Panorama de l'IST pour le doctorant : l'Intégrale

Panorama de l'Information Scientifique et
Technique pour le doctorant

L'intégrale

©Club photo et Maxime Storn

(épisode 1 + épisode 2)
Céline Andrieu, Alain Marois – Bibliothèque Michel Serres
Philippe Eyraud – Bibliothèque du LMFA

Episode 1



La lourde tâche du doctorant...
Participer à des
congrès

Rédiger et publier
Rédiger sa thèse
des articles

Valoriser son travail Assister à des
séminaires

Préparer sa vie professionnelle Se faire connaître, entrer dans un
réseau

16/05/2011 Formation Doctorants Episode 1 - Bibliothèque 16/05/11 2

Mais il n'est pas si seul !

Équipe de recherche
Collège des pairs
(évaluation)

Autres doctorants
Assistance de la bibliothèque,
d'un documentaliste

Outils à sa disposition


Vraiment pas seul...
Vague connaissance croisée sur un
autre campus du PRES

Équipe de recherche
Collège des pairs
(évaluation)
Geekette sympa rencontrée
à la machine à café

Autres doctorants
Assistance de la bibliothèque,
d'un documentaliste

Outils à sa disposition
La secrétaire du Pr. X,
« Le type là-bas qui connaît LaTeX » « super calée en Word »


Objectifs de cette formation

Episode 1
● Se situer dans l'environnement de l'IST
● Optimiser l'utilisation des sources d'information
scientifiques et techniques
● Comprendre l'évaluation de l'information scientifique
● Mettre en place une stratégie de veille


Objectifs de cette formation

Episode 2 :
● Organiser son travail bibliographique
● Gérer ses références bibliographiques et les utiliser dans
sa production, en fonction du logiciel choisi
● Publier et archiver sa production


Se situer dans l'environnement de l'IST


Qu'est-ce que l'IST ?

« L'information scientifique et technique (IST)
regroupe l'ensemble des informations produites par la
recherche et nécessaires à l'activité scientifique comme
à l'industrie ». (Ministère de l'Enseignement supérieur)

L'IST couvre tous les secteurs scientifiques et
techniques et se présente sous de multiples formes.


« Information Scientifique et Technique »
articles, revues
et ouvrages scientifiques

notices de brevet spécifications techniques décrivant
des processus de fabrication

BDD bibliographiques documentation technique

littérature grise :
IST accompagnant les produits

thèses, pre-prints, normes
rapports, actes de
congrès...
banques de données brutes
archives ouvertes et
portails
entrepôts de données
accessibles sur internet


Positionnement du doctorant

Analyser le sujet Mettre en place Produire l'IST
Gérer l'information
Rechercher et une stratégie de Publier
évaluer veille
l'information Archiver

=> penser « flux »

Optimiser l'utilisation
des sources d'information


1. Le kit de survie

Les Techniques de l'ingénieur

Les catalogues de
bibliothèques

Les moteurs de recherche
scientifiques sur le web


Choisir des sources d'informations
http://bibli.ec-lyon.fr/ressourcesElec/ressourcesElec.php

Les sources d'info les plus pertinentes

Accès aux sources
d'informations depuis le
site de la bibliothèque


Les Techniques de l’Ingénieur : recherche avancée

Veille technologique et actualités

Formulaire de recherche avancée

Encyclopédie spécialisée en sciences
et techniques


Les Techniques de l’Ingénieur : résultats


Les Techniques de l’Ingénieur : article

Article au
format PDF

Accédez à des données et services
complémentaires en vous identifiant
: biblio; signets,...


Les Techniques de l’Ingénieur : traducteur multilingue
http://www.techniques-ingenieur.fr/lexique.html

Champ de
recherche


Les catalogues

des bibliothèques localisées sur le campus ECL

des bibliothèques de l'enseignement
supérieur et de la recherche en France :
universités, grandes écoles...

de plus de 70 000 bibliothèques
dans le monde

Pour trouver des livres, revues, thèses...


Le catalogue des bibliothèques du campus ECL :
Bibliothèque Michel Serres et bibliothèques de laboratoires

http://doc.ec-lyon.fr

Un « catalogue », cela permet de
trouver une référence (ex : le titre
d'un livre) et d'accéder au
document (ex : le livre papier ou
électronique)


Catalogue des bibliothèques du campus ECL : recherche experte

1 Localisation des exemplaires sur le campus
2

Pole + Cote => vous
trouvez le document


Le SUDOC, Système universitaire de documentation

La recherche avancée : évitez le
bruit informationnel (les « bons » http://www.sudoc.abes.fr
résultats noyés dans la masse)

Trouvez tout ce que peuvent
avoir les différentes
bibliothèques participantes

Choisir un type de document


Le SUDOC : résultats et localisation
Types de documents
1

Trouver ce livre en 3
France

2
Localisaction des
exemplaires sur la France

Vous pouvez emprunter
gratuitement dans les
principales BU de Lyon
(Insa, Lyon1,2,3, ENS,...);
sinon, pensez au
Prêt Entre Bibliothèques
(PEB)


WorldCat
http://www.worldcat.org/


Focus : rechercher et consulter
des thèses imprimées ou électroniques


Comment consulter une thèse
Les thèses soutenues en France (recensées dans le
SUDOC) peuvent être consultées :
● sous forme imprimée dans la bibliothèque de
l’établissement de soutenance (possibilité de faire un PEB)
● sous forme électronique sur le site des bibliothèques ou
sur TEL-Thèses en ligne


Coming soon...


