SlideShare uma empresa Scribd logo
1 de 126
Baixar para ler offline
ÔÅÄÅÐÀËÜÍÎÅ ÀÃÅÍÒÑÒÂÎ ÏÎ ÎÁÐÀÇÎÂÀÍÈÞ ÐÔ
 Ðîññèéñêèé õèìèêî-òåõíîëîãè÷åñêèé óíèâåðñèòåò èì. Ä. È. Ìåíäåëååâà


          Ôàêóëüòåò èíôîðìàöèîííûõ òåõíîëîãèé è óïðàâëåíèÿ
        Êàôåäðà êèáåðíåòèêè õèìèêî-òåõíîëîãè÷åñêèõ ïðîöåññîâ



                      Ïîÿñíèòåëüíàÿ çàïèñêà

                  ê äèïëîìíîé ðàáîòå íà òåìó:




  Ìîäåëèðîâàíèå ðàñòâîðèìîñòè îðãàíè÷åñêèõ âåùåñòâ
        â ñâåðõêðèòè÷åñêîì äèîêñèäå óãëåðîäà
         ñ èñïîëüçîâàíèåì ìåòîäîëîãèè QSAR


Çàâ. êàôåäðîé ÊÕÒÏ
ä. ò. í., ïðîôåññîð                                     Ãëåáîâ Ì. Á.


Íàó÷íûé ðóêîâîäèòåëü
ä. ò. í., ïðîôåññîð                                Ìåíüøóòèíà Í. Â.


Êîíñóëüòàíòû:



Ïî îõðàíå îêðóæàþùåé ñðåäû
îò ïðîìûøëåííûõ çàãðÿçíåíèé,
ä. õ. í., ïðîôåññîð                               Ñìåòàííèêîâ Þ. Â.


Ïî îõðàíå òðóäà,
àññèñòåíò êàôåäðû ÁÆÄ                                  Àíîñîâà Å. Á.


Äèïëîìàíò                                            Ìàêñèìîâ Ñ. À.

                               Ìîñêâà
                               2010 ã.
Îãëàâëåíèå
    Ââåäåíèå                                                                       3


1   Ëèòåðàòóðíûé îáçîð                                                             4

    1.1   Ìåòîäîëîãèÿ QSAR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .           4
          1.1.1   Ïîñòàíîâêà çàäà÷è QSAR . . . . . . . . . . . . . . . .           4
          1.1.2   Èñòîðè÷åñêîå ðàçâèòèå QSAR . . . . . . . . . . . . . .           7
          1.1.3   Êëàññèôèêàöèÿ äåñêðèïòîðîâ . . . . . . . . . . . . . .          10
          1.1.4   Íåîáõîäèìûå êà÷åñòâà äåñêðèïòîðîâ . . . . . . . . . .           15
          1.1.5   Îáçîð äåñêðèïòîðîâ . . . . . . . . . . . . . . . . . . .        18
          1.1.6   Ñîçäàíèå âûáîðêè ñîåäèíåíèé . . . . . . . . . . . . .           22
          1.1.7   Ðåãðåññèîííûé àíàëèç: ìíîæåñòâåííàÿ ëèíåéíàÿ ðå-
                  ãðåññèÿ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .   23
    1.2   Ñâîéñòâà ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ è èõ ïðèìåíåíèå . . .                 26
          1.2.1   Ïðîèçâîäñòâî è îáðàáîòêà ïîëèìåðîâ . . . . . . . . .            28
          1.2.2   Ïèùåâàÿ ïðîìûøëåííîñòü          . . . . . . . . . . . . . . .   29
          1.2.3   Ôàðìàöåâòèêà è ìåäèöèíà . . . . . . . . . . . . . . . .         30
          1.2.4   Íîâûå ìàòåðèàëû       . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .   33
          1.2.5   Ñâåðõêðèòè÷åñêèå ðåàêöèîííûå ñðåäû . . . . . . . . .            34
          1.2.6   Áèîòåõíîëîãèÿ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .       35
    1.3   Îáçîð ìîäåëåé ðàñòâîðèìîñòè         . . . . . . . . . . . . . . . . .   36

2   Ýêñïåðèìåíòàëüíûå èññëåäîâàíèÿ ðàñòâîðèìîñòè â ñâåðõ-

    êðèòè÷åñêîì äèîêñèäå óãëåðîäà                                                 43

    2.1   Ïðèáîð äëÿ ïðîâåäåíèÿ èçìåðåíèé ðàñòâîðèìîñòè . . . . . .               43
    2.2   Ïðîâåäåíèå èçìåðåíèé ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . . . . . . . .            45
    2.3   Âû÷èñëåíèå âåëè÷èíû ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . . . . . . . .             47
    2.4   Ýêñïåðèìåíòàëüíûå äàííûå äëÿ ìîäåëèðîâàíèÿ . . . . . . .                48


                                          1
3   Ðàçðàáîòêà èíôîðìàöèîííîé ñèñòåìû äëÿ õðàíåíèÿ è îá-

    ðàáîòêè ðåçóëüòàòîâ ýêñïåðèìåíòàëüíîãî îïðåäåëåíèÿ ðàñ-

    òâîðèìîñòè                                                                52

    3.1   Ñòðóêòóðà èíôîðìàöèîííîé ñèñòåìû . . . . . . . . . . . . .          52
          3.1.1   Ðàçðàáîòêà ñòðóêòóðû áàçû äàííûõ . . . . . . . . . .        54
          3.1.2   Ãðàôè÷åñêèé ïîëüçîâàòåëüñêèé èíòåðôåéñ . . . . . .          59
          3.1.3   Ïîäñèñòåìà àíàëèçà äàííûõ . . . . . . . . . . . . . . .     62
    3.2   Ðàçðàáîòêà QSAR-ìîäåëè . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .      66
          3.2.1   Âûáîðêà ñîåäèíåíèé . . . . . . . . . . . . . . . . . . .    66
          3.2.2   Ïðîñòàÿ ìîäåëü ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . . . . . . . .      66
          3.2.3   Ëèíåéíàÿ ðåãðåññèîííàÿ ìîäåëü . . . . . . . . . . . .       67
          3.2.4   Ïðèìåíåíèå êëàññèôèêàöèè äëÿ óëó÷øåíèÿ ïðåäñêà-
                  çàòåëüíûõ ñâîéñòâ ìîäåëè . . . . . . . . . . . . . . . .    69
          3.2.5   Ïîñòðîåíèå äåðåâà âàðèàíòîâ ðåøåíèé . . . . . . . . .       72

4   Èññëåäîâàíèå ìàòåìàòè÷åñêîé ìîäåëè                                        79

    4.1   Ñòàòèñòè÷åñêèå ñâîéñòâà ìîäåëè . . . . . . . . . . . . . . . .      79
    4.2   Èññëåäîâàíèå êëàññèôèêàöèîííîé çàäà÷è . . . . . . . . . . .         86

    Çàêëþ÷åíèå è âûâîäû                                                       89


5   Îõðàíà îêðóæàþùåé ñðåäû                                                   90


6   Îõðàíà òðóäà                                                              99


    Ëèòåðàòóðà                                                               114


A Ñëàéäû ïðåçåíòàöèè                                                         125




                                        2
Ââåäåíèå

   Â íàøè äíè êîíöåïöèè çåëåíîé õèìèè íàõîäÿò âñå áîëüøåå ïðèìåíåíèå
â ïðàêòèêå ïðîâåäåíèÿ õèìè÷åñêèõ ïðîöåññîâ. Äëÿ îáåñïå÷åíèÿ ýêîëîãè÷å-
ñêîé áåçîïàñíîñòè ïðîèçâîäñòâ ñåãîäíÿ ïîÿâèëàñü îñòðàÿ ïîòðåáíîñòü ñíè-
çèòü ïðèìåíåíèå ãîðþ÷èõ, òîêñè÷íûõ è âçðûâîîïàñíûõ âåùåñòâ â õèìè÷å-
ñêîé òåõíîëîãèè. Îäíèì èç ïåðñïåêòèâíûõ íàïðàâëåíèé ýòîé äåÿòåëüíîñòè
ÿâëÿåòñÿ ïðèìåíåíèå ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ. Ôëþèäû ïðèçâàíû çàìå-
íèòü, ãäå ýòî âîçìîæíî, îðãàíè÷åñêèå ðàñòâîðèòåëè, âûñòóïàÿ â êà÷åñòâå
ðàñòâîðèòåëåé, ýêñòðàãåíòîâ, ñðåä äëÿ ñóøêè [1].
   Ïðè ïåðåõîäå â ñâåðõêðèòè÷åñêîå ñîñòîÿíèå, âåùåñòâî êà÷åñòâåííî ìå-
íÿåò ñâîè ôèçè÷åñêèå è õèìè÷åñêèå ñâîéñòâà: äèýëåêòðè÷åñêóþ ïðîíèöàå-
ìîñòü, êîýôôèöèåíò ñàìîäèôôóçèè, ðàñòâîðÿþùóþ ñïîñîáíîñòü, êèñëîòíî-
îñíîâíûå ñâîéñòâà [2]. Ê íàñòîÿùåìó âðåìåíè ìíîæåñòâî âåùåñòâ èçó÷åíî
â ñâåðõêðèòè÷åñêèõ óñëîâèÿõ, îäíàêî íàèáîëüøåå ïðèìåíåíèå íàõîäèò äè-
îêñèä óãëåðîäà (ÑÊÄÓ)  íåòîêñè÷íîå, íåãîðþ÷åå è äåøåâîå ñîåäèíåíèå ñî
ñðàâíèòåëüíî íèçêèìè êðèòè÷åñêèìè ïàðàìåòðàìè.
   Ïåðåõîäó ê øèðîêîìàñøòàáíîìó ïðèìåíåíèþ ÑÊÄÓ ìåøàåò íå ñòîëü-
êî ñëîæíîñòü àïïàðàòíîãî îôîðìëåíèÿ ïðîöåññîâ, ñêîëüêî íåäîñòàòî÷íàÿ
ÿñíîñòü â ìåõàíèçìàõ ôèçè÷åñêèõ è õèìè÷åñêèõ ïðîöåññîâ â òàêîé ¾ýêçî-
òè÷åñêîé¿ ñðåäå.  ëèòåðàòóðå èìååòñÿ ìíîæåñòâî ðàçíîîáðàçíûõ, ïîðîé
ðàçðîçíåííûõ äàííûõ î ïðîöåññàõ â ÑÊÄÓ, îäíàêî â òåîðåòè÷åñêèõ îáîá-
ùåíèÿõ èìååòñÿ îïðåäåëåííûé äåôèöèò.
   Öåëÿìè íàñòîÿùåé äèïëîìíîé ðàáîòû ÿâëÿþòñÿ:

  1. ñîçäàíèå áàçû äàííûõ äëÿ ñáîðà è àíàëèçà ðåçóëüòàòîâ ýêñïåðèìåí-
     òàëüíîãî îïðåäåëåíèÿ ðàñòâîðèìîñòè îðãàíè÷åñêèõ âåùåñòâ â ñâåðõ-
     êðèòè÷åñêîì äèîêñèäå óãëåðîäà;

  2. ïîñòðîåíèå êîëè÷åñòâåííûõ ìîäåëåé ðàñòâîðèìîñòè îðãàíè÷åñêèõ âå-
     ùåñòâ â ÑÊÄÓ ñ èñïîëüçîâàíèåì ìåòîäîëîãèè QSAR.




                                   3
Ãëàâà 1

Ëèòåðàòóðíûé îáçîð
1.1     Ìåòîäîëîãèÿ QSAR

1.1.1   Ïîñòàíîâêà çàäà÷è QSAR

   Ïîñëåäíåå âðåìÿ îáúåêò ðàññìîòðåíèÿ íàóêè õèìèè âûøåë äàëåêî çà
ðàìêè øêîëüíîãî îïðåäåëåíèÿ: ¾õèìèÿ  íàóêà, êîòîðàÿ ðàáîòàåò ñ õèìè-
÷åñêèìè âåùåñòâàìè¿. Âî-ïåðâûõ, ê ¾õèìè÷åñêîìó âåùåñòâàì¿ ìîæíî îò-
íåñòè âñ¼, ÷òî óãîäíî, íà÷èíàÿ îò ïðîñòûõ âåùåñòâ è çàêàí÷èâàÿ ñëîæíûìè
è íåîäíîðîäíûìè áèîìàññàìè. Âî-âòîðûõ, ïîíÿòèå ¾ðàáîòà ñ õèìè÷åñêèìè
âåùåñòâàìè¿ òàêæå î÷åíü øèðîêî.  ýòó êàòåãîðèþ ïîïàäàþò ñèíòåç íî-
âûõ ñîåäèíåíèé, èçó÷åíèå óæå ïîëó÷åííûõ, ïðîãíîç ñâîéñòâ è êà÷åñòâ åùå
íå èññëåäîâàííûõ âåùåñòâ è ò. ä. Îòäåëüíûì âîïðîñîì ÿâëÿåòñÿ ðàçëè÷èå
ìåæäó ïîíÿòèÿìè ¾âåùåñòâî¿ è ¾ìàòåðèàë¿. Ñîãëàñíî îáùåìó ïðåäñòàâëå-
íèþ, êëþ÷åâûì îáúåêòîì èçó÷åíèÿ õèìèè ÿâëÿþòñÿ ðåàêöèè, è ýòèì õèìèÿ
îòëè÷àåòñÿ îò ôèçèêè. Äåéñòâèòåëüíî, ðåàêöèè â õèìèè èãðàþò íåìàëî-
âàæíóþ ðîëü, íî, ïðåæäå âñåãî õèìèÿ  íàóêà î âåùåñòâàõ.
   Âî âòîðîé ïîëîâèíå XIX âåêà À. Ì. Áóòëåðîâûì è äðóãèìè ó÷åíûìè
áûëà ñîçäàíà òåîðèÿ ñòðîåíèÿ õèìè÷åñêèõ ÷àñòèö, â êîòîðîé ñôîðìóëèðî-
âàí ðÿä îñíîâíûõ ïîíÿòèé è çàêîíîâ âíóòðåííåãî ñòðîåíèÿ ìîëåêóëÿðíûõ
îáðàçîâàíèé. Îí ïèñàë: ¾Èñõîäÿ îò ìûñëè, ÷òî êàæäûé õèìè÷åñêèé àòîì,
âõîäÿùèé â ñîñòàâ òåëà, ïðèíèìàåò ó÷àñòèå â îáðàçîâàíèè ýòîãî ïîñëåäíåãî
è äåéñòâóåò çäåñü îïðåäåëåííûì êîëè÷åñòâîì ïðèíàäëåæàùåé åìó õèìè-
÷åñêîé ñèëû (ñðîäñòâà), ÿ íàçûâàþ õèìè÷åñêèì ñòðîåíèåì ðàñïðåäåëåíèå
äåéñòâèÿ ýòîé ñèëû, âñëåäñòâèå êîòîðîãî õèìè÷åñêèå àòîìû, ïîñðåäñòâåí-


                                   4
íî èëè íåïîñðåäñòâåííî âëèÿÿ äðóã íà äðóãà, ñîåäèíÿþòñÿ â õèìè÷åñêóþ
÷àñòèöó¿ [3]. Ñîãëàñíî òåîðèè õèìè÷åñêîãî ñòðîåíèÿ, ñòðóêòóðà ìîëåêóëû
îïðåäåëÿåò ñîâîêóïíîñòü ôèçèêî-õèìè÷åñêèõ ñâîéñòâ, è, íàîáîðîò, èñõî-
äÿ èç äàííûõ ïî ôèçèêî-õèìè÷åñêèì ñâîéñòâàì, ìîæíî äåëàòü âûâîäû î
ñòðóêòóðå ìîëåêóëû äàííîãî ñîåäèíåíèÿ. Ïîèñê êîððåëÿöèé ìåæäó õàðàê-
òåðîì èçìåíåíèÿ ñâîéñòâ âåùåñòâ è èõ ñòðóêòóðîé îòíîñèòñÿ ê òàê íàçû-
âàåìîé ïðîáëåìå ¾ñòðóêòóðà-ñâîéñòâî¿. Äëÿ ëþáûõ ôèçè÷åñêèõ ñâîéñòâ,
õàðàêòåðèçóþùèõ äàííîå âåùåñòâî, èìåþòñÿ êîíêðåòíûå ÷èñëåííûå çíà-
÷åíèÿ, à äëÿ ñòðóêòóðû ìîëåêóëû îáùåïðèíÿòîé ÷èñëåííîé ìåðû íå ñóùå-
ñòâóåò.
   Ýìïèðè÷åñêèå çàêîíîìåðíîñòè èçìåíåíèÿ ñâîéñòâ âåùåñòâ ñ èçìåíåíè-
åì èõ ñòðóêòóðû, óñòàíîâëåííûå ê ñåðåäèíå XIX â, ëåãëè â îñíîâó êîíöåï-
öèè âçàèìîñâÿçè ñâîéñòâ è ñòðóêòóðû õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé. Îòêðûòûé
Ä. È. Ìåíäåëååâûì Ïåðèîäè÷åñêèé çàêîí ìîæíî ðàññìàòðèâàòü â êà÷åñòâå
íàó÷íîé îñíîâû êîíöåïöèè âçàèìîñâÿçè ñòðîåíèå-ñâîéñòâî, à ïðåäñêàçàíèå
ôèçè÷åñêèõ ñâîéñòâ è ñóùåñòâîâàíèå íåîòêðûòûõ íîâûõ ýëåìåíòîâ ÿâëÿ-
åòñÿ ïåðâûì ïðèìåðîì óñòîé÷èâîé ïðåäñêàçàòåëüíîé ìîäåëè ýòîé âçàèìî-
ñâÿçè.
   Äëÿ èçó÷åíèÿ ñëîæíûõ ïðèðîäíûõ ïðîöåññîâ è ÿâëåíèé ñîçäàþòñÿ èõ
ìîäåëè. Ïðåèìóùåñòâà òàêèõ ìîäåëåé ïî ñðàâíåíèþ ñ îðèãèíàëîì çàêëþ-
÷àåòñÿ, íàïðèìåð, â áîëüøåé äîñòóïíîñòè äëÿ èçó÷åíèÿ, âîçìîæíîñòè ìà-
íèïóëèðîâàíèÿ è áîëüøåãî êîíòðîëÿ, ìåíüøèõ çàòðàòàõ íà èññëåäîâàíèÿ.
Ñðåäè ìîäåëåé ìîæíî âûäåëèòü èêîíè÷åñêíå (ñõîäñòâî ïî ôîðìå), àíà-
ëîãîâûå (ñõîäñòâî ïî ôîðìå è ôóíêöèÿì) è àáñòðàêòíûå (ñèìâîëè÷åñêèå,
êîíöåïòóàëüíûå), ïðåäñòàâëÿþùèå âçàèìîñâÿçü ñ îðèãèíàëîì ñ ïîìîùüþ
ñèìâîëîâ [4].




                      Ðèñ. 1.1. Êîíöåíòðû õèìèè.

                                  5
Èñõîäÿ èç âûøåñêàçàííîãî, îò÷¼òëèâî âûðèñîâûâàåòñÿ ïåðâûé êîíöåíòð
õèìèè. Åãî ñîäåðæàíèå  èçó÷åíèå ìíîãîîáðàçèÿ õèìè÷åñêèõ âåùåñòâ, èõ
îïèñàíèå è ñèñòåìàòèêà. Åñëè èíäèâèäóàëüíîå âåùåñòâî îáîçíà÷èòü ñèìâî-
ëîì X , à ìíîæåñòâî âîçìîæíûõ âåùåñòâ  {Xi }, òî îáíàðóæåíèå è èññëå-
äîâàíèå îòäåëüíûõ âåùåñòâ X , èçó÷åíèå èõ ñîâîêóïíîñòè {Xi }  ýòî è åñòü
öåíòðàëüíàÿ çàäà÷à õèìèè. Ñþäà æå îòíîñèòñÿ èíòåðïðåòàöèÿ ìíîæåñòâà
{Xi }, ò. å. âûÿñíåíèÿ ïðè÷èí, ïî÷åìó ñóùåñòâóþò èìåííî íàáëþäàåìûå âå-
ùåñòâà, à íå êàêèå-íèáóäü äðóãèå [5].
   Åñëè ìû ïðîÿâëÿåì èíòåðåñ ê õèìè÷åñêèì âåùåñòâàì, òî âàæíûìè
ñòàíîâÿòñÿ ñïîñîáû èõ ïîëó÷åíèÿ (ñèíòåç) è èäåíòèôèêàöèÿ (àíàëèç) 
ñîñòàâëÿþùèå âòîðîãî êîíöåíòðà. Òàê ñîâñåì åùå íåäàâíî áîëüøèíñòâî
õèìèêîâ çàíèìàëîñü èìåííî ýòèì. Â íàñòîÿùåå âðåìÿ äîëÿ ñèíòåòèêîâ è
àíàëèòèêîâ ñòàëà ìåíüøå, íî è ïî ñåé äåíü àíàëèç è ñèíòåç ñîñòàâëÿþò
âåñîìóþ ÷àñòü õèìè÷åñêèõ èññëåäîâàíèé.
   Îñíîâíóþ ÷àñòü ñîâðåìåííîé õèìèè, êàê è õèìèè ïðîøëûõ âåêîâ, ñî-
ñòàâëÿþò ïîèñêè è èññëåäîâàíèÿ ôóíêöèîíàëüíûõ çàâèñèìîñòåé âèäà p =
p(X), ãäå X  ïî-ïðåæíåìó, õèìè÷åñêîå âåùåñòâî, à p  êàêîå-ëèáî åãî
ñâîéñòâî.  êà÷åñòâå ñâîéñòâà ìîãóò âûñòóïàòü ìíîãèå âåëè÷èíû: òåìïå-
ðàòóðà ïëàâëåíèÿ, ðåàêöèîííàÿ àêòèâíîñòü, ýëåêòðîïðîâîäíîñòü è ò. ä. Òà-
êèì îáðàçîì, ìîæíî îïðåäåëèòü òå âîïðîñû, êîòîðûå èíòåðåñíû õèìèêó:
¾÷òî ïðîèçîéäåò ñî ñâîéñòâîì (òåìïåðàòóðîé ïëàâëåíèÿ, ýëåêòðîïðîâîäíî-
ñòüþ è ò. ä.), åñëè çàìåíèòü àòîì âîäîðîäà óãëåâîäîðîäíûìè ðàäèêàëàìè
 ìåòèëîì, ýòèëîì, ïðîïèëîì èëè íàòðèÿ êàëèåì, ðóáèäèåì èëè öåçèåì?¿.
   Ïåðåõîäÿ ê îáîáùåííîé õàðàêòåðèñòèêå ôóíäàìåíòàëüíûõ õèìè÷åñêèõ
ïîíÿòèé, îòìåòèì, ÷òî îíè â çíà÷èòåëüíîé ìåðå èìåþò ñòðóêòóðíîå ñî-
äåðæàíèå.  ñâÿçè ñ ýòèì íåîáõîäèìî äîñòàòî÷íî ïîëíî è òî÷íî óÿñíèòü
ñóùíîñòü ìíîãîóðîâíåâîãî ïîíÿòèÿ ñòðóêòóðû.
    îáû÷íîì ïðåäñòàâëåíèè õèìèêè ãîâîðÿò îá àòîìíî-ìîëåêóëÿðíîé ñòðó-
êòóðå. Ñòðóêòóðà  ýòî âñåãäà íåêàÿ ìîäåëü, ïðèáëèæåíèå. Ïðîñòåéøàÿ
èç íûíå äåéñòâóþùèõ ìîäåëåé ñòðóêòóðû  ìîäåëü ëîêàëèçîâàííûõ ìåæ-
àòîìíûõ ñâÿçåé, êîòîðàÿ îïèñûâàåò âåùåñòâî ñ ïîìîùüþ êîíå÷íîé èëè
áåñêîíå÷íîé òî÷å÷íî-øòðèõîâîé ñòðóêòóðíîé ôîðìóëû, ãîâîðÿ äðóãèìè
ñëîâàìè, ñ ïîìîùüþ ãðàôà. Ýòà ìîäåëü ïðèìåíèòåëüíî ê îðãàíè÷åñêèì
ìîëåêóëàì áûëà ñîçäàíà À. Ì. Áóòëåðîâûì, Ô. À. Êåêóëå, À. Ñ. Êóïåðîì.
Äëÿ íåîðãàíè÷åñêîé õèìèè, â ÷àñòíîñòè äëÿ êîîðäèíàöèîííûõ ñîåäèíåíèé,

                                   6
åå èñïîëüçîâàíèå ñòàëî âîçìîæíûì áëàãîäàðÿ ðàáîòàì À. Âåðíåðà. Òàêèì
îáðàçîì, ýòî ñàìàÿ ñòàðøàÿ ïî âîçðàñòó è â òî æå âðåìÿ ñàìàÿ âîñòðåáî-
âàííàÿ è ïîíûíå ìîäåëü ñòðóêòóðû, êîòîðàÿ äîñòàòî÷íî áëèçêà ïî ñìûñëó
ñ òåì, ÷òî íàçûâàþò õèìè÷åñêèì ñòðîåíèåì.
    Ïðîøëî ïîðÿäêà 40 ëåò ñ òåõ ïîð êàê ïàðàäèãìà ¾êîëè÷åñòâåííàÿ ñâÿçü
ñòðóêòóðà  ñâîéñòâî¿ (QSAR) íàøëà ñâîå ïåðâîå ïðèìåíåíèå â ôàðìàöåâ-
òèêå, òîêñèêîëîãèè, àãðîõèìèè è â äðóãèõ íàïðàâëåíèÿõ õèìè÷åñêîé íàóêè.
Ïàðàäèãìà çàêëþ÷àåòñÿ â òîì, ÷òî àêòèâíîñòü (ñâîéñòâî)  ýòî ôóíêöèÿ
ñòðóêòóðû âåùåñòâà, îïèñûâàåìàÿ ñ ïîìîùüþ ýëåêòðîííîãî ñòðîåíèÿ, ãèä-
ðîôîáíîñòè è ñòåðè÷åñêèõ (ãåîìåòðè÷åñêèõ) ñâîéñòâ.


1.1.2      Èñòîðè÷åñêîå ðàçâèòèå QSAR

    Áîëüøå âåêà íàçàä Êðàì-Áðàóí è Ôðåéçåð (Crum-Brown, Fraser) âû-
ñêàçàëè ïðåäïîëîæåíèå, ÷òî ôèçèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà ÿâëÿ-
åòñÿ ôóíêöèåé åãî ñîñòàâà è ñòðîåíèÿ [6]. Íåñêîëüêî äåñÿòèëåòèé ñïóñòÿ, â
1893 ãîäó, Ðèøå (Richet) ïîêàçàë, ÷òî öèòîòîêñè÷íîñòü1 ìíîæåñòâà ðàçíî-
îáðàçíûõ ïðîñòûõ îðãàíè÷åñêèõ ìîëåêóë áûëà îáðàòíî ñâÿçàíà ñ èõ ðàñ-
òâîðèìîñòüþ â âîäå.  íà÷àëå XX âåêà Ìàéåð è Îâåðòîí (Meyer, Overton)
íåçàâèñèìî ïðåäïîëîæèëè, ÷òî íàðêîòè÷åñêîå (ñåäàòèâíîå) äåéñòâèå ãðóï-
ïû îðãàíè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ïðîïîðöèîíàëüíî èõ êîýôôèöèåíòó ðàñïðåäå-
ëåíèÿ â ñèñòåìå ¾îëèâêîâîå ìàñëî  âîäà¿.  1939 ãîäó Ôåðãþñîí (Ferguson)
ïîêàçàë íàëè÷èå çàâèñèìîñòè ñåäàòèâíîãî ýôôåêòà îò äàâëåíèÿ ïàðà ðàñ-
òâîðèòåëÿ íàä èõ ðàñòâîðîì. Ìíîãî÷èñëåííûìè ðàáîòàìè Àëáåðòà, Áåëëà
è Ðîáëèíà (Albert, Bell, Roblin) óñòàíîâëåíî âëèÿíèå ñòåïåíè èîíèçàöèè
îñíîâàíèé è ñëàáûõ êèñëîò íà èõ àíòèáàêòåðèàëüíîå äåéñòâèå [7, 8]. Â ýòî
æå âðåìÿ áûëè ñäåëàíû îãðîìíûå øàãè â èçó÷åíèè ýôôåêòîâ çàìåñòèòåëåé
â îðãàíè÷åñêèõ ðåàêöèÿõ, ïðîèçâåäåííîé Ãàììåòîì (Hammet) [9].
    Òàôò (Taft) ïðåäëîæèë ìåòîä ðàçäåëåíèÿ ýëåêòðîííûõ, ñòåðè÷åñêèõ
(ïðîñòðàíñòâåííûõ) è ðåçîíàíñíûõ ýôôåêòîâ, à òàêæå ââåë ïåðâûé ñòå-
ðè÷åñêèé ïàðàìåòð, Es [10]. Ê íàèáîëåå ðàñïðîñòðàíåííûì ýëåêòðîííûì
  1 Öèòîòîêñè÷íîñòü  cïîñîáíîñòü ôèçè÷åñêèõ âîçäåéñòâèé èëè õèìè÷åñêèõ âåùåñòâ âûçûâàòü ïà-
òîëîãè÷åñêèå èçìåíåíèÿ â êëåòêàõ. Öèòîòîêñè÷åñêîå äåéñòâèå ìîæåò ðåàëèçîâàòüñÿ äâîÿêî:
à) öèòîöèäíûé ýôôåêò  ïðèâîäèò êëåòêó ê ãèáåëè;
á) öèòîñòàòè÷åñêèé ýôôåêò  âûêëþ÷àþùèé êëåòêó èç ñâîåâðåìåííîãî ïðîõîæäåíèÿ ïî êëåòî÷íîìó
öèêëó.



                                             7
ýôôåêòàì îòíîñÿòñÿ èíäóêòèâíûé è ìåçîìåðíûé. Åñëè ïîëîæèòåëüíûé
èëè îòðèöàòåëüíûé çàðÿä ¾ïåðåäàåòñÿ¿ (äåëîêàëèçóåòñÿ) ïî öåïî÷êå àòî-
ìîâ çà ñ÷åò ýëåêòðîñòàòè÷åñêîé èíäóêöèè, òî òàêîé ýëåêòðîííûé ýôôåêò
íàçûâàåòñÿ èíäóêòèâíûì è îáîçíà÷àåòñÿ áóêâîé I . Èíäóêòèâíûé ýôôåêò
âàæåí äëÿ îáúÿñíåíèÿ ïîâåäåíèÿ σ -ýëåêòðîííûõ ñèñòåì, îí äîâîëüíî áûñò-
ðî çàòóõàåò ïî öåïî÷êå àòîìîâ. Ìåçîìåðíûé ýëåêòðîííûé ýôôåêò òåñíî
ñâÿçàí ñ ïîíÿòèåì ¾ðåçîíàíñíûõ ñòðóêòóð¿ è ÷àñòè÷íûì ïåðåìåùåíèåì
ýëåêòðîííûì ïàð îò ìåíåå ýëåêòðîîòðèöàòåëüíîãî ýëåìåíòà èëè ôðàãìåí-
òà ñòðóêòóðû ê áîëåå ýëåêòðîîòðèöàòåëüíûì. Ìåçîìåðíûé ýôôåêò ñëó-
æèò äëÿ îïèñàíèÿ ïîâåäåíèÿ ð-ýëåêòðîííûõ îáëàêîâ, îáðàçóþùèõ π -ñâÿçè.
Ïðîñòðàíñòâåííûå ýôôåêòû ââåäåíû äëÿ îáúÿñíåíèÿ ñâîéñòâ ñîåäèíåíèé,
ñâÿçàííûõ ñ âçàèìíûì ðàñïîëîæåíèåì àòîìîâ ìîëåêóëû â òðåõìåðíîì ïðî-
ñòðàíñòâå. Ïðèìåðîì èñïîëüçîâàíèÿ ñòåðè÷åñêèõ ýôôåêòîâ ìîæåò áûòü
âûñîêàÿ óñòîé÷èâîñòü ê ãèäðîëèçó èìèíà, èçîáðàæåííîãî íà ðèñ. 1.2.




