Las moléculas no son rígidas y vibran con una amplitud que depende de la temperatura. La mayoría de moléculas son diamagnéticas debido a que los electrones están apareados en los orbitales moleculares, mientras que las moléculas con un número impar de electrones o los radicales libres son paramagnéticas. La polaridad de una molécula depende de si tiene enlaces covalentes polarizados y de si la suma de los momentos dipolares es cero o no.