Application qui permet de traiter
STAR et diffuser les thèses soutenues
en France


http://www.dart-europe.eu

Portail européen des thèses électroniques,
dont les thèses françaises déposées dans
STAR depuis 2009


Trouver une thèse dans le SUDOC : recherche

Choix du type de document


Trouver une thèse dans le SUDOC : résultats

1

Thèse électronique

Thèse imprimée

2

3

Lien vers la thèse
électronique


Consulter une thèse électronique
sur TEL – Thèses en ligne
http://tel.archives-ouvertes.fr/

● Sous-ensemble de
l'archive ouverte française
HAL : serveur d'auto-
archivage
● Dépôt des thèses
Attention : dépôt volontaire par
le doctorant (ou via le circuit de françaises
la thèse électronique pour
l'ECL par exemple)... ● Objectif : rendre

rapidement et gratuitement
disponibles des documents
...donc si toutes les thèses scientifiques
de TEL sont signalées dans
le Sudoc, tout ce qui est dans
le Sudoc n'est pas dans
TEL !


Les moteurs de recherche scientifiques

Google ...2004

Elsevier ...2001


Des outils parmi d'autres....


« Scientific information only » ?


Que peut-on y trouver ?

Sites « de qualité » indexés

Silos de données indexés

Précisions sur les sources


Gérer la multiplicité des sources


Trier par type de fichiers

Contrôle des sources

Disciplines (algorithme)


« Un jeune homme brillant,
mais inconstant... »


Brillant !

● Simplicité + rapidité
● Facilite l'accès au texte intégral
● Index de citations => ranking, « bibliométrie »
● Large couverture
● Gratuité...


Inconstant...

● Nombre de résultats variables
● Opacité (Sources ? Couverture ?? Algorithme ???)
● Affiliations ?
● Métadonnées (auteurs,...) laissant à désirer
● Peu d'options avancées


Pensez-y : les opérateurs de GS


Résultats Google
Scholar via la
« recherche
universelle » Google


Focus : Archives ouvertes
( HyperArticles en Ligne, arXiv.org)


HAL permet un dépôt et un
signalement rapide des articles,
colloques,...par les chercheurs
eux-mêmes


HAL est une « archive ouverte »
incarnant en France le mouvement dit
du libre accès à l'information
scientifique (Open Access). Généralise
le modèle historique qu'est arXiv.org


2. Approfondir sa recherche avec

des bases de données bibliographiques

des portails d'accès aux revues
scientifiques : accès ECL et CNRS

Pour trouver des articles, pre-prints, actes de congrès...


Les bases de données bibliographiques


Scopus
● BDD pluridisciplinaire créée en 2004 par Elsevier
● Donne accès à de nombreuses références scientifiques
issues de :
● revues à comité de lecture
● sites internet de qualité (< Scirus)
● bases de brevets


Outil similaire...
● au Web of Science, mais couverture + large (+ de 18000
revues)
● à Google Scholar, mais + performant (bonne gestion des
auteurs, citation tracking…)
● Outre la recherche par sujet, elle fournit des indicateurs
pour évaluer la production scientifique d'un auteur ou
d'une institution, une revue (citations depuis 1996)


Scopus : recherche de document

Combiner ses mots-clés

Choix du champ
d’interrogation
Appliquer des limites


Scopus : résultats
Résultats dans Scopus
Résultats sur le web,
dans les brevets...

Affiner ses résultats

Accès direct à l'article*

* le lien pointe vers l'article sur le site
web de la revue; l'accès n'est effectif
que si l'ECL est abonnée à la revue
via la bibliothèque


Télécharger le
PDF
Scopus : notice détaillée
Références de l'article

Les auteurs et leurs affiliations


Scopus : recherche par auteur

Outil conseillé pour retrouver
toutes les publies d'un auteur ou
éviter les homonymes



Accès à la fiche de l'auteur

Accès à ses publications



Accès à ses publications


Web of Science : accès CNRS

Le CNRS propose des
« portails » thématiques;
au sein de ces portails
vous pouvez accéder à
de nombreuses bases

