Este documento presenta un análisis filogenético de 14 especies del género Psychotria utilizando el gen rbCL. Los resultados de los análisis de parsimonia y bayesiano sugieren que las especies de Psychotria constituyen un grupo monofilético. Sin embargo, el análisis de máxima verosimilitud no apoya esta hipótesis, mostrando que las especies no están suficientemente relacionadas por un ancestro común. El documento también discute posibles errores en la identificación del outgroup Cinchona macrocalyx.
ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL GÉNERO Psychotria L. (Rubiaceae)
1. ANÁLISIS FILOGENÉTICO DEL
GÉNERO Psychotria L.
(Rubiaceae)
Jorge Caranqui, Luis Espinoza, Edison Lomas, Ángeles Simbaña
2. INTRODUCCIÓN
Familia Rubiaceae:
Origen etimológico:
Rubia L. latín “ruber”= “rojo” refiere al colorante
rojo que se extrae de la especie asiática Rubia
tinctorum.
Presenta hierbas, arbustos o árboles u
ocasionalmente trepadoras, no presentan látex,
si presentan iridoides, alcaloides y resinas.
3. POSICIÓN FILOGENÉTICA
De acuerdo al APG (Angiosperm Phylogenic
Group), Rubiaceae es el grupo hermano del
resto de familias de Gentianales y se distingue
por la presencia de ovario ínfero y estipulas
interpeciolares.
Anteriormente la Familia estaba en el Orden
Rubiales dentro del S. Clasificación de Cronquist.
5. DISTRIBUCIÓN GEOGRÁFICA
Trópicos, Subtrópicos y en las Zonas templadas.
10.000 spp. y 500-700 (Taylor 2001b)
Ecuador: 499 spp. y 78 géneros (Taylor 1999)
se distribuyen desde las tierras bajas, Bosques
montanos y los Páramos.
6. PROBLEMA
Anteriormente los sistemas de clasificación se
basaban en características morfológicas que
conllevan al problema de confundir caracteres
sinapomórficos de homoplásicos.
7. HIPOTESIS
Las 14 especies en estudio del genéro
Psychotria, son un grupo monofilético
8. PREGUNTAS
¿ Los modelos realizados nos darán patrones
similares en las relaciones filogenéticas entre las
14 especies de Psychotria ?
9. MATERIALES Y MÉTODOS
Familia Rubiaceae
In-group:
Género Psychotria:14 especies
Out-group:
Especies: Cinchona macrocalyx
Palicourea lasiorrachis
10. MATERIALES Y MÉTODOS
Obtención de datos (genes-nucleótidos):
NCBI
EMBL-EBI
DBGET
11. Gen rbCL (ribulose-bisphosphate
carboxylase )
Este gen es el mas comúnmente estudiado en
las plantas, ya que tiene un tamaño más o
menos largo (1428 pares de bases).
Puede ser alineado fácilmente, por lo que es un
gen muy utilizado en sistemática.
Debido a que la proteína codificada por él es
muy importante para las plantas, éste es un gen
que no presenta cambios o mutaciones muy
frecuentes.
16. P. holtzii
P. kirkii
P. peteri
P. nervosa
P. graciliflora
P. micralabastra
P. ramuensis
P. mariniana
0.003
0.001
P. micrococca
Cinchona
macrocalyx
0.001
P. borucaza
P. ipecacuanha
P. leptothyrsa
0.002
0.004
P. bremekampiana
Palicourea lasiorrachis
P. poeppigiana
0.005 substitutions/site
0.002
0.011
0.005
0.012
0.002
0.001
0.005
0.005
0.005
0.054
0.001
0.005
0.001
0.009
0.005
0.067
0.005
0.010
0.004
0.012
0.018
0.012
0.010
0.012
DISTANCIAS
17. MAXIMA VEROSIMILITUD
P. graciliflora
Cinchona macrocalyx
P. holtzii
P. kirkii
P. peteri
P. nervosa
P. micralabastra
P. ramuensis
P. mariniana
95
P. micrococca
88
P. borucaza
P. ipecacuanha
P. bremekampiana
83
P. bremekampiana
Palicourea lasiorrachis
P. peteri
19. DISCUSIÓN
En todos los modelos realizados Cinchona
macrocalyx fue utilizada como Outgroup, sin
embargo ya en los cladogramas apareció
siempre incluido en el Ingroup; esto puede
deberse a un error en la identificación de la
especie, o por otra parte podría ser que no
existen diferencias genéticas marcadas.
20. Al parecer las especies de Psychotria en
estudio, constituyen un grupo monofilético,
según los resultados del modelo de Parsimonia.
El modelo de máxima verosimilitud, demostró
que estas especies de Psychotria no están
suficientemente relacionados por un ancestro
común.