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CLONACION MOLECULAR
RESULTADOS DE APRENDIZAJE
 Comprende y explica los elementos y
fundamentos de la clonación molecular.
 Explica los procedimientos básicos
para la clonación molecular.
 Conocer y discutir aplicaciones de la
clonación molecular en diferentes
campos y actividades humanas.
ERRORES FRECUENTES
 Confundir la acción de las enzimas
que participan en la clonación.
 No comprender el procedimiento de la
clonación molecular.
CLONACION DEL DNA
 Comporta la separación de un gen
especifico o de un fragmento de DNA
de un cromosoma mucho mayor y su
unión a una pequeña molécula de
DNA portador, para después replicar
este DNA modificado miles o millones
de veces, mediante el aumento del
numero de células y la creación de
múltiples copias del DNA clonado en
cada célula.
ELEMENTOS
 Segmento de DNA
 Vector
- Plasmido
- Porción del genoma de un virus
bacteriano (λ)
 Célula
 Enzimas
ENZIMAS UTILIZADAS EN LA
TECNOLOGIA DEL DNA
RECOMBINANTE
ENZIMA FUNCION
Endonucleasas de restricción tipo II Cortan el DNA en secuencias especificas
DNA ligasa Une dos moléculas o fragmentos de DNA
DNA polimerasa I (E. coli) Rellena los huecos en el DNA duplex por adición
secuencial de nucleótidos en los extremos 3`
Transcriptasa inversa Hace una copia del DNA a partir de una molécula de
RNA
Polinucleotido quinasa Añade un grupo fosfato al grupo OH del extremo
5`de un polinucleótido para marcarlo o para permitir
su ligación
Transferasa terminal Añade colas homopolimericas al grupo OH del
extremo 3`de un duplex lineal
Exonucleasa III Elimina nucleótidos de los extremos 5`de una hebra
de DNA
Exonucleasa del bacteriófago λ Elimina nucleótidos de los extremos 5`de un duplex
para exponer los extremos 3`monohebra
Fosfatasa alcalina Elimina fosfatos terminales tanto del extremo
5`como del 3`(o de ambos)
TIPOS DE
ENDONUCLEASAS
- Las del tipo I cortan el DNA al azar.*
- Las de tipo III cortan el DNA a unos 25 pb de
la secuencia de reconocimiento.*
- Las de tipo II no necesitan ATP y cortan el
DNA en la misma secuencia de
reconocimiento.
* Se mueven a lo largo del DNA mediante un
mecanismo que requiere ATP
ESQUEMA BASICO
Vector + Fragmento de DNA
DNA Recombinante
Replicación del DNA recombinante dentro de
las células huésped
Aislamiento, secuenciación y manipulación del
fragmento de DNA purificado
CLONACION EN E. coli
 E. coli fue el primer organismo utilizado y
todavía es la célula huésped mas común.
 Tiene muchas ventajas:
- Se conoce bien el metabolismo de su DNA.
- Muchos vectores de clonación que se
encuentran asociados de manera natural,
están bien caracterizados
- Se dispone de técnicas efectivas para la
transferencia de DNA de una bacteria a
otra.
INTERACCION DE LA ENDONUCLEASA
DE RESTRICCION EcoRV CON SU
SECUENCIA DIANA
 Se muestra la enzima unida a los productos de corte de DNA
en la secuencia reconocida por la endonucleasa.
 La proteína se ha eliminado y el DNA se ha rotado 180. La
enzima crea extremos romos. Átomos de Mg en naranja.
1. Cortar el DNA en lugares
determinados. Las endonucleasas
especificas de secuencia
(endonucleasas de restricción)
hacen las veces de tijeras
moleculares.
2. Selección de una pequeña molécula
de DNA capaz de autoreplicarse.
Vectores de clonación (plásmidos o
DNA vírico).
3. Unión covalente de dos fragmentos
de DNA: La ligasa une el vector de
clonación y el DNA que se desea
clonar.