                       Ðèñ. 1.2. Ñòðîåíèå èìèíà.

   Îáû÷íî ñîåäèíåíèÿ ñî ñâÿçüþ Ñ=NH ãèäðîëèçóþòñÿ ïðîñòî âîäîé. Îä-
íàêî ðàññìàòðèâàåìîå ñîåäèíåíèå íå ãèäðîëèçóåòñÿ ïðè êèïÿ÷åíèè â òå-
÷åíèå 8-10 ÷ ñ êîíöåíòðèðîâàííîé ñîëÿíîé êèñëîòîé, 33 % ðàñòâîðîì èëè
10 % ñïèðòîâûì ðàñòâîðîì ãèäðîêñèäà êàëèÿ, íå èçìåíÿåòñÿ ïðè ÷àñîâîì
íàãðåâàíèè ñ ñåðíîé êèñëîòîé ïðè 100◦ C. Îáúÿñíÿåòñÿ ýòî ïðîñòðàíñòâåí-
íûì ñòðîåíèåì ìîëåêóëû, à èìåííî ýêðàíèðîâàíèåì ìåòèëüíûìè ãðóïïàìè
äâîéíîé ñâÿçè, òàêèì îáðàçîì, ðåàêöèÿ èñïûòûâàåò çàòðóäíåíèÿ â ñáëèæå-
íèè âçàèìîäåéñòâóþùèõ àòîìîâ [11].
   Ðàáîòû Ãàììåòà è Òàôòà ïîëó÷èëè äàëüíåéøåå ðàçâèòèå Ãàí÷åì è Ôóä-
æèòîé (Hansch, Fujita), ñôîðìóëèðîâàâøèõ îñíîâû ïîäõîäà QSAR. Â 1962
ãîäó Ãàí÷ è Ìþà (Muir) îïóáëèêîâàëè áëåñòÿùóþ ðàáîòó ïî ÊÑÑÀ äëÿ ðå-

                                  8
ãóëÿòîðîâ ðîñòà ðàñòåíèé, ãäå ïîñòðîåíû çàâèñèìîñòè îò êîñòàíò Ãàììåòà
è ãèäðîôîáíîñòè [12]. Èñïîëüçóÿ ñèñòåìó ¾îêòàíîë  âîäà¿, áûëè èçìåðå-
íû ñåðèè êîýôôèöèåíòîâ ðàñïðåäåëåíèÿ, è òàêèì îáðàçîì ââåäåíà íîâàÿ
øêàëà ãèäðîôîáíîñòè. Ïàðàìåòð π , ïðåäñòàâëÿþùèé ñîáîé îòíîñèòåëüíóþ
ãèäðîôîáíîñòü, áûë îïðåäåëåí ñëåäóþùèì îáðàçîì:

                          πX = log PX + log PH ,

ãäå PX è PH ïðåäñòàâëÿþò ñîáîé êîýôôèöèåíòû ðàñïðåäåëåíèÿ çàìåùåí-
íîé è ðîäèòåëüñêîé ìîëåêóë ñîîòâåòñòâåííî. Ôóäæèòà è Ãàí÷ îáúåäèíèëè
ãèäðîôîáíûå êîíñòàíòû ñ ýëåêòðîííûìè êîíñòàíòàìè Ãàììåòà è ïîëó÷èëè
óðàâíåíèå (ò. í. óðàâíåíèå Ãàí÷à) [13]:

                          log 1/C = aσ + bπ + cκ,

ãäå log 1/C  áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà, a, b, c  êîýôôèöèåíòû,
σ  êîíñòàíòà Ãàììåòà, π  ãèäðîôîáíîñòü ìîëåêóëû ïî Ãàí÷ó, κ  êîýô-
ôèöèåíò ðàñïðåäåëåíèÿ.
   Âïîñëåäñòâèè, êîãäà áûëî ïîêàçàíî íåàäåêâàòíîå îïèñàíèå ëèíåéíû-
ìè óðàâíåíèÿìè â øèðîêèõ äèàïàçîíàõ ãèäðîôîáíîñòè, áûëî ïðåäëîæåíî
ïàðàáîëè÷åñêîå óðàâíåíèå Ãàí÷à [14]:

                  log 1/C = a log P + b(log P )2 + cσ + d,

ãäå log 1/C  áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà, log P  ëèïîôèëüíîñòü
âåùåñòâà (ëîãàðèôì êîýôôèöèåíòà ðàñïðåäåëåíèÿ â ñèñòåìå ¾í-îêòàíîë 
âîäà¿), σ  êîíñòàíòà Ãàììåòà, a, b, c, d  ïîäãîíî÷íûå ïàðàìåòðû.
   Ïîñëå ïðåäëîæåííîé íåëèíåéíîé ìîäåëè ÷èñëî ðàáîò ðåçêî âîçðàñëî.
Áèëèíåéíàÿ ìîäåëü Êóáèíû (Kubinyi)  ýòî óòî÷íåíèå ïàðàáîëè÷åñêîé
ìîäåëè, è â áîëüøèíñòâå ñëó÷àåâ, êàê îêàçàëîñü, îíà ÿâëÿåòñÿ ïðåâîñõîä-
íîé.
                   log 1/C = a log P + b log(βP + 1) + κ,
ãäå log 1/C  áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà, log P  ëèïîôèëüíîñòü,
a, b, β, κ  êîýôôèöèåíòû.
    Êðîìå ïîäõîäà Ãàí÷à áûëè ðàçðàáîòàíû äðóãèå ìåòîäèêè ðåøåíèÿ çà-
äà÷ QSAR.
    Ôðè è Âèëüñîíîì ïðåäëîæåíî óðàâíåíèå [15]:
                                ∑
                           BA =    ai Xi + u,

                                     9
ãäå ÂÀ  ýòî áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü, u  óñðåäíåííûé âêëàä íåçàìå-
ùåííîé ìîëåêóëû, ai  ïðîïîðöèîíàëüíûé êîýôôèöèåíò âêëàäà êàæäîé
ñòðóêòóðíîé ÷àñòè; Xi îïèñûâàåò íàëè÷èå Xi = 1 èëè îòñóòñòâèå Xi = 0
êîíêðåòíîãî ñòðóêòóðíîãî ôðàãìåíòà. Ïðè íàëè÷èè â ñèñòåìå íåêîòîðîãî
íàáîðà çàìåñòèòåëåé â îïðåäåëåííûõ ïîëîæåíèÿõ óäîáíî ïîñòðîèòü ìàò-
ðèöó Ôðè-Âèëüñîíà, îòîáðàæàþùóþ ïðèñóòñòâèå (èëè îòñóòñòâèå) çàìå-
ñòèòåëåé. Îáðàáîòêà òàêîãî ìàññèâà äàííûõ, íàïðèìåð, ñ ïîìîùüþ ìåòî-
äà íàèìåíüøèõ êâàäðàòîâ (ñì. ðàçä. 1.1.7) ïîçâîëÿåò ïîëó÷èòü èñêîìóþ
ôóíêöèîíàëüíóþ çàâèñèìîñòü àêòèâíîñòè îò ïàðàìåòðîâ ñòðóêòóðû.
   Äëÿ ïðåîäîëåíèÿ îãðàíè÷åíèé ìîäåëè Ôðè-Âèëüñîíà ïðåäëîæåíî óðàâ-
íåíèå Ôóäæèòà-Áàí (Fujita-Ban) [16]:
                                   ∑
                        log BA =        Gi Xi + u,

ãäå u îïðåäåëåíà êàê âû÷èñëåííîå çíà÷åíèå áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè íåçà-
ìåùåííîãî èñõîäíîãî ñîåäèíåíèÿ â êîíêðåòíîì îïûòå. Gi ïðåäñòàâëÿåò ñî-
áîé ýíåðãåòè÷åñêèé âêëàä â áèîëîãè÷åñêóþ àêòèâíîñòü çàìåñòèòåëåé, Xi
îïèñûâàåò íàëè÷èå Xi = 1 èëè îòñóòñòâèå Xi = 0 êîíêðåòíîãî ñòðóêòóð-
íîãî ôðàãìåíòà.
   Òîïîëîãè÷åñêèå ìåòîäû èñïîëüçîâàëèñü äëÿ óñòàíîâëåíèÿ ñâÿçè ìåæäó
ñòðóêòóðîé è ôèçè÷åñêîé èëè áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòüþ. Ìåòîä ìèíèìó-
ìà òîïîëîãè÷åñêèõ îòëè÷èé Ñàéìîíà (Simon) è ìíîãî÷èñëåííûå ðàáîòû ïî
ìîëåêóëÿðíîé ñìåæíîñòè Êèðà è Õîëëà (Kier, Hall) îáåñïå÷èëè ðàçâèòèå
QSAR. Èíäåêñû ìàòðèöû ñìåæíîñòè, îñíîâàííûå íà ñêåëåòíûõ ìîëåêó-
ëÿðíûõ ñòðóêòóðàõ (îðãàíè÷åñêèå ìîëåêóëû, èñêëþ÷àÿ àòîìû âîäîðîäà),
äàþò áîãàòóþ èíôîðìàöèþ î ðàçâåòâëåííîñòè, òðåõàòîìíûõ ôðàãìåíòàõ,
óãëå çàìåùåíèÿ, ñõîäñòâå çàìåñòèòåëåé, äëèíå è ãåòåðîàòîìàõ â çàìåùåí-
íûõ êîëüöàõ.
   Èçâåñòíû áîëåå ïîçäíèå ðàçðàáîòêè òåîðèè QSAR, â òîì ÷èñëå HQSAR
(Hologram QSAR), îáðàòíûé QSAR è äâîè÷íûé QSAR [1721].


1.1.3   Êëàññèôèêàöèÿ äåñêðèïòîðîâ

   Âîçìîæíû ðàçëè÷íûå ñïîñîáû êëàññèôèêàöèè äåñêðèïòîðîâ. Òðè òèïà
êëàññèôèêàöèè ðàññìîòðåíû â ñòàòüå [22].
   Äåñêðèïòîðû ïåðâîãî òèïà äåëÿòñÿ íà ÷èñòûå (îïèñûâàþùèå êàêîé-
ëèáî îäèí ýôôåêò ìåæàòîìíûõ âçàèìîäåéñòâèé) è êîìïîçèòíûå (îïèñû-

                                   10
âàþùèå äâà è áîëåå ýôôåêòà). Ñðåäè êîìïîçèòíûõ äåñêðèïòîðîâ, â ñâîþ
î÷åðåäü, âûäåëÿþòñÿ óíèêîìïîçèòíûå (îïèñûâàþùèå ýôôåêòû îäíîãî è
òîãî æå òèïà) è ìóëüòèêîìïîçèòíûå (îòîáðàæàþùèå ñóììó ýôôåêòîâ ðàç-
ëè÷íûõ òèïîâ).
   Âòîðîé òèï êëàññèôèêàöèè îñíîâûâàåòñÿ íà ñïîñîáàõ îöåíêè äåñêðèï-
òîðîâ  ýêñïåðèìåíòàëüíûå èëè òåîðåòè÷åñêèå.
   Òðåòèé òèï êëàññèôèêàöèè îñíîâûâàåòñÿ íà ó÷åòå ýôôåêòà, êîòîðûé
îïèñûâàåò äàííûé äåñêðèïòîð. Ïðåäëàãàåòñÿ ðàññìàòðèâàòü òðè êàòåãîðèè
ýôôåêòîâ: ýëåêòðîííûå (ýëåêòðè÷åñêèå), ñòåðè÷åñêèå è ìåæìîëåêóëÿðíûå.
×àñòíûì ñëó÷àåì èñïîëüçîâàíèÿ ýòîãî òèïà êëàññèôèêàöèè ÿâëÿåòñÿ êëàñ-
ñè÷åñêîå óðàâíåíèå Ãàí÷à (ñì. âûøå), êîòîðîå îïèñûâàåò áèîëîãè÷åñêóþ
àêòèâíîñòü êàê ôóíêöèþ êîíñòàíò Ãàììåòà (ýëåêòðîííûå ýôôåêòû), Òàô-
òà (ñòåðè÷åñêèå ýôôåêòû) è êîíñòàíò ãèäðîôîáíîñòè (òðàíñïîðòíûå ýô-
ôåêòû çà ñ÷åò ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé).
   Äëÿ íàãëÿäíîñòè îïèñàíèÿ ñòðóêòóðû õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ïðåäëà-
ãàåòñÿ èñïîëüçîâàòü ãåîìåòðè÷åñêèå ôèãóðû, ñîîòâåòñòâóþùèå ðàññìàòðè-
âàåìîìó óðîâíþ ñòðóêòóðû: ýëåìåíòíûé óðîâåíü → äâóìåðíàÿ ñòðóêòóðà
→ òðåõìåðíàÿ ñòðóêòóðà → îáúåìíûå ñâîéñòâà → ñòåðåîäèíàìè÷åñêàÿ
ñòðóêòóðà → ñòåðåîýëåêòðîííàÿ ñòðóêòóðà → âçàèìîäåéñòâèÿ ñ îêðóæå-
íèåì. Ïðè ýòîì èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå êàæäîãî óðîâíÿ âêëþ÷àåò
èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ïðåäûäóùåãî óðîâíÿ.




                 Ðèñ. 1.3. Êëàññèôèêàöèÿ äåñêðèïòîðîâ.

   Íà ðèñ. 1.3 ïðåäñòàâëåíà ñõåìà óðîâíåé äåñêðèïòîðîâ, íà êîòîðîé ïî-
ñëåäóþùèé óðîâåíü âêëþ÷àåò èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ïðåäûäóùåãî

                                  11
óðîâíÿ. Ïðè òàêîì ïðåäñòàâëåíèè ïðåäïîëàãàåòñÿ, ÷òî äåñêðèïòîðû ñòðóê-
òóðíîé ôîðìóëû íåñóò âñþ èíôîðìàöèþ, ñîäåðæàùóþñÿ â äåñêðèïòîðàõ
ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ; äåñêðèïòîðû ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû âêëþ÷àþò âñþ
èíôîðìàöèþ, ñîäåðæàùóþñÿ â äåñêðèïòîðàõ ñòðóêòóðíîé ôîðìóëû, à äå-
ñêðèïòîðû ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé ñîäåðæàò âñþ èíôîðìàöèþ
âñåõ ïðåäûäóùèõ óðîâíåé. Èíîãäà äåñêðèïòîðû ìîãóò è íå ñîäåðæàòü èí-
ôîðìàöèþ ïðåäûäóùåãî óðîâíÿ (íàïðèìåð, òàêèå äåñêðèïòîðû ìåæ ìîëå-
êóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé, êàê ïîëÿðèçóåìîñòü, ãèäðîôîáíîcòü, ÷àñòî ðàñ-
ñ÷èòûâàþòñÿ áåç ó÷åòà òðåõìåðíîé ñòðóêòóðû), îäíàêî â öåëîì óêàçàííûé
ïîäõîä ê êëàññèôèêàöèè äåñêðèïòîðîâ ÿâëÿåòñÿ íàãëÿäíûì, îòðàæàåò ñòå-
ïåíü èõ ñëîæíîñòè è, ñëåäîâàòåëüíî, óäîáåí ïðè àíàëèçå. Â äàííîì îáçîðå
ðàññìîòðåí êàæäûé êëàññ äåñêðèïòîðîâ. Ñëåäóåò îòìåòèòü, ÷òî äåñêðèï-
òîð ëþáîãî èç óêàçàííûõ óðîâíåé ìîæåò õàðàêòåðèçîâàòü êàê ìîëåêóëó â
öåëîì, òàê è åå ÷àñòü (ôðàãìåíò, ñêðèí, ôóíêöèîíàëüíóþ ãðóïïó, çàìåñòè-
òåëü).
   Äåñêðèïòîðû ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ.       Áðóòòî-ôîðìóëà ñîäåðæèò èí-
ôîðìàöèþ î ñîðòàõ àòîìîâ, âõîäÿùèõ â ìîëåêóëó, è ÷èñëå àòîìîâ êàæäîãî
ñîðòà. Åäèíñòâåííûì ñâîéñòâîì, êîòîðîå ìîæåò áûòü òî÷íî ïðåäñêàçàíî
íà îñíîâàíèè áðóòòî-ôîðìóëû, ÿâëÿåòñÿ ìîëåêóëÿðíàÿ ìàññà (M W ), êîòî-
ðóþ ìîæíî ðàññìàòðèâàòü êàê äåñêðèïòîð ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ.  êà÷åñòâå
äðóãèõ äåñêðèïòîðîâ ýòîãî óðîâíÿ èíîãäà áåðóò ÷èñëà àòîìîâ êàêîãî-ëèáî
ñîðòà. Â öåëîì æå äåñêðèïòîðû ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ ñîäåðæàò ñëèøêîì
ìàëî èíôîðìàöèè î ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðå è ïîýòîìó íå ìîãóò ñàìîñòî-
ÿòåëüíî èñïîëüçîâàòüñÿ äëÿ âûÿâëåíèÿ ðåàëüíûõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà
 ñâîéñòâî.
   Òîïîëîãè÷åñêèå äåñêðèïòîðû.      Ñòðóêòóðíàÿ ôîðìóëà ìîëåêóëû ÿâ-
ëÿåòñÿ íàèáîëåå ðàñïðîñòðàíåííûì ñïîñîáîì îïèñàíèÿ õèìè÷åñêîãî ñîåäè-
íåíèÿ. Êàê ìîäåëü ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðû òàêàÿ ôîðìóëà ñîäåðæèò ýëå-
ìåíòû èêîíè÷åñêèõ, àíàëîãîâûõ è àáñòðàêòíûõ ìîäåëåé è ÿâëÿåòñÿ îñíî-
âîé äëÿ êîíñòðóèðîâàíèÿ ìíîãèõ âèäîâ äåñêðèïòîðîâ è, ïðåæäå âñåãî, òî-
ïîëîãè÷åñêèõ äåñêðèïòîðîâ. Òîïîëîãè÷åñêèå äåñêðèïòîðû (èíäåêñû) ðàñ-
ñ÷èòûâàþòñÿ íà îñíîâå îïèñàíèÿ ñòðóêòóðíîé ôîðìóëû ñîåäèíåíèÿ ñ ïî-
ìîùüþ ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà, ïðåäñòàâëÿþùåãî ñîáîé äâóìåðíîå îòîáðà-
æåíèå ìîëåêóëû (âåðøèíû ñîîòâåòñòâóþò àòîìàì, à ðåáðà  õèìè÷åñêèì
ñâÿçÿì ìîëåêóëû). Ïðè ýòîì îáû÷íî ðàññìàòðèâàþòñÿ ñêåëåòíûå àòîìû

                                  12
(ñî ¾ñòåðòûìè¿ àòîìàìè âîäîðîäà) è ñâÿçè ìåæäó íèìè. Ìàòðè÷íûé âèä
ãðàôîâ èñïîëüçóåòñÿ äëÿ îöåíêè òîïîëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ. Íàèáîëåå ÷àñòî
ïðèìåíÿþòñÿ ìàòðèöà ñìåæíîñòè A(G) è ìàòðèöà ðàññòîÿíèé D(G).
   Äåñêðèïòîðû ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû ìîëåêóë. Â êâàíòîâî-õèìè-

÷åñêèõ ðàñ÷åòàõ ñëîæíûõ ìîëåêóë èñïîëüçóþòñÿ àòîìíûå è ìîëåêóëÿðíûå
êâàíòîâî-õèìè÷åñêèå äåñêðèïòîðû.  äàííîì ðàçäåëå êðàòêî ðàññìîòðå-
íû òîëüêî êâàíòîâî-õèìè÷åñêèå äåñêðèïòîðû, îïèñûâàþùèå âíóòðèìîëå-
êóëÿðíûå ýëåêòðîííûå ñâîéñòâà. Òàêèì îáðàçîì, â êà÷åñòâå èíäåêñà ìîëå-
êóëÿðíîé ñòðóêòóðû ìîãóò âûñòóïàòü çàðÿäû íà àòîìàõ, ýíåðãèè âûñøåé
çàíÿòîé è íèçøåé ñâîáîäíîé ìîëåêóëÿðíîé îðáèòàëåé, äèïîëüíûé ìîìåíò.
Äåñêðèïòîðû äàííîãî òèïà ìîãóò áûòü ñâîéñòâàìè ìîëåêóëû èëè óêàçû-
âàòü íà êàêîé-òî áîëåå ïðåäïî÷òèòåëüíûé òèï âçàèìîäåéñòâèÿ.
   Ýíåðãèÿ âûñøåé çàíÿòîé (EHOM O ) è íèçøåé íåçàíÿòîé (ELU M O ) ìîëå-
êóëÿðíûõ îðáèòàëåé  äåñêðèïòîðû, êîòîðûå ÷àñòî èñïîëüçóþòñÿ â ðàñ÷å-
òàõ ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû ìîëåêóë [2325]. Óñòàíîâëåíî, ÷òî â ðÿäå ñëó-
÷àåâ çíà÷åíèÿ EHOM O ïðÿìî êîððåëèðóþò ñ ïîòåíöèàëîì èîíèçàöèè (I ) è
õàðàêòåðèçóþò âîñïðèèì÷èâîñòü ìîëåêóëû ê àòàêå ýëåêòðîôèëàìè. Çíà-
÷åíèÿ æå ELU M O êîððåëèðóþò ñ âåëè÷èíîé ñðîäñòâà ê ýëåêòðîíó (À) è õà-
ðàêòåðèçóþò âîñïðèèì÷èâîñòü ìîëåêóëû ê àòàêå íóêëåîôèëàìè. Îòìåòèì,
÷òî I è À èñïîëüçóþòñÿ òàêæå â êà÷åñòâå ñàìîñòîÿòåëüíûõ äåñêðèïòîðîâ
ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû [26, 27]. Ñ÷èòàåòñÿ, ÷òî ðàçíîñòü EHOM O − ELU M O
îòðàæàåò ìåðó ñòàáèëüíîñòè ìîëåêóëû [28]. Ïîíÿòèÿ æåñòêîñòè è ìÿãêî-
ñòè ìîëåêóë ñâÿçàíû èìåííî ñ ýòèìè äåñêðèïòîðàìè ýëåêòðîííîé ñòðóê-
òóðû [29]. Äåñêðèïòîð ìîëåêóëÿðíàÿ æåñòêîñòü (η ):

                                    I −A
                               η=
                                      2
òàêæå íàøåë ïðèìåíåíèå â ñîîòíîøåíèÿõ ñòðóêòóðà  ñâîéñòâî.
   Äåñêðèïòîðû ìîëåêóëÿðíîé ôîðìû.           Â íàñòîÿùåå âðåìÿ íåîáõî-
äèìîñòü ó÷åòà îñîáåííîñòåé ïðîñòðàíñòâåííîé ñòðóêòóðû ïðè âûÿâëåíèè
âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà  ñâîéñòâà î÷åâèäíà. Äîñòàòî÷íî îòìåòèòü, ÷òî
ïðàêòè÷åñêè âñå ñîâðåìåííûå àâòîìàòèçèðîâàííûå ñèñòåìû ïîèñêà íîâûõ
ñîåäèíåíèé ñîäåðæàò â êà÷åñòâå îáÿçàòåëüíûõ ýëåìåíòîâ ðàçëè÷íûå ïðîöå-
äóðû ñðàâíåíèÿ ïðîñòðàíñòâåííûõ ñòðóêòóð ìîëåêóë. Îïèñàíèå òðåõìåð-
íîé ñòðóêòóðû ìîëåêóë êàêèì-ëèáî îäíèì êîëè÷åñòâåííûì äåñêðèïòîðîì
(èëè íàáîðîì äåñêðèïòîðîâ)  äîñòàòî÷íî ñëîæíàÿ çàäà÷à.

                                    13
Êîëè÷åñòâåííîå ñîïîñòàâëåíèå ïðîåêöèé ñòðóêòóðû ìîëåêóë íà òðè îð-
òîãîíàëüíûõ ïëîñêîñòè âïåðâûå áûëî ïðîâåäåíî Ýéìóðîì (Amoore) ïðè
èçó÷åíèè âçàèìîñâÿçè ñòðóêòóðû õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ñ èõ çàïàõîì.
Ãëàâíàÿ ïðîáëåìà, âîçíèêàþùàÿ ïðè ñðàâíåíèè ïàðàìåòðîâ òðåõìåðíîé
ñòðóêòóðû ìîëåêóë ðàçëè÷íûõ ñîåäèíåíèé, ñâÿçàíà ñ èõ êîíôîðìàöèîí-
íîé ïîäâèæíîñòüþ. Ñ ïîÿâëåíèåì äîïîëíèòåëüíîé îñè âíóòðåííåãî âðàùå-
íèÿ ýêñïîíåíöèàëüíî âîçðàñòàåò ÷èñëî âîçìîæíûõ êîíôîðìàöèé, ïîýòîìó
òðåáóþòñÿ îïðåäåëåííûå îãðàíè÷åíèÿ, à òàêæå ñïåöèàëüíûå ïðîöåäóðû îò-
áîðà ðåàëüíûõ êîíôîðìàöèé è ñðàâíåíèÿ èõ ôîðì.
   Â íàñòîÿùåå âðåìÿ ñóùåñòâóåò ðÿä ìåòîäîâ îöåíêè äåñêðèïòîðîâ ìîëå-
êóëÿðíîé ôîðìû.
   Íàèáîëåå ïîïóëÿðíûå ñðåäè òàêèõ ïîäõîäîâ: ìåòîä äèñòàíöèîííîé ãåî-
ìåòðèè, ìîäåëü ñâÿçûâàþùåé ñòîðîíû, àíàëèç ìîëåêóëÿðíîé ôîðìû, îöåí-
êà ìîëåêóëÿðíûõ ïîçèöèé è ïð.
   Äåñêðèïòîðû ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé.           Êîëè÷åñòâåí-
íî îïèñàòü ìåæìîëåêóëÿðíûå âçàèìîäåéñòâèÿ ïðè óñòàíîâëåíèè âçàèìî-
ñâÿçåé ñòðóêòóðà  áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü ìîæíî ñ ïîìîùüþ ðàçíîñòè
ñâîáîäíûõ ýíåðãèé:
                            ∆G = Gf − Gi ,
ãäå Gf è Gi  ñâîáîäíàÿ ýíåðãèÿ êîíå÷íîãî è èñõîäíîãî ñîñòîÿíèé ñîîò-
âåòñòâåííî.
   Íàïðèìåð, ïðè ìîäåëèðîâàíèè âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà-àêòèâíîñòü â
êà÷åñòâå äåñêðèïòîðà äîñòàòî÷íî ÷àñòî èñïîëüçóþòñÿ êîíñòàíòû äèññîöè-
àöèè êèñëîò è îñíîâàíèé (pKa ).
   Çíà÷èòåëüíàÿ ãðóïïà äåñêðèïòîðîâ ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé,
îöåíèâàåìàÿ èç ýêñïåðèìåíòàëüíûõ äàííûõ ïî ðåàêöèîííîé ñïîñîáíîñòè,
ñîñòîèò èç ðàçëè÷íûõ êîíñòàíò, îïèñûâàþùèõ ýëåêòðîííîå âëèÿíèå çàìå-
ñòèòåëåé íà ðåàêöèîííóþ ñïîñîáíîñòü õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé. Îñíîâû ýòî-
ãî íàïðàâëåíèÿ áûëè çàëîæåíû Ãàììåòîì, óñòàíîâèâøèì çíà÷åíèÿ ïàðà-
ìåòðà σ (êîíñòàíòà Ãàììåòà) íà îñíîâå ñîîòíîøåíèÿ:

                          σX = lg KX − lg KH ,

ãäå KX  ñîîòâåòñòâóþùàÿ êîíñòàíòà äëÿ ìåòà- èëè ïàðà-çàìåùåííîé áåí-
çîéíîé êèñëîòû, KH  êîíñòàíòà èîíèçàöèè äëÿ áåíçîéíîé êèñëîòû â âîäå
ïðè 25◦ Ñ.

                                  14
Èíäèêàòîðíûå äåñêðèïòîðû. Ïðè ìîäåëèðîâàíèè âçàèìîñâÿçè ñòðó-

êòóðà-ñâîéñòâî (àêòèâíîñòü) äîñòàòî÷íîå ðàñïðîñòðàíåíèå ïîëó÷èëè èíäè-
êàòîðíûå äåñêðèïòîðû (èíîãäà èõ íàçûâàþò êîíñòàíòû de novo). Îòíåñòè
ýòè äåñêðèïòîðû ê êàêîìó-ëèáî îäíîìó îïðåäåëåííîìó êëàññó òðóäíî, ïî-
ñêîëüêó îíè ìîãóò êîäèðîâàòü â íåÿâíîì âèäå ðàçëè÷íûå ñòðóêòóðíûå îñî-
áåííîñòè ñîåäèíåíèé (ñâîéñòâà äîíîðîâ èëè àêöåïòîðîâ âîäîðîäíîé ñâÿçè,
íàëè÷èå èëè îòñóòñòâèå âîäîðîäíîé ñâÿçè âíóòðè ìîëåêóë, îðòî-ýôôåêòû,
öèñ-òðàíñ- èëè ñòåðåîèçîìåðèþ, ðàçëè÷íûå ôðàãìåíòû è ò. ä.).
   Èíäèêàòîðíûå äåñêðèïòîðû îñîáåííî ïîëåçíû íà ðàííèõ ñòàäèÿõ èñ-
ñëåäîâàíèé. Ñ ïîìîùüþ òàêèõ äåñêðèïòîðîâ ìîãóò ïðåäâàðèòåëüíî ôîð-
ìèðîâàòüñÿ êîìáèíàöèè ðàçëè÷íûõ ïîäâûáîðîê ñîåäèíåíèé ñ ðàññìàòðè-
âàåìûì ñâîéñòâîì äëÿ ïîëó÷åíèÿ îáó÷àþùåé âûáîðêè, ïðåäíàçíà÷åííîé
äëÿ ìîäåëèðîâàíèÿ ñâÿçè ñòðóêòóðà  ñâîéñòâî íà îñíîâå óæå áîëåå óãëóá-
ëåííîãî îïèñàíèÿ ñòðóêòóðû.


