Workshop PubMed: Informação em Ciências da Saúde

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Workshop PubMed: Informação em Ciências da Saúde

  1. 1. Abril 2011 – Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúdePubMedInformação em ciências da saúde Imagem: Stock.xchng
  2. 2. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Sumário ◌ O que é? ◌ Conteúdos ◌ Funcionalidades ◌ A Medline ◌ O thesaurus MeSH ◌ O acesso ◌ A pesquisa ◌ Subscrição de Feeds RSS ◌ Exportação para o EndNote ◌ Exercícios
  3. 3. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde O que é? A PubMed é uma base de dados de bibliografia especializada, com mais de 20 milhões de  registos de literatura biomédica,  MEDLINE, revistas científicas e livros electrónicos. Abrange  as áreas da medicina, enfermagem, veterinária, entre outras áreas relacionadas com as  ciências da saúde. Tem também um conjunto de links de endereços electrónicos  seleccionados e com relevância para a área, incluindo recursos de biologia molecular. Produzida pela National Library of Medicine (http://www.nlm.nih.gov/) dos Estados Unidos,  em conjunto com editores de literatura biomédica, começa por ser uma inteface de acesso à Medline, incluindo também a Oldmedline e citações avulsas. Contém registos desde 1865 e  faz ligação a todos os artigos que estejam em Open Access disponibilizados no arquivo  PubMedCentral (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/) assim como às revistas subscritas em  formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B‐on (com acesso ua.pt). 
  4. 4. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Conteúdos MeSH Thesaurus  › A MEDLINE, a OLDMEDLINE e citações avulsas; › A OLDMEDLINE contém artigos anteriores a 1966 (1865 a 1965) de cerca de 80 países; › Possibilidade de pesquisa em várias publicações, que podem ir dos artigos científicos aos  pré‐prints e livros; › São também incluídas desde logo na PubMed as citações in‐process e as citações  fornecidas pelos editores;
  5. 5. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Conteúdos › As citações avulsas compreendem as citações out‐of‐scope (por exemplo, de artigos sobre  geofísica, arqueologia, astronomia) de alguns periódicos indexados na MEDLINE,  cujos  artigos relacionados com as ciências da saúde já são indexados. Incluem também citações  que precedem o ano a partir do qual um dado periódico passou a ser integrado na  MEDLINE (catalogação retrospectiva) e citações de outros periódicos não incluídos na  MEDLINE, mas que submetem o seu texto integral à PubMedCentral e são avaliados  positivamente pela NLM; › As citações in‐process fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do  artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos (termos MeSH). Estes registos são acrescentados diariamente e contêm a indicação [PubMed – in process]. À medida que os dados vão sendo acrescentados e os registos ficam completos, passam a  conter a indicação [PubMed – indexed for MEDLINE];
  6. 6. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Conteúdos › Clinical trials: Estudos biomédicos ou investigação relacionada com áreas da saúde, aplicados em seres  humanos e que seguem protocolos pré‐definidos. “Research studies that involve patients. Each study is designed to find better ways to prevent, detect, diagnose, or treat diseases and to  answer scientific questions.” School of Medicine | University of Southern California http://www.usc.edu/schools/medicine/departments/surgery/divisions/colorectal/about/index.html
  7. 7. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Funcionalidades › Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.; › Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not) e termo composto ou pesquisa por frase (“ “); › Acesso ao texto integral de algumas publicações subscritas pela UA ou que fazem parte da B‐on – Biblioteca do Conhecimento Online (desde que no dominio ua.pt);
  8. 8. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Funcionalidades › Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre; › Possibilidade de pesquisa em outras bases de dados e clinical trials; › Thesaurus MeSH; › Subscrição de feeds RSS; › Exportação para EndNote; › Espaço pessoal.
