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David Huy et Damien Steiner

André Mourey                                 Année 2009-2010




                                                               1
M. Van Leeuwenhoek (1632-1723) : animalcules (7 septembre 1674)

Zacharias Janssen (1688-1731) : le microscope (1695)


Microbiologie ?
             Etude du monde microscopique :
                     Identification, classification

Evolution de la microbiologie au cours de l’Histoire


                                                        Microscope optique
                                                              (1751)



                                                                         2
Né le 27 décembre 1822 et mort le 28 septembre 1895

     Chimiste, physicien (catholique) et pionnier de la
Microbiologie

     1840 : baccalauréat en lettres
     1842 : baccalauréat en sciences mathématiques

     1843-1847 : faculté des sciences de Paris (physique,
chimie et cristallographie)
                                                                   Louis pasteur dans son
      1847 : Thèse Etudes des phénomènes relatifs à
                                                                         laboratoire
la polarisation rotatoire des liquides

     Travail sur la fermentation, vaccin, asepsie, génération spontanée…



                                                                                            3
Génération spontanée ?
               Apparition d’un être vivant sans ascendant
                                                                   Ballon au col de cygne
               Spontéparité ou hétérogénie

  1858 : Felix Pouchet avec une preuve

  1859 : Pasteur lutte contre la génération spontanée
                Stabilité par la chaleur des germes de l’air (ballon au col
     de cygne avec le chimiste Balard, cuve a mercure)

                Académie des sciences repris les expériences

  22 juin 1864 : Démonstration de l’altération de solutions par des germes de l’air
ambiant (Louis Pasteur)

  20 février 1865 : La matière ambiante ne peut pas générer un être organisé
nouveau, dénué de parents

                                                                                            4
1787 : Adamo Fabbroni  matière vivante responsable de la fermentation
(moût)

  1857-1867 : Etudes sur les fermentations par Louis Pasteur

      Croissance d’organismes sans O2
      Alcool produit en absence d’ O2 >>> Alcool produit en présence d’ O2

                1857 : « Effet Pasteur » (inhibition synthèse d’alcool par le
                présence d’ O2

      Fermentation lactique, butyrique liée a des levures : micro-organisme
organisé observé par Jean-batiste Dumas en 1843

  1861 : Prix Jecker (créé en 1851 par Louis Jecker ; attribué tous les 4 ans)
  1876 : Les études sur la bière
  29 décembre 1883 : Mérite agricole

                                                                                 5
Louis pasteur a contribué à la naissance de l’asepsie

          Flambage de la verrerie
          Expériences d’élimination de germes par chauffage

     Trois groupes pour asepsie
    • Agents physiques
          Chaleur, radiation…
Ex : 1855 : Robert Wihelm Bunsen (1811-1899)
    • Agents chimiques
          Oxydant, alcool…                                      Flammes obtenues à
                                                                   partir d’un bec
    • Agents chimio-thérapeutique
                                                                       bunsen
          Antibiotiques 1928



                                                Antibiotiques
                                                                                     6
Macroscopie

                  Aspect des colonies (la taille, l’aspect des contours, la couleur, la
                  transparence et le type)
                   1887 : Boite de Pétri de Julius Richard Pétri (1852-1921)




 Boite de Petri


                                        Julius Richard Pétri


                                                                                          7
Microscopie

                      Coloration :                                            Gram+
                               - Coloration de Gram
                                1884 : Hans Christian Gram
                                                                              Gram-

                              - Coloration au vert de malachite
                              Antibactérien, produits de la mer et
                              ovo produits
 Technique de la              Risque 1992, Canada
coloration de gram




    Observation de spore                                             Hans Christian Gram
    au vert de malachite
                                                                                       8
La génétique ?

                   Etude l’ADN sous toutes ces formes et l’hérédité

  Naissance de la génétique ?

