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ENZIMAS:
ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN,
FUNCIÓN
Dr. Ángel Díaz
09/22/13 2
ENZIMAS:
ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
Dr. Ángel Díaz
09/22/13 3
CATALIZADORES
 Sustancias o compuestos que aceleran las reacciones
químicas
ASPECTOS GENERALES
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 4
REACCIÓN QUÍMICA
 Proceso mediante el cual uno o mas compuestos son
transformados en uno o mas compuestos diferentes
 ASPECTOS FUNDAMENTALES DE UNA REACCIÓN
QUÍMICA
 1- velocidad de la reacción
 2- alcance de la reacción
09/22/13 5
ENERGETICA DE LAS REACCIONES
 Toda reacción química va acompañada de un cambio de
energía del sistema reaccionante
 Esto determina la dirección, velocidad y alcance de la
reacción
 TIPOS DE ENERGIA
 Cinética. (del movimiento, el calor)
 Potencial. (almacenada en las estructuras de las
biomoléculas)
09/22/13 6
VELOCIDAD DE REACCION
 Nos da una idea de como se lleva a cabo la reacción
química
 Se determina de acuerdo a la concentración de producto
por unidad de tiempo o mediante la desaparición del
sustrato
 La velocidad de la reacción depende de la concentración
de reactantes a cada momento
 La velocidad se verá afectada por varios factores como
son la temperatura, la presión, etc.
09/22/13 7
ORDEN DE LA REACCION
 Si la velocidad es directamente proporcional a la
concentración del reactante( primer orden)
 Si la velocidad es proporcional al cuadrado de la
concentración de los reactantes o al producto de la
concentración de 2 reactantes( segundo orden)
 Cuando la velocidad de la reacción es independiente
de la concentración de los reactantes decimos que es
de orden cero
09/22/13 8
REVERSIBILIDAD Y EQUILIBRIO DE LAS REACCIONES
 Una reacción es reversible cuando puede realizarse en
ambos sentidos
 REACTANTE PRODUCTO
 PRODUCTO REACTANTE
A B
09/22/13 9
 La relación entre la concentración de reactantes
y la concentración de productos en un momento
del equilibrio depende de la naturaleza de los
compuestos, la temperatura y la presión
 Ke = [DHCP] = 22,2
[GAD3P]
 Mientras mayor sea la Ke, mayor es la tendencia
a la espontaneidad
09/22/13 10
ENERGIA DE ACTIVACION
 Es la diferencia entre la energía que poseen los
reactantes y la que deben poseer para poder reaccionar
 Mientras mayor es ese valor menor será la velocidad
de la reacción
 Es una barrera energética que los reactantes deben
superar en el desarrollo de la reacción en su camino
hacia el producto
09/22/13 11
 Si la energía del reactante esta muy lejos de la que debe
alcanzar para reaccionar entonces la reacción será lenta
 Los catalizadores disminuyen la energía de activación
por lo que aumentan la velocidad de la reacción
09/22/13 12
El Sistema Internacional de unidades (SI) ha definido la
unidad de actividad enzimática como la cantidad de
enzima que transforma 1 mol de sustrato por segundo.
Esta unidad se llama katal
Unidad de actividad enzimática
09/22/13 13
EN LA CONVERSIÓN DEL REACTANTE EN PRODUCTO OCURRE UNA
VARIACIÓN DEL CONTENIDO ENERGÉTICO DEL SISTEMA
 Si la energía de los productos es igual a la de los
reactantes la reacción es isoergonica
 Si la energía de los productos es mayor a la de los
reactantes la reacción es endergonica
 Si la energía de los productos es menor que la de los
reactantes la reacción es exergonica
09/22/13 14
TIPOS DE CATALIZADORES
 BIOTICOS: catalizan reacciones en sistemas vivos
 ABIOTICOS: su actividad catalítica no esta
relacionada necesariamente con sistemas vivos
09/22/13 15
CATALIZADORES CLASIFICACION
 ORGANICOS INORGANICOS
 Enzimas Metales
 Ribozimas Ácidos, sales
 ALGUNAS DIFERENCIAS ENTRE ESTOS:
 Especificidad de sustrato y/o de reacción
 Velocidad de reacción
 Capacidad de realizar varias reacciones sin alterar su estructura
09/22/13 16
COMPONENTES FUNDAMENTALES DE UNA REACCION
QUIMICA
 SUSTRATO CATALIZADOR PRODUCTO


 COFACTOR
Orgánico
Inorgánico
Orgánicos Inorgánicos
(NAD, FAD, PPT, COA) (ZINC, Mg, Fe++)
09/22/13 17
ENZIMAS
Proteínas especializadas en la función
catalítica
ESTRUCTURA
 Centro activo (definición)
 Sitio alostérico (definición)