  9. 9. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde A Medline › A Medline é uma base de dados da National Library of Medicine e que resulta da PubMed.  › Inclui apenas artigos científicos com peer‐review nas áreas da biomedicina. As referências  nela incluídas passam por um processo de análise e indexação mais consistente e todos os  registos contêm descritores do thesaurus Mesh.  › Abrange menos publicações do que a PubMed, mas as que reúne são da máxima  pertinência.  › Está acessível para a UA, através da plataforma ISI Web of Knowledge http://isiknowledge.com/MEDLINE
  10. 10. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde O thesaurus MeSH Vocabulário controlado da PubMed|Medline O MeSH (Medical Subject Headings) é o vocabulário controlado que é utilizado para indexar os  artigos da PubMed e da Medline. A terminologia controlada que é usada no thesaurus MeSH  dá a possibilidade de recuperar informação sobre um determinado assunto de uma forma  sistemática, eliminando os registos que não são pertinentes para aquele tópico. É uma óptima ferramenta de apoio para a realização de pesquisas na PubMed e Medline pois  diminui ou limita o ruído, proporcionando maior precisão.
  11. 11. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde O acesso http://pubmed.gov (acesso universal e gratuito)
  12. 12. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde A pesquisa ◌ Pesquisa básica ◌ Pesquisa avançada ◌ Pesquisa por assunto ◌ Pesquisa por autor ◌ Pesquisa por título de revista ◌ Pesquisa de uma referência em particular ◌ Operadores boleanos ◌ Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico ◌ O texto integral dos artigos
  13. 13. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  A pesquisa básica MeSH Thesaurus  3 4 1 2 1 Certifique‐se que está na base PubMed 3 Estabeleça limites à sua pesquisa (opcional) 2 Coloque os termos no campo de pesquisa 4 Se não obtiver resultados na pesquisa básica, opte pela  pesquisa avançada
  14. 14. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  A pesquisa avançada MeSH Thesaurus  5 6 3 1 2 4 1 Coloque os termos de pesquisa  4 Adicione os termos à caixa de pesquisa “search box” 2 Seleccione o campo a pesquisar (opcional) 5 Verifique se a pesquisa está de acordo com o pretendido 3 Seleccione um dos operadores boleanos 6 Estabeleça limites à sua pesquisa (opcional) (aplica‐se quando há vários termos a combinar)
  15. 15. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Pesquisa por assunto MeSH Thesaurus  Identifique os termos do assunto a pesquisar › Os termos devem ser em língua inglesa;  › Deve ter em conta os sinónimos, o plural, o singular e as abreviaturas; Exemplo: O tratamento com  Metotrexato nas crianças  com artrite juvenil  ideopática poliarticular. As palavras chave são: Methotrexate e Polyarticular juvenile idiopathic arthritis
  16. 16. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Pesquisa por assunto MeSH Thesaurus  Ao colocar os termos na caixa de pesquisa, analise as sugestões de termos apresentadas,  estas dão indicações dos termos mais correctos a usar.
  17. 17. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH) MeSH Thesaurus  Em caso de dificuldade na identificação do termo use o thesaurus MeSH. O MeSH está acessível através do link http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh 3 1 2 1 Coloque o termo de pesquisa  2 Seleccione um dos termos propostos (opcional) 3 Inicia a sua pesquisa em “Search”
  18. 18. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH) MeSH Thesaurus  Em caso de dificuldade na identificação do termo use o thesaurus MeSH. 1 1 Seleccionar o termo de assunto
  19. 19. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH) 1 1 Seleccione um dos termos de assunto 
  20. 20. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Pesquisa por assunto (thesaurus MeSH) 4 1 2 3 6 5 4 Valide o termo  1 Termo de assunto já seleccionado  5 Para juntar mais termos à pesquisa seleccione  2 Termos a adicionar à pesquisa (opcional) um dos operadores boleanos (opcional) 3 Adicione os termos à caixa da pesquisa “Add to search buider” 6 Lance a sua pesquisa na PubMed
  21. 21. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Pesquisa por assunto : quando usar e quando não usar o  MeSH… Use o MeSH quando: Não use o MeSH quando: › pretende efectuar uma pesquisa exaustiva  › pretende informação sobre um conceito  e precisa sobre um determinado tópico (os  médico novo ou emergente, para o qual ainda  documentos ainda não indexados não serão  não existe um termo MeSH. apresentados). › necessita de efectuar uma pesquisa  › quer obter registos de artigos publicados  elaborada, combinando vários aspectos de  recentemente. Uma pesquisa por termo  diferentes tópicos ou assuntos. MeSH não consegue recuperar citações com a  indicação «Pubmed – in process», às quais  ainda não foram associados termos MeSH. › quer encontrar rapidamente um aspecto  › suspeita de que há pouca informação  específico de um tópico genérico. publicada relativa ao tópico que lhe interessa.