Accès au Web of Science


Web of Science : recherche de document

Combiner ses mots-clés
Choix du champ
d’interrogation

Appliquer des limites


Web of Science : résultats
Télécharger le PDF

Les auteurs
Références de l'article


Les portails d'accès
aux revues scientifiques


Depuis le site de la bibliothèque

Accès via la rubrique
« Documentation
électronique »

Accès payé par l'ECL

Editeurs de revues commerciales

Revues en libre accès
(Open access journals)


Les portails d'information du CNRS

Accès par mot de passe, propre à chaque laboratoire CNRS
demandant l’accès à ce service. Accès nomade


Exemple : le portail BiblioST2I

Editeurs de revues commerciales


Comparaison accès ECL / BiblioST2I

ECL BiblioST2I
Web of Science 1991-2011 1899-2011
(abonnement interrompu en 2009) + Current Contents
+ Medline + Medline
+ Journal Citation Report
+ Essential Science Indicator

Science Direct (Elsevier) 1995-2011 Origines-2011 pour de
nombreux titres
Springerlink 1997-2011 Origines-2011 pour de
nombreux titres
Springer e-books Lecture Notes in Computer Science Collection chimie/sciences de
(LNCS) l’ingénieur + LNCS


Comprendre l'évaluation de
l'information scientifique :

de l'évaluation qualitative à l'évaluation
quantitative de la recherche


Critères d'analyse d’un article scientifique
● Auteurs
● Institution (affiliation)
● Notoriété de la revue (Facteur d'impact)
● Date de publication
● Structuration du contenu (démarche scientifique)
● Bibliographie…
→ Grille d'analyse d'un article scientifique


L'évaluation quantitative de la production
scientifique : indicateurs

● Pour un auteur : nombre et types de documents
produits, nombre de citations de sa production, h index...
● Pour un article : nombre de fois où il est cité par d'autres
articles, la revue dans laquelle il est publié (facteur
d'impact)


Outils pour évaluer la production scientifique

● Google Scholar : nombre de citations d'un article
● Scopus : Author Evaluator (nombre de documents
produits, de citations et h index) et View citation overview,
Analytics (comparaison entre revues)...
● Web of Science : Citation Map (pour un document),
Citation Report (pour un auteur), h index
● Journal Citation Reports


Google Scholar : citations

Nombre de citations par document


Scopus : fiche d'un auteur

Accès aux types de documents produits, aux
citations et au h index

Accès aux documents citant la production de cet
auteur


Attention : qu'évalue-t-on exactement ?

En réalité seulement 39 articles sur 101
documents produits


Les biais des indicateurs...

On peut enlever les auto-citations

Et cela impacte le h index


Mise en garde par Scopus...


Scopus : recherche par affiliation
1

2

Accès au nombre de documents et
auteurs appartenant à cette affiliation


Scopus : recherche par affiliation


Scopus : Analytics
Permet de comparer les citations de plusieurs revues entre elles


Web of Science : Citation Map
1

2

Lancer Citation Map à partir d'une publication


Web of Science : Citation Map
1
Choisir le type de
graphique qu'on souhaite
afficher

2


Web of Science : recherche par auteur
1

Nombre de publications de
l'auteur...indexées (présentes) dans
la base du WoS
2


Web of Science : Citation Report

Accéder au Citation
Report


Web of Science : Citation Report

Nombre de citations,
d'articles cités, h
index...

Possibilité d'enlever
les auto-citations

h index


Les limites du h index

● Le h index n’a de sens que si l’on compare des auteurs
dans une même discipline et d'une même tranche d'âge
● Cf Hirsch, J. E. (2005). An index to quantify an
individual's scientific research output. Proceedings of the
National Academy of Sciences of the United States of
America, 102(46), 16569-16572.


Journal Citation Reports :
Facteur d'impact d'une revue

L’édition Science couvre
plus de 7200 revues dans
171 disciplines


Journal Citation Reports
1

2
Choisir une catégorie de
sujet

Puis classer par facteur
d'impact



Comment se situe la
revue par rapport aux
autres revues, selon son
facteur d'impact


1

Possibilité d'enlever les
auto-citations

Impact des auto-citations
2


1

Accéder au JCR à
partir du
Web of Science

2

Facteur d'impact
sur 5 ans


Les limites du facteur d'impact
● Il reflète la situation des revues des 2 années
précédentes (et non la situation actuelle)
● Peu d’articles d’une revue donnée sont fortement cités,
publier dans une revue à fort facteur d’impact n’assure
donc pas forcément que l’article sera lu
● Comparer des facteurs d’impact dans une même
discipline


Mettre en place une stratégie de veille


La veille : définition

« Activité continue et en grande partie itérative visant à
une surveillance active de l'environnement
technologique, commercial, etc., pour en anticiper les
évolutions ». (Norme AFNOR XP X50-053, avril 1998)