09/22/13 18
CENTRO ACTIVO
 Esqueleto peptídico
 Grupos de orientación y fijación
 Grupos catalíticos
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 19
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 20
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
TRIADA CATALITICA
09/22/13 21
09/22/13 22
SECUENCIAS CONSERVADAS EN LOS CENTROS
ACTIVOS DE DIFERENTES PROTEASAS
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
Enzima Sec. alrededor de la Serina Sec. alrededor de la Histidina
Tripsina DSCQDGSGGPVVCSGK VVSAAHCYKSG
Quimotripsina SSCMGDSGGPLVCKKN VVTAAHGGVTT
Trombina DACEGDSGGPFVMKSP VLTAAHCLLYP
09/22/13 23
CARACTERISTICAS CONFORMACIONALES DE LOS
CENTROS ACTIVOS DE SERIN PROTEASAS
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
Enzima Conformación de su centro activo
Quimotripsina
Cavidad hidrofóbica que une las cadenas laterales de los
aminoácidos aromáticos
Tripsina En el fondo de su centro activo hay un Aspartato, que limita
la unión de residuos cargados positivamente
Elastasa Su centro activo esta ocupado por residuos de aminoácidos
con cadenas laterales voluminosas
09/22/13 24
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 25
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 26
GRUPOS FUNCIONALES ESENCIALES PARA LA
CATALISIS EN EL CENTRO ACTIVO DE ALGUNAS
ENZIMAS
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
Enzima GRUPOS CATALITICOS
Ribonucleasa Ser 112, His 119
Quimotripsina Ser 195, His 57, Asp 102
Lisozima Asp 52, Glu 35
Fructosa 1, 6
bisfosfatasa
Glu 327, His 258, His 392
Carboxipeptidasa A Zinc , His 196, His 69, Glu 72
09/22/13 27
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 28
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 29
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
SITIO ALOSTÉRICO
 Sitio en la enzima diferente al sitio activo o
catalítico.
 Sitio de regulación.
 Une moduladores o efectores que aumentan o
disminuyen la actividad de la enzima.
 Enzimas reguladoras o alostéricas.
09/22/13 30
ETAPAS DE LA ACCIÓN CATALITÍCA
 1-Unión física entre el sustrato y el
centro activo de la enzima que da
origen al complejo enzima sustrato
(reversible)
 2-Transformación del sustrato
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 31
TEORIAS DE UNION ENZIMA SUSTRATO
 Teoría de la llave y la cerradura (fischer)
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 32
 Teoría de la llave y la cerradura (fischer)
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 33
TEORIAS DE UNION ENZIMA SUSTRATO
 Teoría del ajuste inducido (Koshland)
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
LYS
P P
MET
MET
HS
HS
LYS
LYS
09/22/13 34
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 35
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
TORCEDURA DE SUSTRATO
09/22/13 36
CLASIFICACIÓN
CATALIZADORES
NOMENCLATURA DE LAS
ENZIMAS
en zymc  “en fermento”
 Nombre Trivial o Antiguo
 Sustrato + asa
 Procedencia o Sitio de Acción + asa
 Nombre Sistemático
 Número Clave
 Nombre Recomendado
 Sustrato + Acción + asa
NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS
Nombre Trivial o Antiguo
 Sustrato + asa
• Amilasa Almidón
• Lipasa  Lípidos
• Ureasa  Urea
 Procedencia o Sitio de Acción + asa
• Ptialina (Ptyalos = Saliva)
• Tripsina (Triptus = Páncreas)
• Pepsina (Pepsus = Estómago)
• Renina (Riñón)
NOMENCLATURA DE LAS
ENZIMAS
Nombre Recomendado
 Sustrato + Acción + asa
• Succinato Deshidrogenasa
• Piruvato Carboxilasa
• Citrato Sintasa
• Triosa P Isomerasa
• Fumarato Hidratasa
• Glucosa 6 Fosfatasa
• Glucosa Oxidasa
NOMENCLATURA DE LAS
ENZIMAS
 Todas las enzimas deben llevar:
1. El nombre del sustrato.
2. El nombre de la reacción química
catalizada.
3. Terminación asa.
 Ejemplo: Glucosa oxidasa
3. Información adicional, si es necesario
aclarar la reacción, puede seguir al
paréntesis.
09/22/13 41
CATALIZADORESNombre Sistemático
Número Clave:
E.C. + 4 dígitos
E.C. 2.7.1.1
El primer dígito  clase de enzima.
El segundo dígito  subclase de enzima.
El tercer dígito  sub-subclase.
El cuarto dígito  el número progresivo de
orden para la enzima específica.