1.1.4   Íåîáõîäèìûå êà÷åñòâà äåñêðèïòîðîâ

    ëèòåðàòóðå ïðèíÿòî ëþáóþ âåëè÷èíó, õàðàêòåðèçóþùóþ ñòðóêòóðó
ìîëåêóëû, íàçûâàòü äåñêðèïòîðîì ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðû. Ê íàñòîÿùå-
ìó âðåìåíè îïèñàíî ìíîæåñòâî äåñêðèïòîðîâ. Ïîíÿòíî, ÷òî óãëóáëåíèå
ïðåäñòàâëåíèé î ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðå ïîáóæäàåò ê ñîçäàíèþ åå íîâûõ
ìîäåëåé è íîâûõ äåñêðèïòîðîâ, îòðàæàþùèõ ýòè ïðåäñòàâëåíèÿ. Îïðàâ-
äàíû òàêæå ïîïûòêè ñîçäàíèÿ íîâûõ äåñêðèïòîðîâ, êîòîðûå ïðè ââîäå â
êîìïüþòåðíûå ïðîãðàììû ëó÷øå ïî ñðàâíåíèþ ñ ïðåäûäóùèìè äåñêðèï-
òîðàìè ñîõðàíÿþò è èñïîëüçóþò èíôîðìàöèþ î ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðå.
   Òåì íå ìåíåå, ââîäèòü íîâûå äåñêðèïòîðû öåëåñîîáðàçíî òîëüêî â äâóõ
ñëó÷àÿõ: åñëè íè îäèí èç ñóùåñòâóþùèõ äåñêðèïòîðîâ èëè èõ ñî÷åòàíèå íå
îáåñïå÷èâàþò ñîçäàíèÿ óñòîé÷èâûõ ìîäåëåé ñòðóêòóðà  ñâîéñòâî â ðàñ-
ñìàòðèâàåìîé îáó÷àþùåé âûáîðêå è åñëè íîâûé äåñêðèïòîð îáåñïå÷èâàåò
çíà÷èòåëüíîå óëó÷øåíèå ñòàòèñòè÷åñêèõ êðèòåðèåâ ìîäåëè.
   Íîâûå äåñêðèïòîðû äîëæíû áûòü äîñòóïíû äëÿ îöåíêè èõ çíà÷åíèé,
óäîáíû â èñïîëüçîâàíèè, óíèâåðñàëüíû, äîëæíû ïîëíî îïèñûâàòü äàííóþ
ñòðóêòóðíóþ îñîáåííîñòü è áûòü èíòåðïðåòèðóåìûìè.
   Ê ñîæàëåíèþ, äàëåêî íå âñåãäà óêàçàííûå âûøå òðåáîâàíèÿ ïðèíèìà-
þòñÿ âî âíèìàíèå. Ýôôåêòèâíîñòü äåñêðèïòîðîâ ðàçíûõ êëàññîâ, èñïîëü-


                                  15
çóþùèõñÿ â èññëåäîâàíèÿõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà  áèîëîãè÷åñêàÿ àê-
òèâíîñòü, âûÿâëÿåòñÿ ïðè ñðàâíåíèè ñòàòèñòè÷åñêèõ êðèòåðèåâ ìîäåëåé,
ïîñòðîåííûõ íà ýòèõ äåñêðèïòîðàõ. Íàïðèìåð, â ðÿäå ðàáîò [30, 31] ïðî-
âåäåíî ñðàâíåíèå ìîäåëåé êëàññèôèêàöèè àãîíèñòîâ è àíòàãîíèñòîâ ñðåäè
çàìåùåííûõ ôåíèëýòèëàìèíîâ íà îñíîâå ðÿäà òîïîëîãè÷åñêèõ è ôèçèêî-
õèìè÷åñêèõ äåñêðèïòîðîâ ñ èñïîëüçîâàíèåì ëèíåéíîãî äèñêðèìèíàíòíî-
ãî àíàëèçà, äèñêðåòíî-ðåãðåññèîííîé ìîäåëè è êëàñòåð-çíà÷èìîãî àíàëèçà.
Íàèëó÷øèé ðåçóëüòàò âî âñåõ óêàçàííûõ òèïàõ êëàññèôèêàöèè áûë ïîëó-
÷åí ïðè èñïîëüçîâàíèè äåñêðèïòîðîâ âîäîðîäíîé ñâÿçè [32].
   Ïðè ñîçäàíèè ìîäåëåé ñòðóêòóðà áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü áîëüøîå
çíà÷åíèå â îòáîðå äåñêðèïòîðîâ èìåþò ñîâðåìåííûå ïðåäñòàâëåíèÿ î ïðî-
öåññàõ â îðãàíèçìå, ïðîèñõîäÿùèõ ñ ó÷àñòèåì õèìè÷åñêèõ âåùåñòâ. Íà-
ïðèìåð, â íàñòîÿùåå âðåìÿ ñ÷èòàåòñÿ, ÷òî ñëîæíûé ìåõàíèçì âîçäåéñòâèÿ
âåùåñòâà íà îðãàíèçì ñîñòîèò èç òðåõ ñòàäèé: ôàðìàöåâòè÷åñêîé, ôàðìà-
êîêèíåòè÷åñêîé è ôàðìàêîäèíàìè÷åñêîé. Ôàðìàöåâòè÷åñêàÿ ñòàäèÿ ñâÿçà-
íà ñ ââåäåíèåì âåùåñòâà â îðãàíèçì è âêëþ÷àåò ïðîöåññû äåçèíòåãðàöèè
ãîòîâîé ôîðìû. Ôàðìàêîêèíåòè÷åñêàÿ ñòàäèÿ îïðåäåëÿåòñÿ òðàíñïîðòîì
âåùåñòâà îò ìåñòà ââåäåíèÿ äî êîíêðåòíîé áèîëîãè÷åñêîé ìèøåíè è âêëþ-
÷àåò â ñåáÿ ïðîöåññû àáñîðáöèè, ðàñïðåäåëåíèÿ, ìåòàáîëèçìà è âûäåëåíèÿ.
Íà ýòîé ñòàäèè ñóùåñòâåííîå çíà÷åíèå èìååò ðåàêöèîííàÿ ñïîñîáíîñòü èñ-
õîäíûõ ñîåäèíåíèé è èõ ñïîñîáíîñòü ê êîìïëåêñîîáðàçîâàíèþ. Ôàðìàêî-
äèíàìè÷åñêàÿ ñòàäèÿ õàðàêòåðèçóåòñÿ âçàèìîäåéñòâèåì èñõîäíîãî âåùå-
ñòâà èëè åãî ïðîäóêòîâ ñ áèîëîãè÷åñêèìè ìèøåíÿìè, îáóñëîâëèâàþùèìè
êîíêðåòíûé âèä áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè. Íà ýòîì ýòàïå áîëüøîå çíà÷å-
íèå èìååò òðåõìåðíàÿ ñòðóêòóðà âçàèìîäåéñòâóþùèõ ïàðòíåðîâ. Èñêëþ÷è-
òåëüíàÿ ïîïóëÿðíîñòü òðåõïàðàìåòðîâîãî óðàâíåíèÿ Ãàí÷à-Ôóäæèòû ñâÿ-
çàíà ïðåæäå âñåãî ñ èñïîëüçîâàíèåì äåñêðèïòîðîâ ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû
(êîíñòàíòû Ãàììåòà), ñòåðè÷åñêèõ âçàèìîäåéñòâèé (ñòåðè÷åñêèå êîíñòàí-
òû Òàôòà) è òðàíñïîðòíûõ ñâîéñòâ (êîýôôèöèåíò ðàñïðåäåëåíèÿ â ñèñòåìå
¾í-îêòàíîë  âîäà¿). Ïîäîáíûå ìîäåëè è ñîîòâåòñòâóþùèå óðàâíåíèÿ è â
íàñòîÿùåå âðåìÿ óñïåøíî èñïîëüçóþòñÿ â ìîëåêóëÿðíîì äèçàéíå áèîëîãè-
÷åñêè àêòèâíûõ âåùåñòâ. Íàïðèìåð, íà îñíîâå òðåõ äåñêðèïòîðîâ ïîëó÷åíî
óðàâíåíèå äëÿ ðÿäà áèöèêëè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé, îïèñûâàþùåå èõ ñïîñîá-
íîñòü ñâÿçûâàòü ìóñêàðèíîâûé ðåöåïòîð [33].



                                  16
∑
              lg K = 1.28(±0.15) lg P − 0.09(±0.06)       Ca +

                 +0.27(±0.08)HBA5.3A − 4.58(±0.48),
                                   ˚

ãäå K  êîíñòàíòà ðàâíîâåñèÿ â ðåàêöèè ìåæäó ñóáñòðàòîì è ðåöåïòîðîì;
P  êîýôôèöèåíò ðàñïðåäåëåíèÿ âåùåñòâà â ñèñòåìå ¾îêòàíîë  âîäà¿;
        ˚
HBA5.3A  äåñêðèïòîð, õàðàêòåðèçóþùèé âçàèìîäåéñòâèå äâóõ àêöåïòî-
                                                    ˚
ðîâ âîäîðîäíîé ñâÿçè, íàõîäÿùèõñÿ íà ðàññòîÿíèè 5.3 A; N = 27; r = 0.918;
S = 0.38; F = 41.1.
    Ïåðâûé èç äåñêðèïòîðîâ õàðàêòåðèçóåò òðàíñïîðòíûå âîçìîæíîñòè ñî-
åäèíåíèé, âòîðîé ñâÿçàí ñ ðàñòâîðèìîñòüþ ñîåäèíåíèé â âîäå è èõ ñïîñîá-
íîñòüþ îáðàçîâûâàòü âîäîðîäíûå ñâÿçè ñ äîíîðíûìè öåíòðàìè ðåöåïòîðà,
à òðåòèé äåñêðèïòîð óêàçûâàåò íà âàæíóþ ðîëü ðàññòîÿíèÿ ìåæäó äâóìÿ
êîíêðåòíûìè àêöåïòîðàìè âîäîðîäíîé ñâÿçè ïðè îáðàçîâàíèè ñóáñòðàò-
ðåöåïòîðíîãî êîìïëåêñà.
    Íà ïðèìåðå ýòîé ìîäåëè ðàññìîòðèì âåëè÷èíû, êîòîðûå òðàäèöèîí-
íî èñïîëüçóþòñÿ äëÿ îöåíêè êà÷åñòâà. N  ÷èñëî âåùåñòâ â âûáîðêå, ïî
êîòîðûì ñòðîèòñÿ ìîäåëü. ×åì áîëüøå ÷èñëî N , òåì, êàê ïðàâèëî, âûøå
ïðåäñêàçàòåëüíàÿ ñèëà ìîäåëè. r  êîýôôèöèåíò ëèíåéíîé êîððåëÿöèè.
×åì áëèæå çíà÷åíèå r ê åäèíèöå, òåì òî÷íåå âûïîëíÿåòñÿ ãèïîòåçà î ëè-
íåéíîì õàðàêòåðå çàâèñèìîñòè. Â ïðîòèâîïîëîæíîñòü êîýôôèöèåíòó ëè-
íåéíîé êîððåëÿöèè ñòàíäàðòíîå îòêëîíåíèå S ÿâëÿåòñÿ àáñîëþòíîé ìåðîé
ïðèãîäíîñòè ìîäåëè. ×åì íèæå çíà÷åíèå S , òåì ìåíüøå îøèáêà ïðîãíîçè-
ðîâàíèÿ ìîäåëè. F  êðèòåðèé Ôèøåðà  îäèí èç íàèáîëåå èçâåñòíûõ
îáîáù¼ííûõ ñòàòèñòè÷åñêèõ êðèòåðèåâ îöåíêè êà÷åñòâà ìîäåëèðîâàíèÿ.
Áîëåå ïîäðîáíî ýòè âåëè÷èíû äëÿ ñëó÷àÿ ìíîæåñòâåííîé ëèíåéíîé ðåãðåñ-
ñèè ðàññìàòðèâàþòñÿ â ðàçäåëå 1.1.7.
    Ïðè ñîçäàíèè ìîäåëåé íåîáõîäèìî ñîáëþäåíèå è ôîðìàëüíûõ êðèòåðè-
åâ. Ñ òî÷êè çðåíèÿ ñòàòèñòèêè ÷èñëî ðàññìàòðèâàåìûõ ñîåäèíåíèé äîëæ-
íî âî ìíîãî ðàç ïðåâûøàòü ÷èñëî äåñêðèïòîðîâ. Ïðè ýòîì äåñêðèïòîðû
äîëæíû áûòü äîñòàòî÷íî èíôîðìàòèâíûìè è â òî æå âðåìÿ ìåæäó íèìè
íå äîëæíî áûòü âçàèìíîé êîððåëÿöèè. Äîñòèãàåòñÿ ýòî ðàçëè÷íûìè ïðî-
öåäóðàìè, âêëþ÷àÿ ýêñïåðèìåíòàëüíûé äèçàéí, ìåòîä SIMCA/PLS, ãëàâ-
íîêîìïîíåíòíûé è ôàêòîðíûé àíàëèçû.



                                   17
1.1.5   Îáçîð äåñêðèïòîðîâ

Òîïîëîãè÷åñêèå è òåîðåòèêî-èíôîðìàöèîííûå èíäåêñû

Òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû.      Êàê îòìå÷àëîñü âûøå, áîëüøàÿ ÷àñòü òîïî-
ëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ ñòðîèòñÿ ïðè ïîìîùè ìàòðèöû ñâÿçíîñòè è ìàòðèöû
êðàò÷àéøèõ ðàññòîÿíèé ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà. Íàèáîëåå ðàñïðîñòðàíåí-
íûìè òîïîëîãè÷åñêèìè èíäåêñàìè, ðàññ÷èòûâàåìûìè íà îñíîâå ìàòðèöû
ñìåæíîñòè, ÿâëÿþòñÿ èíäåêñ Ïëàòà F (G) (ðàâåí ñóììå ñòåïåíåé êàæäî-
ãî ðåáðà â ãðàôå G); èíäåêñ Ãîðäîíà-Ñêàíòëáåðè Y (G) (ðàâåí ÷èñëó ïó-
òåé äëèíû 2); èíäåêñ ïîëíîé ñìåæíîñòè A′ (G) (ðàâåí ñóììå âñåõ íåíóëå-
âûõ ýëåìåíòîâ ìàòðèöû ñìåæíîñòè); èíäåêñ ñâÿçíîñòè Ðàíäè÷à χ(G) (áó-
äåò îáñóæäàòüñÿ íèæå), èíäåêñû çàãðåáñêîé ãðóïïû M (G) è Ì′ (G). Ñðå-
äè äåñêðèïòîðîâ, ðàññ÷èòûâàåìûõ íà îñíîâå ìàòðèöû ðàññòîÿíèé, ìîæíî
îòìåòèòü èíäåêñ Âèíåðà W (G), èíäåêñ Õîñîéè Z(G), ÷èñëî ïîëÿðíîñòè
P (G), èíäåêñ ñóììû ðàññòîÿíèé S(G), èíäåêñ ðàññòîÿíèé ìåæäó âåðøèíà-
ìè V DI(G).




Ðèñ. 1.4. Ñõåìà ïîëó÷åíèÿ òîïîëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ è èíôîðìàöèîííî-
òîïîëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ.

   ×èñëî ïóòåé â ìîëåêóëÿðíîì ãðàôå îïðåäåëåííîé äëèíû.           ×èñ-
ëî ïóòåé ìåæäó âåðøèíàìè äëèíû ¾1¿ (P1 ), ò.å. ÷èñëî õèìè÷åñêè ñâÿçàí-
íûõ ïàð àòîìîâ, ÷èñëî ïóòåé äëèíû ¾2¿ èëè èíäåêñ Ãîðäîíà-Ñêàíòëáåðè
(P2 , Y ), ÷èñëî ïóòåé äëèíû ¾3¿ (P3 ) ïîëó÷àþò ïðîñòûì ïîäñ÷åòîì êîëè-
÷åñòâà åäèíèö, äâîåê èëè òðîåê â îäíîì èç òðåóãîëüíèêîâ ñèììåòðè÷íîé
ìàòðèöû êðàò÷àéøèõ ðàññòîÿíèé.
   Èíäåêñ Âèíåðà    W ðàâåí ñóììå ñâÿçåé, ñóùåñòâóþùèõ ìåæäó âñåìè



                                  18
ïàðàìè ¾òÿæåëûõ¿ àòîìîâ â ãðàôå ìîëåêóëû ñ n âåðøèíàìè:

                                    1∑
                                         n
                                W =       gD (ij).
                                    2 i,j

Èíäåêñ Âèíåðà W (G)  ïåðâûé òîïîëîãè÷åñêèé èíäåêñ, èñïîëüçîâàííûé
â õèìèè. Èíäåêñ Âèíåðà è ðîäñòâåííûå åìó òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû ÷à-
ñòî èñïîëüçóþò â èññëåäîâàíèÿõ ¾ñòðóêòóðà-ñâîéñòâî¿ äëÿ õàðàêòåðèñòè-
êè êîìïàêòíîñòè ìîëåêóë. Îäíàêî, íåîáõîäèìî ïîìíèòü, ÷òî â ìàòðèöå D
â êà÷åñòâå ðàññòîÿíèÿ ìåæäó àòîìàìè ðàññìàòðèâàåòñÿ ÷èñëî ñâÿçåé, ðàç-
äåëÿþùèõ ýòè àòîìû. ×òîáû ïðèáëèçèòü îïèñàíèå ñòðóêòóðû ñ ïîìîùüþ
ìàòðèöû ðàññòîÿíèé ê ðåàëüíîé ñèòóàöèè, ïðåäëîæåíî èñïîëüçîâàòü â êà-
÷åñòâå íå äèàãîíàëüíûõ ýëåìåíòîâ ìàòðèöû óñðåäíåííûå (òèïè÷íûå) ðàñ-
ñòîÿíèÿ ìåæäó àòîìàìè â ìîëåêóëàõ, ïîìåùåííûõ â òðåõìåðíóþ ðåøåòêó,
èëè ðàññòîÿíèÿ, îïðåäåëåííûå ïî ýêñïåðèìåíòàëüíûì äàííûì, ëèáî ïîëó-
÷åííûå íà îñíîâå êâàíòîâî-õèìè÷åñêèõ ðàñ÷åòîâ.
   Èíäåêñ Ðàíäè÷à      χ(1) õàðàêòåðèçóåò ìîëåêóëÿðíóþ ñâÿçíîñòü:
                                   ∑
                            χ(1) =   (vi vj )−1/2 ,
                                     (i,j)

ãäå  vi è vj ñòåïåíè âåðøèí ãðàôà, ò. å. ñîîòâåòñòâóþùåãî êîëè÷åñòâà
ñâÿçåé âåðøèí i è j.
   Êèð è Õîëë óâèäåëè â ñõåìå Ðàíäè÷à îñíîâó äëÿ ðàçâèòèÿ îáùåãî ìå-
òîäà îïèñàíèÿ ñòðóêòóð îðãàíè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ñ èñïîëüçîâàíèåì ïðåä-
ëîæåííîãî èìè ïîíÿòèÿ ìîëåêóëÿðíîé ñâÿçíîñòè. Ïåðâîå óðàâíåíèå äëÿ
òîïîëîãè÷åñêîãî èíäåêñà âûãëÿäåëî òàê:
                                     ∑
                            1
                                X=       (δi δj )(−1/2) ,

ãäå δ ñîîòâåòñòâóåò ÷èñëó ñîñåäíèõ àòîìîâ (áåç ó÷åòà àòîìîâ âîäîðîäà).
Ýòî óðàâíåíèå èäåíòè÷íî óðàâíåíèþ äëÿ èíäåêñà Ðàíäè÷à. Îäíàêî, àâ-
òîðû ðàñøèðèëè ðàññìàòðèâàåìûé ïîäõîä, ðàñïðîñòðàíèâ ôðàãìåíòàöèþ
                                                            (0  ∑          )
ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà íå òîëüêî íà ñâÿçè, íî è íà àòîìû     X = (δ)(−1/2) ,
à òàêæå íà ôðàãìåíòû ñ íåñêîëüêèìè ñâÿçÿìè. Íàïðèìåð, ïðè ðàññå÷åíèè
ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà íà ôðàãìåíòû ñ äâóìÿ ñâÿçÿìè îöåíèâàåòñÿ èíäåêñ
(2     ∑                )
   X = (δi δj δk )(−1/2) , ïðè ðàññå÷åíèè ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà íà ôðàãìåí-
                                         (      ∑               )
òû ñ òðåìÿ ñâÿçÿìè îöåíèâàåòñÿ èíäåêñ 3 X = (δi δj δk δl )(−1/2) è ò. ä. Êðî-

                                        19
ìå òîãî, ðàñ÷åò òàêèõ èíäåêñîâ ñòàë ïðîâîäèòüñÿ è äëÿ ìîëåêóë, ñîäåðæà-
ùèõ ãåòåðîàòîìû. Ïðè ýòîì àòîìû âîäîðîäà ïðè ãåòåðîàòîìàõ (êàê è ðàíåå
àòîìû âîäîðîäà ïðè óãëåðîäå) íå ïðèíèìàëèñü â ðàñ÷åò.
   Ïîçæå Êèð è Õîëë ïðåäëîæèëè îáùåå âûðàæåíèå äëÿ îöåíêè δv ëþáîãî
àòîìà:
                              δv = Zv − h,
ãäå Zv  ÷èñëî âàëåíòíûõ ýëåêòðîíîâ ñ ó÷åòîì ýëåêòðîíîâ íåïîäåë¼ííûõ
ýëåêòðîííûõ ïàð, à h  ÷èñëî àòîìîâ âîäîðîäà ïðè ýòîì àòîìå (èìåþ-
ùèõñÿ â ñòðóêòóðíîé ôîðìóëå, íî îòñóòñòâóþùèõ â ìîëåêóëÿðíîì ãðàôå).
Òàê, çíà÷åíèå δv äëÿ àòîìà óãëåðîäà áåíçîëà ðàâíî òðåì (òàêîé àòîì èìååò
÷åòûðå âàëåíòíûõ ýëåêòðîíà è ñîåäèíåí ñ îäíèì àòîìîì âîäîðîäà), çíà÷å-
íèå δv äëÿ àòîìà êèñëîðîäà â ñïèðòàõ ðàâíî ïÿòè (òàêîé àòîì èìååò øåñòü
âàëåíòíûõ ýëåêòðîíîâ è ñîåäèíåí ñ îäíèì àòîìîì âîäîðîäà), à â ïðîñòûõ
ýôèðàõ ðàâíî øåñòè (òî æå ÷èñëî âàëåíòíûõ ýëåêòðîíîâ, íî îòñóòñòâóþò
àòîìû âîäîðîäà ïðè ãåòåðîàòîìå).
    ïîñëåäóþùèõ ðàáîòàõ Êèðà è Õîëëà áûëî ïðåäëîæåíî êîëè÷åñòâåí-
íî îïèñûâàòü âçàèìíîå âëèÿíèå àòîìîâ íà îñíîâå èíäåêñîâ ýëåêòðîííîãî
ñîñòîÿíèÿ. Çíà÷åíèÿ S ëþáîãî àòîìà îöåíèâàþòñÿ ïî ôîðìóëå:

                              S = I + ∆I,
                                         I −I
                          I = δvδ , ∆I = ir2 j ,
                                +1
                                             ij


ãäå r  ÷èñëî ñâÿçåé ìåæäó äâóìÿ ðàññìàòðèâàåìûìè àòîìàìè.
   Èíäåêñû Êèðà è Õîëëà äîñòàòî÷íî øèðîêî èñïîëüçîâàëèñü ïðè ïîèñêå
êîëè÷åñòâåííûõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà-ñâîéñòâî. Èõ ïîïóëÿðíîñòü ìîæ-
íî îáúÿñíèòü ïðîñòîòîé ðàñ÷åòà è íàãëÿäíûì ïðåäñòàâëåíèåì ñòðóêòóðíûõ
ôîðìóë ðàññìàòðèâàåìûõ ñîåäèíåíèé.
   Îäíàêî îïèñàíèå îñîáåííîñòåé ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû ÷èñëîì âàëåíò-
íûõ ýëåêòðîíîâ, à ðàññòîÿíèé ìåæäó àòîìàìè  ÷èñëîì ñâÿçåé ìåæäó íè-
ìè ÿâëÿåòñÿ ñëèøêîì óïðîùåííûì äëÿ âûÿâëåíèÿ ðåàëüíîé ìîëåêóëÿðíîé
ñòðóêòóðû. Îòñþäà ïîíÿòíà êðèòèêà âîçìîæíîñòè èñïîëüçîâàíèÿ óêàçàí-
íûõ èíäåêñîâ äëÿ íàõîæäåíèÿ ðåàëüíûõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà  áèîëî-
ãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü.
   Èíäåêñ ñðåäíåêâàäðàòè÷íûõ ðàññòîÿíèé            D2:
                                 ∑      2
                              2   iP i
                                 ∑ i ,
                             D =
                                   i Pi

                                   20
ãäå Pi  ÷èñëî ïàð â ìàòðèöå D(G), ðàññòîÿíèå ìåæó êîòîðûìè ðàâíîé i.
   Èíäåêñû çàãðåáñêîé ãðóïïû:
                            ∑                          ∑
                                  2
                 M1 (G) =        vi ,   M2 (G) =               (vi vj ).
                            i                          (i,j)

 ïåðâîì âûðàæåíèè ñóììèðîâàíèå ïðîâîäèòñÿ ïî âñåì âåðøèíàì, à âî
âòîðîì  ïî âñåì ïàðàì ñâÿçàííûõ àòîìîâ. Íàèáîëüøåå ñîáñòâåííîå çíà-
÷åíèå λmax ìàòðèöû ñìåæíîñòè A(G) êàê òîïîëîãè÷åñêèé èíäåêñ áûë ïðåä-
ëîæåí â êà÷åñòâå ìåðû êîëè÷åñòâà ðàçâåòâëåíèé â ñòðóêòóðå ãðàôà.

Òåîðåòèêî-òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû.                   Îñîáîé ãðóïïîé òîïîëîãè÷åñêèõ
èíäåêñîâ ÿâëÿþòñÿ òàê íàçûâàåìûå òåîðåòèêî-òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû, îñ-
íîâàííûå íà èñïîëüçîâàíèè óíèâåðñàëüíîé ôîðìóëû Øåííîíà äëÿ îöåíêè
íåîäíîðîäíîñòè (èíôîðìàöèè) ëþáîé ñèñòåìû. Ïðåäïîëîæèì, ÷òî ñòðóê-
òóðà ìîëåêóëû îïðåäåëåííûì îáðàçîì ðàçáèòà íà ïîäìíîæåñòâà. Òîãäà,
âû÷èñëèâ âåðîÿòíîñòü ïîïàäàíèÿ òîãî èëè èíîãî ýëåìåíòà â çàäàííîå ïîä-
ìíîæåñòâî, ìîæíî îöåíèòü èíôîðìàöèþ î ðàñïðåäåëåíèè âñåõ ýëåìåíòîâ
ïî ïîäìíîæåñòâàì (ôîðìóëà Øåííîíà):
                                  ∑ ni              ni
                     Inf o = −               log2      (áèò),
                                    i
                                        n           n
ãäå ni  êîëè÷åñòâî ýëåìåíòîâ â ïîäìíîæåñòâå i, à n  ñóììàðíîå êîëè-
                                                     ∑
÷åñòâî âñåõ ýëåìåíòîâ ñèñòåìû, ðàâíîå n =                i ni .    ýòîì âûðàæåíèè ëî-
ãàðèôì áåðåòñÿ ïî îñíîâàíèþ 2, ÷òî ñîîòâåòñòâóåò èíôîðìàöèè âûðàæåí-
íîé â áèòàõ. Íà îñíîâå ôîðìóëû Øåííîíà ââåäåíû ñëåäóþùèå òåîðåòèêî-
èíôîðìàöèîííûå èíäåêñû.
   Íåîäíîðîäíîñòü ðàñïðåäåëåíèÿ ðàññòîÿíèé ìåæäó âåðøèíàìè â ãðàôå,
èñïîëüçóåòñÿ äëÿ õàðàêòåðèñòèêè ðàçâåòâëåííîñòè ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòó-
ðû. Çäåñü ñòåïåíü íåîäíîðîäíîñòè ñòðóêòóðû, îöåíèâàåòñÿ íà îñíîâå àíà-
ëèçà ðàñïðåäåëåíèÿ ðàññòîÿíèé ìåæäó âåðøèíàìè ãðàôà. Òîãäà ni = Pi 
êîëè÷åñòâî ñâÿçåé äëèíû ¾i¿, à n  îáùåå êîëè÷åñòâî êðàò÷àéøèõ ðàññòîÿ-
íèé ìåæäó âñåìè ïàðàìè àòîìîâ ñòðóêòóðû. ×àñòî áûâàåò óäîáíî èñïîëü-
çîâàòü îáùåå êîëè÷åñòâî èíôîðìàöèè â ïåðåñ÷åòå íà ãðàô  T ID :

                                T ID = n · I D ,

   Èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ãðàôà îòíîñèòåëüíî îêðåñòíîñòåé k -ãî
ïîðÿäêà  ICk , ïðåäñòàâëÿåò ñîáîé èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå â ðàñ÷åòå

                                        21
íà îäíó âåðøèíó:
                                   ∑
                         ICk = −        pi log2 pi ,
                                   i
ãäå pi  âåðîÿòíîñòü òîãî, ÷òî âûáðàííàÿ ñëó÷àéíûì îáðàçîì âåðøèíà ãðà-
ôà (àòîì) ïîïàäåò â i-òîå ïîäìíîæåñòâî, ïðè÷åì âû÷èñëÿåòñÿ îíà ñ ó÷åòîì
îêðóæåíèÿ.
   T ICk  ïîëíîå èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå  ìåðà ñëîæíîñòè â ðàñ÷åòå
íà îäèí ãðàô:
                           T ICk = n · ICk
   SICk  ñòðóêòóðíîå èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå:
                                         ICk
                            SICk =
                                        log2 n
   BICk  èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ñâÿçûâàíèÿ:
                                         ICk
                           BICk =              ,
                                       log2 Nb

ãäå Nb  ïîëíîå ÷èñëî ðåáåð (êîâàëåíòíûõ ñâÿçåé) â ìîëåêóëÿðíîì ãðàôå.
   CICk  êîìïëåìåíòàðíîå èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå:

                         CICk = log2 n − ICk .


