3. La Biblioteca de El Escorial fue una de las más grandes bibliotecas de la época, conteniendo libros sobre el llamado Trivum (gramática, retórica y dialéctica) y el Quadrivium (aritmética, astronomía, geometría y música) aparte de religiosos. y demás. Esto se debe a la idea de Felipe II de hacer una gran Bibliotecen la que se uniesen, o al menos, conviviesen, Ciencia y Religión. Del primer catálogo de los libros que contendría la Biblioteca se encargó Arias Montano. De la realización de los frescos de la bóveda se encargó el pintor italiano Pellegrino Tibaldi.
4. La bóveda de cañón de la biblioteca, se compone de frescos transversales. En ellos se hace referencia a las 7 artes de la sabiduría. Se divide en “Trivium”(Gramática, retórica, y dialéctica), es decir las tres artes del campo de las letras, y el resto “Quadrivium”(Aritmética, Música, Geometría y Astrología), cuatro artes liberales del campo de la ciencia. Cada fresco representa una escena relacionada con cada arte. Episodios importantes, generalmente de la Antigüedad, influyentes en el desarrollo de cada ciencia.
10. En el centro Dionisio Aeropagita, contemporáneo de Jesucristo, en medio de una multitud asustada observando un eclipse de sol con un astrolabio en la ciudad de Heliópolis (Egipto). Un observador mira a través de un instrumento de pínulas, otro mantiene en su mano izquierda un cuadrante, y al fondo un cuarto observador dirige hacia el cielo un instrumento dorado. El miedo que llena a todos proviene del hecho de que están contemplando un eclipse de sol en época de luna llena, lo cual no es posible salvo un milagro, como el acontecido cuando Jesucristo fue crucificado, en que las tinieblas cubrieron toda La Tierra y se ocultó el Sol desde la hora sexta hasta la hora nona (la novena)
11. San Dionisio, llamado el Areopagita, fue durante mucho tiempo discípulo de San Pablo y de un compañero de éste llamado Hierotheo. San Pablo le consagró obispo de Atenas. Después de regir la Iglesia de Atenas bastante tiempo, fue a Éfeso a conferenciar con San Juan el Evangelista; luego se marchó a Roma a tener una entrevista con el papa Clemente, y desde allí pasó a ejercer su apostolado en Francia.
12. Muchísimo tiempo se creyó que fue el primer arzobispo que hubo en París. Harduino, historiador, dice que en París lo expusieron ante las fieras, pero que él les hizo el signo de la cruz, y las fieras se postraron a sus pies. Los paganos de París, al ver que salió ileso, le arrojaron en un horno encendido, del que también salió fresco y en perfecto estado de salud. Le crucificaron, y ya enclavado, se puso a predicar desde lo alto de la horca.
13. Pero, según Harduino, sucedió un gran milagro: el cuerpo de San Dionisio se puso en pie y cogió su cabeza con las manos; los ángeles le acompañaron cantando. Y como el primer paso es el que cuesta, una vez puesto a andar el santo decapitado, llevó su cabeza hasta el sitio en que se fundó una iglesia, que es la famosa iglesia de San Dionisio.
14. Se le atribuyen diez y siete obras, que, desgraciadamente, se han perdido seis; las once que se conservan las tradujeron del griego Juan Scott, Hugo de Saint-Víctor, Alberto el Grande y otros sabios ilustres.
16. El profeta Isaías en pie y el rey Ezequías en la cama, contemplan un reloj de sol mantenido por un soldado con casco, señalando las cinco horas en un extraño reloj con veinticuatro horas y el gnomon apuntando aparentemente hacia la estrella polar. La escena corresponde a los pasajes bíblicos del milagro de Achaz e Isaías que se mencionan en multitud de libros dedicados a la gnomónic. En el nivel superior y a la izquierda, está dibujado el matemático griego Euclides (S III a. C.) que mantiene un cartulario en su mano izquierda donde está dibujado el ángulo entre dos estrellas, y un cuadrante de pínulas en la derecha. En el otro extremo se encuentra el astrónomo inglés Sacrobosco que observa el cielo a través de de las pínulas de su cuadrante.