Kaja Milanowska, Django

Python i Django, a programowanie
aplikacji webowych.

Kaja Milanowska
©Wszystkie prawa zastrzeżone

Chwilka na autoreklamę

Sp. z o. o.
– Bioinformatics for Science
VitaInSilica to jedna z nielicznych w
Polsce firm skupiających specjalistów z
bioinformatyki,
biologii
molekularnej,
biotechnologii i IT.

VitaInSilica Sp. z o. o., ul. Krzemowa 1, Złotniki, 62-002 Suchy Las
NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl
office@vitainsilica.pl

Nasz zespół

Dr Joanna Kasprzak

Anna Philips

Dr Anna Czerwoniec

Dr Tomasz Puton

Kaja Milanowska

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392


www.vitainsilica.pl

Czym się zajmujemy

Konsultacje Naukowe w
Zakresie Bioinformatyki
•
•

•
•

Bioinformatyka
strukturalna
Modelowanie
molekularne
Analizy sekwencji
biologicznych
Biostatystyka i
filogenetyka

Rozwój
Oprogramowania
Bioinformatycznego
•
•
•
•

Systemy bazodanowe
Zautomatyzowany
przepływ danych
Zarządzanie danymi w
laboratorium
Programy i skrypty
wspomagające
analizy biologiczne i
biomedyczne

Dobra Szkoła
Bioinformatyki
•
•
•
•

Różne zagadnienia
bioinformatyczne
Zastosowanie narzędzi
bioinformatycznych
Języki programowania
Biostatystyka


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Słowem wstępu


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Słowem wstępu
1. Skryptuj!


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Słowem wstępu
1. Skryptuj!
Języki skrytpowe.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Słowem wstępu
1. Skryptuj!
Języki skrytpowe.

Python


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Słowem wstępu
1. Skryptuj!
Języki skrytpowe.

Python
2. Wyjdź do ludzi!


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Słowem wstępu
1. Skryptuj!
Języki skrytpowe.

Python
2. Wyjdź do ludzi!
Frameworki webowe.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Słowem wstępu
1. Skryptuj!
Języki skrytpowe.

Python
2. Wyjdź do ludzi!
Frameworki webowe.
Django


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Skryptuj!
Języki skryptowe.
• Języki programowania służące do kontrolowania danej aplikacji
• Interpretowane - zaprojektowane z myślą o interakcji z użytkownikiem.
• Skrypty powłoki systemów uniksowych oraz narzędzi administracyjnych
• Osadzane w różnych programach - zapewniają możliwość
zautomatyzowania powtarzających się czynności. (pakiet Microsoft
Office wyposażony jest w osadzony interpreter języka Visual Basic for
Applications (VBA)).
• Swoje języki skryptowe mają też inne profesjonalne narzędzia edycyjne,
jak AutoCAD czy 3D Studio Max

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Skryptuj!
Języki skryptowe.
• Interpretery języków skryptowych są wykorzystywane przez serwery
WWW do serwowania dynamicznych stron internetowych (np.
przez interfejs CGI lub dodatkowe funkcjonalności serwera Apache) m.in. PHP, Perl, Python i Ruby
• Są też osadzane w grach komputerowych – sterowanie przebiegiem
gry – fabułą, dialogami, zachowaniem wirtualnych postaci, a czasem
nawet do sterowania działaniem całego interfejsu graficznego

Niektóre z języków określanych jako skryptowe:
• Python
• Awk
• bash

• JavaScript
• Perl
• PHP

• Ruby
• Tcl

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Skryptuj!
Języki skryptowe. Python.
• Dwie główne wersje standardowej (C) implementacji:
• 2.x (najbardziej popularna)
• 3.x
• Kod czyta / piszę się łatwo i przyjemnie 
• Problem z kompilacją z głowy!
• Automatyczna dealokacja pamięci
• Rozbudowana dokumentacja!
• Dostępność wielu bibliotek i rozszerzeń
• Duża i aktywna społeczność (http://python.org)

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Skryptuj!
Ulubiony przykład!
$ ipython
>>> print 'Hello World!'
Hello World!
>>> print('Witaj świecie!')
Witaj świecie!


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Skryptuj!
Prosta klasa:
class Pet(object):
””” ”””
def __init__(self, name, species):
self.name = name
self.species = species
def getName(self):
return self.name

def getSpecies(self):
return self.species
def __str__(self):
return "%s is a %s." % (self.name, self.species)

parrot = Pet(’Polly’, ’bird’)
print parrot
Polly is a bird.