1.1.6   Ñîçäàíèå âûáîðêè ñîåäèíåíèé

   Â ïîäãîòîâêå ê ïðîöåññó àíàëèçà QSAR íåîáõîäèìî îñâåòèòü îòáîð ñî-
åäèíåíèé, êàê íåìàëîâàæíóþ ÷àñòü àíàëèçà. Îäíèì èç ïåðâûõ ðó÷íûõ ìå-
òîäîâ áûë ìåòîä Êðåéãà (Craig), êîòîðûé ðàññìàòðèâàë äâóìåðíûå ãðà-
ôèêè âàæíûõ ôèçèêî-õèìè÷åñêèõ ñâîéñòâ. Âíèìàíèå óäåëÿëîñü âûáîðó
çàìåñòèòåëåé èç âñåõ ÷åòûðåõ êâàäðàíòîâ ãðàôèêà [34]. Cõåìà Òîïëèññà
(Topliss) ïîçâîëÿëà åìó, íà÷àâ ñ äâóõ ñîåäèíåíèé ïîñòðîèòü ãðàô, ð¼áðà
êîòîðîãî ñîåäèíÿëè ìíîæåñòâî çàìåñòèòåëåé, ðàñøèðÿåìîå â ïîøàãîâîì
ðåæèìå [35]. Òîïëèññ ïîçæå ïðåäëîæèë ïåðèîäè÷åñêóþ ñõåìó, âêëþ÷àþ-
ùóþ ïðîâåðåííûå çàìåñòèòåëè, òàêèå êàê 3,4-Cl2 ; 4-Cl; 4-CH3 ; 4-OCH3 è
4-Í-àíàëîãè [36]. Äðóãèå ìåòîäû ðó÷íîãî îòáîðà çàìåñòèòåëåé âêëþ÷àþò
ìåòîä ïîèñêà Ôèáîíà÷÷è, ïîøàãîâàÿ ñèìïëåêñíàÿ ñòðàòåãèÿ è ïàðàìåòð,
ââåäåííûé Ìåãè (Magee) [3739].


                                   22
Îäèí èç ïåðâûõ ìàøèííûõ ìåòîäîâ àíàëèòè÷åñêîãî îòáîðà  êëàñòåð-
íûé àíàëèç, ïðåäëîæåííûé Ãàí÷åì, ïðèçâàí áûë óñêîðèòü ïðîöåññ ðàçäå-
ëåíèÿ çàìåñòèòåëåé. Áîëåå íîâûå ìåòîäèêè, âêëþ÷àþùèå D-îïòèìàëüíûå
ïëàíèðîâàíèå, êîòîðîå îñíîâàíî íà èñïîëüçîâàíèè îïðåäåëèòåëÿ äèñïåðñè-
îííî-êîâàðèàöèîííîé ìàòðèöû. Äåòåðìèíàíò ìàòðèöû  ýòî ÷èñëî, ìàêñè-
ìàëüíîå äëÿ ñîåäèíåíèé, ïîêàçûâàþùèõ ìàêñèìóì äèñïåðñèè è ìèíèìóì
êîâàðèàöèè [4042]. Ñâîþ ïîëüçó ïîêàçàëî ñî÷åòàíèå íåïîëíîãî ôàêòîðíî-
ãî ìîäåëèðîâàíèÿ è îñíîâíûì ìåòîäîâ QSAR. Äîïîëíåíèå ýòîãî ìåòîäà,
èñïîëüçóþùåå ìíîãîìåðíîå ìîäåëèðîâàíèå, îêàçàëîñü ïåðñïåêòèâíûì äëÿ
ïîèñêà êîëè÷åñòâåííûõ ñîîòíîøåíèé ¾ñòðóêòóðà  ñâîéñòâî¿ îêðóæàþùåé
ñðåäû ñ íåñïåöèôè÷åñêèìè ðåàêöèÿìè, ãäå èñïîëüçîâàíèå êëàññè÷åñêîãî
êëàñòåðíîãî àíàëèçà çàòðóäíåíî â âèäó ÷àñòè÷íîãî ïåðåêðûòèÿ êëàñòå-
ðîâ [43]. Äëÿ äàííûõ, èìåþùèõ ÷åòêóþ êëàñòåðèçàöèþ íà íåñêîëüêî êëàñ-
ñîâ ñîåäèíåíèé, îïèñàíà äðóãàÿ ñòðàòåãèÿ, êîòîðàÿ âêëþ÷àåò ëîêàëüíûé
ìíîãîìåðíûé àíàëèç âíóòðè êàæäîãî êëàñòåðà. Îòîáðàííûå âïîñëåäñòâèè
ñîåäèíåíèÿ ïîñëå ëîêàëüíîãî àíàëèçà îáúåäèíÿþòñÿ â îáùèé íàáîð, õàðàê-
òåðèçóþùèé âñå êëàñòåðû [44].


1.1.7   Ðåãðåññèîííûé àíàëèç: ìíîæåñòâåííàÿ ëèíåéíàÿ

        ðåãðåññèÿ

   Ñðåäè ìàòåìàòè÷åñêèõ ìåòîäîâ, èñïîëüçóåìûõ äëÿ ïîñòðîåíèÿ ìîäåëåé
QSAR, íàèáîëåå øèðîêî èçâåñòåí ìíîæåñòâåííûé ðåãðåññèîííûé àíàëèç
(multilinear regression analysis, MRA). Ðåãðåññèîííûé àíàëèç  ñòàòèñòè-
÷åñêàÿ ìåòîäèêà äëÿ óñòàíîâëåíèÿ çàâèñèìîñòè ìåæäó ñâîáîäíûìè (íåçà-
âèñèìûìè) ïåðåìåííûìè è çàâèñèìîé ïåðåìåííîé (ôóíêöèåé), íàïðèìåð,
áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòüþ.
   Â ìåòîäå MRA ïðèíÿòû ñëåäóþùèå äîïóùåíèÿ:

  1. Íåçàâèñèìûå ïåðåìåííûå, êîòîðûå ïðåäñòàâëÿþò ñîáîé ÷àùå âñåãî
     ôèçèêî-õèìè÷åñêèå ïàðàìåòðû, èçìåðåíû áåç îøèáîê. Íî, ê ñîæàëå-
     íèþ, íå âñåãäà áûâàþò ñëó÷àè, êîãäà îøèáêà àðãóìåíòîâ ñëàáî ñîïî-
     ñòàâèìà ñ îøèáêîé ôóíêöèè.

  2. Äëÿ ëþáîãî çàäàííîãî çíà÷åíèÿ Õ, çíà÷åíèÿ Y íåçàâèñèìû è îáðàçó-
     þò íîðìàëüíîå ðàñïðåäåëåíèå. Âåëè÷èíà îøèáêè Ei èìååò íîðìàëü-

                                  23
íîå ðàñïðåäåëåíèå ñ öåíòðîì â íóëå.

  3. Îæèäàåìûå çíà÷åíèÿ ïåðåìåííîé Y äëÿ âñåõ çíà÷åíèé Õ ëåæàò íà
     ïðÿìîé ëèíèè.

  4. Îòêëîíåíèå îò ëèíèè ðåãðåññèè ïîñòîÿííî. ¾Ëó÷øàÿ¿ ïðÿìàÿ ëèíèÿ
     äëÿ ìîäåëè ïðîâîäèòñÿ ÷åðåç òî÷êè òàêèì îáðàçîì, ÷òî ñóììà êâàä-
     ðàòîâ âåðòèêàëüíûõ ðàññòîÿíèé îò òî÷åê äî ëèíèè ìèíèìàëüíà. Yobs
     ïðåäñòàâëÿåò ñîáîé èçìåðåííîå çíà÷åíèå ðàññìàòðèâàåìîé òî÷êè, à
     Ycalc ïðåäñêàçàííîå çíà÷åíèå, ïðèíàäëåæàùåå ëèíèè.

   Ñóììà êâàäðàòîâ îòêëîíåíèé èëè ôóíêöèîíàë íåâÿçêè:
                                        ∑
                                 SS =       (Yobs − Ycalc )2 ,

ãäå Yobs = aXi + b + Ei , Ycalc = aXi + b. Ñëó÷àéíàÿ îøèáêà èçìåðåíèÿ
Ei = Yobs − (aXi + b).
                ∑
                n                ∑                  ∑
                       Ei2   =          2
                                     ∆ = SS =           (Yobs − Ycalc )2 .
                 i=1

   ×òîáû ìèíèìèçèðîâàòü ôóíêöèîíàë íåâÿçêè, íåîáõîäèìî âçÿòü ÷àñò-
íûå ïðîèçâîäíûå ïî êîýôôèöèåíòàì óðàâíåíèÿ ðåãðåññèè, ïðèðàâíÿòü èõ
ê íóëþ è ðåøèòü ñèñòåìó ëèíåéíûõ àëãåáðàè÷åñêèõ óðàâíåíèé:
                  {           ∑
                       ∂SS
                             = −2(Yobs − aXi − b) = 0
                        ∂b
                              ∑
                       ∂SS
                        ∂a   = −2Xi (Yobs − aXi − b) = 0.

Óðàâíåíèÿ ìîæíî ïåðåïèñàòü â âèäå:
                        { ∑       ∑     ∑
                         b Xi + a Xi2 = Xi Yobs
                              ∑     ∑
                         b + a Xi = Yobs .

Ðåøàÿ äàííóþ ñèñòåìó óðàâíåíèé, ïîëó÷èì çíà÷åíèÿ êîýôôèöèåíòîâ a è b.
Áîëåå äåòàëüíî ïðîöåäóðû àíàëèçà ðàññìîòðåíû â èñòî÷íèêàõ [13, 4547].
   Äëÿ ðåãðåññèîííîãî àíàëèçà (X T X) · B = X T Y , îòêóäà ñëåäóåò B =
(X T X)−1 X T Y , ãäå B  ñòîëáåö êîýôôèöèåíòîâ, (X T X)  èíôîðìàöèîí-
íàÿ ìàòðèöà.
   Äëÿ ñòàòèñòè÷åñêîé îöåíêè ðåçóëüòàòîâ ðåãðåññèè èñïîëüçóþò êîýôôè-
öèåíò êîððåëÿöèè r, îáùóþ äèñïåðñèþ SST , îñòàòî÷íóþ äèñïåðñèþ SSQ

                                             24
è ñòàíäàðòíîå îòêëîíåíèå s.
                                            ∆2
                                r2 = 1 −    SST
                       ∑                 ∑       ∑ 2
                 SST = (Yobs − Ycalc )2 = y 2 − ( ny)
                   ∑ 2            ∑
                      ∆ = SSQ = (Yobs − Ycalc )2
                          √∑           √
                               ∆2        SSQ
                       s = n−k−1 = n−k−1 .


Êîýôôèöèåíò êîððåëÿöèè r  ìåðà êà÷åñòâà ïðèãîäíîñòè ìîäåëè, îñíî-
âàííàÿ íà äèñïåðñèè äàííûõ. Â èäåàëüíîé ñèòóàöèè æåëàòåëüíî, ÷òîáû
êîýôôèöèåíò êîððåëÿöèè áûë ðàâåí èëè áëèçîê ê åäèíèöå, íî â ðåàëüíî-
ñòè èç-çà ïðèñóòñòâèÿ â áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ îøèáîê, âåëè÷èíû êîòîðûõ
íåèçâåñòíû, ïðèíèìàåòñÿ, ÷òî ëþáîå çíà÷åíèå ñâûøå 0,9 áóäåò äîïóñòè-
ìûì. Ñòàíäàðòíîå îòêëîíåíèå s ÿâëÿåòñÿ àáñîëþòíîé ìåðîé ïðèãîäíîñòè
ìîäåëè.  ñàìîì ëó÷øåì ñëó÷àå s äîëæåí ñòðåìèòüñÿ ê íóëþ, íî â ðåàëü-
íûõ ýêñïåðèìåíòàõ ýòî äàëåêî íå òàê. Âåëè÷èíà s ìîæåò áûòü îòëè÷íîé
îò íóëÿ, ÷òî îáúÿñíÿåòñÿ ýêñïåðèìåíòàëüíûìè îøèáêàìè â èñõîäíûõ äàí-
íûõ è, êàê ïðàâèëî, íåñîâåðøåíñòâîì ìîäåëè. Áëüøàÿ âûáîðêà äàííûõ è
                                             î
óìåíüøåíèå ÷èñëà ïåðåìåííûõ ÷àùå âñåãî ïðèâîäèò ê ñíèæåíèþ çíà÷åíèé
ñðåäíåêâàäðàòè÷íîãî îòêëîíåíèÿ. ×àñòî äëÿ îïðåäåëåíèÿ óðîâíÿ ñòàòè-
ñòè÷åñêîé çíà÷èìîñòè (àäåêâàòíîñòè) ðåãðåññèîííîé ìîäåëè èñïîëüçóþòñÿ
êâàíòèëè ðàñïðåäåëåíèÿ Ôèøåðà F :

                                    SS1 − SS2 n − k2 − 1
                  Fk2 −k1 ,n−k2 =            ·           .
                                      SS2       k2 − k1
   Áîëåå çíà÷èìîé êîððåëÿöèè ñîîòâåòñòâóåò áîëüøåå çíà÷åíèå êðèòåðèÿ
Ôèøåðà. Äîâåðèòåëüíûå èíòåðâàëû êîýôôèöèåíòîâ â óðàâíåíèè ïîêàçû-
âàþò çíà÷èìîñòü êàæäîãî ÷ëåíà â óðàâíåíèè ðåãðåññèè.
   ×òîáû ïîëó÷èòü ñòàòèñòè÷åñêè çíà÷èìóþ ìîäåëü QSAR, íåîáõîäèìî
äåðæàòü â ïàìÿòè ñäåëàííûå äîïóùåíèÿ. Âàæíî ïîëó÷èòü èíôîðìàöèþ î
êîëëèíåàðíîñòè ìåæäó ïåðåìåííûìè è ñëó÷àéíûõ êîððåëÿöèÿõ. Èñïîëüçî-
âàíèå êîððåëÿöèîííî-êîâàðèàöèîííîé ìàòðèöû îáåñïå÷èâàåò îðòîãîíàëü-
íîñòü ïåðåìåííûõ äðóã äðóãó. Íàðÿäó ñ áûñòðûì ðàçðàñòàíèåì ÷èñëà ïà-
ðàìåòðîâ îñîáîå âíèìàíèå ñëåäóåò óäåëèòü íåäîïóùåíèþ ÷ðåçìåðíîãî êî-
ëè÷åñòâà ïåðåìåííûõ â àíàëèòèêå QSAR. Òîïëèññ íàãëÿäíî ïîêàçàë, ÷òî


                                       25
ñóùåñòâóåò âûñîêèé ðèñê îêîí÷àíèÿ âû÷èñëåíèé ñî ñëó÷àéíûìè êîððåëÿ-
öèÿìè, êîãäà èñïîëüçóåòñÿ ñëèøêîì ìíîãî ïåðåìåííûõ [48].
      Ñâîé õàðàêòåðíûé íåãàòèâíûé îòïå÷àòîê ïðè ñîçäàíèè ìîäåëè QSAR
íàêëàäûâàþò âûáðîñû (ãðóáûå îøèáêè). Åñëè òàêèå òî÷êè ïëîõî ñî÷åòà-
þòñÿ ñ ìîäåëüþ (îòêëîíÿþòñÿ íà âåëè÷èíû, áîëüøèå äâóõ ñòàíäàðòíûõ
îòêëîíåíèé), òî èõ ñëåäóåò èñêëþ÷èòü èç ìîäåëè, à ìîäåëü ïåðåñ÷èòàòü.
Òàêèå îøèáêè ìîæíî îáúÿñíèòü íåòî÷íîñòÿìè â èñõîäíûõ äàííûõ èëè
íåàäåêâàòíîñòüþ ïðåäëîæåííîé QSAR-ìîäåëè.


1.2       Ñâîéñòâà ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ è èõ

          ïðèìåíåíèå

      Ñâåðõêðèòè÷åñêèì ôëþèäîì (ÑÊÔ) íàçûâàþò ñîñòîÿíèå âåùåñòâà, â
êîòîðîì åãî òåìïåðàòóðà è äàâëåíèå ïðåâûøàþò êðèòè÷åñêèå ïàðàìåòðû.
 êðèòè÷åñêîé òî÷êå äâå ôàçû, æèäêàÿ è ãàçîâàÿ, ñòàíîâÿòñÿ íåðàçëè-
÷èìû. Ìíîãèå ôèçè÷åñêèå ñâîéñòâà ÑÊÔ (ïëîòíîñòü, âÿçêîñòü, ñêîðîñòü
äèôôóçèè) ÿâëÿþòñÿ ïðîìåæóòî÷íûìè ìåæäó ñâîéñòâàìè æèäêîñòè è ãà-
çà.
      Ïîñëåäíèå íåñêîëüêî äåñÿòèëåòèé ïðîäîëæàþòñÿ àêòèâíûå ïîèñêè ðàç-
ëè÷íûõ îáëàñòåé ïðèìåíåíèÿ ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ [49]. Àêòèâíîñòü
îòå÷åñòâåííûõ è çàðóáåæíûõ ó÷åíûõ ìîæíî îáúÿñíèòü ñòðåìëåíèåì ñíè-
çèòü ýêîëîãè÷åñêóþ íàãðóçêó õèìè÷åñêèõ ïðîèçâîäñòâ íà îêðóæàþùóþ
ñðåäó, ïåðåðàáàòûâàòü øèðîêèé ñïåêòð îòõîäîâ ïðîèçâîäñòâ, à òàêæå ïåð-
ñïåêòèâàìè îòêðûòèÿ íîâûõ ìàòåðèàëîâ [50, 51] èëè ñïîñîáîâ ïðîâåäåíèÿ
òðàäèöèîííûõ õèìè÷åñêèõ ïðîöåññîâ [2].  ýòîì ðàçäåëå áóäóò ðàññìîòðå-
íû îñíîâíûå íà òåêóùèé ìîìåíò íàïðàâëåíèÿ ïðèìåíåíèÿ ñâåðõêðèòè÷å-
ñêèõ ôëþèäîâ â ïðîìûøëåííîñòè.
      Îñíîâíûìè ïðåèìóùåñòâàìè ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ êàê ðàñòâîðè-
òåëåé ÿâëÿþòñÿ:

      - ñî÷åòàíèå ñâîéñòâ ãàçîâ ïðè âûñîêèõ äàâëåíèÿõ (íèçêàÿ âÿçêîñòü, âû-
        ñîêèé êîýôôèöèåíò äèôôóçèè) è æèäêîñòåé (âûñîêàÿ ðàñòâîðÿþùàÿ
        ñïîñîáíîñòü);

      - áûñòðûé ìàññîïåðåíîñ, îñóùåñòâëÿåìûé áëàãîäàðÿ íèçêîé âÿçêîñòè
        è âûñîêîìó êîýôôèöèåíòó äèôôóçèè;

                                     26
- ñî÷åòàíèå ïðåíåáðåæèìî ìàëîãî ìåæôàçíîãî íàòÿæåíèÿ ñ íèçêîé
     âÿçêîñòüþ è âûñîêèì êîýôôèöèåíòîì äèôôóçèè, ïîçâîëÿþùåå ñâåðõ-
     êðèòè÷åñêèì ôëþèäàì ïðîíèêàòü â ïîðèñòûå ñðåäû áîëåå ëåãêî ïî
     ñðàâíåíèþ ñ æèäêîñòÿìè;

   - âûñîêàÿ ÷óâñòâèòåëüíîñòü ðàñòâîðÿþùåé ñïîñîáíîñòè ÑÊÔ ê èçìå-
     íåíèþ äàâëåíèÿ è òåìïåðàòóðû;

   - ïðîñòîòà ðàçäåëåíèÿ ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ è ðàñòâîð¼ííûõ â
     íèõ âåùåñòâ ïðè ñáðîñå äàâëåíèÿ.

   Óíèêàëüíûå ñâîéñòâà ÑÊÔ êàê ðàñòâîðèòåëÿ íàõîäÿò øèðîêîå ïðèìå-
íåíèå äëÿ ýêñòðàêöèè è ðàçäåëåíèÿ.  ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ñðåäàõ âîçìîæ-
íî ðàñòâîðåíèå ìîëåêóë ñ ðàçëè÷íûìè ðàçìåðàìè, ìîëåêóëÿðíîé ìàññîé
è ïîëÿðíîñòüþ. Â ñðàâíåíèè ñ æèäêîé ôàçîé, ÑÊÔ èìåþò áëüøóþ ñæè-
                                                      î
ìàåìîñòü, èìåþò áîëüøèé ìîëüíûé îáúåì, ÷òî ìîæåò ñïîñîáñòâîâàòü îá-
ðàçîâàíèþ êëàñòåðîâ è íåñòîéêèõ êîìïëåêñîâ è ïîëîæèòåëüíî âëèÿòü íà
ïîâûøåíèå ðàñòâîðèìîñòè.
    íàñòîÿùåå âðåìÿ â êà÷åñòâå ÑÊÔ èñïîëüçóåòñÿ øèðîêèé ñïåêòð îð-
ãàíè÷åñêèõ è íåîðãàíè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé, òàêèõ êàê N2 Î, N Í3 , ÑÍ3 F ,
ÑÍ2 F2 , ÑÍF3 , Ñ6 Í6 , SF6 . Îäíàêî, íàèáîëåå ïîïóëÿðíûì è øèðîêî èñïîëü-
çóåìûì ðàñòâîðèòåëåì â ñâåðõêðèòè÷åñêîì ñîñòîÿíèè, íà îñíîâå êîòîðî-
ãî îñóùåñòâëåíî áîëåå 80 % âñåõ èññëåäîâàíèé â îáëàñòè ñâåðõêðèòè÷å-
ñêèõ ôëþèäíûõ òåõíîëîãèé (ÑÊÔÒ) è ïðîöåññîâ, ÿâëÿåòñÿ äèîêñèä óãëå-
ðîäà. Ýòî îáóñëîâëåíî åãî íèçêèìè êðèòè÷åñêèìè ïàðàìåòðàìè (òåìïåðà-
òóðà 31,2◦ Ñ, äàâëåíèå 72,8 àòì.). Êðîìå òîãî, äèîêñèä óãëåðîäà ÿâëÿåòñÿ
íåòîêñè÷íûì, íåãîðþ÷èì è îòíîñèòåëüíî íåäîðîãèì âåùåñòâîì, êîòîðîå
ïðè íîðìàëüíûõ óñëîâèÿõ ÿâëÿåòñÿ ãàçîì, ÷òî îáëåã÷àåò åãî ðàçäåëåíèå ñ
öåëåâûìè ïðîäóêòàìè ïîñëå çàâåðøåíèÿ ïðîöåññà. Èñïîëüçîâàíèå äèîêñè-
äà óãëåðîäà âìåñòî îðãàíè÷åñêèõ ðàñòâîðèòåëåé ïîâûøàåò ýêîëîãè÷åñêóþ
áåçîïàñíîñòü ïðîèçâîäñòâ, à òàêæå ñòåïåíü ÷èñòîòû ïîëó÷àåìûõ ïðîäóê-
òîâ, ó÷èòûâàÿ îòñóòñòâèå â íèõ ñëåäîâ òîêñè÷íûõ îðãàíè÷åñêèõ ðàñòâîðè-
òåëåé è ñîäåðæàùèõñÿ â íèõ ïðèìåñåé.
   Ñ íà÷àëà 90-õ ãîäîâ ñâåðõêðèòè÷åñêèå ôëþèäû àêòèâíî èçó÷àþòñÿ â
êà÷åñòâå ñðåä äëÿ ïðîâåäåíèÿ ðàçëè÷íûõ òåõíîëîãè÷åñêèõ ïðîöåññîâ. Ê
íàñòîÿùåìó âðåìåíè òàêèå ïðîöåññû íàõîäÿò ïðèìåíåíèå â ñàìûõ ðàçëè÷-
íûõ îáëàñòÿõ íàóêè è òåõíèêè, íàïðèìåð, â òàêèõ êàê ïèùåâàÿ ïðîìûø-

                                   27
ëåííîñòü, ôàðìàöåâòèêà è ìåäèöèíà, ïðîèçâîäñòâî è îáðàáîòêà ïîëèìå-
ðîâ, ïîëó÷åíèå íîâûõ ìàòåðèàëîâ, àíàëèòè÷åñêàÿ õèìèÿ (ïðîáîïîäãîòîâ-
êà, ñâåðõêðèòè÷åñêàÿ õðîìàòîãðàôèÿ), ýêîëîãèÿ, áèîòåõíîëîãèÿ è ïåðåðà-
áîòêà ìàòåðèàëîâ, î÷èñòêà ïîâåðõíîñòåé è ðåãåíåðàöèÿ ñîðáåíòîâ, ïåðå-
ðàáîòêà íåôòè, ãàçà è óãëÿ, îòõîäîâ ìåòàëëóðãèè è â íåêîòîðûõ äðóãèõ
íàïðàâëåíèÿõ.


1.2.1   Ïðîèçâîäñòâî è îáðàáîòêà ïîëèìåðîâ

    ïîñëåäíèå ãîäû ñâåðõêðèòè÷åñêèå ôëþèäû øèðîêî ïðèìåíÿþò â êà-
÷åñòâå ñðåäû â ïðîöåññàõ ïîëèìåðèçàöèè. Îñíîâíûì àðãóìåíòîì â ïîëü-
çó èõ èñïîëüçîâàíèÿ ÿâëÿåòñÿ âûñîêàÿ ðàñòâîðèìîñòü â íèõ ìîíîìåðîâ,
îòñóòñòâèå íåîáõîäèìîñòè ñóøêè ãîòîâîãî ïðîäóêòà è óäàëåíèÿ ðàñòâîðè-
òåëÿ [51].  äàëüíåéøåì ÑÎ2 â ñâåðõêðèòè÷åñêîì ñîñòîÿíèè (ÑÊÄÓ) èñ-
ïîëüçîâàëñÿ äëÿ ïîëèìåðèçàöèè âèíèëõëîðèäà, ñòèðîëà, àêðèëîíèòðèëà,
âèíèëàöåòàòà. Êàê âûÿñíèëîñü, ÑÊÄÓ ÿâëÿåòñÿ ýôôåêòèâíûì ðàñòâîðè-
òåëåì äëÿ ôòîðõëîðóãëåðîäîâ, ÷òî øèðîêî èñïîëüçóåòñÿ ïðè ñèíòåçå âû-
ñîêîìîëåêóëÿðíûõ àìîðôíûõ ôòîðïîëèìåðîâ. Â ñðåäå äèîêñèäà óãëåðîäà
îñóùåñòâëÿþò áåçâîäíóþ çîëü-ãåëü ïîëèìåðèçàöèþ ïðè ïîëó÷åíèè ïîëè-
ñèëîêñàíîâ [50]. Ïåðñïåêòèâíûì ïðåäñòàâëÿåòñÿ èñïîëüçîâàíèå ñâåðõêðè-
òè÷åñêèõ ñðåä äëÿ ïîëó÷åíèÿ áèîðåñîðáèðóåìûõ ïîëèìåðîâ, êîòîðûå ïî-
ñòåïåííî ðàñòâîðÿþòñÿ â ôèçèîëîãè÷åñêèõ æèäêîñòÿõ îðãàíèçìà, ÷òî øè-
ðîêî èñïîëüçóåòñÿ â ìåäèöèíå. Òàêèì ñïîñîáîì ïîëó÷àþò ïîëèëàêòèäû,
ïîëèãëèêîëèäû è ñîïîëèìåðû íà èõ îñíîâå.
   Ïåðñïåêòèâíûì íàïðàâëåíèåì ÿâëÿåòñÿ îáðàáîòêà ïîëèìåðíûõ ìàòåðè-
àëîâ ÑÊÄÓ, ïðè êîòîðîé ïðîèñõîäèò ïëàñòèôèêàöèÿ ñòåêëîîáðàçíûõ ïîëè-
ìåðîâ, ïðèâîäÿùàÿ ê ñóùåñòâåííîìó ñíèæåíèþ òåìïåðàòóðû ñòåêëîâàíèÿ,
òàê êàê íàñûùåííûé äèîêñèäîì óãëåðîäà ïîëèìåð õàðàêòåðèçóåòñÿ ïîâû-
øåííîé ïîäâèæíîñòüþ öåïåé, à òàêæå óâåëè÷åííûì ðàññòîÿíèåì ìåæäó
íèìè. Ïëàñòèôèêàöèÿ ñîïðîâîæäàåòñÿ íàáóõàíèåì ïîëèìåðíîé ìàòðèöû ñ
ïîñëåäóþùèì óâåëè÷åíèåì ñâîáîäíîãî îáúåìà. Êðîìå òîãî, âîçìîæíî ñïå-
öèôè÷åñêîå âçàèìîäåéñòâèå ìåæäó ÑÎ2 è íåêîòîðûìè ôóíêöèîíàëüíûìè
ãðóïïàìè ïîëèìåðîâ, òàêèìè, êàê, íàïðèìåð, êàðáîíèëüíûå ãðóïïû.
   Âûÿâëåíî âàæíîå ñâîéñòâî ïîëèìåðîâ ñîðáèðîâàòü â çíà÷èòåëüíîì êî-
ëè÷åñòâå (îò 1,5 äî 10 %) äèîêñèä óãëåðîäà â ñâåðõêðèòè÷åñêîì ñîñòîÿíèè.


                                  28
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR

Mais conteúdo relacionado

Mais procurados

План дій з реформування системи органів виконавчої влади
План дій з реформування системи органів виконавчої владиПлан дій з реформування системи органів виконавчої влади
План дій з реформування системи органів виконавчої владиCentre of Policy and Legal Reform
 
Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р анги
 Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р анги Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р анги
Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р ангиGanbat Narantsetseg
 
Βιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' Λυκείου
Βιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' ΛυκείουΒιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' Λυκείου
Βιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' ΛυκείουGeorgia Kazakou
 
Τετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄Λυκείου
Τετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄ΛυκείουΤετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄Λυκείου
Τετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄ΛυκείουGeorgia Kazakou
 
7 физ бойко_венгер_2014_укр
7 физ бойко_венгер_2014_укр7 физ бойко_венгер_2014_укр
7 физ бойко_венгер_2014_укрAira_Roo
 
Βιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄Λυκείου
Βιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄ΛυκείουΒιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄Λυκείου
Βιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄ΛυκείουGeorgia Kazakou
 
ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...
ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...
ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...Egor
 
Реформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законів
Реформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законівРеформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законів
Реформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законівCentre of Policy and Legal Reform
 
Malyj pryzhok v anglijskij za 115 minut
Malyj pryzhok v anglijskij za 115 minutMalyj pryzhok v anglijskij za 115 minut
Malyj pryzhok v anglijskij za 115 minutElena Guro
 
Canon Eos 3000 N Rus
Canon Eos 3000 N RusCanon Eos 3000 N Rus
Canon Eos 3000 N Rusguest315b36d
 
Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...
Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...
Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...Centre of Policy and Legal Reform
 
"Общая психотерапия" - оглавление
"Общая психотерапия" - оглавление"Общая психотерапия" - оглавление
"Общая психотерапия" - оглавлениеинна ветрова
 
ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007
ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007
ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007Sergey Erohin
 

Mais procurados (18)

План дій з реформування системи органів виконавчої влади
План дій з реформування системи органів виконавчої владиПлан дій з реформування системи органів виконавчої влади
План дій з реформування системи органів виконавчої влади
 
Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р анги
 Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р анги Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р анги
Монгол орны физик газар зүйн бие даах ажлын дэвтэр -8-р анги
 
Βιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' Λυκείου
Βιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' ΛυκείουΒιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' Λυκείου
Βιβλίο Κοινωνιολογίας Γ' Λυκείου
 
Bull_MASP_3
Bull_MASP_3Bull_MASP_3
Bull_MASP_3
 
Τετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄Λυκείου
Τετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄ΛυκείουΤετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄Λυκείου
Τετράδιο εργασιών Κοινωνιολογίας Γ΄Λυκείου
 
м
мм
м
 
7 физ бойко_венгер_2014_укр
7 физ бойко_венгер_2014_укр7 физ бойко_венгер_2014_укр
7 физ бойко_венгер_2014_укр
 
Βιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄Λυκείου
Βιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄ΛυκείουΒιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄Λυκείου
Βιβλιο καθηγητή για την Κοινωνιολογία Γ΄Λυκείου
 
ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...
ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...
ГОСТ Р ИСО/МЭК 15910-2002 Процесс создания документации пользователя программ...
 
Реформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законів
Реформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законівРеформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законів
Реформа публічної адміністрації в Україні: Проекти концепції та законів
 
Malyj pryzhok v anglijskij za 115 minut
Malyj pryzhok v anglijskij za 115 minutMalyj pryzhok v anglijskij za 115 minut
Malyj pryzhok v anglijskij za 115 minut
 
аутсорсинг
аутсорсингаутсорсинг
аутсорсинг
 
Canon Eos 3000 N Rus
Canon Eos 3000 N RusCanon Eos 3000 N Rus
Canon Eos 3000 N Rus
 
Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...
Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...
Вимоги статті 6 Конвенції про захист прав людини та основних свобод до процед...
 
Shuwar
ShuwarShuwar
Shuwar
 
"Общая психотерапия" - оглавление
"Общая психотерапия" - оглавление"Общая психотерапия" - оглавление
"Общая психотерапия" - оглавление
 
ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007
ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007
ГОСТ Р ИСО/МЭК 18044 2007
 
навигатор N5
навигатор N5навигатор N5
навигатор N5
 

Destaque

דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדותדרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדותMenyNachman
 
Android Apk包反编译入门分享
Android Apk包反编译入门分享Android Apk包反编译入门分享
Android Apk包反编译入门分享jicheng687
 
Expert tm syllabus beta version 041511
Expert tm syllabus beta version 041511Expert tm syllabus beta version 041511
Expert tm syllabus beta version 041511jicheng687
 
Iit jee chem 10 2
Iit jee chem 10 2Iit jee chem 10 2
Iit jee chem 10 2swaaru
 
15 godzin do raju fin
15 godzin do raju fin15 godzin do raju fin
15 godzin do raju finNoemi Gryczko
 
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדותדרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדותMenyNachman
 
Announcements for march 20, 2011
Announcements for march 20, 2011Announcements for march 20, 2011
Announcements for march 20, 2011betollaf
 
W 0300 codingfor_life-batterylifethatis
W 0300 codingfor_life-batterylifethatisW 0300 codingfor_life-batterylifethatis
W 0300 codingfor_life-batterylifethatisjicheng687
 
【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析
【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析
【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析jicheng687
 
Payroll servicesoverview
Payroll servicesoverviewPayroll servicesoverview
Payroll servicesoverviewjohndonley
 
Nonprofits for libraries - participatory grantmaking
Nonprofits for libraries - participatory grantmaking Nonprofits for libraries - participatory grantmaking
Nonprofits for libraries - participatory grantmaking Noemi Gryczko
 
Apresentacao moção jsd 19 mar2011
Apresentacao moção jsd   19 mar2011Apresentacao moção jsd   19 mar2011
Apresentacao moção jsd 19 mar2011informaticacma
 
Technologie mobilne w bibliotekach
Technologie mobilne w bibliotekachTechnologie mobilne w bibliotekach
Technologie mobilne w bibliotekachNoemi Gryczko
 
Na czym polega niekonferencja?
Na czym polega niekonferencja?Na czym polega niekonferencja?
Na czym polega niekonferencja?Noemi Gryczko
 
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...Serg Maksimov
 

Destaque (17)

דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדותדרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
 
Android Apk包反编译入门分享
Android Apk包反编译入门分享Android Apk包反编译入门分享
Android Apk包反编译入门分享
 
Expert tm syllabus beta version 041511
Expert tm syllabus beta version 041511Expert tm syllabus beta version 041511
Expert tm syllabus beta version 041511
 
Iit jee chem 10 2
Iit jee chem 10 2Iit jee chem 10 2
Iit jee chem 10 2
 
test
testtest
test
 
15 godzin do raju fin
15 godzin do raju fin15 godzin do raju fin
15 godzin do raju fin
 
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדותדרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
דרום אדום - פריחת הכלניות בנגב - טיולים ואגדות
 
Announcements for march 20, 2011
Announcements for march 20, 2011Announcements for march 20, 2011
Announcements for march 20, 2011
 
W 0300 codingfor_life-batterylifethatis
W 0300 codingfor_life-batterylifethatisW 0300 codingfor_life-batterylifethatis
W 0300 codingfor_life-batterylifethatis
 
【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析
【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析
【Android终端安全分享】之android程序打包过程分析
 
Payroll servicesoverview
Payroll servicesoverviewPayroll servicesoverview
Payroll servicesoverview
 
Nonprofits for libraries - participatory grantmaking
Nonprofits for libraries - participatory grantmaking Nonprofits for libraries - participatory grantmaking
Nonprofits for libraries - participatory grantmaking
 
Apresentacao moção jsd 19 mar2011
Apresentacao moção jsd   19 mar2011Apresentacao moção jsd   19 mar2011
Apresentacao moção jsd 19 mar2011
 
Unconference
Unconference Unconference
Unconference
 
Technologie mobilne w bibliotekach
Technologie mobilne w bibliotekachTechnologie mobilne w bibliotekach
Technologie mobilne w bibliotekach
 
Na czym polega niekonferencja?
Na czym polega niekonferencja?Na czym polega niekonferencja?
Na czym polega niekonferencja?
 
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...
Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использова...
 

Моделирование растворимости в сверхкритическом диоксиде углерода с использованием методологии QSAR