09/22/13 42COMISIÓN ENZIMÁTICA
CÓDIGO NUMÉRICO
E C
CUATRO NUMEROS SEPARADOS POR PUNTOS
NUM 1: CLASE
NUM 2: SUBCLASE
NUMS 3 Y 4: GRUPOS QUÍMICOS QUE INTERVIENEN
EN LA REACCIÓN
09/22/13 43
COMISIÓN ENZIMÁTICA
GLUCOQUINASA
E C 2.7.1.2
2 TRANSFERASA
7 FOSFOTRANSFERASA
1 EL ACEPTOR ES UN OH
2 EL ACEPTOR ES UN OH DE LA GLUCOSA
E. C. 2 .7.1.1
 2  denota la clase (una transferasa)
 7  subclase (transferencia de fosfato)
 1  sub-subclase (una función alcohol como
aceptor de fosfato)
 1  enzima hexocinasa o ATP: D-hexosa-6-
fosfotransferasa
 Enzima que cataliza la transferencia de fosfato desde
el ATP al grupo hidroxilo del carbono 6 de la glucosa.
CLASIFICACIÓN DE LAS
ENZIMAS
 Las reacciones y las enzimas que las catalizan se
dividen en 6 clases principales, cada una con
subclases y sub-subclases.
 CLASES DE ENZIMAS:
1- OXIDORREDUCTASAS
2- TRANSFERASAS
3- HIDROLASAS
4- LIASAS
5- ISOMERASAS
6- LIGASAS
Grupo Acción ejemplos
1- ÓXIDO-
REDUCTASAS
Reacciones de
Oxidorreducción de todo
tipo.
Dehidrogenasas
Aminooxidasas
Desaminasas
Catalasas
 
2- TRANSFERA-
SAS
Transfieren grupos
activos
(obtenidos de la ruptura
de ciertas moléculas) a
otras sustancias
receptoras. Suelen actuar
en procesos de inter -
conversión de azúcares,
de aminoácidos, etc.
Transaldolasas
Transcetolasas
Transaminasas
Grupo Acción ejemplos
3- HIDROLASAS
Rompimiento hidrolítico de
enlaces con la consiguiente
obtención de monómeros a
partir de polímeros.
Glucosidasas
Lipasas
Peptidasas
Esterasas
Fosfatasas
4- LIASAS
Degradación de los
enlaces C-C, C-O, C-N,
sin ir acoplados a
sustancias de alto valor
energético. Se incluyen
la eliminación de H2O
dejando un doble enlace.
Aldolasas
Descarboxilasa
s
Hidratasas
Grupo Acción ejemplos
5. ISOMERASAS
Actúan sobre determinadas
moléculas obteniendo de
ellas sus isómeros de función
o de posición.
Ej: Cis Trans
L D
Aldehído Cetona
Isomerasas de
azúcar
Epimerasas
Mutasas
6. LIGASAS
Realizan la síntesis de los
enlaces fuertes mediante
el acoplamiento a
sustancias ricas en
energía como los
nucleósidos del ATP.
Carboxilasas
Péptidosintetasas
09/22/13 49
1. OXIDORREDUCTASAS
Transferencia de electrones o sus equivalentes entre
un donante y un aceptor
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 50
2. TRANSFERASAS
Transferencia de un grupo químico entre un
donante y un aceptor
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 51
3.HIDROLASAS
Rotura de enlaces químicos con la
participación de las moléculas de agua
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 52
4. LIASAS
Reacciones en las cuales se produce la adición o
sustracción de grupos químicos a dobles enlaces
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 53
5. ISOMERASAS
Ínterconversión de dos isómeros
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 54
6. LIGASAS
Unión covalente de dos sustratos mediante la energía de
hidrólisis de nucleósidos trifosfatados (generalmente el ATP)
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 55
¿COMO TRABAJAN LAS ENZIMAS?
 Las enzimas aumentan la velocidad de las
reacciones químicas reduciendo la energía de
activación (concepto)
 Estado de transición (concepto)
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 56
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 57
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 58
09/22/13 59
IONES METALICOS EN LA FIJACION
DEL SUSTRATO Y LA CATALISIS
ENZIMATICA
Metaloenzimas
Enzimas activadas por metales
Como activadores de nucleofilos
Como activadores de electrofilos
Enmascaramiento de nucleofilos
Moldes de coordinación
09/22/13 60
CINÉTICA ENZIMÁTICA
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 61
FACTORES CINETICOS
ENZIMATICOS
 Temperatura
 pH
 Concentración de la enzima
 Concentración de sustrato
 Concentración de cofactores
 Inhibidores
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 62
FACTORES CINETICOS
ENZIMATICOS
 Temperatura
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 63
FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS
 pH
ENZIMA pH OPTIMO
Pepsina 1,5
Tripsina 7,7
Arginasa 9,7
Fumarasa 7,8
Ribonucleasa 7,8
ENZIMAS:
ESTRUCTURA,
CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
09/22/13 64
FACTORES CINETICOS ENZIMATICOSCATALIZADORES
 pH
09/22/13 65
FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS
 pH
 Los enzimas poseen grupos químicos ionizables (carboxilos
-COOH; amino -NH2; tiol -SH; imidazol, etc.) en las cadenas
laterales de sus aminoácidos.