  22. 22. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Pesquisa por autor MeSH Thesaurus  Digite na caixa de pesquisa, o último nome do autor, mais as iniciais sem pontuação. Na pesquisa avançada, no “search builder”, coloque o nome do autor e seccione a opção  autor do menu “All fields”. Exemplo: 5 DePinho RA DePinho R 4 6 1 3 2
  23. 23. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Pesquisa por título de revista MeSH Thesaurus  Através da pesquisa do título completo, da abreviatura ou do ISSN de uma revista, a PubMed  apresenta uma relação de todos os artigos nela publicados, desde que indexados na base de  dados. Na pesquisa avançada, no “search builder”, coloque o título da revista e seccione a opção  autor do menu “journal”. Exemplo: 5 Lancet 4 6 1 3 2
  24. 24. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Pesquisa por título de revista MeSH Thesaurus  Para obter informações sobre uma revista, aceda à NLM Catalog: Journals referenced in the  NCBI Databases ‐ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nlmcatalog/journals Exemplo: Lancet 2 1 3 4 1 Digite o título da revista  3 Seleccione a revisa  2 “Search” 4 Dados estruturados da publicação 
  25. 25. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Pesquisa de uma referência em particular Localização de um artigo através de informações bibliográficas já existentes. Quando já tem o título da revista, volume, número e páginas, use o Single Citation Matcher para localizar o artigo ‐ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/citmatch.  Exemplo: Moniz, E. (1950). [Contribution of the  1 Portuguese school to the development of  neurosurgery]. Minerva Med, 41(35), 47‐49. 1 Preencha os campos de acordo com a referência  2 2 Inicie a pesquisa com “Go” 3 3 Consulte o registo do artigo na PubMed 
  26. 26. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Os operadores boleanos na pesquisa MeSH Thesaurus  A pesquisa booleana permite a combinação de diferentes termos numa única pesquisa,  através do uso dos  operadores and, or, not. and Psychology and forensics Resultados PubMed ‐ 5184  or Psychology or forensics Resultados PubMed ‐ 910388  not Psychology not forensics Resultados PubMed ‐ 824935
  27. 27. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico MeSH Thesaurus  Após a pesquisa, a PubMed apresenta uma lista com vários resultados (20 por página),  ordenados cronológicamente e que podem ser de registos de artigos científicos ou capítulos  de livros.  Título Não está indexado com descritores MeSH Autores Em processo de indexação. Ainda não está na Medline Título da revista Na Medline
  28. 28. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico Link para o texto integral Volume e número Ano de publicação Páginas Capítulo de livro
  29. 29. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico MeSH Thesaurus  Os registos bibliográficos são apresentados de uma forma estruturada – título, autor(es),  afiliação, resumo/abstract, revista, ano de publicação, volume, número e páginas, link para o  texto integral, editor, os termos de assunto do thesaurus MeSH, entre outros.
  30. 30. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Os resultados da pesquisa e o registo bibliográfico MeSH Thesaurus  Ligações ao texto  Tipo de publicação /  integral artigo de uma revistas Termos de assunto  indexados com base  no MeSH Os termos de  assunto com * são  considerados os  mais relevantes do  artigo
  31. 31. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  O texto integral dos artigos MeSH Thesaurus  No registo completo do artigo, a existência do icon de “free‐text article” ou ”full‐ text article” dá acesso ao texto integral, caso seja uma revista disponível em acesso livre ou uma  publicação subscrita em formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B‐on.
  32. 32. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Subscrição de feeds RSS MeSH Thesaurus  1 2
  33. 33. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Subscrição de feeds RSS MeSH Thesaurus  3 4 6 5
  34. 34. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Exportação para EndNote  MeSH Thesaurus  21 3 4 5
  35. 35. Abril 2011  Bibliotecas da Universidade de Aveiro  PubMed Informação em ciências da saúde PubMed  Exportação para EndNote  MeSH Thesaurus  6 9 10 7 8
  36. 36. PubMed Informação em ciências da saúde Estes conteúdos estão protegidos por uma licença Creative Commons:universidade de aveiro sbidm serviços de biblioteca,  informação documental  e museologia 2011 http://creativecommons.org/licenses/by‐nc‐sa/3.0/

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