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Literatura
Python.org – oficjalna strona
Python Programming: An Introduction To
Computer Science (2nd edition) – J. Zelle
Python Programming – M. Lutz
Python Essential Reference – D. Beazley

Konferencje:
EuroPython – http://europython.org/
PyCon UK – http://www.pyconuk.org/
RuPy – http://rupy.eu/

Wyjdź do ludzi!
Frameworki webowe.
• wsparcie rozwoju dynamicznych stron, aplikacji internetowych i
serwisów
• w większości oparte o model MVC (model-view-controller)

• Push-based = „action-based” – „pchają” dane do warstwy widoku, by
wygenerować wyniki: Django, Ruby on Rails, Symfony
• Pull-based = „composed-based” – zaczynają od wartswy widoku, która
„ściąga” wyniki od różnych kontrolerów: Stripes, Lift, Tapestry
• Three Tier Organisation – 3 fizyczne warstwy: klient, aplikacja i baza
danych ≠ MVC
• CMS = Content Management Systems: Joomla, Drupal

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Wyjdź do ludzi!
Frameworki webowe. Cechy.
• template system – statyczny HTML + część dynamiczna (kod
generujący HTML) – może być oparta na kodzie bądź na znacznikach
zawartych w HTMLu
• ograniczenie ilości kodu – dane do wypełnienia stron mogą pochodzić
z bazy danych
• język znaczników – niektóre poza zmiennymi dostarczają także proste
operacje logiczne
• niektóre frameworki dostarczają narzędzi do autentykacji i autoryzacji,
nakładki na bazy danych czy narzędzia do tworzenia i zarządzania
serwisami
• mapowanie URL= przyjazne adresy

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Wyjdź do ludzi!
Frameworki webowe. Django.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC
Pozostań DRY


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC
Pozostań DRY
Technicznie rzecz ujmując


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC
Pozostań DRY
W praktyce: Projekt, Aplikacja, Model


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC
Pozostań DRY
W praktyce: Administracja


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC
Pozostań DRY
W praktyce: Widoki na szablony


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC
Pozostań DRY
W praktyce: Adresy stron


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Tajniki Django
Django, czyli co?
MTV = MVC
Pozostań DRY
Django-powered

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?
wysokopoziomowy, opensource'owy framework


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?

przeznaczony do tworzenia aplikacji internetowych


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?


napisany w Pythonie


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?


napisany w Pythonie
stworzony w 2003 przez grupę programistów związanych z
Lawrence Journal-World


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?


napisany w Pythonie
w 2005 roku wydany na licencji BSD


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?


napisany w Pythonie
opiera się na wzorcu projektowym podobnym
do MVC nazywanym MVT (Model-View-Template)


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django, czyli co?


napisany w Pythonie
opiera się na wzorcu projektowym podobnym
do MVC nazywanym MVT (Model-View-Template)
nazwa od imienia gitarzysty Django Reinhardta

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

I jeszcze więcej charakterystyki.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Automatycznie generowany i kompletny panel administracyjny,


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Przyjazne adresy dokumentów


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Prosty lecz funkcjonalny system szablonów


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Oddzielenie logiki aplikacji (widok) logiki biznesowej (model) wyglądu
(szablony) oraz baz danych


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl


Wsparcie dla wielojęzycznych aplikacji


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl


Bardzo duża skalowalność i wydajność


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl




Wydajne systemy cache'owania, obsługa Memcached

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Własny, prosty serwer do testowania aplikacji




NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Współpraca z Apache poprzez WSGI (domyślnie) i mod_python oraz
z innymi serwerami




NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl



Współpraca z Apache poprzez WSGI (domyślnie) i mod python oraz
z innymi serwerami
DRY czyli zasada „nie powtarzaj się” w odniesieniu do tworzenia
aplikacji


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl



z innymi serwerami
aplikacji
Posiada ORM wysokiego poziomu pozwalający na łatwe i
bezpieczne operowania na bazach danych bez użycia SQL


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl



z innymi serwerami
aplikacji
Obsługuje następujące bazy
danych: PostgreSQL, MySQL, SQLite oraz Oracle


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl



z innymi serwerami
aplikacji
Obsługuje następujące bazy
danych: PostgreSQL, MySQL, SQLite oraz Oracle
djangoproject.com.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Literatura
DjangoProject – Oficjalna strona Django

DjangoBook – Darmowa książka o Django
Django.pl – Polska społeczność Django
Python Web Development with Django
– Forcier, Bissex, Chun

DjangoCon – 2 razy w roku (raz w
Europie – maj/czerwiec, raz w Stanach –
wrzesień)

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

MTV = MVC


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

MTV = MVC
MVC - Model View Cotroller - MTV - Model Template View


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

MTV = MVC
Model = Model – klasa Python’a definiująca tabele w bazie
danych (pewna reprezentacja problemu bądź logiki aplikacji)


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

MTV = MVC
Model = Model – klasa Pythona definiująca tabele w bazie
Template = View – Wzorzec, czyli informacja jak wyświetlić
dane na stronie (HTML + znaczniki) (opisuje, jak wyświetlić
pewną część modelu w ramach interfejsu użytkownika)


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

MTV = MVC
Model = Model – klasa Pythona definiująca tabele w bazie
Template = View – Wzorzec, czyli informacja jak wyświetlić
dane na stronie (HTML + znaczniki) (opisuje, jak wyświetlić
pewną część modelu w ramach interfejsu użytkownika)
Views = Controller – funkcje Python’owe operujące na
danych (przyjmuje dane wejściowe od użytkownika i reaguje
na jego poczynania, zarządzając aktualizacje modelu oraz
odświeżenie widoków)

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Pozostań DRY


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Pozostań DRY

Zasada DRY (ang. Don't Repeat Yourself):


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Pozostań DRY

Every piece of knowledge must have a single,
unambiguous, authoritative representation within a system.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Pozostań DRY

vs.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Pozostań DRY

vs.
WET


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Pozostań DRY

vs.
WET We Edit Terribly, Tumultuously, Tempestuously,
Tenaciously, Too much, Timidly, Tortuously, Terrifiedly...


