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Diagnostic de la maladie de Lyme à l’aide
d’autres méthodes et en fonction de
syndromes similaires : voies de recherche
menant vers l’avenir
David M. Patrick
Université de la Colombie-Britannique, Vancouver
(Canada)
Vancouver, Canada
©2016 David Patrick, MD 1
Déclarations
• Aucun conflit d’intérêts de nature commerciale
(aucune rémunération ni aucun honoraire de
consultants).
• Ma recherche est financée par les Instituts de
recherche en santé du Canada (IRSC), le National
Institutes of Health (NIH), le Conseil de recherches en
sciences naturelles et en génie (CRSNG), le ME
Research UK (MERUK) et la fondation du Centre de
contrôle des maladies de la Colombie-Britannique, à
Vancouver.
©2016 David Patrick, MD 2
Nous sommes ici parce que
des gens sont malades
©2016 David Patrick, MD 3
Pour qu’il y ait des progrès,
les idées doivent être mises à l’épreuve
• « Il n’est pas justifié de consacrer davantage de
temps aux opinions qui ne sont pas étayées par
des expériences sérieuses ». [Traduction libre]
– Louis Pasteur, 1879
4
Problèmes scientifiques et définitions
de cas imparfaites
• Au sein d’un groupe de personnes désignées comme
étant atteintes de la maladie de Lyme ou d’une autre
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pour différentes raisons.
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• Les différences clés entre les personnes malades et en
santé sont plus difficiles à repérer lorsqu’une
classification est erronée.
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*Xu GJ, Kula T, Xu Q, Li MZ, Vernon SD, Ndung'u T, Ruxrungtham K, Sanchez J, Brander C, Chung RT, O'Connor KC, Walker B,
Larman HB, Elledge SJ. Viral immunology. Comprehensive serological profiling of human populations using a synthetic human
virome. Science. 2015 Jun 5;348(6239):aaa0698. doi: 10.1126/science.aaa0698. PubMed PMID: 26045439.
©2016 David Patrick, MD 7
Opinions formulées par les intervenants dans le
dossier de la maladie de Lyme en Colombie-
Britannique – 2010
• La bactérie Borrelia est fortement répandue chez
les tiques de la Colombie-Britannique et présente
de nombreuses variations des souches.
• Les « laboratoires spécialisés » détectent
beaucoup mieux la maladie de Lyme.
• Les gens ont besoin de plus d’antibiotiques qu’ils
n’en reçoivent.
• Des études bien conçues produisent des résultats
qui réfutent chacune de ces hypothèses.
• Cela ne change toutefois rien au fait que les gens
se sentent malades.
©2016 David Patrick, MD 8
Surveillance des tiques en C.-B.
• Sites établis en fonction de la modélisation des niches
écologiques
• Rongeurs capturés; tiques regroupées par étapes du
cycle de vie
• Dépistage de l’ARN ribosomique 23S
• Ensuite, dépistage de la protéine de surface A (OspA) et
son séquençage
• Positivité de 0,56 % chez les tiques (de 50 à 100 fois
plus faible que dans les zones à forte prévalence)
• Même taux provenant des zones à surveillance passive
continue
©2016 David Patrick, MD 9
Pourquoi de nombreux médecins ont-ils des
doutes quant aux tests en laboratoire?
• Les laboratoires spécialisés ne dépistaient pas mieux la
maladie de Lyme lorsque présente.
• Toutefois, un laboratoire spécialisé utilisant des « critères
interprétables internes » a déterminé que 23 personnes en
santé sur 40 étaient atteintes de la maladie de Lyme, soit
57 % d’entre elles.
• Le recours à une telle approche est signalé par la plupart
des personnes présentant un syndrome de Lyme ayant été
diagnostiqué à l’aide d’autres méthodes en Colombie-
Britannique.
Fallon BA, Pavlicova M, Coffino SW, Brenner C. A comparison of lyme disease serologic test results from 4
laboratories in patients with persistent symptoms after antibiotic treatment. Clin Infect Dis 2014; 59(12): 1705-10.