  • 1. ÔÅÄÅÐÀËÜÍÎÅ ÀÃÅÍÒÑÒÂÎ ÏÎ ÎÁÐÀÇÎÂÀÍÈÞ ÐÔ Ðîññèéñêèé õèìèêî-òåõíîëîãè÷åñêèé óíèâåðñèòåò èì. Ä. È. Ìåíäåëååâà Ôàêóëüòåò èíôîðìàöèîííûõ òåõíîëîãèé è óïðàâëåíèÿ Êàôåäðà êèáåðíåòèêè õèìèêî-òåõíîëîãè÷åñêèõ ïðîöåññîâ Ïîÿñíèòåëüíàÿ çàïèñêà ê äèïëîìíîé ðàáîòå íà òåìó: Ìîäåëèðîâàíèå ðàñòâîðèìîñòè îðãàíè÷åñêèõ âåùåñòâ â ñâåðõêðèòè÷åñêîì äèîêñèäå óãëåðîäà ñ èñïîëüçîâàíèåì ìåòîäîëîãèè QSAR Çàâ. êàôåäðîé ÊÕÒÏ ä. ò. í., ïðîôåññîð Ãëåáîâ Ì. Á. Íàó÷íûé ðóêîâîäèòåëü ä. ò. í., ïðîôåññîð Ìåíüøóòèíà Í. Â. Êîíñóëüòàíòû: Ïî îõðàíå îêðóæàþùåé ñðåäû îò ïðîìûøëåííûõ çàãðÿçíåíèé, ä. õ. í., ïðîôåññîð Ñìåòàííèêîâ Þ. Â. Ïî îõðàíå òðóäà, àññèñòåíò êàôåäðû ÁÆÄ Àíîñîâà Å. Á. Äèïëîìàíò Ìàêñèìîâ Ñ. À. Ìîñêâà 2010 ã.
  • 2. Îãëàâëåíèå Ââåäåíèå 3 1 Ëèòåðàòóðíûé îáçîð 4 1.1 Ìåòîäîëîãèÿ QSAR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 1.1.1 Ïîñòàíîâêà çàäà÷è QSAR . . . . . . . . . . . . . . . . 4 1.1.2 Èñòîðè÷åñêîå ðàçâèòèå QSAR . . . . . . . . . . . . . . 7 1.1.3 Êëàññèôèêàöèÿ äåñêðèïòîðîâ . . . . . . . . . . . . . . 10 1.1.4 Íåîáõîäèìûå êà÷åñòâà äåñêðèïòîðîâ . . . . . . . . . . 15 1.1.5 Îáçîð äåñêðèïòîðîâ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 1.1.6 Ñîçäàíèå âûáîðêè ñîåäèíåíèé . . . . . . . . . . . . . 22 1.1.7 Ðåãðåññèîííûé àíàëèç: ìíîæåñòâåííàÿ ëèíåéíàÿ ðå- ãðåññèÿ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 1.2 Ñâîéñòâà ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ è èõ ïðèìåíåíèå . . . 26 1.2.1 Ïðîèçâîäñòâî è îáðàáîòêà ïîëèìåðîâ . . . . . . . . . 28 1.2.2 Ïèùåâàÿ ïðîìûøëåííîñòü . . . . . . . . . . . . . . . 29 1.2.3 Ôàðìàöåâòèêà è ìåäèöèíà . . . . . . . . . . . . . . . . 30 1.2.4 Íîâûå ìàòåðèàëû . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33 1.2.5 Ñâåðõêðèòè÷åñêèå ðåàêöèîííûå ñðåäû . . . . . . . . . 34 1.2.6 Áèîòåõíîëîãèÿ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 1.3 Îáçîð ìîäåëåé ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . . . . . . . . . . . . 36 2 Ýêñïåðèìåíòàëüíûå èññëåäîâàíèÿ ðàñòâîðèìîñòè â ñâåðõ- êðèòè÷åñêîì äèîêñèäå óãëåðîäà 43 2.1 Ïðèáîð äëÿ ïðîâåäåíèÿ èçìåðåíèé ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . 43 2.2 Ïðîâåäåíèå èçìåðåíèé ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . . . . . . . . 45 2.3 Âû÷èñëåíèå âåëè÷èíû ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . . . . . . . . 47 2.4 Ýêñïåðèìåíòàëüíûå äàííûå äëÿ ìîäåëèðîâàíèÿ . . . . . . . 48 1
  • 3. 3 Ðàçðàáîòêà èíôîðìàöèîííîé ñèñòåìû äëÿ õðàíåíèÿ è îá- ðàáîòêè ðåçóëüòàòîâ ýêñïåðèìåíòàëüíîãî îïðåäåëåíèÿ ðàñ- òâîðèìîñòè 52 3.1 Ñòðóêòóðà èíôîðìàöèîííîé ñèñòåìû . . . . . . . . . . . . . 52 3.1.1 Ðàçðàáîòêà ñòðóêòóðû áàçû äàííûõ . . . . . . . . . . 54 3.1.2 Ãðàôè÷åñêèé ïîëüçîâàòåëüñêèé èíòåðôåéñ . . . . . . 59 3.1.3 Ïîäñèñòåìà àíàëèçà äàííûõ . . . . . . . . . . . . . . . 62 3.2 Ðàçðàáîòêà QSAR-ìîäåëè . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 3.2.1 Âûáîðêà ñîåäèíåíèé . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 3.2.2 Ïðîñòàÿ ìîäåëü ðàñòâîðèìîñòè . . . . . . . . . . . . . 66 3.2.3 Ëèíåéíàÿ ðåãðåññèîííàÿ ìîäåëü . . . . . . . . . . . . 67 3.2.4 Ïðèìåíåíèå êëàññèôèêàöèè äëÿ óëó÷øåíèÿ ïðåäñêà- çàòåëüíûõ ñâîéñòâ ìîäåëè . . . . . . . . . . . . . . . . 69 3.2.5 Ïîñòðîåíèå äåðåâà âàðèàíòîâ ðåøåíèé . . . . . . . . . 72 4 Èññëåäîâàíèå ìàòåìàòè÷åñêîé ìîäåëè 79 4.1 Ñòàòèñòè÷åñêèå ñâîéñòâà ìîäåëè . . . . . . . . . . . . . . . . 79 4.2 Èññëåäîâàíèå êëàññèôèêàöèîííîé çàäà÷è . . . . . . . . . . . 86 Çàêëþ÷åíèå è âûâîäû 89 5 Îõðàíà îêðóæàþùåé ñðåäû 90 6 Îõðàíà òðóäà 99 Ëèòåðàòóðà 114 A Ñëàéäû ïðåçåíòàöèè 125 2
  • 4. Ââåäåíèå  íàøè äíè êîíöåïöèè çåëåíîé õèìèè íàõîäÿò âñå áîëüøåå ïðèìåíåíèå â ïðàêòèêå ïðîâåäåíèÿ õèìè÷åñêèõ ïðîöåññîâ. Äëÿ îáåñïå÷åíèÿ ýêîëîãè÷å- ñêîé áåçîïàñíîñòè ïðîèçâîäñòâ ñåãîäíÿ ïîÿâèëàñü îñòðàÿ ïîòðåáíîñòü ñíè- çèòü ïðèìåíåíèå ãîðþ÷èõ, òîêñè÷íûõ è âçðûâîîïàñíûõ âåùåñòâ â õèìè÷å- ñêîé òåõíîëîãèè. Îäíèì èç ïåðñïåêòèâíûõ íàïðàâëåíèé ýòîé äåÿòåëüíîñòè ÿâëÿåòñÿ ïðèìåíåíèå ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ. Ôëþèäû ïðèçâàíû çàìå- íèòü, ãäå ýòî âîçìîæíî, îðãàíè÷åñêèå ðàñòâîðèòåëè, âûñòóïàÿ â êà÷åñòâå ðàñòâîðèòåëåé, ýêñòðàãåíòîâ, ñðåä äëÿ ñóøêè [1]. Ïðè ïåðåõîäå â ñâåðõêðèòè÷åñêîå ñîñòîÿíèå, âåùåñòâî êà÷åñòâåííî ìå- íÿåò ñâîè ôèçè÷åñêèå è õèìè÷åñêèå ñâîéñòâà: äèýëåêòðè÷åñêóþ ïðîíèöàå- ìîñòü, êîýôôèöèåíò ñàìîäèôôóçèè, ðàñòâîðÿþùóþ ñïîñîáíîñòü, êèñëîòíî- îñíîâíûå ñâîéñòâà [2]. Ê íàñòîÿùåìó âðåìåíè ìíîæåñòâî âåùåñòâ èçó÷åíî â ñâåðõêðèòè÷åñêèõ óñëîâèÿõ, îäíàêî íàèáîëüøåå ïðèìåíåíèå íàõîäèò äè- îêñèä óãëåðîäà (ÑÊÄÓ) íåòîêñè÷íîå, íåãîðþ÷åå è äåøåâîå ñîåäèíåíèå ñî ñðàâíèòåëüíî íèçêèìè êðèòè÷åñêèìè ïàðàìåòðàìè. Ïåðåõîäó ê øèðîêîìàñøòàáíîìó ïðèìåíåíèþ ÑÊÄÓ ìåøàåò íå ñòîëü- êî ñëîæíîñòü àïïàðàòíîãî îôîðìëåíèÿ ïðîöåññîâ, ñêîëüêî íåäîñòàòî÷íàÿ ÿñíîñòü â ìåõàíèçìàõ ôèçè÷åñêèõ è õèìè÷åñêèõ ïðîöåññîâ â òàêîé ¾ýêçî- òè÷åñêîé¿ ñðåäå.  ëèòåðàòóðå èìååòñÿ ìíîæåñòâî ðàçíîîáðàçíûõ, ïîðîé ðàçðîçíåííûõ äàííûõ î ïðîöåññàõ â ÑÊÄÓ, îäíàêî â òåîðåòè÷åñêèõ îáîá- ùåíèÿõ èìååòñÿ îïðåäåëåííûé äåôèöèò. Öåëÿìè íàñòîÿùåé äèïëîìíîé ðàáîòû ÿâëÿþòñÿ: 1. ñîçäàíèå áàçû äàííûõ äëÿ ñáîðà è àíàëèçà ðåçóëüòàòîâ ýêñïåðèìåí- òàëüíîãî îïðåäåëåíèÿ ðàñòâîðèìîñòè îðãàíè÷åñêèõ âåùåñòâ â ñâåðõ- êðèòè÷åñêîì äèîêñèäå óãëåðîäà; 2. ïîñòðîåíèå êîëè÷åñòâåííûõ ìîäåëåé ðàñòâîðèìîñòè îðãàíè÷åñêèõ âå- ùåñòâ â ÑÊÄÓ ñ èñïîëüçîâàíèåì ìåòîäîëîãèè QSAR. 3
  • 5. Ãëàâà 1 Ëèòåðàòóðíûé îáçîð 1.1 Ìåòîäîëîãèÿ QSAR 1.1.1 Ïîñòàíîâêà çàäà÷è QSAR Ïîñëåäíåå âðåìÿ îáúåêò ðàññìîòðåíèÿ íàóêè õèìèè âûøåë äàëåêî çà ðàìêè øêîëüíîãî îïðåäåëåíèÿ: ¾õèìèÿ íàóêà, êîòîðàÿ ðàáîòàåò ñ õèìè- ÷åñêèìè âåùåñòâàìè¿. Âî-ïåðâûõ, ê ¾õèìè÷åñêîìó âåùåñòâàì¿ ìîæíî îò- íåñòè âñ¼, ÷òî óãîäíî, íà÷èíàÿ îò ïðîñòûõ âåùåñòâ è çàêàí÷èâàÿ ñëîæíûìè è íåîäíîðîäíûìè áèîìàññàìè. Âî-âòîðûõ, ïîíÿòèå ¾ðàáîòà ñ õèìè÷åñêèìè âåùåñòâàìè¿ òàêæå î÷åíü øèðîêî.  ýòó êàòåãîðèþ ïîïàäàþò ñèíòåç íî- âûõ ñîåäèíåíèé, èçó÷åíèå óæå ïîëó÷åííûõ, ïðîãíîç ñâîéñòâ è êà÷åñòâ åùå íå èññëåäîâàííûõ âåùåñòâ è ò. ä. Îòäåëüíûì âîïðîñîì ÿâëÿåòñÿ ðàçëè÷èå ìåæäó ïîíÿòèÿìè ¾âåùåñòâî¿ è ¾ìàòåðèàë¿. Ñîãëàñíî îáùåìó ïðåäñòàâëå- íèþ, êëþ÷åâûì îáúåêòîì èçó÷åíèÿ õèìèè ÿâëÿþòñÿ ðåàêöèè, è ýòèì õèìèÿ îòëè÷àåòñÿ îò ôèçèêè. Äåéñòâèòåëüíî, ðåàêöèè â õèìèè èãðàþò íåìàëî- âàæíóþ ðîëü, íî, ïðåæäå âñåãî õèìèÿ íàóêà î âåùåñòâàõ. Âî âòîðîé ïîëîâèíå XIX âåêà À. Ì. Áóòëåðîâûì è äðóãèìè ó÷åíûìè áûëà ñîçäàíà òåîðèÿ ñòðîåíèÿ õèìè÷åñêèõ ÷àñòèö, â êîòîðîé ñôîðìóëèðî- âàí ðÿä îñíîâíûõ ïîíÿòèé è çàêîíîâ âíóòðåííåãî ñòðîåíèÿ ìîëåêóëÿðíûõ îáðàçîâàíèé. Îí ïèñàë: ¾Èñõîäÿ îò ìûñëè, ÷òî êàæäûé õèìè÷åñêèé àòîì, âõîäÿùèé â ñîñòàâ òåëà, ïðèíèìàåò ó÷àñòèå â îáðàçîâàíèè ýòîãî ïîñëåäíåãî è äåéñòâóåò çäåñü îïðåäåëåííûì êîëè÷åñòâîì ïðèíàäëåæàùåé åìó õèìè- ÷åñêîé ñèëû (ñðîäñòâà), ÿ íàçûâàþ õèìè÷åñêèì ñòðîåíèåì ðàñïðåäåëåíèå äåéñòâèÿ ýòîé ñèëû, âñëåäñòâèå êîòîðîãî õèìè÷åñêèå àòîìû, ïîñðåäñòâåí- 4
  • 6. íî èëè íåïîñðåäñòâåííî âëèÿÿ äðóã íà äðóãà, ñîåäèíÿþòñÿ â õèìè÷åñêóþ ÷àñòèöó¿ [3]. Ñîãëàñíî òåîðèè õèìè÷åñêîãî ñòðîåíèÿ, ñòðóêòóðà ìîëåêóëû îïðåäåëÿåò ñîâîêóïíîñòü ôèçèêî-õèìè÷åñêèõ ñâîéñòâ, è, íàîáîðîò, èñõî- äÿ èç äàííûõ ïî ôèçèêî-õèìè÷åñêèì ñâîéñòâàì, ìîæíî äåëàòü âûâîäû î ñòðóêòóðå ìîëåêóëû äàííîãî ñîåäèíåíèÿ. Ïîèñê êîððåëÿöèé ìåæäó õàðàê- òåðîì èçìåíåíèÿ ñâîéñòâ âåùåñòâ è èõ ñòðóêòóðîé îòíîñèòñÿ ê òàê íàçû- âàåìîé ïðîáëåìå ¾ñòðóêòóðà-ñâîéñòâî¿. Äëÿ ëþáûõ ôèçè÷åñêèõ ñâîéñòâ, õàðàêòåðèçóþùèõ äàííîå âåùåñòâî, èìåþòñÿ êîíêðåòíûå ÷èñëåííûå çíà- ÷åíèÿ, à äëÿ ñòðóêòóðû ìîëåêóëû îáùåïðèíÿòîé ÷èñëåííîé ìåðû íå ñóùå- ñòâóåò. Ýìïèðè÷åñêèå çàêîíîìåðíîñòè èçìåíåíèÿ ñâîéñòâ âåùåñòâ ñ èçìåíåíè- åì èõ ñòðóêòóðû, óñòàíîâëåííûå ê ñåðåäèíå XIX â, ëåãëè â îñíîâó êîíöåï- öèè âçàèìîñâÿçè ñâîéñòâ è ñòðóêòóðû õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé. Îòêðûòûé Ä. È. Ìåíäåëååâûì Ïåðèîäè÷åñêèé çàêîí ìîæíî ðàññìàòðèâàòü â êà÷åñòâå íàó÷íîé îñíîâû êîíöåïöèè âçàèìîñâÿçè ñòðîåíèå-ñâîéñòâî, à ïðåäñêàçàíèå ôèçè÷åñêèõ ñâîéñòâ è ñóùåñòâîâàíèå íåîòêðûòûõ íîâûõ ýëåìåíòîâ ÿâëÿ- åòñÿ ïåðâûì ïðèìåðîì óñòîé÷èâîé ïðåäñêàçàòåëüíîé ìîäåëè ýòîé âçàèìî- ñâÿçè. Äëÿ èçó÷åíèÿ ñëîæíûõ ïðèðîäíûõ ïðîöåññîâ è ÿâëåíèé ñîçäàþòñÿ èõ ìîäåëè. Ïðåèìóùåñòâà òàêèõ ìîäåëåé ïî ñðàâíåíèþ ñ îðèãèíàëîì çàêëþ- ÷àåòñÿ, íàïðèìåð, â áîëüøåé äîñòóïíîñòè äëÿ èçó÷åíèÿ, âîçìîæíîñòè ìà- íèïóëèðîâàíèÿ è áîëüøåãî êîíòðîëÿ, ìåíüøèõ çàòðàòàõ íà èññëåäîâàíèÿ. Ñðåäè ìîäåëåé ìîæíî âûäåëèòü èêîíè÷åñêíå (ñõîäñòâî ïî ôîðìå), àíà- ëîãîâûå (ñõîäñòâî ïî ôîðìå è ôóíêöèÿì) è àáñòðàêòíûå (ñèìâîëè÷åñêèå, êîíöåïòóàëüíûå), ïðåäñòàâëÿþùèå âçàèìîñâÿçü ñ îðèãèíàëîì ñ ïîìîùüþ ñèìâîëîâ [4]. Ðèñ. 1.1. Êîíöåíòðû õèìèè. 5
  • 7. Èñõîäÿ èç âûøåñêàçàííîãî, îò÷¼òëèâî âûðèñîâûâàåòñÿ ïåðâûé êîíöåíòð õèìèè. Åãî ñîäåðæàíèå èçó÷åíèå ìíîãîîáðàçèÿ õèìè÷åñêèõ âåùåñòâ, èõ îïèñàíèå è ñèñòåìàòèêà. Åñëè èíäèâèäóàëüíîå âåùåñòâî îáîçíà÷èòü ñèìâî- ëîì X , à ìíîæåñòâî âîçìîæíûõ âåùåñòâ {Xi }, òî îáíàðóæåíèå è èññëå- äîâàíèå îòäåëüíûõ âåùåñòâ X , èçó÷åíèå èõ ñîâîêóïíîñòè {Xi } ýòî è åñòü öåíòðàëüíàÿ çàäà÷à õèìèè. Ñþäà æå îòíîñèòñÿ èíòåðïðåòàöèÿ ìíîæåñòâà {Xi }, ò. å. âûÿñíåíèÿ ïðè÷èí, ïî÷åìó ñóùåñòâóþò èìåííî íàáëþäàåìûå âå- ùåñòâà, à íå êàêèå-íèáóäü äðóãèå [5]. Åñëè ìû ïðîÿâëÿåì èíòåðåñ ê õèìè÷åñêèì âåùåñòâàì, òî âàæíûìè ñòàíîâÿòñÿ ñïîñîáû èõ ïîëó÷åíèÿ (ñèíòåç) è èäåíòèôèêàöèÿ (àíàëèç) ñîñòàâëÿþùèå âòîðîãî êîíöåíòðà. Òàê ñîâñåì åùå íåäàâíî áîëüøèíñòâî õèìèêîâ çàíèìàëîñü èìåííî ýòèì.  íàñòîÿùåå âðåìÿ äîëÿ ñèíòåòèêîâ è àíàëèòèêîâ ñòàëà ìåíüøå, íî è ïî ñåé äåíü àíàëèç è ñèíòåç ñîñòàâëÿþò âåñîìóþ ÷àñòü õèìè÷åñêèõ èññëåäîâàíèé. Îñíîâíóþ ÷àñòü ñîâðåìåííîé õèìèè, êàê è õèìèè ïðîøëûõ âåêîâ, ñî- ñòàâëÿþò ïîèñêè è èññëåäîâàíèÿ ôóíêöèîíàëüíûõ çàâèñèìîñòåé âèäà p = p(X), ãäå X ïî-ïðåæíåìó, õèìè÷åñêîå âåùåñòâî, à p êàêîå-ëèáî åãî ñâîéñòâî.  êà÷åñòâå ñâîéñòâà ìîãóò âûñòóïàòü ìíîãèå âåëè÷èíû: òåìïå- ðàòóðà ïëàâëåíèÿ, ðåàêöèîííàÿ àêòèâíîñòü, ýëåêòðîïðîâîäíîñòü è ò. ä. Òà- êèì îáðàçîì, ìîæíî îïðåäåëèòü òå âîïðîñû, êîòîðûå èíòåðåñíû õèìèêó: ¾÷òî ïðîèçîéäåò ñî ñâîéñòâîì (òåìïåðàòóðîé ïëàâëåíèÿ, ýëåêòðîïðîâîäíî- ñòüþ è ò. ä.), åñëè çàìåíèòü àòîì âîäîðîäà óãëåâîäîðîäíûìè ðàäèêàëàìè ìåòèëîì, ýòèëîì, ïðîïèëîì èëè íàòðèÿ êàëèåì, ðóáèäèåì èëè öåçèåì?¿. Ïåðåõîäÿ ê îáîáùåííîé õàðàêòåðèñòèêå ôóíäàìåíòàëüíûõ õèìè÷åñêèõ ïîíÿòèé, îòìåòèì, ÷òî îíè â çíà÷èòåëüíîé ìåðå èìåþò ñòðóêòóðíîå ñî- äåðæàíèå.  ñâÿçè ñ ýòèì íåîáõîäèìî äîñòàòî÷íî ïîëíî è òî÷íî óÿñíèòü ñóùíîñòü ìíîãîóðîâíåâîãî ïîíÿòèÿ ñòðóêòóðû.  îáû÷íîì ïðåäñòàâëåíèè õèìèêè ãîâîðÿò îá àòîìíî-ìîëåêóëÿðíîé ñòðó- êòóðå. Ñòðóêòóðà ýòî âñåãäà íåêàÿ ìîäåëü, ïðèáëèæåíèå. Ïðîñòåéøàÿ èç íûíå äåéñòâóþùèõ ìîäåëåé ñòðóêòóðû ìîäåëü ëîêàëèçîâàííûõ ìåæ- àòîìíûõ ñâÿçåé, êîòîðàÿ îïèñûâàåò âåùåñòâî ñ ïîìîùüþ êîíå÷íîé èëè áåñêîíå÷íîé òî÷å÷íî-øòðèõîâîé ñòðóêòóðíîé ôîðìóëû, ãîâîðÿ äðóãèìè ñëîâàìè, ñ ïîìîùüþ ãðàôà. Ýòà ìîäåëü ïðèìåíèòåëüíî ê îðãàíè÷åñêèì ìîëåêóëàì áûëà ñîçäàíà À. Ì. Áóòëåðîâûì, Ô. À. Êåêóëå, À. Ñ. Êóïåðîì. Äëÿ íåîðãàíè÷åñêîé õèìèè, â ÷àñòíîñòè äëÿ êîîðäèíàöèîííûõ ñîåäèíåíèé, 6
  • 8. åå èñïîëüçîâàíèå ñòàëî âîçìîæíûì áëàãîäàðÿ ðàáîòàì À. Âåðíåðà. Òàêèì îáðàçîì, ýòî ñàìàÿ ñòàðøàÿ ïî âîçðàñòó è â òî æå âðåìÿ ñàìàÿ âîñòðåáî- âàííàÿ è ïîíûíå ìîäåëü ñòðóêòóðû, êîòîðàÿ äîñòàòî÷íî áëèçêà ïî ñìûñëó ñ òåì, ÷òî íàçûâàþò õèìè÷åñêèì ñòðîåíèåì. Ïðîøëî ïîðÿäêà 40 ëåò ñ òåõ ïîð êàê ïàðàäèãìà ¾êîëè÷åñòâåííàÿ ñâÿçü ñòðóêòóðà ñâîéñòâî¿ (QSAR) íàøëà ñâîå ïåðâîå ïðèìåíåíèå â ôàðìàöåâ- òèêå, òîêñèêîëîãèè, àãðîõèìèè è â äðóãèõ íàïðàâëåíèÿõ õèìè÷åñêîé íàóêè. Ïàðàäèãìà çàêëþ÷àåòñÿ â òîì, ÷òî àêòèâíîñòü (ñâîéñòâî) ýòî ôóíêöèÿ ñòðóêòóðû âåùåñòâà, îïèñûâàåìàÿ ñ ïîìîùüþ ýëåêòðîííîãî ñòðîåíèÿ, ãèä- ðîôîáíîñòè è ñòåðè÷åñêèõ (ãåîìåòðè÷åñêèõ) ñâîéñòâ. 1.1.2 Èñòîðè÷åñêîå ðàçâèòèå QSAR Áîëüøå âåêà íàçàä Êðàì-Áðàóí è Ôðåéçåð (Crum-Brown, Fraser) âû- ñêàçàëè ïðåäïîëîæåíèå, ÷òî ôèçèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà ÿâëÿ- åòñÿ ôóíêöèåé åãî ñîñòàâà è ñòðîåíèÿ [6]. Íåñêîëüêî äåñÿòèëåòèé ñïóñòÿ, â 1893 ãîäó, Ðèøå (Richet) ïîêàçàë, ÷òî öèòîòîêñè÷íîñòü1 ìíîæåñòâà ðàçíî- îáðàçíûõ ïðîñòûõ îðãàíè÷åñêèõ ìîëåêóë áûëà îáðàòíî ñâÿçàíà ñ èõ ðàñ- òâîðèìîñòüþ â âîäå.  íà÷àëå XX âåêà Ìàéåð è Îâåðòîí (Meyer, Overton) íåçàâèñèìî ïðåäïîëîæèëè, ÷òî íàðêîòè÷åñêîå (ñåäàòèâíîå) äåéñòâèå ãðóï- ïû îðãàíè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ïðîïîðöèîíàëüíî èõ êîýôôèöèåíòó ðàñïðåäå- ëåíèÿ â ñèñòåìå ¾îëèâêîâîå ìàñëî âîäà¿.  1939 ãîäó Ôåðãþñîí (Ferguson) ïîêàçàë íàëè÷èå çàâèñèìîñòè ñåäàòèâíîãî ýôôåêòà îò äàâëåíèÿ ïàðà ðàñ- òâîðèòåëÿ íàä èõ ðàñòâîðîì. Ìíîãî÷èñëåííûìè ðàáîòàìè Àëáåðòà, Áåëëà è Ðîáëèíà (Albert, Bell, Roblin) óñòàíîâëåíî âëèÿíèå ñòåïåíè èîíèçàöèè îñíîâàíèé è ñëàáûõ êèñëîò íà èõ àíòèáàêòåðèàëüíîå äåéñòâèå [7, 8].  ýòî æå âðåìÿ áûëè ñäåëàíû îãðîìíûå øàãè â èçó÷åíèè ýôôåêòîâ çàìåñòèòåëåé â îðãàíè÷åñêèõ ðåàêöèÿõ, ïðîèçâåäåííîé Ãàììåòîì (Hammet) [9]. Òàôò (Taft) ïðåäëîæèë ìåòîä ðàçäåëåíèÿ ýëåêòðîííûõ, ñòåðè÷åñêèõ (ïðîñòðàíñòâåííûõ) è ðåçîíàíñíûõ ýôôåêòîâ, à òàêæå ââåë ïåðâûé ñòå- ðè÷åñêèé ïàðàìåòð, Es [10]. Ê íàèáîëåå ðàñïðîñòðàíåííûì ýëåêòðîííûì 1 Öèòîòîêñè÷íîñòü cïîñîáíîñòü ôèçè÷åñêèõ âîçäåéñòâèé èëè õèìè÷åñêèõ âåùåñòâ âûçûâàòü ïà- òîëîãè÷åñêèå èçìåíåíèÿ â êëåòêàõ. Öèòîòîêñè÷åñêîå äåéñòâèå ìîæåò ðåàëèçîâàòüñÿ äâîÿêî: à) öèòîöèäíûé ýôôåêò ïðèâîäèò êëåòêó ê ãèáåëè; á) öèòîñòàòè÷åñêèé ýôôåêò âûêëþ÷àþùèé êëåòêó èç ñâîåâðåìåííîãî ïðîõîæäåíèÿ ïî êëåòî÷íîìó öèêëó. 7
  • 9. ýôôåêòàì îòíîñÿòñÿ èíäóêòèâíûé è ìåçîìåðíûé. Åñëè ïîëîæèòåëüíûé èëè îòðèöàòåëüíûé çàðÿä ¾ïåðåäàåòñÿ¿ (äåëîêàëèçóåòñÿ) ïî öåïî÷êå àòî- ìîâ çà ñ÷åò ýëåêòðîñòàòè÷åñêîé èíäóêöèè, òî òàêîé ýëåêòðîííûé ýôôåêò íàçûâàåòñÿ èíäóêòèâíûì è îáîçíà÷àåòñÿ áóêâîé I . Èíäóêòèâíûé ýôôåêò âàæåí äëÿ îáúÿñíåíèÿ ïîâåäåíèÿ σ -ýëåêòðîííûõ ñèñòåì, îí äîâîëüíî áûñò- ðî çàòóõàåò ïî öåïî÷êå àòîìîâ. Ìåçîìåðíûé ýëåêòðîííûé ýôôåêò òåñíî ñâÿçàí ñ ïîíÿòèåì ¾ðåçîíàíñíûõ ñòðóêòóð¿ è ÷àñòè÷íûì ïåðåìåùåíèåì ýëåêòðîííûì ïàð îò ìåíåå ýëåêòðîîòðèöàòåëüíîãî ýëåìåíòà èëè ôðàãìåí- òà ñòðóêòóðû ê áîëåå ýëåêòðîîòðèöàòåëüíûì. Ìåçîìåðíûé ýôôåêò ñëó- æèò äëÿ îïèñàíèÿ ïîâåäåíèÿ ð-ýëåêòðîííûõ îáëàêîâ, îáðàçóþùèõ π -ñâÿçè. Ïðîñòðàíñòâåííûå ýôôåêòû ââåäåíû äëÿ îáúÿñíåíèÿ ñâîéñòâ ñîåäèíåíèé, ñâÿçàííûõ ñ âçàèìíûì ðàñïîëîæåíèåì àòîìîâ ìîëåêóëû â òðåõìåðíîì ïðî- ñòðàíñòâå. Ïðèìåðîì èñïîëüçîâàíèÿ ñòåðè÷åñêèõ ýôôåêòîâ ìîæåò áûòü âûñîêàÿ óñòîé÷èâîñòü ê ãèäðîëèçó èìèíà, èçîáðàæåííîãî íà ðèñ. 1.2. Ðèñ. 1.2. Ñòðîåíèå èìèíà. Îáû÷íî ñîåäèíåíèÿ ñî ñâÿçüþ Ñ=NH ãèäðîëèçóþòñÿ ïðîñòî âîäîé. Îä- íàêî ðàññìàòðèâàåìîå ñîåäèíåíèå íå ãèäðîëèçóåòñÿ ïðè êèïÿ÷åíèè â òå- ÷åíèå 8-10 ÷ ñ êîíöåíòðèðîâàííîé ñîëÿíîé êèñëîòîé, 33 % ðàñòâîðîì èëè 10 % ñïèðòîâûì ðàñòâîðîì ãèäðîêñèäà êàëèÿ, íå èçìåíÿåòñÿ ïðè ÷àñîâîì íàãðåâàíèè ñ ñåðíîé êèñëîòîé ïðè 100◦ C. Îáúÿñíÿåòñÿ ýòî ïðîñòðàíñòâåí- íûì ñòðîåíèåì ìîëåêóëû, à èìåííî ýêðàíèðîâàíèåì ìåòèëüíûìè ãðóïïàìè äâîéíîé ñâÿçè, òàêèì îáðàçîì, ðåàêöèÿ èñïûòûâàåò çàòðóäíåíèÿ â ñáëèæå- íèè âçàèìîäåéñòâóþùèõ àòîìîâ [11]. Ðàáîòû Ãàììåòà è Òàôòà ïîëó÷èëè äàëüíåéøåå ðàçâèòèå Ãàí÷åì è Ôóä- æèòîé (Hansch, Fujita), ñôîðìóëèðîâàâøèõ îñíîâû ïîäõîäà QSAR.  1962 ãîäó Ãàí÷ è Ìþà (Muir) îïóáëèêîâàëè áëåñòÿùóþ ðàáîòó ïî ÊÑÑÀ äëÿ ðå- 8
  • 10. ãóëÿòîðîâ ðîñòà ðàñòåíèé, ãäå ïîñòðîåíû çàâèñèìîñòè îò êîñòàíò Ãàììåòà è ãèäðîôîáíîñòè [12]. Èñïîëüçóÿ ñèñòåìó ¾îêòàíîë âîäà¿, áûëè èçìåðå- íû ñåðèè êîýôôèöèåíòîâ ðàñïðåäåëåíèÿ, è òàêèì îáðàçîì ââåäåíà íîâàÿ øêàëà ãèäðîôîáíîñòè. Ïàðàìåòð π , ïðåäñòàâëÿþùèé ñîáîé îòíîñèòåëüíóþ ãèäðîôîáíîñòü, áûë îïðåäåëåí ñëåäóþùèì îáðàçîì: πX = log PX + log PH , ãäå PX è PH ïðåäñòàâëÿþò ñîáîé êîýôôèöèåíòû ðàñïðåäåëåíèÿ çàìåùåí- íîé è ðîäèòåëüñêîé ìîëåêóë ñîîòâåòñòâåííî. Ôóäæèòà è Ãàí÷ îáúåäèíèëè ãèäðîôîáíûå êîíñòàíòû ñ ýëåêòðîííûìè êîíñòàíòàìè Ãàììåòà è ïîëó÷èëè óðàâíåíèå (ò. í. óðàâíåíèå Ãàí÷à) [13]: log 1/C = aσ + bπ + cκ, ãäå log 1/C áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà, a, b, c êîýôôèöèåíòû, σ êîíñòàíòà Ãàììåòà, π ãèäðîôîáíîñòü ìîëåêóëû ïî Ãàí÷ó, κ êîýô- ôèöèåíò ðàñïðåäåëåíèÿ. Âïîñëåäñòâèè, êîãäà áûëî ïîêàçàíî íåàäåêâàòíîå îïèñàíèå ëèíåéíû- ìè óðàâíåíèÿìè â øèðîêèõ äèàïàçîíàõ ãèäðîôîáíîñòè, áûëî ïðåäëîæåíî ïàðàáîëè÷åñêîå óðàâíåíèå Ãàí÷à [14]: log 1/C = a log P + b(log P )2 + cσ + d, ãäå log 1/C áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà, log P ëèïîôèëüíîñòü âåùåñòâà (ëîãàðèôì êîýôôèöèåíòà ðàñïðåäåëåíèÿ â ñèñòåìå ¾í-îêòàíîë âîäà¿), σ êîíñòàíòà Ãàììåòà, a, b, c, d ïîäãîíî÷íûå ïàðàìåòðû. Ïîñëå ïðåäëîæåííîé íåëèíåéíîé ìîäåëè ÷èñëî ðàáîò ðåçêî âîçðàñëî. Áèëèíåéíàÿ ìîäåëü Êóáèíû (Kubinyi) ýòî óòî÷íåíèå ïàðàáîëè÷åñêîé ìîäåëè, è â áîëüøèíñòâå ñëó÷àåâ, êàê îêàçàëîñü, îíà ÿâëÿåòñÿ ïðåâîñõîä- íîé. log 1/C = a log P + b log(βP + 1) + κ, ãäå log 1/C áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü âåùåñòâà, log P ëèïîôèëüíîñòü, a, b, β, κ êîýôôèöèåíòû. Êðîìå ïîäõîäà Ãàí÷à áûëè ðàçðàáîòàíû äðóãèå ìåòîäèêè ðåøåíèÿ çà- äà÷ QSAR. Ôðè è Âèëüñîíîì ïðåäëîæåíî óðàâíåíèå [15]: ∑ BA = ai Xi + u, 9
  • 11. ãäå ÂÀ ýòî áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü, u óñðåäíåííûé âêëàä íåçàìå- ùåííîé ìîëåêóëû, ai ïðîïîðöèîíàëüíûé êîýôôèöèåíò âêëàäà êàæäîé ñòðóêòóðíîé ÷àñòè; Xi îïèñûâàåò íàëè÷èå Xi = 1 èëè îòñóòñòâèå Xi = 0 êîíêðåòíîãî ñòðóêòóðíîãî ôðàãìåíòà. Ïðè íàëè÷èè â ñèñòåìå íåêîòîðîãî íàáîðà çàìåñòèòåëåé â îïðåäåëåííûõ ïîëîæåíèÿõ óäîáíî ïîñòðîèòü ìàò- ðèöó Ôðè-Âèëüñîíà, îòîáðàæàþùóþ ïðèñóòñòâèå (èëè îòñóòñòâèå) çàìå- ñòèòåëåé. Îáðàáîòêà òàêîãî ìàññèâà äàííûõ, íàïðèìåð, ñ ïîìîùüþ ìåòî- äà íàèìåíüøèõ êâàäðàòîâ (ñì. ðàçä. 1.1.7) ïîçâîëÿåò ïîëó÷èòü èñêîìóþ ôóíêöèîíàëüíóþ çàâèñèìîñòü àêòèâíîñòè îò ïàðàìåòðîâ ñòðóêòóðû. Äëÿ ïðåîäîëåíèÿ îãðàíè÷åíèé ìîäåëè Ôðè-Âèëüñîíà ïðåäëîæåíî óðàâ- íåíèå Ôóäæèòà-Áàí (Fujita-Ban) [16]: ∑ log BA = Gi Xi + u, ãäå u îïðåäåëåíà êàê âû÷èñëåííîå çíà÷åíèå áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè íåçà- ìåùåííîãî èñõîäíîãî ñîåäèíåíèÿ â êîíêðåòíîì îïûòå. Gi ïðåäñòàâëÿåò ñî- áîé ýíåðãåòè÷åñêèé âêëàä â áèîëîãè÷åñêóþ àêòèâíîñòü çàìåñòèòåëåé, Xi îïèñûâàåò íàëè÷èå Xi = 1 èëè îòñóòñòâèå Xi = 0 êîíêðåòíîãî ñòðóêòóð- íîãî ôðàãìåíòà. Òîïîëîãè÷åñêèå ìåòîäû èñïîëüçîâàëèñü äëÿ óñòàíîâëåíèÿ ñâÿçè ìåæäó ñòðóêòóðîé è ôèçè÷åñêîé èëè áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòüþ. Ìåòîä ìèíèìó- ìà òîïîëîãè÷åñêèõ îòëè÷èé Ñàéìîíà (Simon) è ìíîãî÷èñëåííûå ðàáîòû ïî ìîëåêóëÿðíîé ñìåæíîñòè Êèðà è Õîëëà (Kier, Hall) îáåñïå÷èëè ðàçâèòèå QSAR. Èíäåêñû ìàòðèöû ñìåæíîñòè, îñíîâàííûå íà ñêåëåòíûõ ìîëåêó- ëÿðíûõ ñòðóêòóðàõ (îðãàíè÷åñêèå ìîëåêóëû, èñêëþ÷àÿ àòîìû âîäîðîäà), äàþò áîãàòóþ èíôîðìàöèþ î ðàçâåòâëåííîñòè, òðåõàòîìíûõ ôðàãìåíòàõ, óãëå çàìåùåíèÿ, ñõîäñòâå çàìåñòèòåëåé, äëèíå è ãåòåðîàòîìàõ â çàìåùåí- íûõ êîëüöàõ. Èçâåñòíû áîëåå ïîçäíèå ðàçðàáîòêè òåîðèè QSAR, â òîì ÷èñëå HQSAR (Hologram QSAR), îáðàòíûé QSAR è äâîè÷íûé QSAR [1721]. 1.1.3 Êëàññèôèêàöèÿ äåñêðèïòîðîâ Âîçìîæíû ðàçëè÷íûå ñïîñîáû êëàññèôèêàöèè äåñêðèïòîðîâ. Òðè òèïà êëàññèôèêàöèè ðàññìîòðåíû â ñòàòüå [22]. Äåñêðèïòîðû ïåðâîãî òèïà äåëÿòñÿ íà ÷èñòûå (îïèñûâàþùèå êàêîé- ëèáî îäèí ýôôåêò ìåæàòîìíûõ âçàèìîäåéñòâèé) è êîìïîçèòíûå (îïèñû- 10
