosomicos. • El estudio analizó una serie de probandos negativos para los métodos convencionales de detección de LQTS. • Se empleo la técnica MLPA (multiplex ligation- dependent probe amplification) que determina el relativo # de copias de un exon. • Duplicación de 3.7Kb en el gen KCNH2 en una filia holandes con LQTS
  • 33. Materiales y métodos • 21 Pacientes • Análisis MLPA: Sondas para exones KCNH2 1-4, 6, 9, 10 y 13 KCNQ1 1-6 y 8-19 • Confirmación y análisis de la gran duplicación de KCNH2 por LA-PCR