1. MODULO 2.2. INTRODUCCION A LA BIOLOGIA DE ORGANISMOS FUNGOSOS
Dra. María de Jesús Yáñez Morales: Tutor
Noviembre, 2013
yanezmj@colpos.mx. Ofna. 118, Lab. 128
CP-Montecilllo: 595-95-20200, ext. 1663
PROGRAMA GLOBAL:
Principal objetivo: Biología (Sistemática), Método Científico, Diagnóstico
LIBRO GUIA: Crous, P.W., Verkley, G.J.M., Groenewald, J.Z. & Samson, R.A. 2009. Fungal
Biodiversity. CBS. Laboratory manual series. CBS - KNAW - Fungal
Biodiversity Centre. Utrecht, The Netherlands. 269 pp.
OTRAS REFERENCIAS EN: CBS-Fungal Biodiversity Centre
http://www.cbs.knaw.nl/
http://studiesinmycology.org/content/by/year
APS: http://www.apsnet.org/apsstore/shopapspress/Pages/default.aspx
www.mycolog.com
Etc.
-OBJETIVOS GENERALES DEL CURSO:
1. Introducción al estudio científico de los organismos fungosos
2. Identificar las estructuras morfológicas que integran el ciclo biológico de los
organismos fungosos facultativos, biotróficos y saprofíticos.
3. Adquirir el conocimiento básico para el manejo de claves taxonómicas
4. Adquirir parte del conocimiento básico que integra el “diagnóstico” fitopatológico
de organismos fungosos.
CAPITULO I. Generalidades e Introducción
-OBJETIVO ESPECIFICO:
Ubicarse en la biodiversidad/diversidad taxonómica de organismos fungosos
Aplicación de la Sistemática y sus subdisciplinas
Literatura de consulta:
1. Agrios, G.N. 2005. Plant Pathology. 5th. Ed. Academic Press Inc. USA. 635 p.
2. Kendrick, B. 2000. The Fifth Kingdom. Second Ed. Mycologue Publications. Waterloo, Ontario.
Canada. 374 p.
3. Kendrick, B. 2012. The Fifth Kingdom. www.mycolog.com
1
2. 4. Kirk, P.M., Cannon, P.F., David, J.C. and Stalpers, J.A. 2008. Dictionary of the Fungi. CAB
International. Oxon, UK. 655 p.
5. Oliver, R., and Schweizer, M. 1999. Molecular Fungal Biology. Cambridge University Press.
UK. 377 p.
6. Redfern, R. 2002. Orígenes. La Evolución de los Continentes, Los Océanos y la Vida en Nuestro
Planeta. Ediciones Paidós Ibérica. Ed. Paidós. Barcelona. Buenos Aires. Italia. 360 p.
7. Ulloa, M., y Hanlin, R.T. 2006. Nuevo Diccionario Ilustrado de Micología. APS Press. The
American Phytopathological Society. St. Paul, Minnesota. USA 672 p.
8. www.cornell.edu (biodiversidad de hongos), etc.
9. www.mycobank.org/Biolomics.aspx?Table=Mycobank
10. www.cbs.knaw.nl/
CAPITULO II. Reino de los Hongos Verdaderos
Eumycota: “ANAMORFOS”
One fungus one name, one fungus what name? one fungus which gene?
http://www.cbs.knaw.nl/index.php/news/98-news-extra/104-cbs-springsymposium-one-fungus-which-genes-2
-OBJETIVOS ESPECIFICOS:
1. Definir a los hongos verdaderos
2. Identificar las estructuras morfológicas vegetativas y “asexuales” de anamorfos.
3. Ubicar los anamorfos dentro de los organismos fungosos
4. Analizar su biología e importancia económica y científica en agricultura
(ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes).
Literatura de consulta:
Alexopoulos, C.J., Mims, C.W., and Blackwell, M. 1996. Introductory Mycology. Fourth Ed. John
Wiley & Sons, Inc. USA. 869 p.
Barnett, H. L. and Hunter, B.B. 1998. Illustrated Genera of Imperfect Fungi. APS Press. The
American Phytopathology Society. St. Paul, Minnesota. USA. 218 p.