  • 12. âàþùèå äâà è áîëåå ýôôåêòà). Ñðåäè êîìïîçèòíûõ äåñêðèïòîðîâ, â ñâîþ î÷åðåäü, âûäåëÿþòñÿ óíèêîìïîçèòíûå (îïèñûâàþùèå ýôôåêòû îäíîãî è òîãî æå òèïà) è ìóëüòèêîìïîçèòíûå (îòîáðàæàþùèå ñóììó ýôôåêòîâ ðàç- ëè÷íûõ òèïîâ). Âòîðîé òèï êëàññèôèêàöèè îñíîâûâàåòñÿ íà ñïîñîáàõ îöåíêè äåñêðèï- òîðîâ ýêñïåðèìåíòàëüíûå èëè òåîðåòè÷åñêèå. Òðåòèé òèï êëàññèôèêàöèè îñíîâûâàåòñÿ íà ó÷åòå ýôôåêòà, êîòîðûé îïèñûâàåò äàííûé äåñêðèïòîð. Ïðåäëàãàåòñÿ ðàññìàòðèâàòü òðè êàòåãîðèè ýôôåêòîâ: ýëåêòðîííûå (ýëåêòðè÷åñêèå), ñòåðè÷åñêèå è ìåæìîëåêóëÿðíûå. ×àñòíûì ñëó÷àåì èñïîëüçîâàíèÿ ýòîãî òèïà êëàññèôèêàöèè ÿâëÿåòñÿ êëàñ- ñè÷åñêîå óðàâíåíèå Ãàí÷à (ñì. âûøå), êîòîðîå îïèñûâàåò áèîëîãè÷åñêóþ àêòèâíîñòü êàê ôóíêöèþ êîíñòàíò Ãàììåòà (ýëåêòðîííûå ýôôåêòû), Òàô- òà (ñòåðè÷åñêèå ýôôåêòû) è êîíñòàíò ãèäðîôîáíîñòè (òðàíñïîðòíûå ýô- ôåêòû çà ñ÷åò ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé). Äëÿ íàãëÿäíîñòè îïèñàíèÿ ñòðóêòóðû õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ïðåäëà- ãàåòñÿ èñïîëüçîâàòü ãåîìåòðè÷åñêèå ôèãóðû, ñîîòâåòñòâóþùèå ðàññìàòðè- âàåìîìó óðîâíþ ñòðóêòóðû: ýëåìåíòíûé óðîâåíü → äâóìåðíàÿ ñòðóêòóðà → òðåõìåðíàÿ ñòðóêòóðà → îáúåìíûå ñâîéñòâà → ñòåðåîäèíàìè÷åñêàÿ ñòðóêòóðà → ñòåðåîýëåêòðîííàÿ ñòðóêòóðà → âçàèìîäåéñòâèÿ ñ îêðóæå- íèåì. Ïðè ýòîì èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå êàæäîãî óðîâíÿ âêëþ÷àåò èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ïðåäûäóùåãî óðîâíÿ. Ðèñ. 1.3. Êëàññèôèêàöèÿ äåñêðèïòîðîâ. Íà ðèñ. 1.3 ïðåäñòàâëåíà ñõåìà óðîâíåé äåñêðèïòîðîâ, íà êîòîðîé ïî- ñëåäóþùèé óðîâåíü âêëþ÷àåò èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ïðåäûäóùåãî 11
  • 13. óðîâíÿ. Ïðè òàêîì ïðåäñòàâëåíèè ïðåäïîëàãàåòñÿ, ÷òî äåñêðèïòîðû ñòðóê- òóðíîé ôîðìóëû íåñóò âñþ èíôîðìàöèþ, ñîäåðæàùóþñÿ â äåñêðèïòîðàõ ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ; äåñêðèïòîðû ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû âêëþ÷àþò âñþ èíôîðìàöèþ, ñîäåðæàùóþñÿ â äåñêðèïòîðàõ ñòðóêòóðíîé ôîðìóëû, à äå- ñêðèïòîðû ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé ñîäåðæàò âñþ èíôîðìàöèþ âñåõ ïðåäûäóùèõ óðîâíåé. Èíîãäà äåñêðèïòîðû ìîãóò è íå ñîäåðæàòü èí- ôîðìàöèþ ïðåäûäóùåãî óðîâíÿ (íàïðèìåð, òàêèå äåñêðèïòîðû ìåæ ìîëå- êóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé, êàê ïîëÿðèçóåìîñòü, ãèäðîôîáíîcòü, ÷àñòî ðàñ- ñ÷èòûâàþòñÿ áåç ó÷åòà òðåõìåðíîé ñòðóêòóðû), îäíàêî â öåëîì óêàçàííûé ïîäõîä ê êëàññèôèêàöèè äåñêðèïòîðîâ ÿâëÿåòñÿ íàãëÿäíûì, îòðàæàåò ñòå- ïåíü èõ ñëîæíîñòè è, ñëåäîâàòåëüíî, óäîáåí ïðè àíàëèçå.  äàííîì îáçîðå ðàññìîòðåí êàæäûé êëàññ äåñêðèïòîðîâ. Ñëåäóåò îòìåòèòü, ÷òî äåñêðèï- òîð ëþáîãî èç óêàçàííûõ óðîâíåé ìîæåò õàðàêòåðèçîâàòü êàê ìîëåêóëó â öåëîì, òàê è åå ÷àñòü (ôðàãìåíò, ñêðèí, ôóíêöèîíàëüíóþ ãðóïïó, çàìåñòè- òåëü). Äåñêðèïòîðû ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ. Áðóòòî-ôîðìóëà ñîäåðæèò èí- ôîðìàöèþ î ñîðòàõ àòîìîâ, âõîäÿùèõ â ìîëåêóëó, è ÷èñëå àòîìîâ êàæäîãî ñîðòà. Åäèíñòâåííûì ñâîéñòâîì, êîòîðîå ìîæåò áûòü òî÷íî ïðåäñêàçàíî íà îñíîâàíèè áðóòòî-ôîðìóëû, ÿâëÿåòñÿ ìîëåêóëÿðíàÿ ìàññà (M W ), êîòî- ðóþ ìîæíî ðàññìàòðèâàòü êàê äåñêðèïòîð ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ.  êà÷åñòâå äðóãèõ äåñêðèïòîðîâ ýòîãî óðîâíÿ èíîãäà áåðóò ÷èñëà àòîìîâ êàêîãî-ëèáî ñîðòà.  öåëîì æå äåñêðèïòîðû ýëåìåíòíîãî óðîâíÿ ñîäåðæàò ñëèøêîì ìàëî èíôîðìàöèè î ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðå è ïîýòîìó íå ìîãóò ñàìîñòî- ÿòåëüíî èñïîëüçîâàòüñÿ äëÿ âûÿâëåíèÿ ðåàëüíûõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà ñâîéñòâî. Òîïîëîãè÷åñêèå äåñêðèïòîðû. Ñòðóêòóðíàÿ ôîðìóëà ìîëåêóëû ÿâ- ëÿåòñÿ íàèáîëåå ðàñïðîñòðàíåííûì ñïîñîáîì îïèñàíèÿ õèìè÷åñêîãî ñîåäè- íåíèÿ. Êàê ìîäåëü ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðû òàêàÿ ôîðìóëà ñîäåðæèò ýëå- ìåíòû èêîíè÷åñêèõ, àíàëîãîâûõ è àáñòðàêòíûõ ìîäåëåé è ÿâëÿåòñÿ îñíî- âîé äëÿ êîíñòðóèðîâàíèÿ ìíîãèõ âèäîâ äåñêðèïòîðîâ è, ïðåæäå âñåãî, òî- ïîëîãè÷åñêèõ äåñêðèïòîðîâ. Òîïîëîãè÷åñêèå äåñêðèïòîðû (èíäåêñû) ðàñ- ñ÷èòûâàþòñÿ íà îñíîâå îïèñàíèÿ ñòðóêòóðíîé ôîðìóëû ñîåäèíåíèÿ ñ ïî- ìîùüþ ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà, ïðåäñòàâëÿþùåãî ñîáîé äâóìåðíîå îòîáðà- æåíèå ìîëåêóëû (âåðøèíû ñîîòâåòñòâóþò àòîìàì, à ðåáðà õèìè÷åñêèì ñâÿçÿì ìîëåêóëû). Ïðè ýòîì îáû÷íî ðàññìàòðèâàþòñÿ ñêåëåòíûå àòîìû 12
  • 14. (ñî ¾ñòåðòûìè¿ àòîìàìè âîäîðîäà) è ñâÿçè ìåæäó íèìè. Ìàòðè÷íûé âèä ãðàôîâ èñïîëüçóåòñÿ äëÿ îöåíêè òîïîëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ. Íàèáîëåå ÷àñòî ïðèìåíÿþòñÿ ìàòðèöà ñìåæíîñòè A(G) è ìàòðèöà ðàññòîÿíèé D(G). Äåñêðèïòîðû ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû ìîëåêóë.  êâàíòîâî-õèìè- ÷åñêèõ ðàñ÷åòàõ ñëîæíûõ ìîëåêóë èñïîëüçóþòñÿ àòîìíûå è ìîëåêóëÿðíûå êâàíòîâî-õèìè÷åñêèå äåñêðèïòîðû.  äàííîì ðàçäåëå êðàòêî ðàññìîòðå- íû òîëüêî êâàíòîâî-õèìè÷åñêèå äåñêðèïòîðû, îïèñûâàþùèå âíóòðèìîëå- êóëÿðíûå ýëåêòðîííûå ñâîéñòâà. Òàêèì îáðàçîì, â êà÷åñòâå èíäåêñà ìîëå- êóëÿðíîé ñòðóêòóðû ìîãóò âûñòóïàòü çàðÿäû íà àòîìàõ, ýíåðãèè âûñøåé çàíÿòîé è íèçøåé ñâîáîäíîé ìîëåêóëÿðíîé îðáèòàëåé, äèïîëüíûé ìîìåíò. Äåñêðèïòîðû äàííîãî òèïà ìîãóò áûòü ñâîéñòâàìè ìîëåêóëû èëè óêàçû- âàòü íà êàêîé-òî áîëåå ïðåäïî÷òèòåëüíûé òèï âçàèìîäåéñòâèÿ. Ýíåðãèÿ âûñøåé çàíÿòîé (EHOM O ) è íèçøåé íåçàíÿòîé (ELU M O ) ìîëå- êóëÿðíûõ îðáèòàëåé äåñêðèïòîðû, êîòîðûå ÷àñòî èñïîëüçóþòñÿ â ðàñ÷å- òàõ ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû ìîëåêóë [2325]. Óñòàíîâëåíî, ÷òî â ðÿäå ñëó- ÷àåâ çíà÷åíèÿ EHOM O ïðÿìî êîððåëèðóþò ñ ïîòåíöèàëîì èîíèçàöèè (I ) è õàðàêòåðèçóþò âîñïðèèì÷èâîñòü ìîëåêóëû ê àòàêå ýëåêòðîôèëàìè. Çíà- ÷åíèÿ æå ELU M O êîððåëèðóþò ñ âåëè÷èíîé ñðîäñòâà ê ýëåêòðîíó (À) è õà- ðàêòåðèçóþò âîñïðèèì÷èâîñòü ìîëåêóëû ê àòàêå íóêëåîôèëàìè. Îòìåòèì, ÷òî I è À èñïîëüçóþòñÿ òàêæå â êà÷åñòâå ñàìîñòîÿòåëüíûõ äåñêðèïòîðîâ ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû [26, 27]. Ñ÷èòàåòñÿ, ÷òî ðàçíîñòü EHOM O − ELU M O îòðàæàåò ìåðó ñòàáèëüíîñòè ìîëåêóëû [28]. Ïîíÿòèÿ æåñòêîñòè è ìÿãêî- ñòè ìîëåêóë ñâÿçàíû èìåííî ñ ýòèìè äåñêðèïòîðàìè ýëåêòðîííîé ñòðóê- òóðû [29]. Äåñêðèïòîð ìîëåêóëÿðíàÿ æåñòêîñòü (η ): I −A η= 2 òàêæå íàøåë ïðèìåíåíèå â ñîîòíîøåíèÿõ ñòðóêòóðà ñâîéñòâî. Äåñêðèïòîðû ìîëåêóëÿðíîé ôîðìû.  íàñòîÿùåå âðåìÿ íåîáõî- äèìîñòü ó÷åòà îñîáåííîñòåé ïðîñòðàíñòâåííîé ñòðóêòóðû ïðè âûÿâëåíèè âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà ñâîéñòâà î÷åâèäíà. Äîñòàòî÷íî îòìåòèòü, ÷òî ïðàêòè÷åñêè âñå ñîâðåìåííûå àâòîìàòèçèðîâàííûå ñèñòåìû ïîèñêà íîâûõ ñîåäèíåíèé ñîäåðæàò â êà÷åñòâå îáÿçàòåëüíûõ ýëåìåíòîâ ðàçëè÷íûå ïðîöå- äóðû ñðàâíåíèÿ ïðîñòðàíñòâåííûõ ñòðóêòóð ìîëåêóë. Îïèñàíèå òðåõìåð- íîé ñòðóêòóðû ìîëåêóë êàêèì-ëèáî îäíèì êîëè÷åñòâåííûì äåñêðèïòîðîì (èëè íàáîðîì äåñêðèïòîðîâ) äîñòàòî÷íî ñëîæíàÿ çàäà÷à. 13
  • 15. Êîëè÷åñòâåííîå ñîïîñòàâëåíèå ïðîåêöèé ñòðóêòóðû ìîëåêóë íà òðè îð- òîãîíàëüíûõ ïëîñêîñòè âïåðâûå áûëî ïðîâåäåíî Ýéìóðîì (Amoore) ïðè èçó÷åíèè âçàèìîñâÿçè ñòðóêòóðû õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ñ èõ çàïàõîì. Ãëàâíàÿ ïðîáëåìà, âîçíèêàþùàÿ ïðè ñðàâíåíèè ïàðàìåòðîâ òðåõìåðíîé ñòðóêòóðû ìîëåêóë ðàçëè÷íûõ ñîåäèíåíèé, ñâÿçàíà ñ èõ êîíôîðìàöèîí- íîé ïîäâèæíîñòüþ. Ñ ïîÿâëåíèåì äîïîëíèòåëüíîé îñè âíóòðåííåãî âðàùå- íèÿ ýêñïîíåíöèàëüíî âîçðàñòàåò ÷èñëî âîçìîæíûõ êîíôîðìàöèé, ïîýòîìó òðåáóþòñÿ îïðåäåëåííûå îãðàíè÷åíèÿ, à òàêæå ñïåöèàëüíûå ïðîöåäóðû îò- áîðà ðåàëüíûõ êîíôîðìàöèé è ñðàâíåíèÿ èõ ôîðì.  íàñòîÿùåå âðåìÿ ñóùåñòâóåò ðÿä ìåòîäîâ îöåíêè äåñêðèïòîðîâ ìîëå- êóëÿðíîé ôîðìû. Íàèáîëåå ïîïóëÿðíûå ñðåäè òàêèõ ïîäõîäîâ: ìåòîä äèñòàíöèîííîé ãåî- ìåòðèè, ìîäåëü ñâÿçûâàþùåé ñòîðîíû, àíàëèç ìîëåêóëÿðíîé ôîðìû, îöåí- êà ìîëåêóëÿðíûõ ïîçèöèé è ïð. Äåñêðèïòîðû ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé. Êîëè÷åñòâåí- íî îïèñàòü ìåæìîëåêóëÿðíûå âçàèìîäåéñòâèÿ ïðè óñòàíîâëåíèè âçàèìî- ñâÿçåé ñòðóêòóðà áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü ìîæíî ñ ïîìîùüþ ðàçíîñòè ñâîáîäíûõ ýíåðãèé: ∆G = Gf − Gi , ãäå Gf è Gi ñâîáîäíàÿ ýíåðãèÿ êîíå÷íîãî è èñõîäíîãî ñîñòîÿíèé ñîîò- âåòñòâåííî. Íàïðèìåð, ïðè ìîäåëèðîâàíèè âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà-àêòèâíîñòü â êà÷åñòâå äåñêðèïòîðà äîñòàòî÷íî ÷àñòî èñïîëüçóþòñÿ êîíñòàíòû äèññîöè- àöèè êèñëîò è îñíîâàíèé (pKa ). Çíà÷èòåëüíàÿ ãðóïïà äåñêðèïòîðîâ ìåæìîëåêóëÿðíûõ âçàèìîäåéñòâèé, îöåíèâàåìàÿ èç ýêñïåðèìåíòàëüíûõ äàííûõ ïî ðåàêöèîííîé ñïîñîáíîñòè, ñîñòîèò èç ðàçëè÷íûõ êîíñòàíò, îïèñûâàþùèõ ýëåêòðîííîå âëèÿíèå çàìå- ñòèòåëåé íà ðåàêöèîííóþ ñïîñîáíîñòü õèìè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé. Îñíîâû ýòî- ãî íàïðàâëåíèÿ áûëè çàëîæåíû Ãàììåòîì, óñòàíîâèâøèì çíà÷åíèÿ ïàðà- ìåòðà σ (êîíñòàíòà Ãàììåòà) íà îñíîâå ñîîòíîøåíèÿ: σX = lg KX − lg KH , ãäå KX ñîîòâåòñòâóþùàÿ êîíñòàíòà äëÿ ìåòà- èëè ïàðà-çàìåùåííîé áåí- çîéíîé êèñëîòû, KH êîíñòàíòà èîíèçàöèè äëÿ áåíçîéíîé êèñëîòû â âîäå ïðè 25◦ Ñ. 14
  • 16. Èíäèêàòîðíûå äåñêðèïòîðû. Ïðè ìîäåëèðîâàíèè âçàèìîñâÿçè ñòðó- êòóðà-ñâîéñòâî (àêòèâíîñòü) äîñòàòî÷íîå ðàñïðîñòðàíåíèå ïîëó÷èëè èíäè- êàòîðíûå äåñêðèïòîðû (èíîãäà èõ íàçûâàþò êîíñòàíòû de novo). Îòíåñòè ýòè äåñêðèïòîðû ê êàêîìó-ëèáî îäíîìó îïðåäåëåííîìó êëàññó òðóäíî, ïî- ñêîëüêó îíè ìîãóò êîäèðîâàòü â íåÿâíîì âèäå ðàçëè÷íûå ñòðóêòóðíûå îñî- áåííîñòè ñîåäèíåíèé (ñâîéñòâà äîíîðîâ èëè àêöåïòîðîâ âîäîðîäíîé ñâÿçè, íàëè÷èå èëè îòñóòñòâèå âîäîðîäíîé ñâÿçè âíóòðè ìîëåêóë, îðòî-ýôôåêòû, öèñ-òðàíñ- èëè ñòåðåîèçîìåðèþ, ðàçëè÷íûå ôðàãìåíòû è ò. ä.). Èíäèêàòîðíûå äåñêðèïòîðû îñîáåííî ïîëåçíû íà ðàííèõ ñòàäèÿõ èñ- ñëåäîâàíèé. Ñ ïîìîùüþ òàêèõ äåñêðèïòîðîâ ìîãóò ïðåäâàðèòåëüíî ôîð- ìèðîâàòüñÿ êîìáèíàöèè ðàçëè÷íûõ ïîäâûáîðîê ñîåäèíåíèé ñ ðàññìàòðè- âàåìûì ñâîéñòâîì äëÿ ïîëó÷åíèÿ îáó÷àþùåé âûáîðêè, ïðåäíàçíà÷åííîé äëÿ ìîäåëèðîâàíèÿ ñâÿçè ñòðóêòóðà ñâîéñòâî íà îñíîâå óæå áîëåå óãëóá- ëåííîãî îïèñàíèÿ ñòðóêòóðû. 1.1.4 Íåîáõîäèìûå êà÷åñòâà äåñêðèïòîðîâ  ëèòåðàòóðå ïðèíÿòî ëþáóþ âåëè÷èíó, õàðàêòåðèçóþùóþ ñòðóêòóðó ìîëåêóëû, íàçûâàòü äåñêðèïòîðîì ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðû. Ê íàñòîÿùå- ìó âðåìåíè îïèñàíî ìíîæåñòâî äåñêðèïòîðîâ. Ïîíÿòíî, ÷òî óãëóáëåíèå ïðåäñòàâëåíèé î ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðå ïîáóæäàåò ê ñîçäàíèþ åå íîâûõ ìîäåëåé è íîâûõ äåñêðèïòîðîâ, îòðàæàþùèõ ýòè ïðåäñòàâëåíèÿ. Îïðàâ- äàíû òàêæå ïîïûòêè ñîçäàíèÿ íîâûõ äåñêðèïòîðîâ, êîòîðûå ïðè ââîäå â êîìïüþòåðíûå ïðîãðàììû ëó÷øå ïî ñðàâíåíèþ ñ ïðåäûäóùèìè äåñêðèï- òîðàìè ñîõðàíÿþò è èñïîëüçóþò èíôîðìàöèþ î ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðå. Òåì íå ìåíåå, ââîäèòü íîâûå äåñêðèïòîðû öåëåñîîáðàçíî òîëüêî â äâóõ ñëó÷àÿõ: åñëè íè îäèí èç ñóùåñòâóþùèõ äåñêðèïòîðîâ èëè èõ ñî÷åòàíèå íå îáåñïå÷èâàþò ñîçäàíèÿ óñòîé÷èâûõ ìîäåëåé ñòðóêòóðà ñâîéñòâî â ðàñ- ñìàòðèâàåìîé îáó÷àþùåé âûáîðêå è åñëè íîâûé äåñêðèïòîð îáåñïå÷èâàåò çíà÷èòåëüíîå óëó÷øåíèå ñòàòèñòè÷åñêèõ êðèòåðèåâ ìîäåëè. Íîâûå äåñêðèïòîðû äîëæíû áûòü äîñòóïíû äëÿ îöåíêè èõ çíà÷åíèé, óäîáíû â èñïîëüçîâàíèè, óíèâåðñàëüíû, äîëæíû ïîëíî îïèñûâàòü äàííóþ ñòðóêòóðíóþ îñîáåííîñòü è áûòü èíòåðïðåòèðóåìûìè. Ê ñîæàëåíèþ, äàëåêî íå âñåãäà óêàçàííûå âûøå òðåáîâàíèÿ ïðèíèìà- þòñÿ âî âíèìàíèå. Ýôôåêòèâíîñòü äåñêðèïòîðîâ ðàçíûõ êëàññîâ, èñïîëü- 15
  • 17. çóþùèõñÿ â èññëåäîâàíèÿõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà áèîëîãè÷åñêàÿ àê- òèâíîñòü, âûÿâëÿåòñÿ ïðè ñðàâíåíèè ñòàòèñòè÷åñêèõ êðèòåðèåâ ìîäåëåé, ïîñòðîåííûõ íà ýòèõ äåñêðèïòîðàõ. Íàïðèìåð, â ðÿäå ðàáîò [30, 31] ïðî- âåäåíî ñðàâíåíèå ìîäåëåé êëàññèôèêàöèè àãîíèñòîâ è àíòàãîíèñòîâ ñðåäè çàìåùåííûõ ôåíèëýòèëàìèíîâ íà îñíîâå ðÿäà òîïîëîãè÷åñêèõ è ôèçèêî- õèìè÷åñêèõ äåñêðèïòîðîâ ñ èñïîëüçîâàíèåì ëèíåéíîãî äèñêðèìèíàíòíî- ãî àíàëèçà, äèñêðåòíî-ðåãðåññèîííîé ìîäåëè è êëàñòåð-çíà÷èìîãî àíàëèçà. Íàèëó÷øèé ðåçóëüòàò âî âñåõ óêàçàííûõ òèïàõ êëàññèôèêàöèè áûë ïîëó- ÷åí ïðè èñïîëüçîâàíèè äåñêðèïòîðîâ âîäîðîäíîé ñâÿçè [32]. Ïðè ñîçäàíèè ìîäåëåé ñòðóêòóðà áèîëîãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü áîëüøîå çíà÷åíèå â îòáîðå äåñêðèïòîðîâ èìåþò ñîâðåìåííûå ïðåäñòàâëåíèÿ î ïðî- öåññàõ â îðãàíèçìå, ïðîèñõîäÿùèõ ñ ó÷àñòèåì õèìè÷åñêèõ âåùåñòâ. Íà- ïðèìåð, â íàñòîÿùåå âðåìÿ ñ÷èòàåòñÿ, ÷òî ñëîæíûé ìåõàíèçì âîçäåéñòâèÿ âåùåñòâà íà îðãàíèçì ñîñòîèò èç òðåõ ñòàäèé: ôàðìàöåâòè÷åñêîé, ôàðìà- êîêèíåòè÷åñêîé è ôàðìàêîäèíàìè÷åñêîé. Ôàðìàöåâòè÷åñêàÿ ñòàäèÿ ñâÿçà- íà ñ ââåäåíèåì âåùåñòâà â îðãàíèçì è âêëþ÷àåò ïðîöåññû äåçèíòåãðàöèè ãîòîâîé ôîðìû. Ôàðìàêîêèíåòè÷åñêàÿ ñòàäèÿ îïðåäåëÿåòñÿ òðàíñïîðòîì âåùåñòâà îò ìåñòà ââåäåíèÿ äî êîíêðåòíîé áèîëîãè÷åñêîé ìèøåíè è âêëþ- ÷àåò â ñåáÿ ïðîöåññû àáñîðáöèè, ðàñïðåäåëåíèÿ, ìåòàáîëèçìà è âûäåëåíèÿ. Íà ýòîé ñòàäèè ñóùåñòâåííîå çíà÷åíèå èìååò ðåàêöèîííàÿ ñïîñîáíîñòü èñ- õîäíûõ ñîåäèíåíèé è èõ ñïîñîáíîñòü ê êîìïëåêñîîáðàçîâàíèþ. Ôàðìàêî- äèíàìè÷åñêàÿ ñòàäèÿ õàðàêòåðèçóåòñÿ âçàèìîäåéñòâèåì èñõîäíîãî âåùå- ñòâà èëè åãî ïðîäóêòîâ ñ áèîëîãè÷åñêèìè ìèøåíÿìè, îáóñëîâëèâàþùèìè êîíêðåòíûé âèä áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòè. Íà ýòîì ýòàïå áîëüøîå çíà÷å- íèå èìååò òðåõìåðíàÿ ñòðóêòóðà âçàèìîäåéñòâóþùèõ ïàðòíåðîâ. Èñêëþ÷è- òåëüíàÿ ïîïóëÿðíîñòü òðåõïàðàìåòðîâîãî óðàâíåíèÿ Ãàí÷à-Ôóäæèòû ñâÿ- çàíà ïðåæäå âñåãî ñ èñïîëüçîâàíèåì äåñêðèïòîðîâ ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû (êîíñòàíòû Ãàììåòà), ñòåðè÷åñêèõ âçàèìîäåéñòâèé (ñòåðè÷åñêèå êîíñòàí- òû Òàôòà) è òðàíñïîðòíûõ ñâîéñòâ (êîýôôèöèåíò ðàñïðåäåëåíèÿ â ñèñòåìå ¾í-îêòàíîë âîäà¿). Ïîäîáíûå ìîäåëè è ñîîòâåòñòâóþùèå óðàâíåíèÿ è â íàñòîÿùåå âðåìÿ óñïåøíî èñïîëüçóþòñÿ â ìîëåêóëÿðíîì äèçàéíå áèîëîãè- ÷åñêè àêòèâíûõ âåùåñòâ. Íàïðèìåð, íà îñíîâå òðåõ äåñêðèïòîðîâ ïîëó÷åíî óðàâíåíèå äëÿ ðÿäà áèöèêëè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé, îïèñûâàþùåå èõ ñïîñîá- íîñòü ñâÿçûâàòü ìóñêàðèíîâûé ðåöåïòîð [33]. 16
  • 18. lg K = 1.28(±0.15) lg P − 0.09(±0.06) Ca + +0.27(±0.08)HBA5.3A − 4.58(±0.48), ˚ ãäå K êîíñòàíòà ðàâíîâåñèÿ â ðåàêöèè ìåæäó ñóáñòðàòîì è ðåöåïòîðîì; P êîýôôèöèåíò ðàñïðåäåëåíèÿ âåùåñòâà â ñèñòåìå ¾îêòàíîë âîäà¿; ˚ HBA5.3A äåñêðèïòîð, õàðàêòåðèçóþùèé âçàèìîäåéñòâèå äâóõ àêöåïòî- ˚ ðîâ âîäîðîäíîé ñâÿçè, íàõîäÿùèõñÿ íà ðàññòîÿíèè 5.3 A; N = 27; r = 0.918; S = 0.38; F = 41.1. Ïåðâûé èç äåñêðèïòîðîâ õàðàêòåðèçóåò òðàíñïîðòíûå âîçìîæíîñòè ñî- åäèíåíèé, âòîðîé ñâÿçàí ñ ðàñòâîðèìîñòüþ ñîåäèíåíèé â âîäå è èõ ñïîñîá- íîñòüþ îáðàçîâûâàòü âîäîðîäíûå ñâÿçè ñ äîíîðíûìè öåíòðàìè ðåöåïòîðà, à òðåòèé äåñêðèïòîð óêàçûâàåò íà âàæíóþ ðîëü ðàññòîÿíèÿ ìåæäó äâóìÿ êîíêðåòíûìè àêöåïòîðàìè âîäîðîäíîé ñâÿçè ïðè îáðàçîâàíèè ñóáñòðàò- ðåöåïòîðíîãî êîìïëåêñà. Íà ïðèìåðå ýòîé ìîäåëè ðàññìîòðèì âåëè÷èíû, êîòîðûå òðàäèöèîí- íî èñïîëüçóþòñÿ äëÿ îöåíêè êà÷åñòâà. N ÷èñëî âåùåñòâ â âûáîðêå, ïî êîòîðûì ñòðîèòñÿ ìîäåëü. ×åì áîëüøå ÷èñëî N , òåì, êàê ïðàâèëî, âûøå ïðåäñêàçàòåëüíàÿ ñèëà ìîäåëè. r êîýôôèöèåíò ëèíåéíîé êîððåëÿöèè. ×åì áëèæå çíà÷åíèå r ê åäèíèöå, òåì òî÷íåå âûïîëíÿåòñÿ ãèïîòåçà î ëè- íåéíîì õàðàêòåðå çàâèñèìîñòè.  ïðîòèâîïîëîæíîñòü êîýôôèöèåíòó ëè- íåéíîé êîððåëÿöèè ñòàíäàðòíîå îòêëîíåíèå S ÿâëÿåòñÿ àáñîëþòíîé ìåðîé ïðèãîäíîñòè ìîäåëè. ×åì íèæå çíà÷åíèå S , òåì ìåíüøå îøèáêà ïðîãíîçè- ðîâàíèÿ ìîäåëè. F êðèòåðèé Ôèøåðà îäèí èç íàèáîëåå èçâåñòíûõ îáîáù¼ííûõ ñòàòèñòè÷åñêèõ êðèòåðèåâ îöåíêè êà÷åñòâà ìîäåëèðîâàíèÿ. Áîëåå ïîäðîáíî ýòè âåëè÷èíû äëÿ ñëó÷àÿ ìíîæåñòâåííîé ëèíåéíîé ðåãðåñ- ñèè ðàññìàòðèâàþòñÿ â ðàçäåëå 1.1.7. Ïðè ñîçäàíèè ìîäåëåé íåîáõîäèìî ñîáëþäåíèå è ôîðìàëüíûõ êðèòåðè- åâ. Ñ òî÷êè çðåíèÿ ñòàòèñòèêè ÷èñëî ðàññìàòðèâàåìûõ ñîåäèíåíèé äîëæ- íî âî ìíîãî ðàç ïðåâûøàòü ÷èñëî äåñêðèïòîðîâ. Ïðè ýòîì äåñêðèïòîðû äîëæíû áûòü äîñòàòî÷íî èíôîðìàòèâíûìè è â òî æå âðåìÿ ìåæäó íèìè íå äîëæíî áûòü âçàèìíîé êîððåëÿöèè. Äîñòèãàåòñÿ ýòî ðàçëè÷íûìè ïðî- öåäóðàìè, âêëþ÷àÿ ýêñïåðèìåíòàëüíûé äèçàéí, ìåòîä SIMCA/PLS, ãëàâ- íîêîìïîíåíòíûé è ôàêòîðíûé àíàëèçû. 17
  • 19. 1.1.5 Îáçîð äåñêðèïòîðîâ Òîïîëîãè÷åñêèå è òåîðåòèêî-èíôîðìàöèîííûå èíäåêñû Òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû. Êàê îòìå÷àëîñü âûøå, áîëüøàÿ ÷àñòü òîïî- ëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ ñòðîèòñÿ ïðè ïîìîùè ìàòðèöû ñâÿçíîñòè è ìàòðèöû êðàò÷àéøèõ ðàññòîÿíèé ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà. Íàèáîëåå ðàñïðîñòðàíåí- íûìè òîïîëîãè÷åñêèìè èíäåêñàìè, ðàññ÷èòûâàåìûìè íà îñíîâå ìàòðèöû ñìåæíîñòè, ÿâëÿþòñÿ èíäåêñ Ïëàòà F (G) (ðàâåí ñóììå ñòåïåíåé êàæäî- ãî ðåáðà â ãðàôå G); èíäåêñ Ãîðäîíà-Ñêàíòëáåðè Y (G) (ðàâåí ÷èñëó ïó- òåé äëèíû 2); èíäåêñ ïîëíîé ñìåæíîñòè A′ (G) (ðàâåí ñóììå âñåõ íåíóëå- âûõ ýëåìåíòîâ ìàòðèöû ñìåæíîñòè); èíäåêñ ñâÿçíîñòè Ðàíäè÷à χ(G) (áó- äåò îáñóæäàòüñÿ íèæå), èíäåêñû çàãðåáñêîé ãðóïïû M (G) è Ì′ (G). Ñðå- äè äåñêðèïòîðîâ, ðàññ÷èòûâàåìûõ íà îñíîâå ìàòðèöû ðàññòîÿíèé, ìîæíî îòìåòèòü èíäåêñ Âèíåðà W (G), èíäåêñ Õîñîéè Z(G), ÷èñëî ïîëÿðíîñòè P (G), èíäåêñ ñóììû ðàññòîÿíèé S(G), èíäåêñ ðàññòîÿíèé ìåæäó âåðøèíà- ìè V DI(G). Ðèñ. 1.4. Ñõåìà ïîëó÷åíèÿ òîïîëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ è èíôîðìàöèîííî- òîïîëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ. ×èñëî ïóòåé â ìîëåêóëÿðíîì ãðàôå îïðåäåëåííîé äëèíû. ×èñ- ëî ïóòåé ìåæäó âåðøèíàìè äëèíû ¾1¿ (P1 ), ò.å. ÷èñëî õèìè÷åñêè ñâÿçàí- íûõ ïàð àòîìîâ, ÷èñëî ïóòåé äëèíû ¾2¿ èëè èíäåêñ Ãîðäîíà-Ñêàíòëáåðè (P2 , Y ), ÷èñëî ïóòåé äëèíû ¾3¿ (P3 ) ïîëó÷àþò ïðîñòûì ïîäñ÷åòîì êîëè- ÷åñòâà åäèíèö, äâîåê èëè òðîåê â îäíîì èç òðåóãîëüíèêîâ ñèììåòðè÷íîé ìàòðèöû êðàò÷àéøèõ ðàññòîÿíèé. Èíäåêñ Âèíåðà W ðàâåí ñóììå ñâÿçåé, ñóùåñòâóþùèõ ìåæäó âñåìè 18
