Biodiversité de l'Estuaire de la Loire : enjeux avifaunistiques et batrachologiques Foucher Julien (1,2,3), Fonteneau Frédéric(4), Guilloteau Liv(5), Marion Loïc(4), Monin Paul(6) & Montfort Didier(7) 1 ACROLA, 2 GIS Atlantic Flyway Network, 3 Réseau Français d’Ornithologie (RFO), 4 UMR CNRS 6553 Ecobio/Université de Rennes 1, 5 SICGEBLN, 6 ONCFS, 7 Ouest Am’ (France)

1. Biodiversité de l'Estuaire de la Loire : enjeux
avifaunistiques et batrachologiques
Foucher Julien1,2,3
, Fonteneau Frédéric4
, Guilloteau Liv5
, Marion Loïc4
,
Monin Paul6
& MontfortDidier7
1
ACROLA, 2
GIS Atlantic Flyway Network, 3
Réseau Français d’Ornithologie (RFO), 4
UMR CNRS 6553 Ecobio/Université
de Rennes 1, 5
SICGEBLN, 6
ONCFS, 7
Ouest Am’ (France)
Avec le soutien :
ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan.

2. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan. Contexte
Localisation
Estuaire de la Loire
Transformations physiques de
l’estuaire notamment depuis 50 ans
- Accentuation de la chenalisation et de la
profondeur du fleuve
- Coupure du bras du Migron et
atterrissement du bras de la Taillée
- Remblaiements de vasières
- Linéaire de quais industrialo-portuaires
Conséquence : atterrissement rapide
du lit majeur
Zone d’étude : fleuve et bas-marais
estuariens (environ 11000 ha),
Estuaire de la Loire : 20 000ha de
zones humides

3. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan. Contexte
Habitats
Lit mineur : fleuve, vasières, étiers.
Lit majeur : roselières et prairies (dont fossés,
cuvettes et dépressions naturelles).
Evolution
Sources : GIPLE, inventaire des roselières de 2006,
cahier indicateur roselières,2007; Résultats campagne
LIDAR, 2010)

4. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan. Objectif de la présentation
Objectifs :
1_ Présenter l’état actuel des connaissances sur l’avifaune et les
amphibiens de l’estuaire de la Loire
2_ Présenter les outils de gestion déjà en place et en projet

5. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan. Avifaune de l’estuaire de la Loire
Avifaune du lit mineur_effectifs et description du peuplement
- Peuplement d’oiseaux d’eau
caractérisé par une liste plus
restreinte d’espèces (5 sp. d’Anatidés,
2sp. Laridés, 7 sp. de Limicoles avec effectifs >
3 % de l’effectif total d’oiseaux d’eau)
(données 2010-2011, Univ. Rennes1/Ouest
Am‘/GPMNSN)
- Fréquentation maximale du lit
mineur entre novembre et février
(données 2010-2011, Univ. Rennes1/Ouest
Am‘/GPMNSN)

6. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan. Avifaune de l’estuaire de la Loire _ lit mineur
- Espèces caractéristiques : 7 espèces avec effectifs proches ou ≥ 1 % seuil
d’importance internationale (Canard pilet, Canard souchet, Tadorne de Belon,
Grand Gravelot, Avocette élégante, Huîtrier pie, Barge à queue noire).
(données 2010-2011, Univ. Rennes1/Ouest Am‘/GPMNSN)
Effectifs de Sarcelles d'hiver vasières < 1 % au seuil international,
MAIS effectifs vasières + étiers > au seuil presque chaque année !
(effet réserve du Migron) (Wetlands International dpt. 44)

7. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan.
Effectifs reproducteurs : 7 espèces nicheuses d’oiseaux d’eau en 2011
(données Univ. Rennes1/Ouest Am‘/ONCFS/GPMNSN)
Avifaune de l’estuaire de la Loire _ lit mineur
Évolution des effectifs nicheurs de Goélands dans le lit mineur
de l’estuaire de la Loire de 1986 à 2011 (données ONCFS) :
- Diminution notable des effectifs depuis le début des années
2000 pour les Goélands argentés et bruns
90% des Goélands sur le
banc de Bilho

8. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan. Avifaune de l’estuaire de la Loire _lit majeur
Roselières _ Passereaux paludicoles nicheurs
• Rousserolle effarvatte (49% des
captures mai-juin)
• Gorgebleue à miroir (22%)
Caractéristique habitat « roseau » (GIPLE,
2007)
3,2 couples/ha * 300 ha : environ 1000
couples
• Panure à moustaches (16%)
Liée à la présence de litière, exigeante,
Caractéristique habitat « roseau » (GIPLE,
2007)
1,25 *150 ha : environ 190 couples
• Rousserolle turdoïde (3%)
Apprécie les phragmitaies hautes et
denses, avec présence de tiges sèches
d’un diamètre suffisant
Répartie sur l’ensemble de l’Estuaire
0,12*300 ha : environ 36 couples
• Locustelle luscinioïde (2%)
Proportion
Loire-
Atlantique
Pays de
Loire
France
Panure à
moustaches
+ + 3.1%
Gorgebleue à
miroir
56.1% 30.3% 10.6%
Rousserolle
turdoïde
48.0% 31.3% 0.7%
Source : Avifaune prioritaire PdL, 2008

9. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan.
Roselières _ Halte migratoire
Avifaune de l’estuaire de la Loire _ lit majeur
- Phragmite aquatique
Utilisation globale de l’Estuaire par les migrateurs, mais avec des densités différentes, espèce exigeante vis-à-vis de
son habitat (prairie humide haute)
Proportion plus ou moins forte, individus utilisant l’Estuaire dans son ensemble, voire les zones humides adjacentes
comme la Brière
-Phragmite des joncs
Quasi-absent des roselières rivulaires en reproduction (1%
des captures mai-juin) mais omniprésent en migration
(56% en août)
Afflux lors de l’émancipation des jeunes locaux (Brière, …)
Afflux migratoire principalement du nord-Ouest de
l’Europe
Corrélation captures nord et sud-
Loire données ACROLA/ONCFS

10. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan.
Prairies, fossés, cuvettes et dépressions naturelles
(données ONCFS, Cochard et al. 2011)
Avifaune de l’estuaire de la Loire _ lit majeur
- Diminution, jusqu’à disparition, des effectifs nicheurs de Râle des
genêts de 2002 à 2011.
- L’estuaire constitue aussi une zone refuge en période de
reproduction pour de nombreuses espèces d’oiseaux agri-bocagères
d’intérêt patrimonial au niveau régional (Pie-grièche écorcheur CR,
Tarier des prés EN, Bruant proyer VU…).
- Les prairies estuariennes jouent également un rôle important :
Bécassine des marais, repos et alimentation
Repos et alimentation pour les oies, notamment pour l’Oie cendrée
Gagnage nocturne pour les autres anatidés (remises lit mineur et
Grand-Lieu).
- Alimentation des Ardéidés et spatules (estuaire et Grand-Lieu)

11. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan.
Espèces patrimoniales
Amphibiens de l’estuaire de la Loire
le Crapaud calamite (Bufo calamita)
- présent dans milieux anthropisés de l’estuaire
- densités uniques en Régions Pays de la Loire et Bretagne :
entre 15 et 30 individus adultes/ha en 2014 à Donges Est par
exemple (données inédites Ouest Am’ - GPMNSN).
- effectifs remarquables de plusieurs milliers d’individus.
le Pélodyte ponctué (Pelodytes punctatus)
- halotolérant, bien adapté au lit majeur de la Basse-Loire.
- populations parmi les plus importantes du département
- forte responsabilité à l’égard de cette espèce jugée
aujourd’hui « vulnérable » dans les vallées alluviales
françaises (Atlas amphibiens-reptiles S.H.F. 2012).

12. Rouge: réserves
Bleu : terrains du Conservatoire
Mesures de gestion en cours et en projet :
- Futurs plans de gestion des
espaces « naturels » du
Port Nantes-St Nazaire (+800 ha)
- Politique d’acquisition par le
CELRL et de gestion par le Conseil Général
-Réserve du Massereau et du Migron
ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan. Outils de gestion pour la biodiversité dans l’estuaire
Effets « réserves » ? : augmentation des effectifs d’Oies cendrées et de
Sarcelles d’hiver sur la réserve du Migron (données hivernage novembre à
février ONCFS et Wetlands 44)

13. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan.
Mesures de gestion en cours et en projet (suite) :
- Démarche de Parc Naturel Régional
- Projet de Réserve Naturelle Nationale de l’estuaire de la Loire,
- Gestion raisonnée des habitats et des ressources
Exemple pour la chasse : SICGEBLN
mise en place de quotas de chasse,
Création et restauration de mares et de
cuvette naturelles
reproduction Echasse blanche
- Mesures agro-environnementales.
Valorisation du patrimoine naturel (écotourisme) :
- Circuit touristique « La Loire à vélo »,
- Observatoire de Lavau-sur-Loire,
Outils de gestion pour la biodiversité dans l’estuaire

14. ColloqueEcosystèmesestuariens:Quelsenjeuxpourlabiodiversité?
29janvier2015,Royan.
Merci de votre attention !