Elle nécessite la mise en place d’une stratégie


La veille : objectifs

● Faciliter l'identification des ressources pertinentes
● Maintenir un flux régulier d’informations dans son
domaine / actualiser ses informations
● Déceler les évolutions du domaine étudié
● Continuer à être informé de nouvelles parutions
pertinentes après une recherche documentaire


La veille : objectifs

●

●
Gagner
Faciliter l'identification des ressources pertinentes

Maintenir un flux régulier d’informations dans son

●
du
domaine / actualiser ses informations

Déceler les évolutions du domaine étudié
●
temps !
Continuer à être informé de nouvelles parutions
pertinentes après une recherche documentaire


La veille : les étapes...

récolte
ciblage

VEILLE

analyse
diffusion


...pour une approche stratégique
● Le ciblage : définir les thèmes étudiés et les sources à utiliser
● La récolte des informations : utiliser les bons outils
● L’analyse des données : collecter uniquement ce qui est utile
en excluant les données non fiables et non pertinentes
● La diffusion des résultats de la veille pour valoriser (on la
gestion / conservation / partage)


La veille : accès à l’information
Deux méthodes :
● PULL : l’usager va chercher l’information (recherche
précise mais qui demande du temps)
→ historiques de recherche, signets web, consultation de
sommaires de revues, personnes ressources...
● PUSH : l’information vient à l’usager (gain de temps
mais risque de surabondance de l'information)
→ profils et alertes par e-mail, fils rss...


La méthode PUSH
Elle apporte de manière directe et automatique des informations en
fonction de critères préétablis. Différents outils peuvent être utilisés :
● Bulletins d’informations, newsletters électroniques
● Listes de discussion
● Fils d’informations grâce aux flux RSS rassemblés dans des agrégateurs
(Netvibes, Google Reader…)
● Services d’alertes par envoi de courriels (Google Alerts)
● Outils de monitoring qui aspirent, à intervalles définis, les sites web
sélectionnés et signalent les changements intervenus (Wysigot Light,
WebSite-Watcher, Update Scanner....)

Veille et flux RSS : exemple sur le web
Fils RSS : flux structurés de contenus en
provenance de sites Internet, incluant les titres
des articles et des liens vers ces articles à
consulter en ligne.

Certains sites proposent plusieurs flux


Veille et flux RSS : exemple sur le web
Pour lire un flux RSS facilement, utiliser
un...logiciel de lecture de flux RSS

Les navigateurs modernes sont
compatibles avec les flux RSS. Ce peut
être un premier choix

Pour plus d'informations sur l'utilisation des flux RSS
=> « Optimiser sa veille avec les flux RSS »
http://bibli.ec-lyon.fr/documents/RSS_2010-2.pdf

Veille avec une BDD biblio : Scopus
●
Recevoir les derniers articles correspondant à votre
recherche : sauvegarder une requête et créer une
alerte par e-mail ou par flux RSS
●
Etre prévenu d'une nouvelle citation d'un article : créer
une alerte sur un document cité
●
Connaître les nouvelles publications d’un auteur ou des
publications citant cet auteur : créer une alerte sur un
auteur
●
Suivre l’actualité d’une institution : créer une alerte sur
une institution
16/05/2011 Formation Doctorants Episode 1 - Bibliothèque 16/05/11 104 104

Votre veille sous Scopus : 4 méthodes

requête document

Scopus

auteur institution


Scopus : créer son compte
1 Pour créer son compte

2


Scopus : créer une alerte sur une requête
Sauvegarder une Créer une alerte
requête dans « My par e-mail sur la
settings » requête

Créer une alerte
grâce au fil RSS


Scopus : créer une alerte sur une citation

Créer une alerte
par e-mail sur un Créer une alerte
document cité grâce au fil RSS


Scopus : créer une alerte sur un auteur

Créer une alerte par e- Créer une alerte
mail sur une nouvelle grâce au fil RSS
publication de cet auteur

Créer une alerte par e-mail
sur une nouvelle citation
d'une publication de cet
auteur


Scopus : créer une alerte sur une
institution

Créer une alerte par e-
mail sur une nouvelle
publication rattachée à
cette institution Créer une alerte
grâce au fil RSS


Scopus : gérer ses alertes
dans « My alerts »


Scopus : « My settings »

Requêtes
Alertes sauvegardées
sauvegardées

Listes
bibliographiques
sauvegardées


En attendant l'épisode 2...
Retrouvez nos supports de formation thématiques :

http://bibli.ec-lyon.fr/Formation/consulter_supports.php?rb=supports


Questions ?

Céline Andrieu 04.72.18.67.44 celine.andrieu@ec-lyon.fr
Alain Marois 04.72.18.64.50 alain.marois@ec-lyon.fr
Philippe Eyraud 04.72.18.65.00 philippe.eyraud@ec-lyon.fr


Episode 2



Rappels...