©2016 David Patrick, MD 10
Résultats attendus lorsqu’un laboratoire spécialisé fait appel
à une interprétation « à l’interne »
(Fallon, Clin Infect Dis)
©2016 David Patrick, MD 11
Plus d’exactitude à une fraction du coût
12
$$$
$$$
Tests vendus à profit
Ceci amplifie grandement la perception
du fardeau de la maladie, du risque
individuel et potentiellement, de la
demande pour des tests
De nombreuses personnes
ayant reçu un résultat faux-
positif joignent les rangs des
quelques personnes atteintes
de la maladie
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susceptibles de mentionner ou
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tests au moyen d’autres
méthodes
Réunions portant sur la défense
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Un laboratoire canadien signalant un
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contraint de faire parvenir des avis de
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méthodes de dépistage.
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Un diagnostic erroné présente des
risques
• Retard dans la détermination de la cause
initiale
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• Problème pour les groupes de revendication
• Qu’est-ce qui est important? Être perçu
comme ayant raison ou trouver une meilleure
réponse pour les gens que l’on représente?
©2016 David Patrick, MD 15
Pourquoi effectuer des recherches sur la
maladie de Lyme chronique diagnostiquée à
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périphériques à cellule T?
• Les gens sont malades et souvent handicapés.
• Ils ont eu de la difficulté à trouver un bon
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• Un désaccord sur la cause ne devrait pas faire
en sorte que les gens ne soient pas choisis
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©2016 David Patrick, MD 16
Étude de l’UBC sur les maladies chroniques complexes
Encéphalomyélite
myalgique/syndrome de la
fatigue chronique (E.M.)
(Définition
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Témoins
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disséminé (LED)
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chronique
diagnostiquée à l’aide
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Examen des définitions de cas
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©2016 David Patrick, MD 17
©2016 David Patrick, MD
Rendement sur des
échelles fonctionnelles
par groupe
18
Résultats cliniques
• Les personnes atteintes d’E.M. et celles qui sont
atteintes de la maladie de Lyme chronique
diagnostiquée à l’aide d’autres méthodes présentent
des symptômes très semblables dans cette étude
– Antécédents médicaux et physiques
– Analyses en laboratoire
• Aucun cas de maladie de Lyme diagnostiqué au moyen
d’autres méthodes n’a été confirmé par un test de
référence.
• Les gens sont assez malades pour qu’il vaille la peine
d’essayer de mieux comprendre les causes.
©2016 David Patrick, MD 19
Tests de laboratoires spécialisés faux positifs
ou tests de référence faux négatifs?
• Douze cas ont été diagnostiqués par un (1)
laboratoire spécialisé
• Quelle est la probabilité d’obtenir 12 tests faux
positifs d’un tel laboratoire?
• .9812 = 78 %
• Quelle est la probabilité d’obtenir des tests de
référence faux négatifs?
• 0,612 = 0,2 %
• Pas très probable
©2016 David Patrick, MD 20
Métagénomique
©2016 David Patrick, MD 21
Rapport précoce sur la
transcriptomique du séquençage de
l’acide ribonucléique (ARN)
• Chiu et Bouquet (UCSF) ont révélé une signature
transcriptionnelle unique pour la maladie de Lyme en
phase aiguë
• Il y avait relativement peu de gènes différentiellement
exprimés entre les personnes atteintes d’E.M./syndrome de
fatigue chronique, de maladie de Lyme chronique
diagnostiquée à l’aide d’autres méthodes et les personnes
en santé (les personnes atteintes de LED en avaient
plusieurs)
• À l’heure actuelle, on établit une corrélation entre ces
variances et les covariables aléatoires de base (intensité de
la fatigue, âge, etc.)
©2016 David Patrick, MD 22
Travail lié à l’immunosignature
23
Vers où devrait-on diriger
les études étiologiques?