4. Traslado del DNA del tubo de
ensayo a una célula huésped que
proporcionara la maquinaria
enzimática necesaria para la
replicación.
5. Selección o identificación de las
células huésped que contienen DNA
recombinante.
CORTE DE MOLECULAS DE DNA MEDIANTE
ENDONUCLEASAS DE RESTRICCION.
 Los
fragmentos
pueden
ligarse a un
plasmido
CORTE DE MOLECULAS DE DNA
MEDIANTE ENDONUCLEASAS DE
RESTRICCION
Un fragmento sintético de
DNA que contenga las
secuencias de
reconocimiento de
varias endonucleasas
de restricción se
puede insertar en un
plásmido tratado
previamente con una
endonucleasa de
restricción
DISEÑO DEL PLASMIDO
pBR322
1. Posee un origen de replicación,
en el cual las enzimas celulares
inician la replicación (10-20
copias por célula)
2. Contiene dos genes que
confieren resistencia a
antibióticos.
3. Varias secuencias únicas de
reconocimiento para diferentes
endonucleasas suministran los
sitios donde cortar para insertar
las secuencias de DNA foráneo.
4. Su pequeño tamaño facilita su
entrada en la célula y la
manipulación bioquímica del
DNA.
CLONACION E IDENTIFICACION
DE DNA FORANEO EN E. coli
1. pBR322 se corta en el elemento de
resistencia a ampicilina.
2. El DNA foráneo se liga al pBR322
cortado. Si tiene éxito, el elemento
de resistencia a la penicilina es
inactivado.
3. Se transforman las células de E.
coli. Después se cultivan en placas
de agar que contienen tetraciclina
para seleccionar aquellas que han
incorporado el plásmido.
4. Las colonias individuales se
transfieren a posiciones
equivalentes de placas adicionales.
Una placa contiene tetraciclina y la
otra ampicilina.
 Los plasmidos recombinantes se agregan a
un cultivo bacteriano que se trato antes con
iones de calcio.
 Se someten a un breve golpe de calor y las
bacterias se estimulan para que capten el
DNA del medio.
 El plasmido se replica en forma autónoma
en la célula receptora y se pasa a la
progenie durante la división celular.
CLONACION DE DNA EUCARIOTA EN
GENOMAS DE FAGOS
 El DNA digerido se
fracciona por
electroforesis en gel
o centrifugación con
gradiente de
densidad y los
fragmentos de 20 kb
de largo (aprox) se
incorporan
EL FRAGMENTO LAMBDA
1. El DNA se empaca bien en una forma
que es facil de almacenar y extraer.
2. Todo paquete que contenga un DNA
recombinante es capaz de infectar
una celula bacteriana.
3. Una caja Petri puede contener mas
de 100,000 placas diferentes.
EL CROMOSOMA
ARTIFICIAL BACTERIANO
 Puede aceptar
grandes fragmentos de
DNA (hasta 500 kb)
 Son plasmidos
bacterianos
especializados
EL CROMOSOMA
ARTIFICIAL DE LEVADURA
 Puede aceptar
segmentos de DNA
de hasta 1000 kb
 Son versiones
artificiales de un
cromosoma
artificial de
levadura
APLICACIONES
 El 24 de febrero de 1997 el Instituto Roslin, de Escocia, se
anuncia la reproducción con éxito de la oveja "Dolly".
 En julio de 1997 los mismos científicos que habían clonado a
"Dolly" produjeron el cordero "Polly" que porta genes
humanos.
 En noviembre de 2001 la empresa Advanced Cell Technology
(ACT) consiguió clonar el primer embrión humano de la
historia, aunque su desarrollo se detuvo de forma natural
cuando sólo contaba con seis células, mucho antes de
alcanzar la fase de blastocito, necesaria para obtener las
llamadas células madre. El objetivo era el de obtener células
madre para la investigación de terapias génicas.
 En enero 2002, la empresa escocesa PPL Therapeutics
anuncia el nacimiento de unos cerditos, a los que se les pudo
eliminar el gen que causa que el sistema inmunológico del ser
humano rechace transplantes de los órganos del cerdo.
