Workshop: Drupal para Bioinformática

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Workshop: Drupal para Bioinformática

  1. 1. Workshop - Drupal para BioInformática José Fernandesemail@josefernandes.pt - www.josefernandes.pt - twitter.com/introfini - drupal.org/user/42293
  2. 2. Gestor de conteúdos / Framework
  3. 3. Como funciona? Drupal PHP Apache MySQL PostgreSQL, Oracle, SQLIIS, Nginx, lighttpd, etc Server, etcSistema Operativo
  4. 4. http://opensource.com
  5. 5. http://drupal.org
  6. 6. A comunidade Mais de 500.000 membros Mais de 12.000 developers Membros em mais de 200 países Traduzido em 88 línguas
  7. 7. http://www.flickr.com/photos/nidhug/4923618478
  8. 8. Comunidade portuguesa Drupal Portugal: núcleos em Lisboa e no Norte http://drupal-pt.org A.D.P. - Associação Drupal Portugal 3.600 membros portugueses registados http://drupal.org/profile/country/Portugal
  9. 9. 10 razões para escolher Drupal1. Comunidade apaixonada e dedicada2. Desenvolvimento rápido3. Desenvolvimento flexível4. Altamente extensível5. Escalabilidade garantida6. Construído para ser social7. Aberto para a sua marca8. Sem custos de aquisição ou de licenciamento9. Segue os standards10. Segurança máxima
  10. 10. Tipos de sites Comunidades  Aplicações web E-commerce  Formação online Institucionais  Intranets Conferências  Wikis Portais  Fóruns Páginas pessoais  Marketing Jornais online  ...
  11. 11. Alguns prémios ganhos
  12. 12. Quem o usa?
  13. 13. http://www.mensa.org
  14. 14. http://www.ebi.ac.uk/
  15. 15. http://brix.crg.es/
  16. 16. http://www.pacbb.net
  17. 17. http://biology.stanford.edu/
  18. 18. http://news.harvard.edu
  19. 19. http://aribi.arizona.edu/
  20. 20. http://www.bioinfo.wsu.edu/
  21. 21. http://bisite.usal.es
  22. 22. http://www.biology.umd.edu/
  23. 23. http://www.ncbi.nlm.nih.gov
  24. 24. http://www.playboy.de
  25. 25. Quem mais o usa?
  26. 26. Emprego?http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html
  27. 27. Drupal + Bioinformática http://www.bioinfo.wsu.edu/node/557
  28. 28. O que vem incluído? Blogues, livros,  Gestão de permissões comentários, fóruns  Gestão de sessões Estatísticas de acessos e  OpenID logins  Gestão de ficheiros e Pesquisa avançada imagens Sistemas avançados de  Feeds RSS performance  Sistema de notificações URL amigáveis para actualizações Menus multi-nível  Perfis de utilizadores Suporte multi-site  Ferramentas de workflow Gestão de utilizadores  …
  29. 29. E muito mais! Mais de 12.000 módulos disponíveis Principais módulos: CCK, Views, Rules, Pathauto, Commerce, Google Analytics, Devel, Rules, Fivestar, VBO, Advanced Forum, Organic Groups, XML Sitemap, Features, Context, Panels, Flag, FeedsLista completa: http://drupal.org/project/Modules
  30. 30. Módulos para Bioinformática Bioinformatic Software Bench http://drupal.org/project/biosoftware_bench The Bioinformatic Software Bench for Drupal allows for a rapid and secure deployment of bioinformatic software. The BLAST, InterProScan, SSAHA2 and annot8r software are provided by default and plugins for new software can be readily written. GMOD Drupal Bioinformatic Server Framework http://drupal.org/project/gmod_dbsf Genes4all http://drupal.org/project/genes4all Genes4all is a package of modules for visualizing bioinformatic information using GMOD, BioPerl and Chado.. Pubmed Integration http://drupal.org/project/pubmed_integration Entrez Database Import http://drupal.org/project/entrez Jbrowse http://drupal.org/project/Jbrowse
  31. 31. http://insectacentral.org/bench/blastall
  32. 32. Como saber mais? Documentação no Drupal.org http://drupal.org/handbook API para developers http://api.drupal.org Vídeos com tutoriais http://drupal.org/node/124318 IRC #drupal http://drupal.org/irc BioInformatics no Groups.Drupal http://groups.drupal.org/bioinformatics O meu blog http://josefernandes.pt/topicos/drupal
  33. 33. Dezenas de livros ...
  34. 34. Mãos ao trabalho! Ter a stack (L/W/M)AMP a funcionar Fazer o download do Drupal Versão 6 ou 7 ? Que módulos usar? Desenvolver o 1º projecto!

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