 Según el pH del medio, estos grupos pueden tener carga eléctrica
positiva, negativa o neutra.
 Como la conformación de las proteínas depende, en parte, de sus
cargas eléctricas, habrá un pH en el cual la conformación será la
más adecuada para la actividad catalítica. Este es el llamado pH
óptimo.
CATALIZADORES
09/22/13 66
FACTORES CINETICOS
ENZIMATICOS
 Concentración de la enzima
CATALIZADORES
09/22/13 67
FACTORES CINETICOS
ENZIMATICOS
 Concentración de sustrato
CATALIZADORES
09/22/13 68
FACTORES CINETICOS
ENZIMATICOS
 Cofactores
CATALIZADORES
09/22/13 69
FACTORES CINETICOS
ENZIMATICOS
 Inhibidores
 Ciertas moléculas pueden inhibir la acción catalítica de un
enzima: son los inhibidores.
 Estos inhibidores bien pueden ocupar temporalmente el
centro activo por semejanza estructural con el sustrato
original (inhibidor competitivo) o bien alteran la
conformación espacial del enzima, impidiendo su unión al
sustrato (inhibidor no competitivo) .Inhibidor
competitivoInhibidor no competitivo
CATALIZADORES
09/22/13 70
FACTORES CINETICOS
ENZIMATICOS
 Inhibidores
CATALIZADORES
09/22/13 71
FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS
 Inhibidores
09/22/13 72
FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS
 Inhibidores
09/22/13 73
REGULACIÓN DE LAACTIVIDAD
ENZIMATICA
CATALIZADORES
09/22/13 74
VIDA
PRODUCCION
DE
ATP
SECRECION
TRANSPORTE
SINTESIS DE
BIOMOLECULAS
ABSORCION
FENÓMENOS QUÍMICOS
09/22/13 75
09/22/13 76
CONTROL GENÉTICO
CONTROL COVALENTE
COMPARTIMENTALIZACION
ZIMOGENOS
09/22/13 77
El allostérie (de griego ἄλλως , allos: otro y στερεός, stereós:
forma) es un modo de regulación de las enzimas por el cual la
fijación de una molécula en una ubicación (sitio catalítico)
modifica las condiciones de fijación de otra molécula, en otra
ubicación distante de la proteína.
La fijación de la molécula induce un cambio de conformación
espacial de la proteína enzimática. Es decir, la disposición
espacial de sus átomos constitutivos es modificada. En el marco
del allostérie, esto tiene la consecuencia de modificar la ubicación
del enlace de por lo menos uno de los reactivos implicados en el
09/22/13 78
Los enzimas alostéricos son aquellos cuya actividad es
alterada por la unión de ligandos a sitios distintos a los de
unión al sustrato (sitio alostérico). El ligando puede
activar (efector positivo) o inhibir
(efector negativo) la actividad del enzima.
La unión del efector al sitio alostérico induce un cambio
conformacional que facilita/inhibe la actividad enzimática
09/22/13 79
Son multiméricas, cada monómero fija una molécula.
Poseen por lo menos un eje de simetría.
Existen bajo dos conformaciones diferentes: uno llamado T,
para (tensa), designando convencionalmente la forma de
afinidad débil para el substrato, la otra R, para liberada
(relajada), de afinidad fuerte para el substrato.
En el seno de una proteína, adopta totalmente la misma
configuración, R o T (transición concertada). En otros términos,
no existe híbrido R/T
09/22/13 80
Modelo simetrico
Modelo secuencial
09/22/13 81
09/22/13 82
La cooperatividad (positiva) consiste en que la fijación
de una molécula de substrato favorece la fijación del
Siguiente, y así hasta ocuparse toda la molécula
s s s ss s
s
s
s s
+ + +
1 2 3
Existe también cooperatividad negativa, cuando la fijación
de una molécula de substrato dificulta la fijación del
siguiente.