• Démarches multicentriques
• Nouveaux cas dans le cadre d’études de cohortes éventuelles
fondées sur un vaste échantillonnage de population (Projet de
partenariat canadien Espoir pour demain)
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au spectre complet des plateformes « omiques » sur le
matériel mis en banque
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©2016 David Patrick, MD 24
Si l’on établit un consensus selon lequel
la résolution de problèmes pour les
patients est plus importante que
l’approbation intégrale de la théorie
actuelle, nous pourrons alors accroître la
probabilité que l’avenir de la recherche
et des soins soit meilleur
comparativement au passé.
©2016 David Patrick, MD 25
Remerciements
• Participants à l’étude
• L’équipe de recherche du CCD
• Robbin Lindsay, pour les analyses sérologiques qu’il a réalisées
au Laboratoire national de microbiologie, et Isabel McAuliffe,
pour ses analyses aux Centers for Disease Control and
Prevention
• Centre for Health Evaluation and Outcome Sciences
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• Laboratoire Tang
• Fondation du Centre de contrôle des maladies de la Colombie-
Britannique et ministère de la Santé de la Colombie-
Britannique
• Réseau national d’action en matière d’encéphalomyélite
myalgique et de fibromyalgie (Canada)
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English: Dr. Liz Zubek & Dr. Alison Bested
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Français: Dr. David M. Patrick

  • 1. Diagnostic de la maladie de Lyme à l’aide d’autres méthodes et en fonction de syndromes similaires : voies de recherche menant vers l’avenir David M. Patrick Université de la Colombie-Britannique, Vancouver (Canada) Vancouver, Canada ©2016 David Patrick, MD 1
  • 2. Déclarations • Aucun conflit d’intérêts de nature commerciale (aucune rémunération ni aucun honoraire de consultants). • Ma recherche est financée par les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), le National Institutes of Health (NIH), le Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie (CRSNG), le ME Research UK (MERUK) et la fondation du Centre de contrôle des maladies de la Colombie-Britannique, à Vancouver. ©2016 David Patrick, MD 2
  • 3. Nous sommes ici parce que des gens sont malades ©2016 David Patrick, MD 3
  • 4. Pour qu’il y ait des progrès, les idées doivent être mises à l’épreuve • « Il n’est pas justifié de consacrer davantage de temps aux opinions qui ne sont pas étayées par des expériences sérieuses ». [Traduction libre] – Louis Pasteur, 1879 4
  • 5. Problèmes scientifiques et définitions de cas imparfaites • Au sein d’un groupe de personnes désignées comme étant atteintes de la maladie de Lyme ou d’une autre maladie, plusieurs personnes peuvent être malades pour différentes raisons. • Définition de cas imparfaite – > Classification erronée • Les différences clés entre les personnes malades et en santé sont plus difficiles à repérer lorsqu’une classification est erronée. • Par conséquent, il devient difficile de trouver de bons tests. • Il devient aussi difficile de mettre à l’essai des options de traitement. ©2016 David Patrick, MD 5
  • 6. Pouvons-nous clarifier ce que nous entendons par « maladie de Lyme »? ©2016 David Patrick, MD 6
  • 7. Que ferait Louis Pasteur s’il était parmi nous aujourd’hui? • Métagénomique : Découverte de microbes • Comprendre le microbiote intestinal • Transcriptomique : Expression génétique • Épigénétique : Modification des gènes • Essai biologique lié à l’immunosignature – aperçu complet de l’expression des anticorps *Xu GJ, Kula T, Xu Q, Li MZ, Vernon SD, Ndung'u T, Ruxrungtham K, Sanchez J, Brander C, Chung RT, O'Connor KC, Walker B, Larman HB, Elledge SJ. Viral immunology. Comprehensive serological profiling of human populations using a synthetic human virome. Science. 2015 Jun 5;348(6239):aaa0698. doi: 10.1126/science.aaa0698. PubMed PMID: 26045439. ©2016 David Patrick, MD 7