Episode 1
● Se situer dans l'environnement de l'IST
● Optimiser l'utilisation des sources d'information
● Comprendre l'évaluation de l'information scientifique
● Mettre en place une stratégie de veille

Formation Doctorants Episode 2 - Bibliothèque 26/05/2011 2

Ce qu'on vous propose aujourd'hui

Episode 2 :
● Gérer ses références bibliographiques et les utiliser dans
sa production, en fonction du logiciel choisi :
● Zotero
● Mendeley
● Publier et archiver sa production


Gérer ses références bibliographiques
et les utiliser dans sa production


Trop de références bibliographiques

sur une idée originale de Valentin Vivier


Gérer sa bibliographie
● S'organiser
● Capitaliser

● Privilégier le fond sur la forme

● Partager des références, collaborer

● Découvrir de nouveaux travaux ?


Des outils dédiés


Besoins* classiques...et émergents

*données 06/2010

sur une idée originale de Martin Fenner

Zotero


Zotero
● Extension du navigateur Firefox + services en
ligne (http://www.zotero.org)
● = > Windows + Mac + Linux

● Gratuit...

● ...comptes « premium » si besoin

● Opensource

● Institutions + vaste communauté

● Nombreux styles bibliographiques

● Évolution rapide


Zotero : l'appui institutionnel

+


Un couteau suisse


Installation de Zotero


Installation : autoriser et redémarrer Firefox
1

Comme toute extension Firefox, vous
devez redémarrer votre navigateur
pour finaliser l'installation

Cliquer sur Installer...
2

3

Une fois Firefox redémarré, Zotero
apparaît dans la liste des modules
complémentaires


Il vous est proposé de vous créer un
compte sur le site zotero.org. Ce n'est
pas obligatoire...

...mais cela vous permettra d'utiliser les
fonctionnalités de synchronisation et
de collaboration de l'outil


Utilisation de Zotero


La barre d'outils La recherche

Votre bibliothèque et
vos marqueurs Détail d'une référence


Zotero :: Collecter des références


Zotero :: Organiser sa bibliothèque


Zotero :: Citer des références


Zotero :: Exporter pour BibTeX


« Avant toute chose : avoir du style »

Répertoire public des styles zotero.
Respecte le standards CSL1.0.

Les fichiers de styles sont chargés
automatiquement (« Install »)


Zotero :: Synchroniser et collaborer


La confidentialité en question

« Tout ou rien » : vous ne pourrez pas
(pour l'instant) restreindre la visibilité de
certaines collections; idem pour les
notes


Les groupes Zotero
3 types de groupes

Les groupes permettent de partager
des notices, notes et fichiers entre
membre en maitrisant finement la
confidentialité

Private Groups : pas de profil public; page du
groupe visible pour membres invités; invisible
dans les recherche
Public, Closed Membership : pqge publique
possible; sur invitation ou validation d'une
demandre; collections visible ou pas au sein de
la bibliothèque
Public, Open Membership : adhésion libre;
visibilité; pas de stockage de fichiers


L'avenir de Zotero


Zotero : aide, information
Blog de Zotero

Zotero francophone, communauté fr
autour de Zotero

Tutoriels vidéo en ligne

Forums actifs sur Zotero.org


Mendeley


Mendeley
● Logiciel à installer + service en ligne
(http://www.mendeley.com)
● Windows + Mac + Linux

● Modèle de Last.fm (partage de musique)

● Version beta, gratuit, mais...

●...business model en évolution, mais...

●... « what is free now will remain free »

● Société basée à Londres


Mendeley


Installation de Mendeley


Téléchargement : option 1

Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte


Téléchargement : option 2

Il est aussi possible d'installer l'outil sans créer de compte à priori

Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes


Installation : les plugins Word et OpenOffice
1 2

4
3

Compatibilité OpenOffice

Compatibilité Word 2003 - 2007


Vue d'ensemble de l'interface « Desktop »
Barre d'outils
Moteur de recherche

Collections, collections
partagées, corbeille

Liste des références

Filtres (auteurs, journaux,
tag, mots clés auteur)

Détails, tag et annotations,
références citées


Créer sa bibliothèque de références


Ajouter des références : via Mendeley Desktop

Différentes stratégies :
● Ajout d'un document ou d'un répertoire de documents
● « Watch a folder », pour l'import automatique de PDF
● Ajout de références au format EndNote, BibTeX, RIS, etc.

Ajout par « glisser-déposer » de fichiers PDF...

...et Mendeley extraira les descriptions du document
PDF automatiquement


Ajouter des références : utiliser l'import web
1

Un simple lien placé dans la barre d'adresse 2
permet d'importer directement des résultats
de recherche à partir des sites compatibles

Choisir les références dans la fenêtre
dédiée, annoter, ajouter des tag


Import web : installation et compatibilité
http://www.mendeley.com/import

Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer...