09/22/13 83
09/22/13 84
09/22/13 85
Inhibidores y activadores
alostéricos
s
0 2 4 6 8 10 12
Y
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
(+ Inhibidor)
(+ Activador)
(sin efectores)
V+
V0
V-
09/22/13 86
09/22/13 87
09/22/13 88
09/22/13 89
09/22/13 90
09/22/13 91
REGULACIÓN COVALENTE DE LA
ACTIVIDAD ENZIMATICA
CATALIZADORES
09/22/13 92
09/22/13 93
09/22/13 94
09/22/13 95
09/22/13 96
Algunos enzimas no se sintetizan como tales, sino como proteínas
precursoras sin actividad enzimática. Estas proteínas se llaman
proenzimas o zimógenos. Para activarse, los zimógenos sufren
un ataque hidrolítico que origina la liberación de uno o varios
péptidos.
09/22/13 97
 Piruvato dhasa
 Fosfofructocinasa
 Isocitrato dhasa
 Fructosa 16 bisfosfatasa
 Acetil CoA carboxilasa
 Citrato sintasa
 HMG COA REDUCTASA
 GLUCOGENO FOSFORILASA
 GLUCOGENO SINTASA
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Enzimologia clinica parte 1

  • 3. 09/22/13 3 CATALIZADORES  Sustancias o compuestos que aceleran las reacciones químicas ASPECTOS GENERALES ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 4. 09/22/13 4 REACCIÓN QUÍMICA  Proceso mediante el cual uno o mas compuestos son transformados en uno o mas compuestos diferentes  ASPECTOS FUNDAMENTALES DE UNA REACCIÓN QUÍMICA  1- velocidad de la reacción  2- alcance de la reacción
  • 5. 09/22/13 5 ENERGETICA DE LAS REACCIONES  Toda reacción química va acompañada de un cambio de energía del sistema reaccionante  Esto determina la dirección, velocidad y alcance de la reacción  TIPOS DE ENERGIA  Cinética. (del movimiento, el calor)  Potencial. (almacenada en las estructuras de las biomoléculas)
  • 6. 09/22/13 6 VELOCIDAD DE REACCION  Nos da una idea de como se lleva a cabo la reacción química  Se determina de acuerdo a la concentración de producto por unidad de tiempo o mediante la desaparición del sustrato  La velocidad de la reacción depende de la concentración de reactantes a cada momento  La velocidad se verá afectada por varios factores como son la temperatura, la presión, etc.
  • 7. 09/22/13 7 ORDEN DE LA REACCION  Si la velocidad es directamente proporcional a la concentración del reactante( primer orden)  Si la velocidad es proporcional al cuadrado de la concentración de los reactantes o al producto de la concentración de 2 reactantes( segundo orden)  Cuando la velocidad de la reacción es independiente de la concentración de los reactantes decimos que es de orden cero
  • 8. 09/22/13 8 REVERSIBILIDAD Y EQUILIBRIO DE LAS REACCIONES  Una reacción es reversible cuando puede realizarse en ambos sentidos  REACTANTE PRODUCTO  PRODUCTO REACTANTE A B
  • 9. 09/22/13 9  La relación entre la concentración de reactantes y la concentración de productos en un momento del equilibrio depende de la naturaleza de los compuestos, la temperatura y la presión  Ke = [DHCP] = 22,2 [GAD3P]  Mientras mayor sea la Ke, mayor es la tendencia a la espontaneidad
  • 10. 09/22/13 10 ENERGIA DE ACTIVACION  Es la diferencia entre la energía que poseen los reactantes y la que deben poseer para poder reaccionar  Mientras mayor es ese valor menor será la velocidad de la reacción  Es una barrera energética que los reactantes deben superar en el desarrollo de la reacción en su camino hacia el producto
  • 11. 09/22/13 11  Si la energía del reactante esta muy lejos de la que debe alcanzar para reaccionar entonces la reacción será lenta  Los catalizadores disminuyen la energía de activación por lo que aumentan la velocidad de la reacción
  • 12. 09/22/13 12 El Sistema Internacional de unidades (SI) ha definido la unidad de actividad enzimática como la cantidad de enzima que transforma 1 mol de sustrato por segundo. Esta unidad se llama katal Unidad de actividad enzimática
  • 13. 09/22/13 13 EN LA CONVERSIÓN DEL REACTANTE EN PRODUCTO OCURRE UNA VARIACIÓN DEL CONTENIDO ENERGÉTICO DEL SISTEMA  Si la energía de los productos es igual a la de los reactantes la reacción es isoergonica  Si la energía de los productos es mayor a la de los reactantes la reacción es endergonica  Si la energía de los productos es menor que la de los reactantes la reacción es exergonica