Boerema, G.H., Gruyter, J., Noordeloos, M.E., and Hamers, M.E.C. 2004. Phoma Identification
Manual. CABI Publishing. CAB International. UK. 470 p.
2
3. Borkovich, K., and Ebbole, D.J. (eds). 2010. Cellular and Molecular Biology of Filamentous Fungi.
American Society for Microbiology Press. USA. 788 p.
Cole, G.T., and Samson, R.A. 1979. Patterns of Development in Conidial Fungi. I. Imperfect
Fungi. Pitman Publishing. USA. Toronto, CA. 190 p.
Crous, P.W. and Braun, U. 2003. Mycosphaerella and its anamorphs. 1. Names published in
Cercospora and Passalora. CBS Biodiversity Series 1. Centraalbureau voor
Schimmelcultures. Utrecht, The Netherlands. 571 p.
Deacon, J. 2006. Fungal Biology. Fourth Ed. Blackwell Publishing. England. UK. 371 p.
Ellis, M.B. 1971. Dematiaceous Hyphomycetes. CAB International. Kew, Surrey, England. 608 p.
Ellis, M.B. 1976. More Dematiaceous Hyphomycetes. CAB International. Kew, Surrey, England. 512
p.
McNeill, J., Barrie, F. R., et al. (Eds.). 2006. International Code of Botanical Nomenclature (ICBN)
(Vienna Code). Seventeenth International Botanical Congress Vienna, Austria, July 2005.
568 p.
DESDE International Botanical Congress in Melbourne, Australia in July 2011, Cambió a:
International Code of Nomenclature for algae, fungi and plants
Griffin, D.H. 1994. Fungal Physiology. Second Ed. Wiley-Liss. New York, NY. USA. 458 p.
Noyd, R.K. 2000. Mycology Reference Cards. American Phytopathology Society. St. Paul,
Minnesota. USA. 10 p.
Seifert, K., Morgan-Jones, G., Gams, W. and Kendrick, B. 2011. The Genera of Hyphomycetes.
CBS Biodiversity Series 9. 997 p.
Simmons, E.M. 2007. ALTERNARIA. An Identification Manual. CBS. Fungal Biodiversity Centre.
Utrecht, the Netherlands. 773 p.
Sutton, B.C. 1980. The Coelomycetes. Fungi Imperfecti with Pycnidia Acervuli and Stromata.
Commonwealth Mycological Institute. Kew, Surrey, England. 696 p.
CAPITULO III. Reino Eumycota
Phylum Ascomycota: “Holomorfos” = anamorfo + “teleomorfo”
Ahora: One fungus one name
3
4. -OBJETIVOS ESPECIFICOS:
1. Identificar las estructuras morfológicas “sexuales” de teleomorfos.
2. Clasificar taxonómicamente los tipos de ascoma.
3. Analizar la biología del holomorfo, y su importancia económica y científica en
Agricultura (ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes).
“Tema” de estudio
Bases Biológicas
Taphrinomyctes
Saccharomycetes
“Subtemas”
Reproducción Sexual. El Holomorfo.
Ciclos biológicos. Morfología.
Ascas desnudas. Taphrina deformans
Ascas desnudas. Levaduras.
Ascomycetes
Leotiomycetidae ¡!! (chaesmothecia: cenicilla)
Eurotiomycetidae y Onygenales (cleistotecios)
Sordariomycetidae (peritecios)
Dothideomycetidae (pseudotecios)
Leotiomycetidae, Pezizomycetidae (apotecios)
Lecanoromycetidae (líquenes): apotecios, etc.
Laboulbeniomycetidae (peritecios)
Entomopatógenos
Control Biológico
Literatura de consulta:
Ainsworth, G. C., Sparrow, F.K., and Sussman, A.S. (eds.). 1973. The Fungi. An Advanced
Treatise. Vol. IVA. Academic Press. New York – London. 621 p.
Dennis, R.W.G. 1978. British Ascomycetes. J. Cramer. Vaduz. Germany. 585 p.
Domsch, K.H., Gams, W., and Anderson, T.H. 1980. Compendium of Soil Fungi.