Les principales sources d'information scientifique


Synchronisation de sa bibliothèque de
références

Synchronisez votre bibliothèque Mendeley
Dekstop avec votre compte en ligne

Gestion et édition en ligne de vos références


Si vous disposez d'un lot de fichiers PDF
1
Indiquez le dossier à importer contenant les
PDF

3 Mendeley va chercher les informations décrivant
les documents dans les bases de données
2 d'information scientifique

L'importation se déroule automatiquement et les références
correspondant aux documents PDF apparaissent


Si vous venez de EndNote
1

Sélectionner les références à exporter

Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS)

Dans Mendeley, choisir le format d'import
RIS ou EndNote Xml suivant le format
d'export EndNote
2

De la même manière, Mendeley peut
importer des listes de références aux
formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,...


Gérer sa bibliothèque de références


Des fonctions de gestion simples et utiles
Collections créées par défaut :
●Toutes les références

●Ajouts récents Triez rapidement vos listes en
●Mes favoris cliquant sur les entêtes de colonne
●Références à vérifier

●Mes publications

●Publications non classées

Affichez le PDF attaché à la référence pour lecture

Créez vos propres collections

Les références peuvent être marquées
comme « à lire », « lues », « favorites »

Filtrez vos listes de références de façon aisée


Recherche incrémentielle et suggestion de recherche
Recherche dans les références et
les PDF de toutes les collections

Suggestion de termes au
court de la frappe

Mise à jour de la liste de Mise en contexte et surlignage
résultats au cour de la frappe des termes recherchés


Utilisation avancée du moteur de recherche

champs:terme à rechercher

Exemples :
● author:harnad

● keyword:Bacteria

● publication:nature

● tag:tools

● title:« open access »


PDF : lecteur intégré et recherche de mots-clés
Outils d'exploitation avancée : notes,
surlignage manuel, lecture plein écran, etc.

Ouverture des PDF
dans des onglet dédiés

Surlignage du terme recherché dans le PDF


PDF : surlignez et annotez vos documents

Annotation (avec auteur et date) Notes générales

Listes des annotations avec leurs
liens pour une navigation aisée

Passage surligné manuellement


Classez et renommez automatiquement vos fichiers
Tools > Option > File Organizer

L'outil de gestion des fichiers et ses options

Classement et nommage paramétrables


Classez et renommez automatiquement vos fichiers

PDF (et autres fichiers) joints renommés

Fichiers organisés automatiquement en arborescence


Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation des
noms de journaux, auteurs, tag, etc.

2

Mendeley modifie automatiquement
les références en conséquence

1 Les entrées d'index peuvent être glissée-déposée les
unes sur les autres pour homogénéiser leurs valeurs

Passage surligné manuellement


Citer en utilisant ses références


Citer dans Word et OpenOffice 1/2
Cliquer sur « Insert Citation » dans
la barre d'outil Mendeley de Word

2

1

Placer son curseur à l'emplacement de
l'appel de citation dans votre texte

3

Dans Mendeley, choisir la référence à citer


Citer dans Word et OpenOffice 2/2
Cliquer sur « Send Citation to Word »

4

5

L'appel de citation est intégré au format
choisi à l'emplacement du curseur


Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice
Cliquer sur « insert Bibliography »

2 Choisir un style bibliographique

Vous pouvez changer le style :
Finaliser son texte avec
le document se met à jour
tous les appels de citation

1

Positionner son curseur à l'endroit
où doit figurer la bibliographie
3

La bibliographie est générée automatiquement


Produire une simple liste de références formatées

Sélectionnez des références La liste est au format sélectionné

Déplacez les dans votre document (« drag & drop »)

Cela fonctionne aussi par copier-coller


Un vaste choix de styles bibliographiques

Ooo : « Choose Citation Style »
Word : « Other citations from Mendeley »

Recherchez et sélectionnez un style


Utiliser LaTeX / BibTeX : options de synchronisation de
la bibliothèque de références
Tools > Options > BibTeX
Prise en compte de caractères spéciaux

Mise à jour automatique du fichier .bib

Un ou plusieurs fichiers. On peut
imaginer le mettre sur un dossier
Clés BibTeX éditables si besoin partagé...
référence par référence


Partager, collaborer, s'intégrer à une
communauté en gérant son identité
numérique


Rendre une collection publique
Les critères de publication des collections sont paramétrables
pour chacune d'entre elles indépendamment des autres

Rendez vos collections
publiques via « Edit Settings »

D'autres usagers pourront s'abonner
à vos collections publiques. Vos
modifications seront répercutées
dans les Mendeley Desktop des
autres membres abonnées. Les
membres abonnées à une collection
sont visibles, ainsi que l'auteur d'une
collection


Créer une collection partagée pour collaborer

Une collection partagée entre membres n'est
visible uniquement que par ses membres.
Vous pouvez inviter vos contacts à partager
une collection que vous avez créée.
Les références sont alors visibles et
modifiables par tous les membres partageant
la collection.
Les fichiers PDF peuvent être mis en commun
et annotés collaborativement.