  • 14. 09/22/13 14 TIPOS DE CATALIZADORES  BIOTICOS: catalizan reacciones en sistemas vivos  ABIOTICOS: su actividad catalítica no esta relacionada necesariamente con sistemas vivos
  • 15. 09/22/13 15 CATALIZADORES CLASIFICACION  ORGANICOS INORGANICOS  Enzimas Metales  Ribozimas Ácidos, sales  ALGUNAS DIFERENCIAS ENTRE ESTOS:  Especificidad de sustrato y/o de reacción  Velocidad de reacción  Capacidad de realizar varias reacciones sin alterar su estructura
  • 16. 09/22/13 16 COMPONENTES FUNDAMENTALES DE UNA REACCION QUIMICA  SUSTRATO CATALIZADOR PRODUCTO    COFACTOR Orgánico Inorgánico Orgánicos Inorgánicos (NAD, FAD, PPT, COA) (ZINC, Mg, Fe++)
  • 17. 09/22/13 17 ENZIMAS Proteínas especializadas en la función catalítica ESTRUCTURA  Centro activo (definición)  Sitio alostérico (definición)
  • 18. 09/22/13 18 CENTRO ACTIVO  Esqueleto peptídico  Grupos de orientación y fijación  Grupos catalíticos ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 22. 09/22/13 22 SECUENCIAS CONSERVADAS EN LOS CENTROS ACTIVOS DE DIFERENTES PROTEASAS ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN Enzima Sec. alrededor de la Serina Sec. alrededor de la Histidina Tripsina DSCQDGSGGPVVCSGK VVSAAHCYKSG Quimotripsina SSCMGDSGGPLVCKKN VVTAAHGGVTT Trombina DACEGDSGGPFVMKSP VLTAAHCLLYP
  • 23. 09/22/13 23 CARACTERISTICAS CONFORMACIONALES DE LOS CENTROS ACTIVOS DE SERIN PROTEASAS ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN Enzima Conformación de su centro activo Quimotripsina Cavidad hidrofóbica que une las cadenas laterales de los aminoácidos aromáticos Tripsina En el fondo de su centro activo hay un Aspartato, que limita la unión de residuos cargados positivamente Elastasa Su centro activo esta ocupado por residuos de aminoácidos con cadenas laterales voluminosas
  • 26. 09/22/13 26 GRUPOS FUNCIONALES ESENCIALES PARA LA CATALISIS EN EL CENTRO ACTIVO DE ALGUNAS ENZIMAS ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN Enzima GRUPOS CATALITICOS Ribonucleasa Ser 112, His 119 Quimotripsina Ser 195, His 57, Asp 102 Lisozima Asp 52, Glu 35 Fructosa 1, 6 bisfosfatasa Glu 327, His 258, His 392 Carboxipeptidasa A Zinc , His 196, His 69, Glu 72
  • 29. 09/22/13 29 ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN SITIO ALOSTÉRICO  Sitio en la enzima diferente al sitio activo o catalítico.  Sitio de regulación.  Une moduladores o efectores que aumentan o disminuyen la actividad de la enzima.  Enzimas reguladoras o alostéricas.
  • 30. 09/22/13 30 ETAPAS DE LA ACCIÓN CATALITÍCA  1-Unión física entre el sustrato y el centro activo de la enzima que da origen al complejo enzima sustrato (reversible)  2-Transformación del sustrato ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 31. 09/22/13 31 TEORIAS DE UNION ENZIMA SUSTRATO  Teoría de la llave y la cerradura (fischer) ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 32. 09/22/13 32  Teoría de la llave y la cerradura (fischer) ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 33. 09/22/13 33 TEORIAS DE UNION ENZIMA SUSTRATO  Teoría del ajuste inducido (Koshland) ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN LYS P P MET MET HS HS LYS LYS
  • 37. NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS en zymc  “en fermento”  Nombre Trivial o Antiguo  Sustrato + asa  Procedencia o Sitio de Acción + asa  Nombre Sistemático  Número Clave  Nombre Recomendado  Sustrato + Acción + asa
  • 38. NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS Nombre Trivial o Antiguo  Sustrato + asa • Amilasa Almidón • Lipasa  Lípidos • Ureasa  Urea  Procedencia o Sitio de Acción + asa • Ptialina (Ptyalos = Saliva) • Tripsina (Triptus = Páncreas) • Pepsina (Pepsus = Estómago) • Renina (Riñón)
  • 39. NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS Nombre Recomendado  Sustrato + Acción + asa • Succinato Deshidrogenasa • Piruvato Carboxilasa • Citrato Sintasa • Triosa P Isomerasa • Fumarato Hidratasa • Glucosa 6 Fosfatasa • Glucosa Oxidasa
  • 40. NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS  Todas las enzimas deben llevar: 1. El nombre del sustrato. 2. El nombre de la reacción química catalizada. 3. Terminación asa.  Ejemplo: Glucosa oxidasa 3. Información adicional, si es necesario aclarar la reacción, puede seguir al paréntesis.