               Johann Gregor Mendel (1822-1884) : un moine botaniste
               autrichien
               Les lois de Mendel

  1883 : August Weismann  théorie : ADN = un matériel de l’hérédité
  1995 : Séquençage génome bactérien Haemophilus influenzae par Craig Venter
(Saccharomyces cerevisiae en 1996, Escherichia coli en 1997 et Arabidopsis
thalianaen 2000)

               Classification a partir des ARNr


                                                                               9
1789 : Eau de javel (NaOCl)


     Louis Pasteur : Problèmes de brasserie de la région de Lille avec la
                 fermentation

                    Bactéries : sucres  acides

                             Pasteurisation (1865)

     Année 1980 : Contrôle qualité HACCP


Ex : Bactéries lactiques




                                                                            10
Généralités
   -3000 ans avant JC : pain fermenté (suisse), produits laitiers (Orient), bière
 (Egypte)

   1873 : isolement de Bacterium Lactis

  1890 : ferments lactiques (acidification du lait et maturation de la crème) par
 Weigmann et Storch

   1901 : Beijerinck décrit un Lactobacillus

   XXe siècles : utilisation en IAA des LAB

    1919 : Orla-Jensen décrit les LAB : G+, immobiles, micro-aérophiles, acide
 lactique


                                                                                    11
Identification

                   Caractéristiques phénotypiques :

Croissance à :

-   5, 10, 15, 45 C ;
-   en présence d’NaCl <8%
-   Présence d’acétate (Rogosa)
-   pH 9.6
-   Fermentation des glucides
-   Caractère homo/hétérofermentaire
-   …



                                                      12
Identification
Ex : Bactéries lactiques en coques  G+, catalase -, oxydase –

                                                                  Hetérofermentaires :
                                                                     Leuconostoc

                                      Chainettes
                                                                  Homofermentaires :
                                                                 Lactococcus, Streptoco
                                                                         ccus
        Coques



                                                                  Homofermentaires :
                                       Tétrades
                                                                    Pediococcus




                                                                                          13
Classifications (taxonomie)
                   2 Types :

-   Classique : morphologique et physiologique : Coques (Lactococcus,
    Streptococcus,…), coccoïde (Leuconostoc, Oenococcus),bâtonnets (Lactobacillus,
    Carnobacterium)

-   Caractèristiques moléculaires : %C+G, structure ARNr

                   Arbres phylogénétiques

1987 : Schleifer apporte des changement important e au niveau des études taxonomique




                                                                                       14
Bactéries lactiques




Louis Pasteur = fondateur de la microbiologie




Evolution de la microbiologie




                                                15
   Livres

-   Jean-Paul Larpent. Mémento technique de microbiologie. 1997.1039p.
-   R.Y. Stanier et M.Doudoroff. Microbiologie générale.
-   Bulletin de la Société Française de Microbiologie : février 2003 vol.18, N HS ; avril 2005 vol.20, N HS ; octobre 2008
    vol.23, N 3 ;décembre 2008 vol.23, N 4.
-   A.Meyer, J.Deiana, A.Bernard. Cours de microbiologiegénérale. Doin, 2004. 416p. Biosciences et techniques. ISBN 2-7040-
    1170-2 (http://books.google.fr/)
-   Prescott, Harley, Klein. Microbiologie. Edution 2, 2003. 1164p.ISBN 2-8041-4256-6 (http://books.google.fr/)

   Sites internet

http://www.enzyme.wikibis.com/microbiologie.php
http://bacterioweb.univ-fcomte.fr/bibliotheque/M1-BBCM/Classification_biodiversite.pdf
http://fr.wikipedia.org/
http://knol.google.com/k/une-page-d-histoire-de-la-microbiologie# (2005)
http://mendeleiev.cyberscol.qc.ca/Chimisterie/9606/JFPare.html (1998)
http://microbiologie.univ-tours.fr/ (2009)
http://www.ac-grenoble.fr/disciplines/sti/biotec/pages/microbiologie/cours_types_trophiques.htm(2006)
http://www.biotechno.fr/Le-laboratoire-de-microbiologie.html (2009)
http://www.bacterio.cict.fr/bacdico/bacteriogene/structure.html#paroi (2004)
http://www.bacteriologie.net/generale/piliflagelles.html (1999)
http://www.fao.org/docrep/004/X6551F/X6551F03.htm (1987)
http://www.sante.univ-nantes.fr/med/ticem/ressources/1438.pdf (2010)
http://www.techno-science.net/?onglet=glossaire&definition=7266 (2009)