 En enero de 2002, los creadores de la oveja Dolly, anuncian que el
animal sufre artritis, por el envejecimiento prematuro que padece, a
sus cinco años de edad.
 En febrero de 2002 un equipo investigador que había clonado una
docena de ratones informó de que ninguno de ellos logró sobrevivir.
Además un equipo investigador japonés llamó la atención sobre la
mayor frecuencia de abortos, deformidades, sobrepeso y muertes
prematuras entre otros animales que habían sido clonados.
 También en febrero de 2002, la Universidad A&M de Texas
presentó el primer gato clonado del mundo, un cachorro de dos
meses de edad al que llamaron "CC", siglas de "copia al carbón".
Según los científicos "los gatos tienen una forma felina del síndrome
de inmunodeficiencia humana que es un buen modelo para el
estudio del sida humano".
 En noviembre de 2002 el experto italiano en fertilidad Severino
Antinori dice que espera que una paciente dé a luz un bebé clonado
en enero de 2003.
RATONES TRANSGENICOS
 Se muestra un par de
hermanos de la misma
camada de 10 semanas
de edad.
 El mas grande se
desarrollo con un huevo
inyectado con DNA + GH.
 El mas grande pesa 44 gr,
y el pequeño 29 gr.
 El gen GH se transmitió a
los descendientes.
BIBLIOGRAFIA
 Nelson, D; Cox, M. LEHNINGER PRINCIPIOS DE
BIOQUIMICA. 4ª edicion. Edit. Omega. Pags. 306-
317.
 Alberts y cols. BIOLOGIA MOLECULAR DE LA
CELULA. 4ª edicion. Ediciones Omega. Pags. 500-
504.
 Lodish y cols. BIOLOGIA CELULAR Y
MOLECULAR. 5ª edicion. Ed. Medica
Panamericana. Pags.
 Karp, G. BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR. 4ª
edicion. Edit. Mc Graw Hill. Pags. 822-835
 http://laguna.fmedic.unam.mx/lenpres/CH29.ppt#286
 http://cultura.terra.es/cac/articulo/html/cac1321.htm
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  • 2. RESULTADOS DE APRENDIZAJE  Comprende y explica los elementos y fundamentos de la clonación molecular.  Explica los procedimientos básicos para la clonación molecular.  Conocer y discutir aplicaciones de la clonación molecular en diferentes campos y actividades humanas.
  • 3. ERRORES FRECUENTES  Confundir la acción de las enzimas que participan en la clonación.  No comprender el procedimiento de la clonación molecular.
  • 4. CLONACION DEL DNA  Comporta la separación de un gen especifico o de un fragmento de DNA de un cromosoma mucho mayor y su unión a una pequeña molécula de DNA portador, para después replicar este DNA modificado miles o millones de veces, mediante el aumento del numero de células y la creación de múltiples copias del DNA clonado en cada célula.