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Pozostań DRY

vs.
WET We Edit Terribly, Tumultuously, Tempestuously,
Tenaciously, Too much, Timidly, Tortuously, Terrifiedly...

"We Enjoy Typing"

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Technicznie
Instalacja i konfiguracja Django.
→ djangoproject.com
Współpraca z Apache za pomocą mod_WSGI
• mod_wsgi – moduł stworzony przez Grahama
Dumpletona – dostarcza interfesju WSGI do obsługi
aplikacji webowych opartych na Pythonie 2.3+ pod Apache
• Wspiera Pythona 2.6+ i 3.1

• Alternatywa dla mod_python, CGI, FastCGI

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

W praktyce: Projekt
Projekt – „kontener” dla zbioru aplikacji, umożliwiający ich
współdziałanie
$ django-admin startproject my_project

my_project/
manage.py
my_project/
__init__.py
settings.py
urls.py
wsgi.py

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

W praktyce: Projekt
# Django settings for my_project.
DEBUG = True
TEMPLATE_DEBUG = DEBUG
ADMINS = (
('Kaja Milanowska', 'kaja.milanowska@vitainsilica.pl'),
)
MANAGERS = ADMINS
DATABASES = {
'default': {
'ENGINE': 'django.db.backends.mysql',
'sqlite3' or 'oracle'.
'NAME': 'microtoolbox_db',
sqlite3.
'USER': 'liriela',
'PASSWORD': 'micro1234db',
'HOST': '150.254.120.209',
used with sqlite3.
'PORT': '3306',
used with sqlite3.
}
}

# Add 'postgresql_psycopg2', 'mysql',
# Or path to database file if using
# Not used with sqlite3.
# Not used with sqlite3.
# Set to empty string for localhost. Not
# Set to empty string for default. Not


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

W praktyce: Projekt

Serwer deweloperski
$ python manage.py runserver
Validating models...
0 errors found
Django version 1.4.1, using settings
'my_blog.settings'
Development server is running at
http://127.0.0.1:8000/
Quit the server with CONTROL-C.


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

W praktyce: Aplikacja

Aplikacja
$ django-admin.py startapp app
my_project/
…
app/
__init__.py
models.py
tests.py
views.py

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

W praktyce: Model
Model
# -*- coding: utf-8 -*__author__ = 'Kaja Milanowska kaja.milanowska@vitainsilica.pl'
from django.db import models
class Reagent(models.Model):
name = models.CharField(max_length=60)
description = models.TextField()
created = models.DateTimeField(auto_now_add=True)
def __unicode__(self):
return self.name

Baza danych
$ python manage.py syncdb

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Panel administracyjny


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Widoki

my_project/
…
app/
__init__.py
models.py
tests.py
views.py
admin.py


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

from django.shortcuts import render_to_response, get_object_or_404
from django.template import RequestContext
from django.contrib.auth.decorators import login_required
from reagents.models import Reagent
@login_required
def reagents_list(request):
""" shows list of reagents """
all_reagents = Reagent.objects.all().order_by('name')
return render_to_response(
'reagents/reagents_list.html', {'all_reagents' : all_reagents,},
context_instance=RequestContext(request),
)

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Ćwiczenia: Widoki na szablony
from django.shortcuts import render_to_response, get_object_or_404
from django.template import RequestContext
from django.contrib.auth.decorators import login_required
from reagents.models import Reagent
@login_required
def reagents_list(request):
""" shows list of reagents """
all_reagents = Reagent.objects.all().order_by('name')
return render_to_response(
'reagents/reagents_list.html', {'all_reagents' : all_reagents,},
context_instance=RequestContext(request),
)

NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl


my_project/
…
manage.py
urls.py
app/
__init__.py
models.py
tests.py
views.py
admin.py
templates/


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl


my_project/
…
manage.py
# -*- coding: utf-8 -*settings.py
__author__ = 'Kaja Milanowska kaja.milanowska@vitainsilica.pl'
urls.py
from django.conf.urls import patterns, url
app/
urlpatterns = patterns('reagents.views',
__init__.py
url(r'^reagents/', 'reagents_list', name='reagents_list'),
models.py
)
tests.py
views.py
admin.py


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

W praktyce: Wynik
http://127.0.0.1:8000/reagents/


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django-powered
http://www.mozilla.org


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django-powered
http://instagram.com


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Django-powered
http://pinterest.com


NIP: 9721237412 REGON: 301973876 KRS: 0000415392

www.vitainsilica.pl

Kaja Milanowska, Django

Recomendados

Recomendados

Mais conteúdo relacionado

Mais de Geek Girls Carrots Poznan

Mais de Geek Girls Carrots Poznan (17)

Kaja Milanowska, Django