                                                                                                                              16
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La microbiologie de louis pasteur à nos jours

  • 1. David Huy et Damien Steiner André Mourey Année 2009-2010 1
  • 2. M. Van Leeuwenhoek (1632-1723) : animalcules (7 septembre 1674) Zacharias Janssen (1688-1731) : le microscope (1695) Microbiologie ? Etude du monde microscopique : Identification, classification Evolution de la microbiologie au cours de l’Histoire Microscope optique (1751) 2
  • 3. Né le 27 décembre 1822 et mort le 28 septembre 1895 Chimiste, physicien (catholique) et pionnier de la Microbiologie 1840 : baccalauréat en lettres 1842 : baccalauréat en sciences mathématiques 1843-1847 : faculté des sciences de Paris (physique, chimie et cristallographie) Louis pasteur dans son 1847 : Thèse Etudes des phénomènes relatifs à laboratoire la polarisation rotatoire des liquides Travail sur la fermentation, vaccin, asepsie, génération spontanée… 3
  • 4. Génération spontanée ? Apparition d’un être vivant sans ascendant Ballon au col de cygne Spontéparité ou hétérogénie 1858 : Felix Pouchet avec une preuve 1859 : Pasteur lutte contre la génération spontanée Stabilité par la chaleur des germes de l’air (ballon au col de cygne avec le chimiste Balard, cuve a mercure) Académie des sciences repris les expériences 22 juin 1864 : Démonstration de l’altération de solutions par des germes de l’air ambiant (Louis Pasteur) 20 février 1865 : La matière ambiante ne peut pas générer un être organisé nouveau, dénué de parents 4
  • 5. 1787 : Adamo Fabbroni  matière vivante responsable de la fermentation (moût) 1857-1867 : Etudes sur les fermentations par Louis Pasteur Croissance d’organismes sans O2 Alcool produit en absence d’ O2 >>> Alcool produit en présence d’ O2 1857 : « Effet Pasteur » (inhibition synthèse d’alcool par le présence d’ O2 Fermentation lactique, butyrique liée a des levures : micro-organisme organisé observé par Jean-batiste Dumas en 1843 1861 : Prix Jecker (créé en 1851 par Louis Jecker ; attribué tous les 4 ans) 1876 : Les études sur la bière 29 décembre 1883 : Mérite agricole 5
  • 6. Louis pasteur a contribué à la naissance de l’asepsie Flambage de la verrerie Expériences d’élimination de germes par chauffage Trois groupes pour asepsie • Agents physiques Chaleur, radiation… Ex : 1855 : Robert Wihelm Bunsen (1811-1899) • Agents chimiques Oxydant, alcool… Flammes obtenues à partir d’un bec • Agents chimio-thérapeutique bunsen Antibiotiques 1928 Antibiotiques 6
  • 7. Macroscopie Aspect des colonies (la taille, l’aspect des contours, la couleur, la transparence et le type) 1887 : Boite de Pétri de Julius Richard Pétri (1852-1921) Boite de Petri Julius Richard Pétri 7
  • 8. Microscopie Coloration : Gram+ - Coloration de Gram 1884 : Hans Christian Gram Gram- - Coloration au vert de malachite Antibactérien, produits de la mer et ovo produits Technique de la Risque 1992, Canada coloration de gram Observation de spore Hans Christian Gram au vert de malachite 8