  • 5. ELEMENTOS  Segmento de DNA  Vector - Plasmido - Porción del genoma de un virus bacteriano (λ)  Célula  Enzimas
  • 6. ENZIMAS UTILIZADAS EN LA TECNOLOGIA DEL DNA RECOMBINANTE ENZIMA FUNCION Endonucleasas de restricción tipo II Cortan el DNA en secuencias especificas DNA ligasa Une dos moléculas o fragmentos de DNA DNA polimerasa I (E. coli) Rellena los huecos en el DNA duplex por adición secuencial de nucleótidos en los extremos 3` Transcriptasa inversa Hace una copia del DNA a partir de una molécula de RNA Polinucleotido quinasa Añade un grupo fosfato al grupo OH del extremo 5`de un polinucleótido para marcarlo o para permitir su ligación Transferasa terminal Añade colas homopolimericas al grupo OH del extremo 3`de un duplex lineal Exonucleasa III Elimina nucleótidos de los extremos 5`de una hebra de DNA Exonucleasa del bacteriófago λ Elimina nucleótidos de los extremos 5`de un duplex para exponer los extremos 3`monohebra Fosfatasa alcalina Elimina fosfatos terminales tanto del extremo 5`como del 3`(o de ambos)
  • 7. TIPOS DE ENDONUCLEASAS - Las del tipo I cortan el DNA al azar.* - Las de tipo III cortan el DNA a unos 25 pb de la secuencia de reconocimiento.* - Las de tipo II no necesitan ATP y cortan el DNA en la misma secuencia de reconocimiento. * Se mueven a lo largo del DNA mediante un mecanismo que requiere ATP
  • 8. ESQUEMA BASICO Vector + Fragmento de DNA DNA Recombinante Replicación del DNA recombinante dentro de las células huésped Aislamiento, secuenciación y manipulación del fragmento de DNA purificado
  • 9. CLONACION EN E. coli  E. coli fue el primer organismo utilizado y todavía es la célula huésped mas común.  Tiene muchas ventajas: - Se conoce bien el metabolismo de su DNA. - Muchos vectores de clonación que se encuentran asociados de manera natural, están bien caracterizados - Se dispone de técnicas efectivas para la transferencia de DNA de una bacteria a otra.
  • 10. INTERACCION DE LA ENDONUCLEASA DE RESTRICCION EcoRV CON SU SECUENCIA DIANA  Se muestra la enzima unida a los productos de corte de DNA en la secuencia reconocida por la endonucleasa.  La proteína se ha eliminado y el DNA se ha rotado 180. La enzima crea extremos romos. Átomos de Mg en naranja.
  • 11. 1. Cortar el DNA en lugares determinados. Las endonucleasas especificas de secuencia (endonucleasas de restricción) hacen las veces de tijeras moleculares. 2. Selección de una pequeña molécula de DNA capaz de autoreplicarse. Vectores de clonación (plásmidos o DNA vírico). 3. Unión covalente de dos fragmentos de DNA: La ligasa une el vector de clonación y el DNA que se desea clonar. 4. Traslado del DNA del tubo de ensayo a una célula huésped que proporcionara la maquinaria enzimática necesaria para la replicación. 5. Selección o identificación de las células huésped que contienen DNA recombinante.
  • 12. CORTE DE MOLECULAS DE DNA MEDIANTE ENDONUCLEASAS DE RESTRICCION.  Los fragmentos pueden ligarse a un plasmido
  • 13. CORTE DE MOLECULAS DE DNA MEDIANTE ENDONUCLEASAS DE RESTRICCION Un fragmento sintético de DNA que contenga las secuencias de reconocimiento de varias endonucleasas de restricción se puede insertar en un plásmido tratado previamente con una endonucleasa de restricción
  • 14. DISEÑO DEL PLASMIDO pBR322 1. Posee un origen de replicación, en el cual las enzimas celulares inician la replicación (10-20 copias por célula) 2. Contiene dos genes que confieren resistencia a antibióticos. 3. Varias secuencias únicas de reconocimiento para diferentes endonucleasas suministran los sitios donde cortar para insertar las secuencias de DNA foráneo. 4. Su pequeño tamaño facilita su entrada en la célula y la manipulación bioquímica del DNA.
  • 15. CLONACION E IDENTIFICACION DE DNA FORANEO EN E. coli 1. pBR322 se corta en el elemento de resistencia a ampicilina. 2. El DNA foráneo se liga al pBR322 cortado. Si tiene éxito, el elemento de resistencia a la penicilina es inactivado. 3. Se transforman las células de E. coli. Después se cultivan en placas de agar que contienen tetraciclina para seleccionar aquellas que han incorporado el plásmido. 4. Las colonias individuales se transfieren a posiciones equivalentes de placas adicionales. Una placa contiene tetraciclina y la otra ampicilina.
  • 16.  Los plasmidos recombinantes se agregan a un cultivo bacteriano que se trato antes con iones de calcio.  Se someten a un breve golpe de calor y las bacterias se estimulan para que capten el DNA del medio.  El plasmido se replica en forma autónoma en la célula receptora y se pasa a la progenie durante la división celular.