  • 41. 09/22/13 41 CATALIZADORESNombre Sistemático Número Clave: E.C. + 4 dígitos E.C. 2.7.1.1 El primer dígito  clase de enzima. El segundo dígito  subclase de enzima. El tercer dígito  sub-subclase. El cuarto dígito  el número progresivo de orden para la enzima específica.
  • 42. 09/22/13 42COMISIÓN ENZIMÁTICA CÓDIGO NUMÉRICO E C CUATRO NUMEROS SEPARADOS POR PUNTOS NUM 1: CLASE NUM 2: SUBCLASE NUMS 3 Y 4: GRUPOS QUÍMICOS QUE INTERVIENEN EN LA REACCIÓN
  • 43. 09/22/13 43 COMISIÓN ENZIMÁTICA GLUCOQUINASA E C 2.7.1.2 2 TRANSFERASA 7 FOSFOTRANSFERASA 1 EL ACEPTOR ES UN OH 2 EL ACEPTOR ES UN OH DE LA GLUCOSA
  • 44. E. C. 2 .7.1.1  2  denota la clase (una transferasa)  7  subclase (transferencia de fosfato)  1  sub-subclase (una función alcohol como aceptor de fosfato)  1  enzima hexocinasa o ATP: D-hexosa-6- fosfotransferasa  Enzima que cataliza la transferencia de fosfato desde el ATP al grupo hidroxilo del carbono 6 de la glucosa.
  • 45. CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS  Las reacciones y las enzimas que las catalizan se dividen en 6 clases principales, cada una con subclases y sub-subclases.  CLASES DE ENZIMAS: 1- OXIDORREDUCTASAS 2- TRANSFERASAS 3- HIDROLASAS 4- LIASAS 5- ISOMERASAS 6- LIGASAS
  • 46. Grupo Acción ejemplos 1- ÓXIDO- REDUCTASAS Reacciones de Oxidorreducción de todo tipo. Dehidrogenasas Aminooxidasas Desaminasas Catalasas   2- TRANSFERA- SAS Transfieren grupos activos (obtenidos de la ruptura de ciertas moléculas) a otras sustancias receptoras. Suelen actuar en procesos de inter - conversión de azúcares, de aminoácidos, etc. Transaldolasas Transcetolasas Transaminasas
  • 47. Grupo Acción ejemplos 3- HIDROLASAS Rompimiento hidrolítico de enlaces con la consiguiente obtención de monómeros a partir de polímeros. Glucosidasas Lipasas Peptidasas Esterasas Fosfatasas 4- LIASAS Degradación de los enlaces C-C, C-O, C-N, sin ir acoplados a sustancias de alto valor energético. Se incluyen la eliminación de H2O dejando un doble enlace. Aldolasas Descarboxilasa s Hidratasas
  • 48. Grupo Acción ejemplos 5. ISOMERASAS Actúan sobre determinadas moléculas obteniendo de ellas sus isómeros de función o de posición. Ej: Cis Trans L D Aldehído Cetona Isomerasas de azúcar Epimerasas Mutasas 6. LIGASAS Realizan la síntesis de los enlaces fuertes mediante el acoplamiento a sustancias ricas en energía como los nucleósidos del ATP. Carboxilasas Péptidosintetasas
  • 49. 09/22/13 49 1. OXIDORREDUCTASAS Transferencia de electrones o sus equivalentes entre un donante y un aceptor ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 50. 09/22/13 50 2. TRANSFERASAS Transferencia de un grupo químico entre un donante y un aceptor ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 51. 09/22/13 51 3.HIDROLASAS Rotura de enlaces químicos con la participación de las moléculas de agua ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 52. 09/22/13 52 4. LIASAS Reacciones en las cuales se produce la adición o sustracción de grupos químicos a dobles enlaces ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 53. 09/22/13 53 5. ISOMERASAS Ínterconversión de dos isómeros ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 54. 09/22/13 54 6. LIGASAS Unión covalente de dos sustratos mediante la energía de hidrólisis de nucleósidos trifosfatados (generalmente el ATP) ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 55. 09/22/13 55 ¿COMO TRABAJAN LAS ENZIMAS?  Las enzimas aumentan la velocidad de las reacciones químicas reduciendo la energía de activación (concepto)  Estado de transición (concepto) ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 59. 09/22/13 59 IONES METALICOS EN LA FIJACION DEL SUSTRATO Y LA CATALISIS ENZIMATICA Metaloenzimas Enzimas activadas por metales Como activadores de nucleofilos Como activadores de electrofilos Enmascaramiento de nucleofilos Moldes de coordinación
  • 61. 09/22/13 61 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  Temperatura  pH  Concentración de la enzima  Concentración de sustrato  Concentración de cofactores  Inhibidores ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 62. 09/22/13 62 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  Temperatura ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 63. 09/22/13 63 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  pH ENZIMA pH OPTIMO Pepsina 1,5 Tripsina 7,7 Arginasa 9,7 Fumarasa 7,8 Ribonucleasa 7,8 ENZIMAS: ESTRUCTURA, CLASIFICACIÓN, FUNCIÓN