  • 9. La génétique ? Etude l’ADN sous toutes ces formes et l’hérédité Naissance de la génétique ? Johann Gregor Mendel (1822-1884) : un moine botaniste autrichien Les lois de Mendel 1883 : August Weismann  théorie : ADN = un matériel de l’hérédité 1995 : Séquençage génome bactérien Haemophilus influenzae par Craig Venter (Saccharomyces cerevisiae en 1996, Escherichia coli en 1997 et Arabidopsis thalianaen 2000) Classification a partir des ARNr 9
  • 10. 1789 : Eau de javel (NaOCl) Louis Pasteur : Problèmes de brasserie de la région de Lille avec la fermentation Bactéries : sucres  acides Pasteurisation (1865) Année 1980 : Contrôle qualité HACCP Ex : Bactéries lactiques 10
  • 11. Généralités -3000 ans avant JC : pain fermenté (suisse), produits laitiers (Orient), bière (Egypte) 1873 : isolement de Bacterium Lactis 1890 : ferments lactiques (acidification du lait et maturation de la crème) par Weigmann et Storch 1901 : Beijerinck décrit un Lactobacillus XXe siècles : utilisation en IAA des LAB 1919 : Orla-Jensen décrit les LAB : G+, immobiles, micro-aérophiles, acide lactique 11
  • 12. Identification Caractéristiques phénotypiques : Croissance à : - 5, 10, 15, 45 C ; - en présence d’NaCl <8% - Présence d’acétate (Rogosa) - pH 9.6 - Fermentation des glucides - Caractère homo/hétérofermentaire - … 12
  • 13. Identification Ex : Bactéries lactiques en coques  G+, catalase -, oxydase – Hetérofermentaires : Leuconostoc Chainettes Homofermentaires : Lactococcus, Streptoco ccus Coques Homofermentaires : Tétrades Pediococcus 13
  • 14. Classifications (taxonomie) 2 Types : - Classique : morphologique et physiologique : Coques (Lactococcus, Streptococcus,…), coccoïde (Leuconostoc, Oenococcus),bâtonnets (Lactobacillus, Carnobacterium) - Caractèristiques moléculaires : %C+G, structure ARNr Arbres phylogénétiques 1987 : Schleifer apporte des changement important e au niveau des études taxonomique 14
  • 15. Bactéries lactiques Louis Pasteur = fondateur de la microbiologie Evolution de la microbiologie 15
  • 16. Livres - Jean-Paul Larpent. Mémento technique de microbiologie. 1997.1039p. - R.Y. Stanier et M.Doudoroff. Microbiologie générale. - Bulletin de la Société Française de Microbiologie : février 2003 vol.18, N HS ; avril 2005 vol.20, N HS ; octobre 2008 vol.23, N 3 ;décembre 2008 vol.23, N 4. - A.Meyer, J.Deiana, A.Bernard. Cours de microbiologiegénérale. Doin, 2004. 416p. Biosciences et techniques. ISBN 2-7040- 1170-2 (http://books.google.fr/) - Prescott, Harley, Klein. Microbiologie. Edution 2, 2003. 1164p.ISBN 2-8041-4256-6 (http://books.google.fr/)  Sites internet http://www.enzyme.wikibis.com/microbiologie.php http://bacterioweb.univ-fcomte.fr/bibliotheque/M1-BBCM/Classification_biodiversite.pdf http://fr.wikipedia.org/ http://knol.google.com/k/une-page-d-histoire-de-la-microbiologie# (2005) http://mendeleiev.cyberscol.qc.ca/Chimisterie/9606/JFPare.html (1998) http://microbiologie.univ-tours.fr/ (2009) http://www.ac-grenoble.fr/disciplines/sti/biotec/pages/microbiologie/cours_types_trophiques.htm(2006) http://www.biotechno.fr/Le-laboratoire-de-microbiologie.html (2009) http://www.bacterio.cict.fr/bacdico/bacteriogene/structure.html#paroi (2004) http://www.bacteriologie.net/generale/piliflagelles.html (1999) http://www.fao.org/docrep/004/X6551F/X6551F03.htm (1987) http://www.sante.univ-nantes.fr/med/ticem/ressources/1438.pdf (2010) http://www.techno-science.net/?onglet=glossaire&definition=7266 (2009) 16
  • 17. Merci de votre attention 17