Academic Press. New York, London, England. 859 p.
Vol. 2.
Domsch, K.H., Gams, W. and Anderson, T.H. 2007. Compendium of Soil Fungi. Second Edition.
Academic Press. New York, London, England. 672 pp.
Hanlin, R.T. 1992. Illustrated Genera of Ascomycetes. Vol. I. The American Phytopathology
Society. St. Paul, Minnesota. USA. 263 p.
Hanlin, R.T. 1998. Combined Keys to Illustrated Genera of Ascomycetes. Volumens I & II. APS
Press. USA. 113 p.
4
5. Hanlin, R.T. 1998. Illustrated Genera of Ascomycetes. Vol. II. APS Press. USA. 268 p.
Reynolds, D.R., and Taylor, J.W. 1993. The Fungal Holomorph: Mitotic, Meiotic and Pleomorphic
Speciation in Fungal Systematics. CAB International. UK. 375 p.
Sivanesan, A. 1984. The Bitunicate Ascomycetes and their Anamorphs. J. Cramer. Germany. 701
p.
Wingfield, M.J., Seifert, K.A., and Webber, J.F. 1999. Ceratocystis and Ophiostoma. Taxonomy,
Ecology, and Pathogenicity. APS Press. The American Phytopatological Society. St. Paul,
Minnesota. USA. 293 p.
Phylum Basidiomycota
Reproducción sexual (con o sin basidiocarpo)
-OBJETIVOS ESPECIFICOS:
1. Identificar las estructuras morfológicas del basidiocarpo
2. Clasificar taxonómicamente los tipos de basidios.
3. Analizar la biología, ecología, e importancia económica y científica en agricultura
(ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes).
“Tema” de estudio
“Subtemas”
Agaricomycotina
Bases biológicas (holomorfo).
Dacrymycetes, Tremellomycetes, Agaricomycetes
Glomeromycota
Endo y Ectomicorrizas (asexual)
Ascomycetes y Agaricomycetes (sexual)
Pucciniomycetes
Royas
Ustilaginomycotina
Carbones
Otros Phyla de hongos verdaderos:
Zygomycota ¡!!
Mohos y pudriciones suaves
Esporas con un flagelo posterior: Chytridiomycota y Blastocladiomycota
5
6. Literatura de consulta:
Ainsworth, G.C., Sparrow, F.K., and Sussman, A.S. (eds.). 1973. The Fungi. An Advanced
Treatise. Vol. IVB. Academic Press. New York – London. 504 p.
Cummins, G.B., and Hiratsuka, Y. 2003. Illustrated Genera of Rust Fungi. APS Press. The
American Phytopathology Society St. Paul, Minnesota. USA. 225 p.
Fischer, G.W., and Holton, Ch.S. 1957. Biology and Control of the Smut Fungi. The Ronal Press
Co. NY. USA.
Herrera, T., y Ulloa, M. 1998. El Reino de los Hongos. Universidad Nacional Autónoma de
México. Fondo de Cultura Económica. México. 552 p.
Sneh, B., Burpee, L., and Ogoshi, A. 1991. Identification of Rhizoctonia Species. APS Press. St.
Paul, Minnesota. USA. 135 p.
Vánky, K. 2002. Illustrated Genera of Smut Fungi. APS Press. The American Phytopathology
Society. St. Paul, Minnesota. USA. 238 p.
Vánky, K. 2012. Smut Fungi of the World. APS Press. The American Phytopathology Society. St.
Paul, Minnesota. USA. 1458 p.
CAPITULO IV. Reino de los Hongos Inferiores
-OBJETIVOS ESPECIFICOS:
1. Comparar la unidad del talo “amoeba” con la célula de otros organismos fungosos.
2. Identificar las estructuras morfológicas de reproducción asexual y sexual.
3. Analizar la biología, ecología, e importancia económica y científica en agricultura
(ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes).
.
“Tema” de estudio
“Subtemas”
Myxogastromycetidae
Hongos mucilaginosos.
Plasmodiophoridae
Biotróficos endoparásitos.