  • 8. Opinions formulées par les intervenants dans le dossier de la maladie de Lyme en Colombie- Britannique – 2010 • La bactérie Borrelia est fortement répandue chez les tiques de la Colombie-Britannique et présente de nombreuses variations des souches. • Les « laboratoires spécialisés » détectent beaucoup mieux la maladie de Lyme. • Les gens ont besoin de plus d’antibiotiques qu’ils n’en reçoivent. • Des études bien conçues produisent des résultats qui réfutent chacune de ces hypothèses. • Cela ne change toutefois rien au fait que les gens se sentent malades. ©2016 David Patrick, MD 8
  • 9. Surveillance des tiques en C.-B. • Sites établis en fonction de la modélisation des niches écologiques • Rongeurs capturés; tiques regroupées par étapes du cycle de vie • Dépistage de l’ARN ribosomique 23S • Ensuite, dépistage de la protéine de surface A (OspA) et son séquençage • Positivité de 0,56 % chez les tiques (de 50 à 100 fois plus faible que dans les zones à forte prévalence) • Même taux provenant des zones à surveillance passive continue ©2016 David Patrick, MD 9
  • 10. Pourquoi de nombreux médecins ont-ils des doutes quant aux tests en laboratoire? • Les laboratoires spécialisés ne dépistaient pas mieux la maladie de Lyme lorsque présente. • Toutefois, un laboratoire spécialisé utilisant des « critères interprétables internes » a déterminé que 23 personnes en santé sur 40 étaient atteintes de la maladie de Lyme, soit 57 % d’entre elles. • Le recours à une telle approche est signalé par la plupart des personnes présentant un syndrome de Lyme ayant été diagnostiqué à l’aide d’autres méthodes en Colombie- Britannique. Fallon BA, Pavlicova M, Coffino SW, Brenner C. A comparison of lyme disease serologic test results from 4 laboratories in patients with persistent symptoms after antibiotic treatment. Clin Infect Dis 2014; 59(12): 1705-10. ©2016 David Patrick, MD 10
  • 11. Résultats attendus lorsqu’un laboratoire spécialisé fait appel à une interprétation « à l’interne » (Fallon, Clin Infect Dis) ©2016 David Patrick, MD 11
  • 12. Plus d’exactitude à une fraction du coût 12
  • 13. $$$ $$$ Tests vendus à profit Ceci amplifie grandement la perception du fardeau de la maladie, du risque individuel et potentiellement, de la demande pour des tests De nombreuses personnes ayant reçu un résultat faux- positif joignent les rangs des quelques personnes atteintes de la maladie Plus de gens subissent des tests. Les intervenants plus susceptibles de mentionner ou de suggérer l’administration de tests au moyen d’autres méthodes Réunions portant sur la défense des intérêts des promoteurs des laboratoires ©2016 David Patrick, MD 13
  • 14. Un laboratoire canadien signalant un taux d’erreurs aussi élevé serait contraint de faire parvenir des avis de rappel à ses clients, même s’il procédait à une modification de ses méthodes de dépistage. ©2016 David Patrick, MD 14
  • 15. Un diagnostic erroné présente des risques • Retard dans la détermination de la cause initiale • Risques reliés à certains traitements • Non-participation à des recherches qui pourraient fournir une meilleure réponse • Problème pour les groupes de revendication • Qu’est-ce qui est important? Être perçu comme ayant raison ou trouver une meilleure réponse pour les gens que l’on représente? ©2016 David Patrick, MD 15
  • 16. Pourquoi effectuer des recherches sur la maladie de Lyme chronique diagnostiquée à l’aide d’autres méthodes ou les lymphomes périphériques à cellule T? • Les gens sont malades et souvent handicapés. • Ils ont eu de la difficulté à trouver un bon modèle de soins, ce qui crée de l’indignation ou du scepticisme. • Un désaccord sur la cause ne devrait pas faire en sorte que les gens ne soient pas choisis pour des soins de santé ou des études. ©2016 David Patrick, MD 16