  • 64. 09/22/13 64 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOSCATALIZADORES  pH
  • 65. 09/22/13 65 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  pH  Los enzimas poseen grupos químicos ionizables (carboxilos -COOH; amino -NH2; tiol -SH; imidazol, etc.) en las cadenas laterales de sus aminoácidos.  Según el pH del medio, estos grupos pueden tener carga eléctrica positiva, negativa o neutra.  Como la conformación de las proteínas depende, en parte, de sus cargas eléctricas, habrá un pH en el cual la conformación será la más adecuada para la actividad catalítica. Este es el llamado pH óptimo. CATALIZADORES
  • 66. 09/22/13 66 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  Concentración de la enzima CATALIZADORES
  • 67. 09/22/13 67 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  Concentración de sustrato CATALIZADORES
  • 69. 09/22/13 69 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  Inhibidores  Ciertas moléculas pueden inhibir la acción catalítica de un enzima: son los inhibidores.  Estos inhibidores bien pueden ocupar temporalmente el centro activo por semejanza estructural con el sustrato original (inhibidor competitivo) o bien alteran la conformación espacial del enzima, impidiendo su unión al sustrato (inhibidor no competitivo) .Inhibidor competitivoInhibidor no competitivo CATALIZADORES
  • 71. 09/22/13 71 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  Inhibidores
  • 72. 09/22/13 72 FACTORES CINETICOS ENZIMATICOS  Inhibidores
  • 73. 09/22/13 73 REGULACIÓN DE LAACTIVIDAD ENZIMATICA CATALIZADORES
  • 76. 09/22/13 76 CONTROL GENÉTICO CONTROL COVALENTE COMPARTIMENTALIZACION ZIMOGENOS
  • 77. 09/22/13 77 El allostérie (de griego ἄλλως , allos: otro y στερεός, stereós: forma) es un modo de regulación de las enzimas por el cual la fijación de una molécula en una ubicación (sitio catalítico) modifica las condiciones de fijación de otra molécula, en otra ubicación distante de la proteína. La fijación de la molécula induce un cambio de conformación espacial de la proteína enzimática. Es decir, la disposición espacial de sus átomos constitutivos es modificada. En el marco del allostérie, esto tiene la consecuencia de modificar la ubicación del enlace de por lo menos uno de los reactivos implicados en el
  • 78. 09/22/13 78 Los enzimas alostéricos son aquellos cuya actividad es alterada por la unión de ligandos a sitios distintos a los de unión al sustrato (sitio alostérico). El ligando puede activar (efector positivo) o inhibir (efector negativo) la actividad del enzima. La unión del efector al sitio alostérico induce un cambio conformacional que facilita/inhibe la actividad enzimática
  • 79. 09/22/13 79 Son multiméricas, cada monómero fija una molécula. Poseen por lo menos un eje de simetría. Existen bajo dos conformaciones diferentes: uno llamado T, para (tensa), designando convencionalmente la forma de afinidad débil para el substrato, la otra R, para liberada (relajada), de afinidad fuerte para el substrato. En el seno de una proteína, adopta totalmente la misma configuración, R o T (transición concertada). En otros términos, no existe híbrido R/T
  • 82. 09/22/13 82 La cooperatividad (positiva) consiste en que la fijación de una molécula de substrato favorece la fijación del Siguiente, y así hasta ocuparse toda la molécula s s s ss s s s s s + + + 1 2 3 Existe también cooperatividad negativa, cuando la fijación de una molécula de substrato dificulta la fijación del siguiente.
  • 85. 09/22/13 85 Inhibidores y activadores alostéricos s 0 2 4 6 8 10 12 Y 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 (+ Inhibidor) (+ Activador) (sin efectores) V+ V0 V-
  • 91. 09/22/13 91 REGULACIÓN COVALENTE DE LA ACTIVIDAD ENZIMATICA CATALIZADORES
  • 96. 09/22/13 96 Algunos enzimas no se sintetizan como tales, sino como proteínas precursoras sin actividad enzimática. Estas proteínas se llaman proenzimas o zimógenos. Para activarse, los zimógenos sufren un ataque hidrolítico que origina la liberación de uno o varios péptidos.
  • 97. 09/22/13 97  Piruvato dhasa  Fosfofructocinasa  Isocitrato dhasa  Fructosa 16 bisfosfatasa  Acetil CoA carboxilasa  Citrato sintasa  HMG COA REDUCTASA  GLUCOGENO FOSFORILASA  GLUCOGENO SINTASA APLICACIÓN