  • 20. ïàðàìè ¾òÿæåëûõ¿ àòîìîâ â ãðàôå ìîëåêóëû ñ n âåðøèíàìè: 1∑ n W = gD (ij). 2 i,j Èíäåêñ Âèíåðà W (G) ïåðâûé òîïîëîãè÷åñêèé èíäåêñ, èñïîëüçîâàííûé â õèìèè. Èíäåêñ Âèíåðà è ðîäñòâåííûå åìó òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû ÷à- ñòî èñïîëüçóþò â èññëåäîâàíèÿõ ¾ñòðóêòóðà-ñâîéñòâî¿ äëÿ õàðàêòåðèñòè- êè êîìïàêòíîñòè ìîëåêóë. Îäíàêî, íåîáõîäèìî ïîìíèòü, ÷òî â ìàòðèöå D â êà÷åñòâå ðàññòîÿíèÿ ìåæäó àòîìàìè ðàññìàòðèâàåòñÿ ÷èñëî ñâÿçåé, ðàç- äåëÿþùèõ ýòè àòîìû. ×òîáû ïðèáëèçèòü îïèñàíèå ñòðóêòóðû ñ ïîìîùüþ ìàòðèöû ðàññòîÿíèé ê ðåàëüíîé ñèòóàöèè, ïðåäëîæåíî èñïîëüçîâàòü â êà- ÷åñòâå íå äèàãîíàëüíûõ ýëåìåíòîâ ìàòðèöû óñðåäíåííûå (òèïè÷íûå) ðàñ- ñòîÿíèÿ ìåæäó àòîìàìè â ìîëåêóëàõ, ïîìåùåííûõ â òðåõìåðíóþ ðåøåòêó, èëè ðàññòîÿíèÿ, îïðåäåëåííûå ïî ýêñïåðèìåíòàëüíûì äàííûì, ëèáî ïîëó- ÷åííûå íà îñíîâå êâàíòîâî-õèìè÷åñêèõ ðàñ÷åòîâ. Èíäåêñ Ðàíäè÷à χ(1) õàðàêòåðèçóåò ìîëåêóëÿðíóþ ñâÿçíîñòü: ∑ χ(1) = (vi vj )−1/2 , (i,j) ãäå vi è vj ñòåïåíè âåðøèí ãðàôà, ò. å. ñîîòâåòñòâóþùåãî êîëè÷åñòâà ñâÿçåé âåðøèí i è j. Êèð è Õîëë óâèäåëè â ñõåìå Ðàíäè÷à îñíîâó äëÿ ðàçâèòèÿ îáùåãî ìå- òîäà îïèñàíèÿ ñòðóêòóð îðãàíè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé ñ èñïîëüçîâàíèåì ïðåä- ëîæåííîãî èìè ïîíÿòèÿ ìîëåêóëÿðíîé ñâÿçíîñòè. Ïåðâîå óðàâíåíèå äëÿ òîïîëîãè÷åñêîãî èíäåêñà âûãëÿäåëî òàê: ∑ 1 X= (δi δj )(−1/2) , ãäå δ ñîîòâåòñòâóåò ÷èñëó ñîñåäíèõ àòîìîâ (áåç ó÷åòà àòîìîâ âîäîðîäà). Ýòî óðàâíåíèå èäåíòè÷íî óðàâíåíèþ äëÿ èíäåêñà Ðàíäè÷à. Îäíàêî, àâ- òîðû ðàñøèðèëè ðàññìàòðèâàåìûé ïîäõîä, ðàñïðîñòðàíèâ ôðàãìåíòàöèþ (0 ∑ ) ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà íå òîëüêî íà ñâÿçè, íî è íà àòîìû X = (δ)(−1/2) , à òàêæå íà ôðàãìåíòû ñ íåñêîëüêèìè ñâÿçÿìè. Íàïðèìåð, ïðè ðàññå÷åíèè ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà íà ôðàãìåíòû ñ äâóìÿ ñâÿçÿìè îöåíèâàåòñÿ èíäåêñ (2 ∑ ) X = (δi δj δk )(−1/2) , ïðè ðàññå÷åíèè ìîëåêóëÿðíîãî ãðàôà íà ôðàãìåí- ( ∑ ) òû ñ òðåìÿ ñâÿçÿìè îöåíèâàåòñÿ èíäåêñ 3 X = (δi δj δk δl )(−1/2) è ò. ä. Êðî- 19
  • 21. ìå òîãî, ðàñ÷åò òàêèõ èíäåêñîâ ñòàë ïðîâîäèòüñÿ è äëÿ ìîëåêóë, ñîäåðæà- ùèõ ãåòåðîàòîìû. Ïðè ýòîì àòîìû âîäîðîäà ïðè ãåòåðîàòîìàõ (êàê è ðàíåå àòîìû âîäîðîäà ïðè óãëåðîäå) íå ïðèíèìàëèñü â ðàñ÷åò. Ïîçæå Êèð è Õîëë ïðåäëîæèëè îáùåå âûðàæåíèå äëÿ îöåíêè δv ëþáîãî àòîìà: δv = Zv − h, ãäå Zv ÷èñëî âàëåíòíûõ ýëåêòðîíîâ ñ ó÷åòîì ýëåêòðîíîâ íåïîäåë¼ííûõ ýëåêòðîííûõ ïàð, à h ÷èñëî àòîìîâ âîäîðîäà ïðè ýòîì àòîìå (èìåþ- ùèõñÿ â ñòðóêòóðíîé ôîðìóëå, íî îòñóòñòâóþùèõ â ìîëåêóëÿðíîì ãðàôå). Òàê, çíà÷åíèå δv äëÿ àòîìà óãëåðîäà áåíçîëà ðàâíî òðåì (òàêîé àòîì èìååò ÷åòûðå âàëåíòíûõ ýëåêòðîíà è ñîåäèíåí ñ îäíèì àòîìîì âîäîðîäà), çíà÷å- íèå δv äëÿ àòîìà êèñëîðîäà â ñïèðòàõ ðàâíî ïÿòè (òàêîé àòîì èìååò øåñòü âàëåíòíûõ ýëåêòðîíîâ è ñîåäèíåí ñ îäíèì àòîìîì âîäîðîäà), à â ïðîñòûõ ýôèðàõ ðàâíî øåñòè (òî æå ÷èñëî âàëåíòíûõ ýëåêòðîíîâ, íî îòñóòñòâóþò àòîìû âîäîðîäà ïðè ãåòåðîàòîìå).  ïîñëåäóþùèõ ðàáîòàõ Êèðà è Õîëëà áûëî ïðåäëîæåíî êîëè÷åñòâåí- íî îïèñûâàòü âçàèìíîå âëèÿíèå àòîìîâ íà îñíîâå èíäåêñîâ ýëåêòðîííîãî ñîñòîÿíèÿ. Çíà÷åíèÿ S ëþáîãî àòîìà îöåíèâàþòñÿ ïî ôîðìóëå: S = I + ∆I, I −I I = δvδ , ∆I = ir2 j , +1 ij ãäå r ÷èñëî ñâÿçåé ìåæäó äâóìÿ ðàññìàòðèâàåìûìè àòîìàìè. Èíäåêñû Êèðà è Õîëëà äîñòàòî÷íî øèðîêî èñïîëüçîâàëèñü ïðè ïîèñêå êîëè÷åñòâåííûõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà-ñâîéñòâî. Èõ ïîïóëÿðíîñòü ìîæ- íî îáúÿñíèòü ïðîñòîòîé ðàñ÷åòà è íàãëÿäíûì ïðåäñòàâëåíèåì ñòðóêòóðíûõ ôîðìóë ðàññìàòðèâàåìûõ ñîåäèíåíèé. Îäíàêî îïèñàíèå îñîáåííîñòåé ýëåêòðîííîé ñòðóêòóðû ÷èñëîì âàëåíò- íûõ ýëåêòðîíîâ, à ðàññòîÿíèé ìåæäó àòîìàìè ÷èñëîì ñâÿçåé ìåæäó íè- ìè ÿâëÿåòñÿ ñëèøêîì óïðîùåííûì äëÿ âûÿâëåíèÿ ðåàëüíîé ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòóðû. Îòñþäà ïîíÿòíà êðèòèêà âîçìîæíîñòè èñïîëüçîâàíèÿ óêàçàí- íûõ èíäåêñîâ äëÿ íàõîæäåíèÿ ðåàëüíûõ âçàèìîñâÿçåé ñòðóêòóðà áèîëî- ãè÷åñêàÿ àêòèâíîñòü. Èíäåêñ ñðåäíåêâàäðàòè÷íûõ ðàññòîÿíèé D2: ∑ 2 2 iP i ∑ i , D = i Pi 20
  • 22. ãäå Pi ÷èñëî ïàð â ìàòðèöå D(G), ðàññòîÿíèå ìåæó êîòîðûìè ðàâíîé i. Èíäåêñû çàãðåáñêîé ãðóïïû: ∑ ∑ 2 M1 (G) = vi , M2 (G) = (vi vj ). i (i,j)  ïåðâîì âûðàæåíèè ñóììèðîâàíèå ïðîâîäèòñÿ ïî âñåì âåðøèíàì, à âî âòîðîì ïî âñåì ïàðàì ñâÿçàííûõ àòîìîâ. Íàèáîëüøåå ñîáñòâåííîå çíà- ÷åíèå λmax ìàòðèöû ñìåæíîñòè A(G) êàê òîïîëîãè÷åñêèé èíäåêñ áûë ïðåä- ëîæåí â êà÷åñòâå ìåðû êîëè÷åñòâà ðàçâåòâëåíèé â ñòðóêòóðå ãðàôà. Òåîðåòèêî-òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû. Îñîáîé ãðóïïîé òîïîëîãè÷åñêèõ èíäåêñîâ ÿâëÿþòñÿ òàê íàçûâàåìûå òåîðåòèêî-òîïîëîãè÷åñêèå èíäåêñû, îñ- íîâàííûå íà èñïîëüçîâàíèè óíèâåðñàëüíîé ôîðìóëû Øåííîíà äëÿ îöåíêè íåîäíîðîäíîñòè (èíôîðìàöèè) ëþáîé ñèñòåìû. Ïðåäïîëîæèì, ÷òî ñòðóê- òóðà ìîëåêóëû îïðåäåëåííûì îáðàçîì ðàçáèòà íà ïîäìíîæåñòâà. Òîãäà, âû÷èñëèâ âåðîÿòíîñòü ïîïàäàíèÿ òîãî èëè èíîãî ýëåìåíòà â çàäàííîå ïîä- ìíîæåñòâî, ìîæíî îöåíèòü èíôîðìàöèþ î ðàñïðåäåëåíèè âñåõ ýëåìåíòîâ ïî ïîäìíîæåñòâàì (ôîðìóëà Øåííîíà): ∑ ni ni Inf o = − log2 (áèò), i n n ãäå ni êîëè÷åñòâî ýëåìåíòîâ â ïîäìíîæåñòâå i, à n ñóììàðíîå êîëè- ∑ ÷åñòâî âñåõ ýëåìåíòîâ ñèñòåìû, ðàâíîå n = i ni .  ýòîì âûðàæåíèè ëî- ãàðèôì áåðåòñÿ ïî îñíîâàíèþ 2, ÷òî ñîîòâåòñòâóåò èíôîðìàöèè âûðàæåí- íîé â áèòàõ. Íà îñíîâå ôîðìóëû Øåííîíà ââåäåíû ñëåäóþùèå òåîðåòèêî- èíôîðìàöèîííûå èíäåêñû. Íåîäíîðîäíîñòü ðàñïðåäåëåíèÿ ðàññòîÿíèé ìåæäó âåðøèíàìè â ãðàôå, èñïîëüçóåòñÿ äëÿ õàðàêòåðèñòèêè ðàçâåòâëåííîñòè ìîëåêóëÿðíîé ñòðóêòó- ðû. Çäåñü ñòåïåíü íåîäíîðîäíîñòè ñòðóêòóðû, îöåíèâàåòñÿ íà îñíîâå àíà- ëèçà ðàñïðåäåëåíèÿ ðàññòîÿíèé ìåæäó âåðøèíàìè ãðàôà. Òîãäà ni = Pi êîëè÷åñòâî ñâÿçåé äëèíû ¾i¿, à n îáùåå êîëè÷åñòâî êðàò÷àéøèõ ðàññòîÿ- íèé ìåæäó âñåìè ïàðàìè àòîìîâ ñòðóêòóðû. ×àñòî áûâàåò óäîáíî èñïîëü- çîâàòü îáùåå êîëè÷åñòâî èíôîðìàöèè â ïåðåñ÷åòå íà ãðàô T ID : T ID = n · I D , Èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ãðàôà îòíîñèòåëüíî îêðåñòíîñòåé k -ãî ïîðÿäêà ICk , ïðåäñòàâëÿåò ñîáîé èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå â ðàñ÷åòå 21
  • 23. íà îäíó âåðøèíó: ∑ ICk = − pi log2 pi , i ãäå pi âåðîÿòíîñòü òîãî, ÷òî âûáðàííàÿ ñëó÷àéíûì îáðàçîì âåðøèíà ãðà- ôà (àòîì) ïîïàäåò â i-òîå ïîäìíîæåñòâî, ïðè÷åì âû÷èñëÿåòñÿ îíà ñ ó÷åòîì îêðóæåíèÿ. T ICk ïîëíîå èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ìåðà ñëîæíîñòè â ðàñ÷åòå íà îäèí ãðàô: T ICk = n · ICk SICk ñòðóêòóðíîå èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå: ICk SICk = log2 n BICk èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå ñâÿçûâàíèÿ: ICk BICk = , log2 Nb ãäå Nb ïîëíîå ÷èñëî ðåáåð (êîâàëåíòíûõ ñâÿçåé) â ìîëåêóëÿðíîì ãðàôå. CICk êîìïëåìåíòàðíîå èíôîðìàöèîííîå ñîäåðæàíèå: CICk = log2 n − ICk . 1.1.6 Ñîçäàíèå âûáîðêè ñîåäèíåíèé  ïîäãîòîâêå ê ïðîöåññó àíàëèçà QSAR íåîáõîäèìî îñâåòèòü îòáîð ñî- åäèíåíèé, êàê íåìàëîâàæíóþ ÷àñòü àíàëèçà. Îäíèì èç ïåðâûõ ðó÷íûõ ìå- òîäîâ áûë ìåòîä Êðåéãà (Craig), êîòîðûé ðàññìàòðèâàë äâóìåðíûå ãðà- ôèêè âàæíûõ ôèçèêî-õèìè÷åñêèõ ñâîéñòâ. Âíèìàíèå óäåëÿëîñü âûáîðó çàìåñòèòåëåé èç âñåõ ÷åòûðåõ êâàäðàíòîâ ãðàôèêà [34]. Cõåìà Òîïëèññà (Topliss) ïîçâîëÿëà åìó, íà÷àâ ñ äâóõ ñîåäèíåíèé ïîñòðîèòü ãðàô, ð¼áðà êîòîðîãî ñîåäèíÿëè ìíîæåñòâî çàìåñòèòåëåé, ðàñøèðÿåìîå â ïîøàãîâîì ðåæèìå [35]. Òîïëèññ ïîçæå ïðåäëîæèë ïåðèîäè÷åñêóþ ñõåìó, âêëþ÷àþ- ùóþ ïðîâåðåííûå çàìåñòèòåëè, òàêèå êàê 3,4-Cl2 ; 4-Cl; 4-CH3 ; 4-OCH3 è 4-Í-àíàëîãè [36]. Äðóãèå ìåòîäû ðó÷íîãî îòáîðà çàìåñòèòåëåé âêëþ÷àþò ìåòîä ïîèñêà Ôèáîíà÷÷è, ïîøàãîâàÿ ñèìïëåêñíàÿ ñòðàòåãèÿ è ïàðàìåòð, ââåäåííûé Ìåãè (Magee) [3739]. 22
  • 24. Îäèí èç ïåðâûõ ìàøèííûõ ìåòîäîâ àíàëèòè÷åñêîãî îòáîðà êëàñòåð- íûé àíàëèç, ïðåäëîæåííûé Ãàí÷åì, ïðèçâàí áûë óñêîðèòü ïðîöåññ ðàçäå- ëåíèÿ çàìåñòèòåëåé. Áîëåå íîâûå ìåòîäèêè, âêëþ÷àþùèå D-îïòèìàëüíûå ïëàíèðîâàíèå, êîòîðîå îñíîâàíî íà èñïîëüçîâàíèè îïðåäåëèòåëÿ äèñïåðñè- îííî-êîâàðèàöèîííîé ìàòðèöû. Äåòåðìèíàíò ìàòðèöû ýòî ÷èñëî, ìàêñè- ìàëüíîå äëÿ ñîåäèíåíèé, ïîêàçûâàþùèõ ìàêñèìóì äèñïåðñèè è ìèíèìóì êîâàðèàöèè [4042]. Ñâîþ ïîëüçó ïîêàçàëî ñî÷åòàíèå íåïîëíîãî ôàêòîðíî- ãî ìîäåëèðîâàíèÿ è îñíîâíûì ìåòîäîâ QSAR. Äîïîëíåíèå ýòîãî ìåòîäà, èñïîëüçóþùåå ìíîãîìåðíîå ìîäåëèðîâàíèå, îêàçàëîñü ïåðñïåêòèâíûì äëÿ ïîèñêà êîëè÷åñòâåííûõ ñîîòíîøåíèé ¾ñòðóêòóðà ñâîéñòâî¿ îêðóæàþùåé ñðåäû ñ íåñïåöèôè÷åñêèìè ðåàêöèÿìè, ãäå èñïîëüçîâàíèå êëàññè÷åñêîãî êëàñòåðíîãî àíàëèçà çàòðóäíåíî â âèäó ÷àñòè÷íîãî ïåðåêðûòèÿ êëàñòå- ðîâ [43]. Äëÿ äàííûõ, èìåþùèõ ÷åòêóþ êëàñòåðèçàöèþ íà íåñêîëüêî êëàñ- ñîâ ñîåäèíåíèé, îïèñàíà äðóãàÿ ñòðàòåãèÿ, êîòîðàÿ âêëþ÷àåò ëîêàëüíûé ìíîãîìåðíûé àíàëèç âíóòðè êàæäîãî êëàñòåðà. Îòîáðàííûå âïîñëåäñòâèè ñîåäèíåíèÿ ïîñëå ëîêàëüíîãî àíàëèçà îáúåäèíÿþòñÿ â îáùèé íàáîð, õàðàê- òåðèçóþùèé âñå êëàñòåðû [44]. 1.1.7 Ðåãðåññèîííûé àíàëèç: ìíîæåñòâåííàÿ ëèíåéíàÿ ðåãðåññèÿ Ñðåäè ìàòåìàòè÷åñêèõ ìåòîäîâ, èñïîëüçóåìûõ äëÿ ïîñòðîåíèÿ ìîäåëåé QSAR, íàèáîëåå øèðîêî èçâåñòåí ìíîæåñòâåííûé ðåãðåññèîííûé àíàëèç (multilinear regression analysis, MRA). Ðåãðåññèîííûé àíàëèç ñòàòèñòè- ÷åñêàÿ ìåòîäèêà äëÿ óñòàíîâëåíèÿ çàâèñèìîñòè ìåæäó ñâîáîäíûìè (íåçà- âèñèìûìè) ïåðåìåííûìè è çàâèñèìîé ïåðåìåííîé (ôóíêöèåé), íàïðèìåð, áèîëîãè÷åñêîé àêòèâíîñòüþ.  ìåòîäå MRA ïðèíÿòû ñëåäóþùèå äîïóùåíèÿ: 1. Íåçàâèñèìûå ïåðåìåííûå, êîòîðûå ïðåäñòàâëÿþò ñîáîé ÷àùå âñåãî ôèçèêî-õèìè÷åñêèå ïàðàìåòðû, èçìåðåíû áåç îøèáîê. Íî, ê ñîæàëå- íèþ, íå âñåãäà áûâàþò ñëó÷àè, êîãäà îøèáêà àðãóìåíòîâ ñëàáî ñîïî- ñòàâèìà ñ îøèáêîé ôóíêöèè. 2. Äëÿ ëþáîãî çàäàííîãî çíà÷åíèÿ Õ, çíà÷åíèÿ Y íåçàâèñèìû è îáðàçó- þò íîðìàëüíîå ðàñïðåäåëåíèå. Âåëè÷èíà îøèáêè Ei èìååò íîðìàëü- 23
  • 25. íîå ðàñïðåäåëåíèå ñ öåíòðîì â íóëå. 3. Îæèäàåìûå çíà÷åíèÿ ïåðåìåííîé Y äëÿ âñåõ çíà÷åíèé Õ ëåæàò íà ïðÿìîé ëèíèè. 4. Îòêëîíåíèå îò ëèíèè ðåãðåññèè ïîñòîÿííî. ¾Ëó÷øàÿ¿ ïðÿìàÿ ëèíèÿ äëÿ ìîäåëè ïðîâîäèòñÿ ÷åðåç òî÷êè òàêèì îáðàçîì, ÷òî ñóììà êâàä- ðàòîâ âåðòèêàëüíûõ ðàññòîÿíèé îò òî÷åê äî ëèíèè ìèíèìàëüíà. Yobs ïðåäñòàâëÿåò ñîáîé èçìåðåííîå çíà÷åíèå ðàññìàòðèâàåìîé òî÷êè, à Ycalc ïðåäñêàçàííîå çíà÷åíèå, ïðèíàäëåæàùåå ëèíèè. Ñóììà êâàäðàòîâ îòêëîíåíèé èëè ôóíêöèîíàë íåâÿçêè: ∑ SS = (Yobs − Ycalc )2 , ãäå Yobs = aXi + b + Ei , Ycalc = aXi + b. Ñëó÷àéíàÿ îøèáêà èçìåðåíèÿ Ei = Yobs − (aXi + b). ∑ n ∑ ∑ Ei2 = 2 ∆ = SS = (Yobs − Ycalc )2 . i=1 ×òîáû ìèíèìèçèðîâàòü ôóíêöèîíàë íåâÿçêè, íåîáõîäèìî âçÿòü ÷àñò- íûå ïðîèçâîäíûå ïî êîýôôèöèåíòàì óðàâíåíèÿ ðåãðåññèè, ïðèðàâíÿòü èõ ê íóëþ è ðåøèòü ñèñòåìó ëèíåéíûõ àëãåáðàè÷åñêèõ óðàâíåíèé: { ∑ ∂SS = −2(Yobs − aXi − b) = 0 ∂b ∑ ∂SS ∂a = −2Xi (Yobs − aXi − b) = 0. Óðàâíåíèÿ ìîæíî ïåðåïèñàòü â âèäå: { ∑ ∑ ∑ b Xi + a Xi2 = Xi Yobs ∑ ∑ b + a Xi = Yobs . Ðåøàÿ äàííóþ ñèñòåìó óðàâíåíèé, ïîëó÷èì çíà÷åíèÿ êîýôôèöèåíòîâ a è b. Áîëåå äåòàëüíî ïðîöåäóðû àíàëèçà ðàññìîòðåíû â èñòî÷íèêàõ [13, 4547]. Äëÿ ðåãðåññèîííîãî àíàëèçà (X T X) · B = X T Y , îòêóäà ñëåäóåò B = (X T X)−1 X T Y , ãäå B ñòîëáåö êîýôôèöèåíòîâ, (X T X) èíôîðìàöèîí- íàÿ ìàòðèöà. Äëÿ ñòàòèñòè÷åñêîé îöåíêè ðåçóëüòàòîâ ðåãðåññèè èñïîëüçóþò êîýôôè- öèåíò êîððåëÿöèè r, îáùóþ äèñïåðñèþ SST , îñòàòî÷íóþ äèñïåðñèþ SSQ 24
  • 26. è ñòàíäàðòíîå îòêëîíåíèå s. ∆2 r2 = 1 − SST ∑ ∑ ∑ 2 SST = (Yobs − Ycalc )2 = y 2 − ( ny) ∑ 2 ∑ ∆ = SSQ = (Yobs − Ycalc )2 √∑ √ ∆2 SSQ s = n−k−1 = n−k−1 . Êîýôôèöèåíò êîððåëÿöèè r ìåðà êà÷åñòâà ïðèãîäíîñòè ìîäåëè, îñíî- âàííàÿ íà äèñïåðñèè äàííûõ.  èäåàëüíîé ñèòóàöèè æåëàòåëüíî, ÷òîáû êîýôôèöèåíò êîððåëÿöèè áûë ðàâåí èëè áëèçîê ê åäèíèöå, íî â ðåàëüíî- ñòè èç-çà ïðèñóòñòâèÿ â áèîëîãè÷åñêèõ äàííûõ îøèáîê, âåëè÷èíû êîòîðûõ íåèçâåñòíû, ïðèíèìàåòñÿ, ÷òî ëþáîå çíà÷åíèå ñâûøå 0,9 áóäåò äîïóñòè- ìûì. Ñòàíäàðòíîå îòêëîíåíèå s ÿâëÿåòñÿ àáñîëþòíîé ìåðîé ïðèãîäíîñòè ìîäåëè.  ñàìîì ëó÷øåì ñëó÷àå s äîëæåí ñòðåìèòüñÿ ê íóëþ, íî â ðåàëü- íûõ ýêñïåðèìåíòàõ ýòî äàëåêî íå òàê. Âåëè÷èíà s ìîæåò áûòü îòëè÷íîé îò íóëÿ, ÷òî îáúÿñíÿåòñÿ ýêñïåðèìåíòàëüíûìè îøèáêàìè â èñõîäíûõ äàí- íûõ è, êàê ïðàâèëî, íåñîâåðøåíñòâîì ìîäåëè. Áëüøàÿ âûáîðêà äàííûõ è î óìåíüøåíèå ÷èñëà ïåðåìåííûõ ÷àùå âñåãî ïðèâîäèò ê ñíèæåíèþ çíà÷åíèé ñðåäíåêâàäðàòè÷íîãî îòêëîíåíèÿ. ×àñòî äëÿ îïðåäåëåíèÿ óðîâíÿ ñòàòè- ñòè÷åñêîé çíà÷èìîñòè (àäåêâàòíîñòè) ðåãðåññèîííîé ìîäåëè èñïîëüçóþòñÿ êâàíòèëè ðàñïðåäåëåíèÿ Ôèøåðà F : SS1 − SS2 n − k2 − 1 Fk2 −k1 ,n−k2 = · . SS2 k2 − k1 Áîëåå çíà÷èìîé êîððåëÿöèè ñîîòâåòñòâóåò áîëüøåå çíà÷åíèå êðèòåðèÿ Ôèøåðà. Äîâåðèòåëüíûå èíòåðâàëû êîýôôèöèåíòîâ â óðàâíåíèè ïîêàçû- âàþò çíà÷èìîñòü êàæäîãî ÷ëåíà â óðàâíåíèè ðåãðåññèè. ×òîáû ïîëó÷èòü ñòàòèñòè÷åñêè çíà÷èìóþ ìîäåëü QSAR, íåîáõîäèìî äåðæàòü â ïàìÿòè ñäåëàííûå äîïóùåíèÿ. Âàæíî ïîëó÷èòü èíôîðìàöèþ î êîëëèíåàðíîñòè ìåæäó ïåðåìåííûìè è ñëó÷àéíûõ êîððåëÿöèÿõ. Èñïîëüçî- âàíèå êîððåëÿöèîííî-êîâàðèàöèîííîé ìàòðèöû îáåñïå÷èâàåò îðòîãîíàëü- íîñòü ïåðåìåííûõ äðóã äðóãó. Íàðÿäó ñ áûñòðûì ðàçðàñòàíèåì ÷èñëà ïà- ðàìåòðîâ îñîáîå âíèìàíèå ñëåäóåò óäåëèòü íåäîïóùåíèþ ÷ðåçìåðíîãî êî- ëè÷åñòâà ïåðåìåííûõ â àíàëèòèêå QSAR. Òîïëèññ íàãëÿäíî ïîêàçàë, ÷òî 25
  • 27. ñóùåñòâóåò âûñîêèé ðèñê îêîí÷àíèÿ âû÷èñëåíèé ñî ñëó÷àéíûìè êîððåëÿ- öèÿìè, êîãäà èñïîëüçóåòñÿ ñëèøêîì ìíîãî ïåðåìåííûõ [48]. Ñâîé õàðàêòåðíûé íåãàòèâíûé îòïå÷àòîê ïðè ñîçäàíèè ìîäåëè QSAR íàêëàäûâàþò âûáðîñû (ãðóáûå îøèáêè). Åñëè òàêèå òî÷êè ïëîõî ñî÷åòà- þòñÿ ñ ìîäåëüþ (îòêëîíÿþòñÿ íà âåëè÷èíû, áîëüøèå äâóõ ñòàíäàðòíûõ îòêëîíåíèé), òî èõ ñëåäóåò èñêëþ÷èòü èç ìîäåëè, à ìîäåëü ïåðåñ÷èòàòü. Òàêèå îøèáêè ìîæíî îáúÿñíèòü íåòî÷íîñòÿìè â èñõîäíûõ äàííûõ èëè íåàäåêâàòíîñòüþ ïðåäëîæåííîé QSAR-ìîäåëè. 1.2 Ñâîéñòâà ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ è èõ ïðèìåíåíèå Ñâåðõêðèòè÷åñêèì ôëþèäîì (ÑÊÔ) íàçûâàþò ñîñòîÿíèå âåùåñòâà, â êîòîðîì åãî òåìïåðàòóðà è äàâëåíèå ïðåâûøàþò êðèòè÷åñêèå ïàðàìåòðû.  êðèòè÷åñêîé òî÷êå äâå ôàçû, æèäêàÿ è ãàçîâàÿ, ñòàíîâÿòñÿ íåðàçëè- ÷èìû. Ìíîãèå ôèçè÷åñêèå ñâîéñòâà ÑÊÔ (ïëîòíîñòü, âÿçêîñòü, ñêîðîñòü äèôôóçèè) ÿâëÿþòñÿ ïðîìåæóòî÷íûìè ìåæäó ñâîéñòâàìè æèäêîñòè è ãà- çà. Ïîñëåäíèå íåñêîëüêî äåñÿòèëåòèé ïðîäîëæàþòñÿ àêòèâíûå ïîèñêè ðàç- ëè÷íûõ îáëàñòåé ïðèìåíåíèÿ ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ [49]. Àêòèâíîñòü îòå÷åñòâåííûõ è çàðóáåæíûõ ó÷åíûõ ìîæíî îáúÿñíèòü ñòðåìëåíèåì ñíè- çèòü ýêîëîãè÷åñêóþ íàãðóçêó õèìè÷åñêèõ ïðîèçâîäñòâ íà îêðóæàþùóþ ñðåäó, ïåðåðàáàòûâàòü øèðîêèé ñïåêòð îòõîäîâ ïðîèçâîäñòâ, à òàêæå ïåð- ñïåêòèâàìè îòêðûòèÿ íîâûõ ìàòåðèàëîâ [50, 51] èëè ñïîñîáîâ ïðîâåäåíèÿ òðàäèöèîííûõ õèìè÷åñêèõ ïðîöåññîâ [2].  ýòîì ðàçäåëå áóäóò ðàññìîòðå- íû îñíîâíûå íà òåêóùèé ìîìåíò íàïðàâëåíèÿ ïðèìåíåíèÿ ñâåðõêðèòè÷å- ñêèõ ôëþèäîâ â ïðîìûøëåííîñòè. Îñíîâíûìè ïðåèìóùåñòâàìè ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ êàê ðàñòâîðè- òåëåé ÿâëÿþòñÿ: - ñî÷åòàíèå ñâîéñòâ ãàçîâ ïðè âûñîêèõ äàâëåíèÿõ (íèçêàÿ âÿçêîñòü, âû- ñîêèé êîýôôèöèåíò äèôôóçèè) è æèäêîñòåé (âûñîêàÿ ðàñòâîðÿþùàÿ ñïîñîáíîñòü); - áûñòðûé ìàññîïåðåíîñ, îñóùåñòâëÿåìûé áëàãîäàðÿ íèçêîé âÿçêîñòè è âûñîêîìó êîýôôèöèåíòó äèôôóçèè; 26
  • 28. - ñî÷åòàíèå ïðåíåáðåæèìî ìàëîãî ìåæôàçíîãî íàòÿæåíèÿ ñ íèçêîé âÿçêîñòüþ è âûñîêèì êîýôôèöèåíòîì äèôôóçèè, ïîçâîëÿþùåå ñâåðõ- êðèòè÷åñêèì ôëþèäàì ïðîíèêàòü â ïîðèñòûå ñðåäû áîëåå ëåãêî ïî ñðàâíåíèþ ñ æèäêîñòÿìè; - âûñîêàÿ ÷óâñòâèòåëüíîñòü ðàñòâîðÿþùåé ñïîñîáíîñòè ÑÊÔ ê èçìå- íåíèþ äàâëåíèÿ è òåìïåðàòóðû; - ïðîñòîòà ðàçäåëåíèÿ ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ôëþèäîâ è ðàñòâîð¼ííûõ â íèõ âåùåñòâ ïðè ñáðîñå äàâëåíèÿ. Óíèêàëüíûå ñâîéñòâà ÑÊÔ êàê ðàñòâîðèòåëÿ íàõîäÿò øèðîêîå ïðèìå- íåíèå äëÿ ýêñòðàêöèè è ðàçäåëåíèÿ.  ñâåðõêðèòè÷åñêèõ ñðåäàõ âîçìîæ- íî ðàñòâîðåíèå ìîëåêóë ñ ðàçëè÷íûìè ðàçìåðàìè, ìîëåêóëÿðíîé ìàññîé è ïîëÿðíîñòüþ.  ñðàâíåíèè ñ æèäêîé ôàçîé, ÑÊÔ èìåþò áëüøóþ ñæè- î ìàåìîñòü, èìåþò áîëüøèé ìîëüíûé îáúåì, ÷òî ìîæåò ñïîñîáñòâîâàòü îá- ðàçîâàíèþ êëàñòåðîâ è íåñòîéêèõ êîìïëåêñîâ è ïîëîæèòåëüíî âëèÿòü íà ïîâûøåíèå ðàñòâîðèìîñòè.  íàñòîÿùåå âðåìÿ â êà÷åñòâå ÑÊÔ èñïîëüçóåòñÿ øèðîêèé ñïåêòð îð- ãàíè÷åñêèõ è íåîðãàíè÷åñêèõ ñîåäèíåíèé, òàêèõ êàê N2 Î, N Í3 , ÑÍ3 F , ÑÍ2 F2 , ÑÍF3 , Ñ6 Í6 , SF6 . Îäíàêî, íàèáîëåå ïîïóëÿðíûì è øèðîêî èñïîëü- çóåìûì ðàñòâîðèòåëåì â ñâåðõêðèòè÷åñêîì ñîñòîÿíèè, íà îñíîâå êîòîðî- ãî îñóùåñòâëåíî áîëåå 80 % âñåõ èññëåäîâàíèé â îáëàñòè ñâåðõêðèòè÷å- ñêèõ ôëþèäíûõ òåõíîëîãèé (ÑÊÔÒ) è ïðîöåññîâ, ÿâëÿåòñÿ äèîêñèä óãëå- ðîäà. Ýòî îáóñëîâëåíî åãî íèçêèìè êðèòè÷åñêèìè ïàðàìåòðàìè (òåìïåðà- òóðà 31,2◦ Ñ, äàâëåíèå 72,8 àòì.). Êðîìå òîãî, äèîêñèä óãëåðîäà ÿâëÿåòñÿ íåòîêñè÷íûì, íåãîðþ÷èì è îòíîñèòåëüíî íåäîðîãèì âåùåñòâîì, êîòîðîå ïðè íîðìàëüíûõ óñëîâèÿõ ÿâëÿåòñÿ ãàçîì, ÷òî îáëåã÷àåò åãî ðàçäåëåíèå ñ öåëåâûìè ïðîäóêòàìè ïîñëå çàâåðøåíèÿ ïðîöåññà. Èñïîëüçîâàíèå äèîêñè- äà óãëåðîäà âìåñòî îðãàíè÷åñêèõ ðàñòâîðèòåëåé ïîâûøàåò ýêîëîãè÷åñêóþ áåçîïàñíîñòü ïðîèçâîäñòâ, à òàêæå ñòåïåíü ÷èñòîòû ïîëó÷àåìûõ ïðîäóê- òîâ, ó÷èòûâàÿ îòñóòñòâèå â íèõ ñëåäîâ òîêñè÷íûõ îðãàíè÷åñêèõ ðàñòâîðè- òåëåé è ñîäåðæàùèõñÿ â íèõ ïðèìåñåé. Ñ íà÷àëà 90-õ ãîäîâ ñâåðõêðèòè÷åñêèå ôëþèäû àêòèâíî èçó÷àþòñÿ â êà÷åñòâå ñðåä äëÿ ïðîâåäåíèÿ ðàçëè÷íûõ òåõíîëîãè÷åñêèõ ïðîöåññîâ. Ê íàñòîÿùåìó âðåìåíè òàêèå ïðîöåññû íàõîäÿò ïðèìåíåíèå â ñàìûõ ðàçëè÷- íûõ îáëàñòÿõ íàóêè è òåõíèêè, íàïðèìåð, â òàêèõ êàê ïèùåâàÿ ïðîìûø- 27
  • 29. ëåííîñòü, ôàðìàöåâòèêà è ìåäèöèíà, ïðîèçâîäñòâî è îáðàáîòêà ïîëèìå- ðîâ, ïîëó÷åíèå íîâûõ ìàòåðèàëîâ, àíàëèòè÷åñêàÿ õèìèÿ (ïðîáîïîäãîòîâ- êà, ñâåðõêðèòè÷åñêàÿ õðîìàòîãðàôèÿ), ýêîëîãèÿ, áèîòåõíîëîãèÿ è ïåðåðà- áîòêà ìàòåðèàëîâ, î÷èñòêà ïîâåðõíîñòåé è ðåãåíåðàöèÿ ñîðáåíòîâ, ïåðå- ðàáîòêà íåôòè, ãàçà è óãëÿ, îòõîäîâ ìåòàëëóðãèè è â íåêîòîðûõ äðóãèõ íàïðàâëåíèÿõ. 1.2.1 Ïðîèçâîäñòâî è îáðàáîòêà ïîëèìåðîâ  ïîñëåäíèå ãîäû ñâåðõêðèòè÷åñêèå ôëþèäû øèðîêî ïðèìåíÿþò â êà- ÷åñòâå ñðåäû â ïðîöåññàõ ïîëèìåðèçàöèè. Îñíîâíûì àðãóìåíòîì â ïîëü- çó èõ èñïîëüçîâàíèÿ ÿâëÿåòñÿ âûñîêàÿ ðàñòâîðèìîñòü â íèõ ìîíîìåðîâ, îòñóòñòâèå íåîáõîäèìîñòè ñóøêè ãîòîâîãî ïðîäóêòà è óäàëåíèÿ ðàñòâîðè- òåëÿ [51].  äàëüíåéøåì ÑÎ2 â ñâåðõêðèòè÷åñêîì ñîñòîÿíèè (ÑÊÄÓ) èñ- ïîëüçîâàëñÿ äëÿ ïîëèìåðèçàöèè âèíèëõëîðèäà, ñòèðîëà, àêðèëîíèòðèëà, âèíèëàöåòàòà. Êàê âûÿñíèëîñü, ÑÊÄÓ ÿâëÿåòñÿ ýôôåêòèâíûì ðàñòâîðè- òåëåì äëÿ ôòîðõëîðóãëåðîäîâ, ÷òî øèðîêî èñïîëüçóåòñÿ ïðè ñèíòåçå âû- ñîêîìîëåêóëÿðíûõ àìîðôíûõ ôòîðïîëèìåðîâ.  ñðåäå äèîêñèäà óãëåðîäà îñóùåñòâëÿþò áåçâîäíóþ çîëü-ãåëü ïîëèìåðèçàöèþ ïðè ïîëó÷åíèè ïîëè- ñèëîêñàíîâ [50]. Ïåðñïåêòèâíûì ïðåäñòàâëÿåòñÿ èñïîëüçîâàíèå ñâåðõêðè- òè÷åñêèõ ñðåä äëÿ ïîëó÷åíèÿ áèîðåñîðáèðóåìûõ ïîëèìåðîâ, êîòîðûå ïî- ñòåïåííî ðàñòâîðÿþòñÿ â ôèçèîëîãè÷åñêèõ æèäêîñòÿõ îðãàíèçìà, ÷òî øè- ðîêî èñïîëüçóåòñÿ â ìåäèöèíå. Òàêèì ñïîñîáîì ïîëó÷àþò ïîëèëàêòèäû, ïîëèãëèêîëèäû è ñîïîëèìåðû íà èõ îñíîâå. Ïåðñïåêòèâíûì íàïðàâëåíèåì ÿâëÿåòñÿ îáðàáîòêà ïîëèìåðíûõ ìàòåðè- àëîâ ÑÊÄÓ, ïðè êîòîðîé ïðîèñõîäèò ïëàñòèôèêàöèÿ ñòåêëîîáðàçíûõ ïîëè- ìåðîâ, ïðèâîäÿùàÿ ê ñóùåñòâåííîìó ñíèæåíèþ òåìïåðàòóðû ñòåêëîâàíèÿ, òàê êàê íàñûùåííûé äèîêñèäîì óãëåðîäà ïîëèìåð õàðàêòåðèçóåòñÿ ïîâû- øåííîé ïîäâèæíîñòüþ öåïåé, à òàêæå óâåëè÷åííûì ðàññòîÿíèåì ìåæäó íèìè. Ïëàñòèôèêàöèÿ ñîïðîâîæäàåòñÿ íàáóõàíèåì ïîëèìåðíîé ìàòðèöû ñ ïîñëåäóþùèì óâåëè÷åíèåì ñâîáîäíîãî îáúåìà. Êðîìå òîãî, âîçìîæíî ñïå- öèôè÷åñêîå âçàèìîäåéñòâèå ìåæäó ÑÎ2 è íåêîòîðûìè ôóíêöèîíàëüíûìè ãðóïïàìè ïîëèìåðîâ, òàêèìè, êàê, íàïðèìåð, êàðáîíèëüíûå ãðóïïû. Âûÿâëåíî âàæíîå ñâîéñòâî ïîëèìåðîâ ñîðáèðîâàòü â çíà÷èòåëüíîì êî- ëè÷åñòâå (îò 1,5 äî 10 %) äèîêñèä óãëåðîäà â ñâåðõêðèòè÷åñêîì ñîñòîÿíèè. 28