Compléter son profil et sa liste de publications :
l'identité numérique du chercheur

Liste des publications du
chercheur, mise à jour via une
collection Mendeley

CV du chercheur
Statistiques sur ce
chercheur

Contacts du chercheur

Contacter ce chercheur

Collections publiques
du chercheur


Mendeley : un réseau social pour les chercheurs ?

“ We define social network sites as web-
based services that allow individuals to
(1) construct a public or semi-public
profile within a bounded system, (2)
articulate a list of other users with
whom they share a connection, and (3)
view and traverse their list of
connections and those made by others
within the system.
”
Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship.
Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from
world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>.


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Ajout d'une notice à la
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Format de notice selon
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Créer une nouvelle entrée manuellement

Baguette magique :
création automatique de la
clé bibtex


« Recherche internet »
1

2

Interrogation de bases sur
internet...depuis JabRef

Rapatriement
automatique des notices


Finalement, quel outil choisir ?
Voir Cadiou, C. & Sarah-Blin, S., 2010. Principaux logiciels de gestion
bibliographiques utilisés au Cemagref : récapitulatif des avantages et
inconvénients. Available at: http://tinyurl.com/RefMagSoftCompareCadiou2010
[Consulté mai15, 2011].


JabRef
Les «+»
● compatible avec Windows, Linux et Mac

● gestion des fichiers joints

● création de groupes de références

● accès aux bases par onglets

Les « - »
● encore quelques soucis avec Open Office

● pas de partage de données

● l’interface reste moins intuitive que celle des autres logiciels

● pas de gestion des doublons

● importation irrégulière à cause de la répartition des champs en

onglets (le contenu d’un champ vide peut se retrouver dans BibTeX)

Cadiou, C. & Sarah-Blin, S., 2010

Zotero
Les «+»
● La capture de pages web très facile, le téléchargement de PDF et la

compatibilité avec de nombreux catalogues et bases de données
● Outil gratuit et open source

● Requêtes dynamiques

● Chronologie, rapport, liste biblio : faciles à éditer

● Accès distant : synchronisation possible d’une base sur un serveur

de Zotero ou sur un serveur interne WebDav

Les « - »
● L’interface pourrait être améliorée

● Espace de stockage limité à 500 Mo par compte gratuit sur serveur

● On ne peut gérer qu’une bibliothèque et on ne peut pas

synchroniser ou partager une sous-collection
● Liens avec traitement de texte pas toujours très fiables


Mendeley
Les «+»
● Interface claire et intuitive

● Le collaboratif avec «Shared Collection»: partage d’une sélection de

références et de leurs documents attachés
● Tags personnalisés

● Gestion des PDF performante (moteur de recherche, annotations...)

● Consultation, édition, et alimentation en ligne de la base

● Réseau social, partage avec la communauté de chercheurs

Les « - »
● Espace de stockage limité à 500 Mo par compte

● Pas plus de 10 participants par "SharedCollection"

● Pas de détection des doublons

● Pas de gestion et création de styles élaborée

● Les nouvelles fonctionnalités ou capacités de stockage sont payantes


Publier et archiver sa production


Droit d'auteur ?
● Vos droits par rapport à votre éditeur et vos lecteurs
● Vos devoirs envers les auteurs que vous citez
● Protection des œuvres littéraires et artistiques, sur tout
support (œuvre originale et mise en forme pour être
communiquée)
● Droits moraux / Droits patrimoniaux


Droits moraux

● Perpétuels, transmissibles aux héritiers
● Droit de paternité : revendiquer la paternité de l’œuvre
et exiger la mention de son nom lors de l'exploitation
(citation)
● Droit de divulgation, de présentation au public et au
respect de l’œuvre


Droits patrimoniaux

● Droit de reproduction : autoriser ou non la
reproduction d'une œuvre, sa traduction, son adaptation
● En contrôler sa distribution, importation, reproduction ,
citation, prêt.
● Droit de représentation
● Rémunération de l'auteur


Droits patrimoniaux

● L'auteur peut par contrat céder ses droits patrimoniaux
ou consentir une licence à un tiers (éditeur) :
rémunération de 5 à 15 %
● Pas de rémunération pour la rédaction d'un article ou
d'un ouvrage collectif (cession gratuite souvent tacite)


Alternative : licences Creative Commons

● Logique inverse : quelques droits réservés (choix de
l'auteur)
● En accord parfait avec le principe du libre accès
● Licences perpétuelles (70 ans après la mort de l'auteur)
et irrévocables (on ne peut revenir sur la licence
accordée)