Literatura de consulta:
6
7. Herrera, T., y Ulloa, M. 1998. El Reino de los Hongos. Universidad Nacional Autónoma de México. Fondo
de Cultura Económica. México. 552 p.
Stephenson, S.L., and Stempen, H. 1994. Myxomycetes. A Handbook of Slime Molds. Timber Press.
Portland, Oregon. USA. 183 p.
www.eumycetozoa.com
www.mycolog.com
www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=taxonomy
CAPITULO V. Stramenopiles: OOMYCETES
-OBJETIVOS ESPECIFICOS:
1. Identificar las estructuras morfológicas vegetativas, asexuales, y sexuales.
2. Analizar la filogenia del reino, y evolución de especies.
3. Analizar su biología e importancia económica y científica en agricultura
(ciclos biológicos ejemplificados y análisis personal en resúmenes).
“Tema” de estudio
“Subtemas”
Bases Biológicas
Reproducción. Ciclos biológicos.
Morfología.
Pythiales
Pythium spp.
Peronosporales
Phytophthora spp.
Peronosporales
Cenicillas (vellosa)
Literatura de consulta:
Dick, M.W. 2001. Straminipilous Fungi. Kluwer Academic Publishers. The Netherlands. 670 p.
Erwin, D.C., and Ribeiro, O.K. 1996. Phytophthora Diseases Worldwide. APS Press. USA. 562 p.
Gallegly, M. E. and Hong, Ch. 2008. Phytophthora: Identifying Species by Morphology and DNA
Fingerprints. APS Press. USA. 168 pp.
Spencer, D.M. 1981. The Downy Mildews. Academic Press Inc. New York, NY. USA. 636 pp.
7
8. Spencer-Phillips, P. and Jeger, M. 2004. Advances in Downy Mildew Research. Volume 2. Kluwer Academic
Publishers. Dordrecht, The Netherlands. 296 pp.
Spencer, D.M. 2006, 2008. The Downy Mildews.
Streets, R.B. 1972. The Diagnosis of Plant Diseases. The University of Arizona Press. Tucson, Arizona.
11.11 p.
Ristaino, J.B. 2011. Key for Identification of Common Phytophthora Species. APS Press. USA. CD.
van der Plaats-Niterink, J. 1981. Monograph of the genus Pythium. Studies in Mycology. No. 21.
Centraalbureau voor Schimmelcultures, Baarn. Netherlands.
www.biolib.cz/en/taxon/id104800/
http://pythium.plantbiology.msu.edu/
CAPITULO VI. DNA Código de Barras (caracterización molecular)
one fungus which gene?
http://www.cbs.knaw.nl/index.php/news/98-news-extra/104-cbs-springsymposium-one-fungus-which-genes-2
-OBJETIVOS ESPECIFICOS:
1. Usar la biología molecular en taxonomía de hongos
2. Identificar hongos por análisis filogenéticos: “concepto de especie filogenética”
3. Secuenciación (en dos direcciones) de un gene hasta multilocus análisis
Análisis básico:
PCR-ITS de genes rRNA.
Regiones Internas ITS1, ITS2
Etc., etc.
Literatura de consulta de aplicaciones y conceptos básicos:
Ahrens, U., and Seemüller, E. 1992. Detection of DNA of plant pathogenic mycoplasmalike
organisms by polimerasa chain reaction that amplifies a sequence of the 16S rRNA gene.
Phytopathology 82: 828-832.
8
9. Crous, P.W., Verkley, G.J.M., Groenewald, J.Z. & Samson, R.A. 2009. Fungal Biodiversity. CBS.
Laboratory manual series. CBS - KNAW - Fungal Biodiversity Centre. Utrecht, The
Netherlands. 269 pp.
DNA Barcode of Life. www.barcoding.si.edu
http://www.boldsystems.org./views/login.php
www.ncbi.nlm.nih.gov/
White, T. J., Bruns, T., Lee, S., and Taylor, J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal
ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: PCR Protocols: A guide to Methods and
Applications. MA Innis, DH Gelfand, JJ Sninsky, and TJ White (eds.). Academic Press, St.
Diego, CA. USA. p 315-322.
Etc., etc.
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I N *******************************
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