  • 17. Étude de l’UBC sur les maladies chroniques complexes Encéphalomyélite myalgique/syndrome de la fatigue chronique (E.M.) (Définition canadienne/internationale) Témoins en santé Lupus érythémateux disséminé (LED) Maladie de Lyme chronique diagnostiquée à l’aide d’autres méthodes Antécédents Examen physique Échelles Tests de dépistage Examen des définitions de cas Consentement pour les études sur l’étiologie ©2016 David Patrick, MD 17
  • 18. ©2016 David Patrick, MD Rendement sur des échelles fonctionnelles par groupe 18
  • 19. Résultats cliniques • Les personnes atteintes d’E.M. et celles qui sont atteintes de la maladie de Lyme chronique diagnostiquée à l’aide d’autres méthodes présentent des symptômes très semblables dans cette étude – Antécédents médicaux et physiques – Analyses en laboratoire • Aucun cas de maladie de Lyme diagnostiqué au moyen d’autres méthodes n’a été confirmé par un test de référence. • Les gens sont assez malades pour qu’il vaille la peine d’essayer de mieux comprendre les causes. ©2016 David Patrick, MD 19
  • 20. Tests de laboratoires spécialisés faux positifs ou tests de référence faux négatifs? • Douze cas ont été diagnostiqués par un (1) laboratoire spécialisé • Quelle est la probabilité d’obtenir 12 tests faux positifs d’un tel laboratoire? • .9812 = 78 % • Quelle est la probabilité d’obtenir des tests de référence faux négatifs? • 0,612 = 0,2 % • Pas très probable ©2016 David Patrick, MD 20
  • 22. Rapport précoce sur la transcriptomique du séquençage de l’acide ribonucléique (ARN) • Chiu et Bouquet (UCSF) ont révélé une signature transcriptionnelle unique pour la maladie de Lyme en phase aiguë • Il y avait relativement peu de gènes différentiellement exprimés entre les personnes atteintes d’E.M./syndrome de fatigue chronique, de maladie de Lyme chronique diagnostiquée à l’aide d’autres méthodes et les personnes en santé (les personnes atteintes de LED en avaient plusieurs) • À l’heure actuelle, on établit une corrélation entre ces variances et les covariables aléatoires de base (intensité de la fatigue, âge, etc.) ©2016 David Patrick, MD 22
  • 23. Travail lié à l’immunosignature 23
  • 24. Vers où devrait-on diriger les études étiologiques? • Démarches multicentriques • Nouveaux cas dans le cadre d’études de cohortes éventuelles fondées sur un vaste échantillonnage de population (Projet de partenariat canadien Espoir pour demain) • Approche d’études cas-témoins nichée • Mais elles doivent être liées aux biobanques de pointe et au spectre complet des plateformes « omiques » sur le matériel mis en banque – Sang – ARN stabilisé – Cheveux – Selles ©2016 David Patrick, MD 24
  • 25. Si l’on établit un consensus selon lequel la résolution de problèmes pour les patients est plus importante que l’approbation intégrale de la théorie actuelle, nous pourrons alors accroître la probabilité que l’avenir de la recherche et des soins soit meilleur comparativement au passé. ©2016 David Patrick, MD 25
  • 26. Remerciements • Participants à l’étude • L’équipe de recherche du CCD • Robbin Lindsay, pour les analyses sérologiques qu’il a réalisées au Laboratoire national de microbiologie, et Isabel McAuliffe, pour ses analyses aux Centers for Disease Control and Prevention • Centre for Health Evaluation and Outcome Sciences • Unité de recherche clinique de l’Hôpital général de Vancouver • Laboratoire Tang • Fondation du Centre de contrôle des maladies de la Colombie- Britannique et ministère de la Santé de la Colombie- Britannique • Réseau national d’action en matière d’encéphalomyélite myalgique et de fibromyalgie (Canada) ©2016 David Patrick, MD 26
  • 27. 27