  • 17. CLONACION DE DNA EUCARIOTA EN GENOMAS DE FAGOS  El DNA digerido se fracciona por electroforesis en gel o centrifugación con gradiente de densidad y los fragmentos de 20 kb de largo (aprox) se incorporan
  • 18. EL FRAGMENTO LAMBDA 1. El DNA se empaca bien en una forma que es facil de almacenar y extraer. 2. Todo paquete que contenga un DNA recombinante es capaz de infectar una celula bacteriana. 3. Una caja Petri puede contener mas de 100,000 placas diferentes.
  • 19. EL CROMOSOMA ARTIFICIAL BACTERIANO  Puede aceptar grandes fragmentos de DNA (hasta 500 kb)  Son plasmidos bacterianos especializados
  • 20. EL CROMOSOMA ARTIFICIAL DE LEVADURA  Puede aceptar segmentos de DNA de hasta 1000 kb  Son versiones artificiales de un cromosoma artificial de levadura
  • 21. APLICACIONES  El 24 de febrero de 1997 el Instituto Roslin, de Escocia, se anuncia la reproducción con éxito de la oveja "Dolly".  En julio de 1997 los mismos científicos que habían clonado a "Dolly" produjeron el cordero "Polly" que porta genes humanos.  En noviembre de 2001 la empresa Advanced Cell Technology (ACT) consiguió clonar el primer embrión humano de la historia, aunque su desarrollo se detuvo de forma natural cuando sólo contaba con seis células, mucho antes de alcanzar la fase de blastocito, necesaria para obtener las llamadas células madre. El objetivo era el de obtener células madre para la investigación de terapias génicas.  En enero 2002, la empresa escocesa PPL Therapeutics anuncia el nacimiento de unos cerditos, a los que se les pudo eliminar el gen que causa que el sistema inmunológico del ser humano rechace transplantes de los órganos del cerdo.
  • 22.  En enero de 2002, los creadores de la oveja Dolly, anuncian que el animal sufre artritis, por el envejecimiento prematuro que padece, a sus cinco años de edad.  En febrero de 2002 un equipo investigador que había clonado una docena de ratones informó de que ninguno de ellos logró sobrevivir. Además un equipo investigador japonés llamó la atención sobre la mayor frecuencia de abortos, deformidades, sobrepeso y muertes prematuras entre otros animales que habían sido clonados.  También en febrero de 2002, la Universidad A&M de Texas presentó el primer gato clonado del mundo, un cachorro de dos meses de edad al que llamaron "CC", siglas de "copia al carbón". Según los científicos "los gatos tienen una forma felina del síndrome de inmunodeficiencia humana que es un buen modelo para el estudio del sida humano".  En noviembre de 2002 el experto italiano en fertilidad Severino Antinori dice que espera que una paciente dé a luz un bebé clonado en enero de 2003.
  • 23. RATONES TRANSGENICOS  Se muestra un par de hermanos de la misma camada de 10 semanas de edad.  El mas grande se desarrollo con un huevo inyectado con DNA + GH.  El mas grande pesa 44 gr, y el pequeño 29 gr.  El gen GH se transmitió a los descendientes.
  • 24. BIBLIOGRAFIA  Nelson, D; Cox, M. LEHNINGER PRINCIPIOS DE BIOQUIMICA. 4ª edicion. Edit. Omega. Pags. 306- 317.  Alberts y cols. BIOLOGIA MOLECULAR DE LA CELULA. 4ª edicion. Ediciones Omega. Pags. 500- 504.  Lodish y cols. BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR. 5ª edicion. Ed. Medica Panamericana. Pags.  Karp, G. BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR. 4ª edicion. Edit. Mc Graw Hill. Pags. 822-835  http://laguna.fmedic.unam.mx/lenpres/CH29.ppt#286  http://cultura.terra.es/cac/articulo/html/cac1321.htm