Creative Commons 101
● 4 attributs combinables, 6 contrats différents :
● BY : attribution, paternité (droit moral)
● NC (Non Commercial) : pas d'utilisation commerciale de
l’œuvre dérivée
● ND (No Derivate works) : reproduction sans
modification
● SA (Share Alike) : partage aux conditions identiques


Licences Creative Commons


La production scientifique de l'ECL

Toutes les informations sur le
dépôt et la rédaction de la thèse


Circuit de la thèse

Vade-mecum : circuit de la thèse


Valoriser sa production dans une
archive ouverte


HAL (Hyper Articles en Ligne)

Se créer des alertes

Les derniers dépôts par discipline


HAL (Hyper Articles en Ligne)
● « Archive ouverte » pluridisciplinaire destinée au dépôt et à la diffusion de
documents
● => communication scientifique directe

● Donne libre accès à l’information scientifique et technique

Types de documents présents dans HAL :
● Publications dans des revues à comité de lecture

● Conférences invitées dans des congrès

● Proceedings à comité de lecture

● Publications dans des revues sans comité

● Communications à des congrès, symposiums

● Séminaires, workshops

● Chapitres dans les ouvrages

● Livres et ouvrages

● Thèses...


Pourquoi déposer dans HAL ?
Accessibilité + visibilité
Consultation et dépôt ouverts à tous
Visibilité scientifique internationale :
● du chercheur

● du laboratoire

● de l’établissement ou de l’institution

● des équipes de recherches par rapport aux financeurs (ANR…)

Dépôt fortement préconisé par l’ECL et le CNRS

Simplicité + pérennité
Dépôt simple et rapide : un auteur archive pour les co-auteurs
Possibilité d’ajout de nouvelles versions du document
Pérennité et stabilité des URL (Archivage des données au CINES)


Pourquoi déposer dans HAL ?
Intérêt pour la publication
Taux de citation plus élevé pour un article déposé dans une archive
ouverte
Accroissement du facteur d’impact de la revue
Augmentation du cycle de vie de l’article
Extraction et export de bibliographie (rapport d’activité…)
Dépôt simultané dans arXiv

Plagiat / Responsabilité scientifique
Le dépôt permet :
● de garantir la paternité de l’œuvre

● de prendre date

Responsabilisation du déposant (aucun dépôt ne peut être retiré)
Validation de la teneur scientifique et technique du document


Les différentes versions d'un document
scientifique

●Pre-print : version auteur d'un article avant
évaluation par les pairs (document de travail ou
document soumis pour publication)

●Post-print : version auteur finale d’un article après
évaluation par les pairs (généralement acceptée pour
publication)

● Pdf éditeur : version publiée par l'éditeur sur son
site, avec mention du titre du journal

Politique des éditeurs scientifiques sur le dépôt dans HAL
SHERPA RoMEO


Politique des éditeurs scientifiques sur le dépôt dans HAL
SHERPA RoMEO
Des couleurs sont attribuées aux éditeurs selon les droits de dépôts accordés aux auteurs :
● vert : pré-print et post-print ou pdf éditeur

● bleu : post-print ou pdf éditeur

● jaune : pré-print

● blanc : archivage non accepté

Dépôt ? Editeur Editeur Editeur Vert Editeur Blanc
Vert Vert Pdf éditeur Dépôt non
Editeur Pré-print Post-print accepté
AIAA X
AIP X X X*
ASME X
Cambridge X X X**
Elsevier X
IEEE X X X
IOP X X
*Sur site perso ou
Springer X X institutionnel uniquement
Wiley X X
** 1 an d’embargo


Déposer dans HAL : vérification, authentification,
inscription
Après vérification
● du droit accordé par l'éditeur

● de l'accord des co-auteurs

● que l'article n'est pas déjà déposé

1

Interroger sur les
documents en
texte intégral
2
3


Déposer dans HAL : saisie des « métadonnées »


Déposer dans HAL : saisie des auteurs


Déposer dans HAL : dépôt des fichiers


Déposer dans HAL : confirmation par e-mail après
vérification humaine


Questions ?

Céline Andrieu 04.72.18.67.44 celine.andrieu@ec-lyon.fr
Alain Marois 04.72.18.64.50 alain.marois@ec-lyon.fr
Philippe Eyraud 04.72.18.65.00 philippe.eyraud@ec-lyon.fr


Ressources

● Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur
le world wide web :
<http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>.

Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS
●

Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204>
● Mendeley Teaching Presentation [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation>
● Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web :
<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/>
● Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cité 31 Mai 2010].
Disponible sur le world wide web :
<http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html>
● Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327-
328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008

Pochet, Bernard. La rédaction d’un article scientifique. Petit guide pratique adapté aux sciences appliquées et sciences de la vie à l’heure
●

du libre accès. [Gembloux (Belgique)]: Les Presses agronomiques de Gembloux, 2009 [cité 24 mai 2011]. Disponible sur le world wide web :
<http://orbi.ulg.ac.be/handle/2268/24998>.


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